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文档简介
数据统计分析模型第1页,共16页,2023年,2月20日,星期五参考书施雨,李耀武编,概率论与数理统计应用,西安交通大学出版社梅长林,范金成编,数据分析方法,高等教育出版社,王学民编,应用多元统计分析,上海财经大学出版社方开泰编,使用多元统计分析,华东师范大学出版社第2页,共16页,2023年,2月20日,星期五统计软件SAS(StatisticalAnalysisSystem)SPSS(StatisticalPackagefortheSocialScience)R第3页,共16页,2023年,2月20日,星期五数据统计分析常用模型方差分析回归分析判别分析聚类分析主成分分析相关分析(典型相关分析)因子分析列联表分析时间序列分析第4页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子例1:为了比较同一类型的三种不同食谱的营养效果,将19只幼鼠随机地分为三组,每只分为8只、4只、7只,各采用这三种食谱喂养。假定其他条件均保持相同,12周后测得其体重增加量如下表所示,是比较这三种食谱的营养效果是否有显著差异食谱体重增加量甲164190203205206214228257乙185197201231丙187212215220248265281第5页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子例2:为了研制一种治疗枯草热病的药物,将两种成分(A和B)各按三种不同剂量(低、中、高)混合,将36位自愿受试患者随机分为9组,每组4人服用各种剂量回合下的药物,记录其病情缓解的时间(单位:小时)如下表所示,试分析两种成分及交互作用对病情缓解的时间是否有显著影响。第6页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子AB低剂量中剂量高剂量低剂量2.42.72.32.54.64.24.94.7
4.84.54.44.6低剂量5.85.25.55.38.99.18.79.0
9.19.38.79.4低剂量6.15.75.96.29.910.510.610.113.513.013.313.2第7页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子例3:费希尔(Fisher)于1936年发表了关于鸢尾花(Iris)的数据。数据是对3种鸢尾花:刚毛鸢尾花(第1组)、变色鸢尾花(第2组)和费吉尼亚鸢尾花(第3组)各抽取一个容量为50的样本,测量其花萼长x1,花萼宽x2,花瓣长x3,花瓣宽x4,单位为mm,数据如下表所示。假定有新样品(x1,x2,x3,x4)=(62.35,58,18),试判别该样品属于哪种鸢尾花。第8页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子编号品种萼长x1萼宽x2瓣长x3瓣宽x4
1503314214634143………………265284615262224515………………364285622………………150363336025第9页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子例4:2000年全国大学生数学建模竞赛A题DNA序列分类
2000年6月,人类基因组计划中DNA全序列草图完成,预计2001年可以完成精确的全序列图,此后人类将拥有一本记录着自身生老病死及遗传进化的全部信息的“天书”。这本大自然写成的“天书”是由4个字符A,T,C,G按一定顺序排成的长约30亿的序列,其中没有“断句”也没有标点符号,除了这4个字符表示4种碱基以外,人们对它包含的“内容”知之甚少,难以读懂。破译这部世界上最巨量信息的“天书”是二十一世纪最重要的任务之一。在这个目标中,研究DNA全序列具有什么结构,由这4个字符排成的看似随机的序列中隐藏着什么规律,又是解读这部天书的基础,是生物信息学(Bioinformatics)最重要的课题之一。
虽然人类对这部“天书”知之甚少,但也发现了DNA序列中的一些规律性和结构。例如,在全序列中有一些是用于编码蛋白质的序列片段,即由这4个字符组成的64种不同的3字符串,其中大多数用于编码构成蛋白质的20种氨基酸。又例如,在不用于编码蛋白质的序列片段中,A和T的含量特别多些,于是以某些碱基特别丰富作为特征去研究DNA序列的结构也取得了一些结果。此外,利用统计的方法还发现序列的某些片段之间具有相关性,等等。这些发现让人们相信,DNA序列中存在着局部的和全局性的结构,充分发掘序列的结构对理解DNA全序列是十分有意义的。目前在这项研究中最普通的思想是省略序列的某些细节,突出特征,然后将其表示成适当的数学对象。这种被称为粗粒化和模型化的方法往往有助于研究规律性和结构。
第10页,共16页,2023年,2月20日,星期五作为研究DNA序列的结构的尝试,提出以下对序列集合进行分类的问题:
1)下面有20个已知类别的人工制造的序列(见下页),其中序列标号1—10
为A类,11-20为B类。请从中提取特征,构造分类方法,并用这些已知类别的序列,衡量你的方法是否足够好。然后用你认为满意的方法,对另外20个未标明类别的人工序列(标号21—40)进行分类,把结果用序号(按从小到大的顺序)标明它们的类别(无法分类的不写入):
A类__________
;B类_______________
。
请详细描述你的方法,给出计算程序。如果你部分地使用了现成的分类方法,也要将方法名称准确注明。
这40个序列也放在如下地址的网页上,用数据文件Art-model-data
标识,供下载:
网易网址:
教育频道
在线试题;
教育网:
New
mcm2000
教育网:
/mcm
第11页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子
2)在同样网址的数据文件Nat-model-data
中给出了182个自然DNA序列,它们都较长。用你的分类方法对它们进行分类,像1)一样地给出分类结果。
提示:衡量分类方法优劣的标准是分类的正确率,构造分类方法有许多途径,例如提取序列的某些特征,给出它们的数学表示:几何空间或向量空间的元素等,然后再选择或构造适合这种数学表示的分类方法;又例如构造概率统计模型,然后用统计方法分类等。第12页,共16页,2023年,2月20日,星期五例子Art-model-data
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2.cggaggacaaacgggatggcggtattggaggtggcggactgttcggggaattattcggtttaaacgggacaaggaaggcggctggaacaaccggacggtggcagcaaagga
3.gggacggatacggattctggccacggacggaaaggaggacacggcggacatacacggcggcaacggacggaacggaggaaggagggcggcaatcggtacggaggcggcgga
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6.atggaaaattttcggaaaggcggcaggcaggaggcaaaggcggaaaggaaggaaacggcggatatttcggaagtggatattaggagggcggaataaaggaacggcggcaca
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