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文档简介
遗传学连锁互换和基因作图演示文稿现在是1页\一共有194页\编辑于星期日遗传学连锁互换和基因作图现在是2页\一共有194页\编辑于星期日第一节连锁与重组现在是3页\一共有194页\编辑于星期日性状连锁遗传的发现现在是4页\一共有194页\编辑于星期日现在是5页\一共有194页\编辑于星期日现在是6页\一共有194页\编辑于星期日现在是7页\一共有194页\编辑于星期日连锁遗传的解释现在是8页\一共有194页\编辑于星期日测交:杂合体或未知基因型的个体与隐性纯合体的交配
现在是9页\一共有194页\编辑于星期日现在是10页\一共有194页\编辑于星期日现在是11页\一共有194页\编辑于星期日现在是12页\一共有194页\编辑于星期日
1912年Morgan用果蝇为材料研究连锁现象,提出了遗传学的第三定律——连锁与互换定律现在是13页\一共有194页\编辑于星期日现在是14页\一共有194页\编辑于星期日现在是15页\一共有194页\编辑于星期日现在是16页\一共有194页\编辑于星期日现在是17页\一共有194页\编辑于星期日完全连锁与不完全连锁现在是18页\一共有194页\编辑于星期日现在是19页\一共有194页\编辑于星期日现在是20页\一共有194页\编辑于星期日现在是21页\一共有194页\编辑于星期日现在是22页\一共有194页\编辑于星期日二、交叉与交(互)换交叉:1909年Janssens首先观察到减数分裂同源染色体部分区域的交叉。互换:Morgan设想交叉的区域应该是染色体互换的区域,因此表现为不完全连锁(如上例的11%重组合)。完全连锁:雄果蝇和雌家蚕现在是23页\一共有194页\编辑于星期日现在是24页\一共有194页\编辑于星期日几个概念:
1、重组与交换:重组是指基因的重新组合;交换是指染色体片段的交换。2、单交换和双交换:单交换是指在考察区域内发生了一次交换,同理双交换是指发生了两次交换。现在是25页\一共有194页\编辑于星期日现在是26页\一共有194页\编辑于星期日现在是27页\一共有194页\编辑于星期日现在是28页\一共有194页\编辑于星期日现在是29页\一共有194页\编辑于星期日现在是30页\一共有194页\编辑于星期日现在是31页\一共有194页\编辑于星期日现在是32页\一共有194页\编辑于星期日现在是33页\一共有194页\编辑于星期日现在是34页\一共有194页\编辑于星期日第二节重组率及测定
现在是35页\一共有194页\编辑于星期日现在是36页\一共有194页\编辑于星期日交换值的测定现在是37页\一共有194页\编辑于星期日现在是38页\一共有194页\编辑于星期日现在是39页\一共有194页\编辑于星期日交换值与连锁强度的关系现在是40页\一共有194页\编辑于星期日影响交换值的因子现在是41页\一共有194页\编辑于星期日第三节基因定位与连锁遗传图
现在是42页\一共有194页\编辑于星期日基因定位现在是43页\一共有194页\编辑于星期日两点测验
现在是44页\一共有194页\编辑于星期日现在是45页\一共有194页\编辑于星期日现在是46页\一共有194页\编辑于星期日现在是47页\一共有194页\编辑于星期日现在是48页\一共有194页\编辑于星期日现在是49页\一共有194页\编辑于星期日三点测验
现在是50页\一共有194页\编辑于星期日现在是51页\一共有194页\编辑于星期日现在是52页\一共有194页\编辑于星期日现在是53页\一共有194页\编辑于星期日现在是54页\一共有194页\编辑于星期日现在是55页\一共有194页\编辑于星期日果蝇三点测验
现在是56页\一共有194页\编辑于星期日果蝇三点测交作图:例:果蝇Y染色体上有y—黄身,Y—灰身;ct—截翅,Ct—正常翅;ec—棘眼,Ec—正常眼。杂交:YCtEc/yctec(♀)xyctec/Y(♂)子代:yctec1071YCtEc1080Yctec66yCtEc78YCtec6yCtec282YctEc293yctEc4
现在是57页\一共有194页\编辑于星期日例如:y+w+ec+/ywec可产生8种配子,这8种配子来源于非交换、单交换及双交换。现在是58页\一共有194页\编辑于星期日现在是59页\一共有194页\编辑于星期日分析:归类:把一次交换产生的配子(表型)归为一类,填入表中:
重组类型数目占总数%y—ecec—cty—ctyctec107174.68YCtEc1080Yctec665.00√√yCtEc78yCtec28219.97√√YctEc293YCtec40.35√√yctEc6现在是60页\一共有194页\编辑于星期日确定基因顺序:根据双交换类型的特点,我们知道这3个基因的顺序为y—ec—ct。
统计各类型的数据,计算重组值:
y—ec:5.00%+0.35%=5.35%ec—ct:19.97%+0.35%=20.32%y—ct:5.00%+19.97=24.97%图距:y5.35ec20.32ct24.97现在是61页\一共有194页\编辑于星期日问题:24.97≠5.35+20.32原因:双交换引起校正:
5.35+20.32=24.97+2x0.35=25.67y5.35ec20.32ct25.67现在是62页\一共有194页\编辑于星期日双交换的特点:双交换的比率最低:如果3个基因是自由组合的,则8种配子的比率为1:1:1:1:1:1:1:1,如果是连锁的,则非交换>单交换>双交换。双交换的结果是3个基因中只有中间的基因位置发生改变,另两个基因位置不变。重组值与交换值的区别:发生双交换后,头尾两个基因间发生了两次交换,但两基因没有重组。理论上说,染色体图距应由交换值表示,但我们能观察到的只有表型(基因)的重组。现在是63页\一共有194页\编辑于星期日现在是64页\一共有194页\编辑于星期日现在是65页\一共有194页\编辑于星期日干扰与符合
现在是66页\一共有194页\编辑于星期日现在是67页\一共有194页\编辑于星期日干涉(扰)和并发系数(率)干涉:发生一次单交换后会影响临近发生另一次单交换,称干涉。可分为正干涉和负干涉。真核生物一般为正干涉,原核生物为负干涉。干涉的大小用并发系数(C)表示:观察到的双交换频率并发系数C=
两个单交换的乘积干涉I=1-并发系数上例:C=0.35%/(5.35%x20.32%)=0.3211I=1-0.3211=0.6789(67.89%)现在是68页\一共有194页\编辑于星期日连锁遗传图
现在是69页\一共有194页\编辑于星期日连锁遗传图现在是70页\一共有194页\编辑于星期日连锁群:彼此连锁,具有一起往下传递的趋势的许多基因,构成一个连锁群。某种生物的连锁群的数目等于该生物的染色体对数。现在是71页\一共有194页\编辑于星期日重组频率(值):重组合
Rf=X100%
亲组合+重组合染色体图距:两个基因在染色体上的相对距离。1%的重组值定义为1个图距单位(mapunit,mu)。也有人将1个图距单位称为1个厘摩(centiMorgan,cM)。现在是72页\一共有194页\编辑于星期日果蝇的4个连锁群现在是73页\一共有194页\编辑于星期日现在是74页\一共有194页\编辑于星期日现在是75页\一共有194页\编辑于星期日第三节真菌的遗传分析现在是76页\一共有194页\编辑于星期日真菌类的遗传分析---四分子分析顺序四分子分析非顺序四分子分析:
着丝粒作图重组作图重组作图四分子分析现在是77页\一共有194页\编辑于星期日一、脉孢霉(红色面包霉)的生活史现在是78页\一共有194页\编辑于星期日现在是79页\一共有194页\编辑于星期日无性孢子——分生孢子有性孢子——子囊孢子现在是80页\一共有194页\编辑于星期日优点:单倍体生物生活史简单,生长快,易培养具有有性生殖过程一次减数分裂的产物在一个子囊内,易分析现在是81页\一共有194页\编辑于星期日
红色面包霉的特点生活史简单,易于繁殖、培养、管理;子囊孢子是单倍体,表型直接反映基因型,可直接观察基因表现,无需测交;一次只分析一个减数分裂产物,可获得并分析单次减数分裂的结果;可进行有性生殖,染色体结构和功能类似于高等生物。现在是82页\一共有194页\编辑于星期日现在是83页\一共有194页\编辑于星期日粗糙链孢霉的生活史现在是84页\一共有194页\编辑于星期日现在是85页\一共有194页\编辑于星期日二、顺序四分子分析现在是86页\一共有194页\编辑于星期日单倍体营养体在营养或生长环境不利时,转入有性生殖。菌丝产生的单倍体分生孢子与另一个菌丝的原子囊果中的单倍体子囊孢子杂交。形成2倍体的杂合体,该2倍体经过第一次减数分裂,获得一个细胞内含有4个单倍体的产物,4个单倍体产物呈直线排列,称为:四分子由于脉孢霉一次减数分裂的四个产物被包裹在窄窄的子囊内,称为四分子,对其分析称四分子分析(tetradanalysis)四分子在子囊中的排列顺序取决于减数分裂时着丝粒的取向,因此可以将着丝粒看作一个“基因”,以它作为标准点,将基因与它比较,分析各基因间的顺序与距离,该方法也称着丝粒作图。现在是87页\一共有194页\编辑于星期日PhotomicrographshowingsegregationofdarkandlightascosporesinNeurospora.现在是88页\一共有194页\编辑于星期日四分子分析的优越性:1、可把着丝粒看作一个座位2、子囊孢子的对称性,证明减数分裂是一个交互过程。3、可以检验染色单体的交换是否有干涉,还可用于基因转变的研究。4、证明双交换可以包括4线中的两线、3线或4线。现在是89页\一共有194页\编辑于星期日三、着丝点作图(centromeremapping):利用四分子分析法,测定基因与着丝粒间的距离。现在是90页\一共有194页\编辑于星期日(1)、第一次分裂分离与第二次分裂分离现在是91页\一共有194页\编辑于星期日M1:第一次分裂分离
着丝粒与标记基因的分离时期在第一次减数分裂时期M2:第二次分裂分离着丝粒与标记基因的分离时期在第二次减数分裂时期现在是92页\一共有194页\编辑于星期日现在是93页\一共有194页\编辑于星期日现在是94页\一共有194页\编辑于星期日现在是95页\一共有194页\编辑于星期日现在是96页\一共有194页\编辑于星期日现在是97页\一共有194页\编辑于星期日现在是98页\一共有194页\编辑于星期日现在是99页\一共有194页\编辑于星期日现在是100页\一共有194页\编辑于星期日现在是101页\一共有194页\编辑于星期日(3)、着丝点作图的计算现在是102页\一共有194页\编辑于星期日着丝粒作图与基因重组交换的子囊孢子数着丝粒距离=
总孢子数
交换型子囊数
=x1/2
总子囊数
M2=x1/2
M1+M2
现在是103页\一共有194页\编辑于星期日例:红色面包霉的连锁与交换红色面包霉有一个与赖氨酸合成有关的基因(lys):野生型——能够合成赖氨酸,记为lys+,能在基本培养基(不含赖氨酸)上正常生长,成熟子囊孢子呈黑色;突变型——不能合成赖氨酸,称为赖氨酸缺陷型,记为lys-,在基本培养基上生长缓慢,子囊孢子成熟较迟,呈灰色。用不同接合型的lys+和lys-杂交,可预期八个孢子中lys+和lys-呈4:4的比例,事实也是如此。在对子囊进行镜检时发现孢子中lys+和lys-有六种排列方式,即我们教材p80表3-7所示的六种排列方式。现在是104页\一共有194页\编辑于星期日粗糙脉孢菌+X-杂交子代子囊类型(1)(2)(3)(4)(5)(6)子囊类型++----+++-+--+-++--+-++-子囊型105129951016分裂类型M1M1M2M2M2M2未交换型交换型现在是105页\一共有194页\编辑于星期日着丝点距离与着丝点作图将着丝点当作一个基因位点看待,计算基因位点与着丝点间的交换值,估计基因与着丝点间的遗传距离,称为着丝点距离。每个交换型子囊中,基因位点与着丝粒间发生一次交换,其中半数孢子是重组型(重组型配子)。因此,交换值(重组率RF)的计算公式为:MⅡ×1/2RF=×100%
MⅠ+MⅡRF0-lys=(9+5+10+16)×1/2/(105+129+9+5+10+16)×100%=7.3%即着丝粒与lys间的距离为7.3c M。现在是106页\一共有194页\编辑于星期日着丝粒距离=如:将两种菌株进行杂交lys+×lys-,得如下结果子囊类型子囊数分裂类型(1)(2)(3)(4)(5)(6)++--++--+-+--+-++--+-++-105129951016MIMIMIIMIIMIIMII非交换型交换型现在是107页\一共有194页\编辑于星期日现在是108页\一共有194页\编辑于星期日Lys基因与着丝粒之间的距离是7.3cM。现在是109页\一共有194页\编辑于星期日(4)交换型与非交换型现在是110页\一共有194页\编辑于星期日六种子囊孢子排列方式现在是111页\一共有194页\编辑于星期日六种子囊孢子排列方式现在是112页\一共有194页\编辑于星期日第一次分裂分离与第二次分裂分离(1-2)两种排列方式:野生型lys+和突变型lys-在M1彼此分离,称第一次分裂分离(firstdivisionsegregation)。着丝粒和lys基因位点间不发生非姊妹染色单体交换,因此这两种子囊类型就是非交换型子囊。现在是113页\一共有194页\编辑于星期日(3-6)四种排列方式:第一分裂产物中野生型与突变型未发生分离,野生型和突变型M2发生分离,称第二次分裂分离(seconddivisionsegregation)。着丝粒与基因位点间发生非姊妹染色单体交换,因此这四种子囊均为交换型子囊。现在是114页\一共有194页\编辑于星期日非交换型、交换型子囊的形成现在是115页\一共有194页\编辑于星期日四、两个连锁基因的作图现在是116页\一共有194页\编辑于星期日亲二型(PD)、非亲二型(NPD)、四型(T)
PD:四个孢子中只有两种基因型,且分别与两亲本相同,基因间没有重组。
NPD:四个孢子中只有两种基因型,且分别与两亲本不同,是由基因重组产生的。T:四个孢子中只有四种基因型,两种分别与两亲本相同(没有重组),另两种分别与两亲本不同(重组)。现在是117页\一共有194页\编辑于星期日现在是118页\一共有194页\编辑于星期日两对基因杂交,如不考虑孢子排列,只考虑性状组合时,子囊可以分为3种四分子类型。亲二型(parentalditype,PD),有两种基因型,并与亲代相同。包括子囊型①和⑤。非亲二型(non-parentalditype,NPD),有两种基因型都跟亲代不同,是重组型。包括子囊型②和⑥。四型(tetratype,T),有四种基因型,2种与亲代相同,2种重组型,包括子囊型③、④和⑦。下图是从染色体交换和重组来理解各类子囊的形成原因。现在是119页\一共有194页\编辑于星期日交换类型染色体图象重组四分子类型子囊型无交换四线双交换单交换0%100%50%+an++an++an++a,+a,n+,n+(PD)++,++,na,na(NPD)+++,+a,n+,na(T)①②③现在是120页\一共有194页\编辑于星期日交换类型染色体图象重组四分子类型子囊型二线双交换单交换四线多交换50%0%100%+an++a,na,++,n+(T)+a,n+,+a,n+(PD)++,na,++,na(NPD)④⑤⑥+an++an+现在是121页\一共有194页\编辑于星期日Neurosporacrassa杂交结果51905901808实得子囊数TNPDPDTTNPDPD四分子类别分离发生时期四分子基因型次序⑦⑥⑤④③②①子囊型+a+an+n+++++nana+++an+na+ana++n++an++an+++na++na++na+an+MIMIMIMIMIMIIMIIMIMIIMIIMIIMIIMIIMII现在是122页\一共有194页\编辑于星期日+an+++,na,+a,n+(T)⑦50%三线双交换资料分析:计算nic与着丝粒之间的重组率:现在是123页\一共有194页\编辑于星期日2.计算ade与着丝粒之间的重组率:3.判断nic、ade基因是独立分配还是连锁。如果两个基因是自由组合的话,则PD︰NPD=1︰1而实验结果PD=808+90=898,NPD=1+1=2,PD远远大于NPD。说明这两个基因是相互连锁的。现在是124页\一共有194页\编辑于星期日5.059.30nicadenicade5.059.30哪一种排列正确呢?现在是125页\一共有194页\编辑于星期日如果我们把资料用另一种方式排列,得下表:按照分离时期排列nic/++/ade子囊数MIMIMIIMIIMIMIIMIMII(808+1)809(90)90(5)5(90+5+1)961000RF(·-nic)=5.05%RF(·-ade)=9.30%现在是126页\一共有194页\编辑于星期日若n和a各自独立的与着丝粒发生交换的话,则MII的子囊数应为9.30%︰5.05%≈1.84︰1事实上:交换发生在着丝粒与ade间,n是MI,a是MII的子囊有90个。交换发生在着丝粒与n间,n是MII
,a是MI的子囊只有5个。比例相差悬殊,所以这两个基因处在着丝粒的同一侧。另从上表可见,在n与着丝粒发生交换时,a基因也一道与着丝粒发生了交换。即n是MII
,a也是MII共计96(=90+1+5)个子囊。同一交换使+/n出现MII型分离,也使+/a出现MII型分离,101次中有96次,证明n,a在着丝粒的同一侧。现在是127页\一共有194页\编辑于星期日着丝粒nicade5.055.210.25+an++ana
++
n+现在是128页\一共有194页\编辑于星期日被低估的重组值从下表的分析可以将·-a间的重组值得到校正子囊型每一子囊被计算为重组子的染色单体数子囊数在所有子囊中被计算为重组子的染色单体数
·-nn-a·-a
·-nn-a·-a234567040022220202242222190590150400180180101001800180242101010总数202208372现在是129页\一共有194页\编辑于星期日被低估的重组值现在是130页\一共有194页\编辑于星期日两连锁基因的作图(二)
1杂交实验
Pn+X+a
(n)(n)+n+a(2n)
减数分裂
36种不同组合
7种不同类型子囊型现在是131页\一共有194页\编辑于星期日
粗糙脉孢菌n+x+a杂交结果子囊型(1)(2)(3)(4)(5)(6)(7)四分子基因型顺序+a+an+n+++++nana+++an+na+ana++n++an++an+++na++na++na+an+分离发生时期M1M1M1M1M1M2M2M1M2M2M2M2M2M2四分子类型PDNPDTTPDNPDT实得子囊数80819059015现在是132页\一共有194页\编辑于星期日2计算着丝粒距离
nic--.=M2/(M1+M2)X1/2X100%=(5+90+1+5)/1000X100%X1/2=5.05%ade--.=M2/(M1+M2)X1/2X100%=(90+90+1+5)/1000X1/2X100%=9.30%两基因可能的位置关系:三种:自由组合连锁:着丝粒两侧着丝粒同侧现在是133页\一共有194页\编辑于星期日例:n+x+a杂交n:烟酸依赖型,a:腺嘌呤依赖型现在是134页\一共有194页\编辑于星期日
M25+90+1+5——n=x½==5.05M1+M21000x2
M190+90+1+5——a=x½==9.3M1+M21000x2
NPD+1/2T(1+1)+1/2(90+5+5)a——b===5.2NPD+PD+T1000现在是135页\一共有194页\编辑于星期日5.05N5.2A9.3?校正:——a的重组应为子囊型2、4、7分别有两次交换,子囊型6有三次,子囊型3、5各一次。但在计算时,只计算了子囊型3、5、6、7各一次。因此校正因子为:
2x1+2x5+2x1+519==0.951000x22000
9.30+0.95=5.05+5.2=10.25现在是136页\一共有194页\编辑于星期日现在是137页\一共有194页\编辑于星期日3分型与连锁关系的判断亲二型(PD):P82非亲二型(NPD):四型(T):连锁判断:自由组合连锁结果
NPD/PD=1NPD/PD‹12/898
结果表明:nic与ade连锁
现在是138页\一共有194页\编辑于星期日4两个连锁基因位置的判断(同臂或不同臂)(1)利用连锁基因都处于MII时,PD和NPD四分子类型频率判断现在是139页\一共有194页\编辑于星期日(2)比较n和a分别为MI和MII时的子囊数进行判断+/n+/aM1M1809M1M290M2M15M2M296如果两基各在一侧:M2(a)/M2(n)≈2
实验结果:M1M2/M2M1=90/5=18(倍)与实验不符,说明两基因在同侧。5作图:
nicade
05.0510.25现在是140页\一共有194页\编辑于星期日子囊型
每一子囊被计算为重组子的染色单体数
.—nn—a.—a子囊型在所有子囊中被计算为重组子的染色单体数
.—nn—a.—a234567040022220202242222190590150400180180101001800180242101010总数202208372202+208-372=3838/4000=0.95%9.3+0.95=10.25现在是141页\一共有194页\编辑于星期日两个连锁基因的作图(三)粗糙链孢酶有两个突变型:烟酸依赖型(nic)----需在培养基中添加烟酸才能生长腺嘌呤依赖型(ade)---需在培养基中添加腺嘌呤才能生长
nic+×+ade,必有6×6=36种不同的子囊型,但若把着丝粒在减数分裂中的随机趋向造成的不同归为一类,可归纳为7种基本子囊型(见P82表3-8)如只考虑性状组合,不考虑孢子排列顺序,还可把子囊分为3种类型:现在是142页\一共有194页\编辑于星期日子囊型①②③④⑤⑥⑦四分子基因型次序+ade+adenic+nic+++++nicadenicade+++adenic+nicade+adenicade++nic++adenic++adenic+++nicade++nicade++nicade+adenic+分离发生的时期MⅠMⅠMⅠMⅠMⅠMⅡMⅡMⅠMⅡMⅡMⅡMⅡMⅡMⅡ
四分子类别PDNPDTTPDNPDT实得子囊数808190590151、亲二型(parentalditypePD),2种基因型,都为亲型,包括①和②2、非亲二型(non-parentalditype,NPD):2种基因型,都为重组型,包括②和⑥。3、四型(tetratype,T):4种基因型,2亲本2重组,包括③、④和⑦现在是143页\一共有194页\编辑于星期日1、判断nic和ade是独立分配还是连锁:
若独立分配,则PD:NPD=1或≈1
若连锁,则PD:NPD﹥1
实际上:PD:NPD﹥﹥1,所以两基因连锁。2、计算着丝粒和两基因间的RF:
RF(0-nic)=(MⅡ×1/2)/(MⅠ+MⅡ)×100%=1/2×(5+90+1+5)/1000×100%=5.05%;图距=5.05cMRF(0-ade)=(MⅡ×1/2)/(MⅠ+MⅡ)×100%=1/2×(90+90+1+5)/1000×100%=9.3%;图距=9.3cM根据RF值可知两基因在染色体上有两种可能排列方式:
nicadenicade
5.059.35.059.3
现在是144页\一共有194页\编辑于星期日3、判定两基因在染色体的同臂还是异臂上:估算两基因的RF值:
RF(nic-ade)=重组型/(亲本型+重组型)×100%=(1/2T+NPD)/(T+PD+NPD)×100%=1/2(90+5+5)+(1+1)/1000×100%=5.2%,图距=5.2cM0nicade
5.055.210.25现在是145页\一共有194页\编辑于星期日利用两连锁都处在MⅡ时的PD和NPD四分子类型出现的频率来判断它们处在同臂还是异臂上:
类型同一染色体上标记基因交换产物在异臂上在同臂上PDMⅡMⅡ+an
+两线双交换+an
+单交换+an
++an
+MⅡMⅡNPD+an
++an
+
++na
++na现在是146页\一共有194页\编辑于星期日若两连锁基因在异臂上,则PD与NPD都由双交换形成且机会相等,所以PD=NPD。但事实上PD≠NPD故此情况不可能∴nic和ade在同臂上已知RF(0-nic)+RF(nic-ade)=5.05%+5.2%RF(0-ade)=9.3%
即RF(0-nic)+RF(nic-ade)≠RF(0-ade)原因:着丝粒和ade间发生过双交换,但在计算RF(0-ade)时却没有计算在内,而在计算RF(0-nic)和RF(nic-ade)时都各计算一次。现在是147页\一共有194页\编辑于星期日校正着丝粒与ade间的重组值子囊型每一子囊被计算为重组子的染色单体数子囊数在所有子囊中被计算为重组子的染色单体数o-nn-ao-ao-nn-ao-a234567总数
040022220202242222
190590150400180180101001800180242101010202208372现在是148页\一共有194页\编辑于星期日由上表可以看出202+208≠372,低估的重组值=(202+208-372)/4000×100%=0.95%RF(0-nic)+RF(nic-ade)=RF(0-ade)+0.95%=9.3%+0.95%=10.25%现在是149页\一共有194页\编辑于星期日五、非顺序四分子的遗传分析现在是150页\一共有194页\编辑于星期日非顺序四分子的遗传分析AB×ab杂交时,无论有无连锁,只产生3种可能的无序四分子。ABABababaBaBAbAbabaBAbABPDNPDT现在是151页\一共有194页\编辑于星期日RF=0.5A,B基因不连锁RF<0.5A,B基因连锁现在是152页\一共有194页\编辑于星期日非顺序四分子遗传分析
子囊:PDNPDTABaBabABaBaBabAbAbabAbABRF(重组值)=1/2T+NPD/总子囊数X100%
重组值可能被低估,可用PD、NPD、T三种子囊的频率推导出两基因间平均每个减数分裂的交换数(m);
m=SCO+2DCO交换值(X)=1/2m;
m=T+6NPD交换值(X)=(T+6NPD)X50%
现在是153页\一共有194页\编辑于星期日3种无序四分子的形成
abPDABNCO
abTABSCO
abTABDCO
abNPDABDCO现在是154页\一共有194页\编辑于星期日如果假设双交换在四条染色单体间随机发生:
DCO(4线双交换)=4NPD如果假设双交换在三条染色单体间随机发生:
DCO(3线双交换)=4T=2NPDT=SCO(单交换)+DCO(3线双交换)
SCO=T-DCO(3线双交换)=T–2NPDm=SCO+DCO=(T-2NPD)+2(4NPD)
=T+6NPD例如:PD=0.56;NPD=0.03;T=0.41
交换值=1/2m=(T+6NPD)X50%
图距=50(T+6NPD)=50(0.41+6X0.03)=29.5现在是155页\一共有194页\编辑于星期日第四节人类染色体的基因定位
现在是156页\一共有194页\编辑于星期日一、人类基因定位方法现在是157页\一共有194页\编辑于星期日(一)家系分析法与基因定位家系分析法(pedigreemethod):通过分析、统计家系中有关性状的连锁情况和重组率而进行基因定位的方法。
1伴Y遗传——家系中的某一性状只出现在男性中;
2X连锁遗传原理:根据伴性遗传特点
现在是158页\一共有194页\编辑于星期日3外祖父法
(1)前提条件:两个连锁基因位于X染色体上的;母亲是两对基因的杂合体;如:红绿色盲基因a;蚕豆病(G6PD-)基因:g
(2)外祖父法定位原理
外祖父母亲(双杂合体)儿子
AG/YAG/agAG/Yag/YAg/YaG/YaG/YaG/AgaG/YAg/YAG/Yag/YAg/YAg/aGAg/YaG/YAG/Yag/Y
亲组合重组合统计结果,计算交换值。现在是159页\一共有194页\编辑于星期日家系分析法家系的连锁分析首先要从群体中选择适合的家系,要求被挑选家系中双亲之一或两个为双杂合体,并且注意双杂合体家系要随机抽样,避免产生偏倚。现在是160页\一共有194页\编辑于星期日同时必须剔除下列几种家系:(1)双亲性状不能在子代中得到分离的,如GgTt╳GGTT;(2)家庭中仅有一个子代的;(3)亲本之一的基因型不明或死亡的。现在是161页\一共有194页\编辑于星期日三代的系谱在三代系谱中较容易确定子代是否发生基因重组,可直接计算重组值。例:如图,设黑色表示患一种显性的肌强直功能不全(mytonicdystrophy);性状标志为唾液分泌类型,由Se和se一对等位基因所控制,Se为显性基因。现在是162页\一共有194页\编辑于星期日图肌强直功能不全和唾液分泌类型发生分离的家庭现在是163页\一共有194页\编辑于星期日I-1个体患有肌强直功能不全症并伴有唾液分泌型的特性;I-2不患此病并为非分泌型。其生育的女儿(II-1)也为肌强直功能不全症并伴有唾液分泌型,所以她(II-1)的疾病和分泌型性状的两个基因来自父亲,说明疾病基因和Se基因在一条染色体上,她的基因型为GSe/gse,为相引相的双杂合体。第三代的性状开始分离,有的为分泌型伴疾病,有的不伴病。现在是164页\一共有194页\编辑于星期日在第三代六个子代中,III-1个体为健康者并为分泌型,说明原来疾病基因和Se基因连锁的染色体与其同源染色体间发生了交换,因此该个体为重组体。III-2~III-6均为非重组体。因此重组率为:1/6。现在是165页\一共有194页\编辑于星期日以人类X连锁的色盲基因(a)和蚕豆病基因(G6PD)(g)为例说明外祖父法。⑴若X染色体没有重组交换,则不论母亲是顺式还是反式杂合体,其儿子中的X染色体只有两种类型。AGagAGag母亲儿子或AgaGAgaG正常色盲、蚕豆病蚕豆病色盲现在是166页\一共有194页\编辑于星期日⑵若母亲X染色体的两个基因间发生了交换:外祖父AG母亲(双重杂合子)AGag儿子AGagAgaG(互引相)正常色盲、蚕豆病蚕豆病色盲aGaGAgaGAgagAGAgAgaGAgaGAGag(互斥相)(互斥相)色盲色盲正常正常蚕豆病蚕豆病色盲、蚕豆病色盲、蚕豆病现在是167页\一共有194页\编辑于星期日根据外祖父的表型确定作为母亲的双重杂合体的连锁相(反式或顺式),然后判断其儿子中的各种表型中哪种属于重组型,统计其重组体多占的比例,就可计算两个基因间的重组率。RF(a-g)=5%=5cM家系分析法在原则上也可用于常染色体上的基因定位。现在是168页\一共有194页\编辑于星期日(二)体细胞杂交定位法1克隆分布板法
1)人鼠细胞融合培养
2)杂种细胞筛选
3)各种杂种细胞系
4)生化分析和细胞学观察
5)观察,比较分析、定位现在是169页\一共有194页\编辑于星期日体细胞是生物体除生殖细胞外的所有细胞。细胞杂交又称细胞融合(cellfusion),是将来源不同的两种细胞融合成一个新细胞。大多数体细胞杂交是用人的细胞与小鼠、大鼠或仓鼠的体细胞进行杂交。这种新产生的融合细胞称为杂种细胞(hybridcell),含有双亲不同的染色体。现在是170页\一共有194页\编辑于星期日杂种细胞有一个重要的特点是在其繁殖传代过程中出现保留啮齿类一方染色体而人类染色体则逐渐丢失,最后只剩一条或几条,其原因至今不明。这种仅保留少数甚至一条人染色体的杂种细胞正是进行基因连锁分析和基因定位的有用材料。现在是171页\一共有194页\编辑于星期日由于人和鼠类细胞都有各自不同的生化和免疫学特征,Miller等运用体细胞杂交并结合杂种细胞的特征,证明杂种细胞的存活需要胸苷激酶(TK)。但凡含有人第17号染色体的杂种细胞都因有TK活性而存活,反之则死亡。从而推断TK基因定位于第17号染色体上(表6.6)。这是首例用细胞杂交法进行的基因定位。由此可见,研究基因定位时,由于有杂种细胞这一工具,只需要集中精力于某一条染色体上,就可找到某一基因座位。现在是172页\一共有194页\编辑于星期日现在是173页\一共有194页\编辑于星期日现在是174页\一共有194页\编辑于星期日
杂种细胞系的染色体和TK活性
细胞系 人类染色体TK活性 (1) 5,9,12,21 - (2) 3,4,17,21 + (3)5,6,14,17,22 + (4) 3,4,9,18,22 - (5) 1,2,6,7,20 - (6) 1,9,17,18,20 + 现在是175页\一共有194页\编辑于星期日保留的人体染色体号数12345678杂种细胞克隆ABC++++----++--++--+-+-+-+-克隆分布法基因定位2利用染色体异常进行基因定位(1)基因剂量效应法:(2)染色体缺失定位法—采用染色体分带技术人类染色体的标准带型:臂、区、带、亚带。现在是176页\一共有194页\编辑于星期日53—1233441现在是177页\一共有194页\编辑于星期日(三)、利用染色体异常进行基因定位(1)基因剂量效应法:(2)染色体缺失定位法—采用染色体分带技术人类染色体的标准带型:臂、区、带、亚带。现在是178页\一共有194页\编辑于星期日(四)DNA介导的基因定位1克隆基因定位法
原理:采用已克隆基因的cDNA作探针,与杂种细胞中人染色体DNA进行分子杂交。
保留的人体染色体号数12345678杂种细胞克隆ABC++++----++--++--+-+-+-+-现在是17
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