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n几种常用 n猕猴 扫描序列n猕猴 数据一般分析流n常用 数据分析方法及其结果解n几种常用 n猕猴 扫描序列n猕猴 数据一般分析流n常用 数据分析方法及其结果解常用 成像模图像(对比度一个或几个量 (N)MRIMRI系

MRI信Anti-Anti-1yy1yy描

RF(B

M0 ReceiverM0yM述

Bloch’s 成 BraintissuesatMMM10 1 eTRShortTRShort

LongTRLong

LongTRShort

扩 成像S

Se0b 0

222

3Mori,血氧水平依赖(BOLD)成NeuronalActivityincreaseDeoxyhemoglobin(paramagnetic)decreaseMRsignal

11112T22T2*Paulingetal.,1936,PNAS;Ogawaetal.,

Ogawaetal.,1992,Biswaletal.,n几种常用 n猕猴 扫描序列n猕猴 数据一般分析流n常用 数据分析方法及其结果解猕猴MRI扫描CourtesyofXiaoyu猕猴MRI扫描期间生理状态维持猕猴MRI线猕猴MRI扫描 成像扫描序列:T1_MPRAGE(~7主要参数:TR2300msTE3msTI1000msFA9°voxelsize0.5x0.5x0.5 扩 成像扫描序列:ep2d_diff(~12主要参数:TR11000msTE99msTR6300msTE76msforAC88voxelsize1.31.3x1.3mm3b-value1000s/mm2diff_directions746410b0),相位AP和PA成对…

扩散方… 血氧水平依赖成像扫描序列:ep2d_bold主要参数:TR2000msTE29msvoxelsize1.5x1.5x2.5mm3measurements200一般重…时n几种常用 n猕猴 扫描序列n猕猴 数据一般分析流n常用 数据分析方法及其结果解猕猴静息态fMRISTEP1:Convertingfrom (.dcm/.IMA)formattoNIFTIformat(.nii/.imgand.hdr)STEP2:CheckingstabilityofBOLDsignalsSTEP3:DistortionSTEP4:Slicetiming,RealignmentandSTEP5:MovetheoriginoftheimagestoanteriorcommissureSTEP6:BrainextractionSTEP7:NormalizationtoF99STEP8:WritingnormalizationparametersandsmoothingSTEP9:Detrending,bandpassfilterandregressingCourtesyofQian猕猴DTI数据预STEP1:Converting (.dcm/.IMA)formattoNIFTIformat(.nii/.imgand.STEP2:CheckingqualityofrawdataSTEP3:Eddy-currentcorrectionSTEP4:Distortioncorrection(AcquireDWIsfrombothAPandPAdirections)STEP5:Brainextraction(BETinFSL)STEP6:TensorCourtesyofQimingn几种常用 n猕猴 扫描序列n猕猴 数据一般分析流n常用 数据分析方法及其结果解静息态fMRI分析静息态局部分

WWR 2i1K2 Zangetal.,2007,Brain&Development;Zangetal.,静息态功能连接分析-基于nniir niniVincentetal.,2007,Nature;Luetal.,2012,静息态功能连接分析-基于 Lvetal.,2016,Biological网络分析-图

Nodes:brainregionsEdges:connectionsHighCpHighLp

Watts&HighCpLowLp

LowCpLowLpCourtesyofDr.He

Small-worldnetworkscontainpredominantlylocallinksandafewlong-distancelinks(“shortcuts”)AssumethatabinaryundirectednetworkwithNWedefinedsubgraphGiasthesetofnodesthatarethedirectneighborsoftheithnode

ShortestpathlengthoftheKi

Lp

d1Sparsity(cost)ofthe1

HarmonicmeanofK

Ki

ijG ClusteringCoefficientofithC

ClusteringCoefficientofthe

Cp LrandCp iC 1ipNp

Watts&Strogatz,1998,Nature;Maslov& ,2003,SIAMRevSocIndApplGlobal Nodal E

Ki N

i

d

Local

DegreeE N

exponentialtruncatedpowercciSmall-WorldidEBetweenness

pka powerbi

R21

yy

yyNormalized

…Latoraetal.,2001,PhysRev man,1977,Sociometry;Achardetal.,2006,J ,2006,…动态功能连接滑动Allenetal.,2013,CerebCortex;Hutchisonetal.,2013,FunctionalBrainAllenetal.,2013,CerebCortex;Barttfeldetal.,2014,PNAS;Liaoetal.,2015,Front.Hum.Coleetal.,2013,Nat.

FlexibleHubFunctionalFlexibilityDuringExecutiveBraunetal.,2015,InherentFunctionalYinetal.,2016,JNeurosci,InYinetal.,2016,JNeurosci,InHilletal.,2011,常用的软件工 https:扩散张量成像分SSeSSe0bG 3DDDDD

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