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文档简介
(优选)分子生物学中心法则当前第1页\共有45页\编于星期五\3点Reversetranscription中心法则及补充当前第2页\共有45页\编于星期五\3点第19章DNA复制与修复(一)复制方式:半保留复制。物质基础:双螺旋结构当前第3页\共有45页\编于星期五\3点氮标记技术证实了DNA的半保留复制
以15NH4Cl为唯一氮源培养大肠杆菌,连续培养12代,使所有DNA标记上15N;在普通培养基(14N)培养一代后,所有DNA密度介于14N~15N之间;培养两代后,14N和14N~15N杂合分子等量出现。继续培养,14N分子增多。当前第4页\共有45页\编于星期五\3点(深蓝:15N)(粉红:14N)DNA半保留复制的证据培养于普通培养液继续培养于普通培养液含15N-DNA的细菌普通DNA重DNA第一代中等密度DNA第二代普通DNA中等密度DNA当前第5页\共有45页\编于星期五\3点当前第6页\共有45页\编于星期五\3点当前第7页\共有45页\编于星期五\3点第二节原核生物DNA的复制DNA的复制实际上就是以DNA为模板在DNA聚合酶作用下,将游离的四种脱氧三核苷酸(dATP,dGTP,dCTP,dTTP,简写为dNTP)聚合成DNA的过程。这是一个非常复杂的酶促反应,需要许多种酶和蛋白质参与。当前第8页\共有45页\编于星期五\3点一、DNA复制所需原料1)底物:dATP,dGTP,dCTP,dTTP, 总称为dNTP2)DNA聚合酶,DNA-pol3)模板(template):解开成单链的DNA母链4)引物(primer):RNA引物5)其他酶和蛋白质因子当前第9页\共有45页\编于星期五\3点1、DNA聚合酶-复制的基本酶作用特点:从引物游离3’-OH开始加入脱氧核苷酸,需要底物,引物,模板,能量,Mg2+。DNA聚合酶为DNA指导的酶。当前第10页\共有45页\编于星期五\3点原核细胞DNA聚合酶539DNA聚合酶ⅠDNA聚合酶ⅡDNA聚合酶Ⅲ
5’→3’聚合活性
+++聚合速度nt/s16~207250~1000对dNTP亲和力
低低高5’→3’外切活性
+-+3’→5’外切活性
+++功能
修复;去除引物;填补空缺
协助修复主要复制酶DNA聚合酶Ⅳ和Ⅴ:与突变存活有关的酶。当前第11页\共有45页\编于星期五\3点DNA-pol的5´3´聚合作用3’5’5’3’3’5’DNA-pol5’3’OHP当前第12页\共有45页\编于星期五\3点DNA-pol
I
5´3´外切活性切除引物,切除突变片段DNA-pol
I
3´5´外切活性:校读(proofread)功能5’3’AG5’3’当前第13页\共有45页\编于星期五\3点小片段大片段(Klenowfragment)5‘→3’聚合功能,3'→5'外切酶活性5'→3'外切酶活性DNApolI的酶切片段EJPNMLHIORQGCDBFAK当前第14页\共有45页\编于星期五\3点引物酶(Primase)5´5´DNA合成需在RNA引物的基础上进行。RNA引物5´3´5´3´当前第15页\共有45页\编于星期五\3点解除DNA高级结构的酶与蛋白:DNA复制从起始点开始复制时,局部的DNA双链必须打开,主要靠解螺旋酶(helicase)的作用,打开后的单链还需要单链结合蛋白与其结合,防止复性。在复制叉向前移动时造成前方DNA分子产生正超螺旋,必须由拓扑异构酶来解决。当前第16页\共有45页\编于星期五\3点3、解螺旋酶(helicase)解螺旋酶作用:断裂互补碱基间的氢键,使DNA成单链。基因:dnaA、B、C…蛋白:DnaA、B、C…ATP当前第17页\共有45页\编于星期五\3点4、拓扑异构酶(topoisomerase,Topo)一类能调节DNA分子超螺旋类型和水平的酶。DNA正超螺旋与负超螺旋复制后形成负超螺旋复制前方形成正超螺旋DNA双螺旋拓扑异构酶Ⅰ酶Ⅱ,引入负超螺旋当前第18页\共有45页\编于星期五\3点消除复制叉前方形成的正超螺旋,即引入负超螺旋。切割DNA双链,此时不需ATP;尔后由ATP供能,连接切口。不需ATP,切割双链DNA中的一链,使DNA松弛后,连接切口。TopoⅠ:TopoⅡ:临床上使用的某些抗肿瘤药(如喜树碱等)是通过抑制Topo酶活性而杀死肿瘤细胞的。作用方式:切割DNA链,使其松弛后再连接。当前第19页\共有45页\编于星期五\3点5、DNA连接酶-连接DNA片断的酶连接酶(ligase)的作用是催化相邻的DNA片段以3’、5’-磷酸二酯键相连接。连接反应中的能量来自ATP(动物细胞或噬菌体)或NAD+(细菌)。连接酶要求催化反应时缺口处有一条链是连续的。不能将两条游离的DNA分子连接起来。当前第20页\共有45页\编于星期五\3点连接酶的催化反应当前第21页\共有45页\编于星期五\3点二、DNA复制过程(544)各种生物DNA的复制过程大同小异,大致包括以下几个阶段。1、起始-有固定的起点(1)识别起始位点
复制是从DNA分子上的特定部位开始的,这一部位叫做复制起始点(originalreplication)常用ori或o表示。多双向、对称等速复制。当前第22页\共有45页\编于星期五\3点大肠杆菌的oriC大肠杆菌染色体DNA复制起始点oriC由245bp组成,关键序列在于两组短的重复:三个13bp和四个9bp组成的保守序列,是大肠杆菌中DnaA蛋白识别的位置。当前第23页\共有45页\编于星期五\3点(2)DNA解旋,形成复制叉解旋酶、拓扑异构酶与复制起点结合,解开双螺旋成两条局部的单链,SSB也随即结合上保护单链。(3)RNA引物的合成
引物合成酶结合上去,形成结构复杂的引发体。引物合成酶合成引物。
当前第24页\共有45页\编于星期五\3点起始:OriC开始,形成复杂的引发体,合成RNA引物当前第25页\共有45页\编于星期五\3点2、延伸-酶催化以高速度进行在DNA聚合酶Ⅲ的催化下,根据模板链3’→5’的核苷酸顺序,从引物游离3’-OH开始加入脱氧核苷酸,直至合成整个DNA片断。酶的催化方向:5’→3’,所以新生DNA链的延伸方向也是5’→3’。两条链复制又同时进行。如何解决?一条链连续合成,称为前导链;另一条链不连续合成,为滞后链。冈崎片断:以DNA5’→3’链为模板时合成的不连续的较短的DNA片断。当前第26页\共有45页\编于星期五\3点’ThemodelofDNA-polIII
formthecatalyticcore
LinkstwocoresLeadingstrandsynthesisLaggingstrandsynthesisactasaclamp当前第27页\共有45页\编于星期五\3点复制过程:两条链同时进行当前第28页\共有45页\编于星期五\3点聚合酶Ⅰ切除引物连接酶连接冈崎片断聚合酶Ⅲ合成冈崎片断当前第29页\共有45页\编于星期五\3点3、终止两复制叉在终止区相遇,形成的连锁体由拓扑异构酶Ⅳ分开。终止子ter和终止蛋白Tus防止复制叉超过终止区过界复制。当前第30页\共有45页\编于星期五\3点当前第31页\共有45页\编于星期五\3点第三节真核生物DNA的复制真核DNA的合成的基本过程类似于原核DNA,不同之处:多复制起点至少有五种聚合酶αβγδε
端粒的复制依赖于端粒酶
当前第32页\共有45页\编于星期五\3点(1)真核细胞多复制起点当前第33页\共有45页\编于星期五\3点(2)真核生物DNA聚合酶真核生物至少拥有5种DNA聚合酶,分别命名为α、β、γ、δ及ε。能在5’→3’方向聚合DNA链,但功能不尽相同。真核细胞中与DNA复制有关的酶是DNApolα(合成引物)和δ(合成前导链和滞后链)。δ还具有3’→5’外切酶的校正功能,并具有解螺旋的作用。酶β和ε:参与修复。酶γ参与线粒体DNA复制。当前第34页\共有45页\编于星期五\3点(3)端粒及端粒酶真核生物染色体DNA是线性的,每复制一次,子链的5’有缺失。3’端有特殊的序列,是线性DNA末端复制必需的---端粒作用:稳定染色体当前第35页\共有45页\编于星期五\3点线形DNA复制末端问题5’3’5’3’5’3’5’3’当前第36页\共有45页\编于星期五\3点端粒缩短当前第37页\共有45页\编于星期五\3点当前第38页\共有45页\编于星期五\3点第四节反转录逆转录:在RNA指导下DNA的合成。即以RNA为模板,合成DNA的过程。此过程和一般遗传信息流转录的方向相反,故称为反转录,催化此过程的DNA聚合酶叫做反转录酶(reversetranscriptase)。反转录酶不仅普遍存在于RNA病毒中,哺乳动物的胚胎细胞和正在分裂的淋巴细胞中也有反转录酶。
当前第39页\共有45页\编于星期五\3点反转录酶的活性
①RNA指导的DNA聚合酶活性:反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。②RNaseH活性:由反转录酶催化合成的cDNA与模板RNA形成的杂交分子,由RNaseH从RNA5′端水解掉RNA分子。③DNA指导的DNA聚合酶活性;以反转录合成的第一条DNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成第二条DNA分子。当前第40页\共有45页\编于星期五\3点RNA模板逆转录活性RNaseH活性RNA:DNA杂化双链单链DNADNApol活性整合(integration)入细胞基因组双链DNA
病毒基因组通过基因重组插入到宿主细胞基因组中,称为整合。tRNA引物当前第41页\共有45页\编于星期五\3点逆转录酶将RNA逆转录成双链DNA,与宿主细胞DNA整合,可能导致癌变!病毒DNA随宿主细胞复制,转录生成RNA并翻译成蛋白。RNA和蛋白组装成病毒。当前第42页\共有45页\编于星期五\3点第五节DNA的损伤修复一、DNA的损伤(突变)的概念DNA分子一级结构的改变称为DNA损伤(DNAdamage)或突变(mutation)。自发突变:大多数突变属此类,原因不明。诱发突变:由理化因素诱发物理因素(紫外、高能射线、电离辐射)化学因素(5-F-U,烷基化试剂、亚硝酸盐、碱基类似物)当前第43页\共有45页\编于星期五\3点二、突变的类型1.点突变(pointmutation)
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