从流行病学看微生物检测

各级传染病实验室的作用和职责临床实验室检测病例样本，报告有公共卫生意义的检测结果，并向公共卫生实验室报送样本/阳性菌(毒)株有条件者可以申请成为省级和国家级参比实验室，承担参比和专门化检测、应急、综合数据管理等职能鼓励医生一旦发现具有潜在公共卫生意义的异常临床现象或疾病的聚集性病例,立即向疾控机构报告,采集并提交标本,进行实验室检测。

第一页，共41页。各级微生物实验室的职责国家级公共卫生实验室国家级参比实验室专业化检测高危险性疾病检测新出现疑难的病原体为省级实验室提供参比服务负责全国的综合数据管理、政策开发、应急、公共卫生相关研究等工作。第二页，共41页。省级公共卫生实验室省级参比实验室专业化检测高危险性疾病检测新出现的病原体为各级各类实验室提供参比服务协调综合数据管理和卫生应急检测第三页，共41页。地市和县级公共卫生实验室

低发病率疾病的检测监测常见疾病病原学变化辖区内卫生应急检测第四页，共41页。其他检测实验室大学、研究机构和独立实验室临床实验室的补充提供疾病病原学检测服务报告有公共卫生意义的检测结果，并将样本/阳性菌(毒)株报送当地公共卫生实验室第五页，共41页。实验室诊断发展方向改善实验室诊断服务的可及性，加强以实验室检测为基础的传染病监测，提高传染病实验室诊断率加强对临床医生的培训，增强实验室检测在传染病诊疗决策中的作用支持有公共卫生意义的实验室检测项目的开展，不额外增加患者和医疗机构的负担第六页，共41页。实验室诊断发展方向（2）根据传染病监测和防控需求，扩大基于实验室检测的传染病病种。法定传染病报告症候群监测哨点监测基于人群或医疗机构的主动监测第七页，共41页。实验室诊断发展方向（3）建设和完善实验室质量管理体系推动传染病实验室资质认证/认可工作，发展传染病诊断分级参比实验室建立实验室信息及时报告、分析和反馈的机制，优化传染病实验室监测信息的利用。第八页，共41页。实验室诊断发展方向（4）发展独立于各医院的商业化或非商业化临床实验室建立和完善配套的临床标本的快捷安全运送服务体系。疾控部门需要将实验室诊断结果及时向医疗机构反馈加强宣传和教育,建立通畅的信息交流平台,帮助临床医生便捷地获取相关信息第九页，共41页。实验室诊断发展方向（4）疾控部门也需要将实验室诊断结果及时向医疗机构反馈加强宣传和教育,建立通畅的信息交流平台,帮助临床医生便捷地获取相关信息第十页，共41页。流行病学和实验室检测的关系第十一页，共41页。暴发调查的步骤调查前的准备证实暴发存在核实诊断制定病例定义、病例搜索、个案访谈、环境卫生学调查描述三间分布特征形成假设验证假设重新调查并再次验证假设实施控制措施调查结果进行交流和反馈Time第十二页，共41页。（一）调查前准备采样器材现场快速检测采样个人防护物资第十三页，共41页。1.采样器材疾病临床诊断是否明确？疾病暴发流行病学病因是否明确？首次现场？采样器材的准备实际上可能决定了后续的样品采集和检测方案第十四页，共41页。案例临床表现：18例病例中，体温最高39.7℃，最低37.9℃，多为中等热，占72.2%（13/18）。发热持续时间最短1天，最长4天，以2~3天多见，占72.2%（13/18）。其他临床表现主要为精神反应欠佳、呕吐/吐奶、气促。个别病例有腹胀、发绀（各2例）、流涕、咳嗽、寒战、呼吸困难和吸吮困难（各1例）。第十五页，共41页。第十六页，共41页。第十七页，共41页。2.快速实验室诊断快速实验室诊断在暴发疫情诊断中的作用？快速诊断方法发展：胶体金法、干化学测定、免疫层析测定、生物传感器、生物芯片和一些综合了免疫荧光、微激光、微校准和集成芯片技术为一体的技术快速诊断试剂发展：除开各种传染病外，尚有粪便隐血（FOB）、C反应蛋白、反恐系列（炭疽杆菌、A型肉毒杆菌、肺鼠疫、类鼻疽菌、鼻疽菌、等）第十八页，共41页。3.防护用品准备正确有效防护的重要性避免过度防护防护用品的选择第十九页，共41页。二.样品采集采什么样什么时间采采集时的条件怎么采采多少怎么样保存运送第二十页，共41页。二.样品采集初期一般为不明原因事件，样品种类和数量宜多（现场是不可以复制的，并非要对所有的样品都进行检验）同一种疾病在不同病程阶段有着不同的样品采集样品的保存条件至关重要——雨花区H5N6病例确定第二十一页，共41页。二.样品采集所有标本在采集时立即分装，一式N份(不同检验项目、重复实验、其它实验室复核、留样)第二十二页，共41页。（三）检验项目确定实验项目要结合现场流行病学调查.临床.血检.电生理.影像学检查等结果。临床常规对确定病原学检验项目有着重要的意义第二十三页，共41页。粪便异常性状及可能原因1粪便性状可能机制常见原因球状硬块便粪便在肠内停留过久，水分吸收过多便秘患者、老年人、经产妇排便无力者和儿童巨结肠症粘液便

肠道受刺激、炎症或过敏反应各种肠炎、细菌性痢疾、阿米巴痢疾和急性血吸虫病等鲜血便下消化道出血肛裂、痔疮、直肠息肉、直肠癌及结肠癌等脓便及脓血便炎症，寄生虫感染恶性肿瘤细菌性痢疾、阿米巴痢疾、溃疡性结肠炎、局限性肠炎、肠结核、结肠癌或直肠癌和急性血吸虫病柏油样便上消化道出血消化道溃疡等第二十四页，共41页。检测项目为沙门氏菌、志贺氏菌、金黄色葡萄球菌、致泻性大肠埃希氏菌、第二十五页，共41页。第二十六页，共41页。第二十七页，共41页。粪便异常性状及可能原因2粪便性状可能机制常见原因稀糊状样便肠蠕动亢进或分泌物增多所致各种因素引起的感染性或非感染性腹泻米泔样便霍乱弧菌外毒素刺激所致分泌性腹泻霍乱、副霍乱患者白陶土样便胆道梗阻时，分泌到肠道的胆汁减少或缺如阻塞性黄疸胨状便肠易激综合征腹部绞痛后排出乳凝块状便脂肪或酪蛋白消化不全婴儿消化不良和腹泻条状便直肠狭窄直肠癌第二十八页，共41页。第二十九页，共41页。第三十页，共41页。第三十一页，共41页。10月10日，*卫生院对前来就诊的学生采集血液标本5份，进行血常规检测，各项指标未见异常；采集两份粪便标本进行常规检测，未检出异常第三十二页，共41页。第三十三页，共41页。三、实验室结果判读第三十四页，共41页。

4起食物中毒事件的临床表现腹泻：82%腹痛：52%发热：41%呕吐：20%恶心：17%腹泻：82%腹痛：75%发热：62%呕吐：23%恶心：15%沙门氏菌志贺氏菌腹泻100%腹痛93%恶心72%呕吐44%血便28%发热26%副溶血弧菌腹泻98%腹痛88%里急后重47%恶心26%腹胀12%呕吐4.5%发热3.5%产气荚膜梭菌第三十五页，共41页。流行病学——实验室

配合合作第三十六页，共41页。流行病学——实验室样本采集方案与检测人员沟通，便于以后实验室分析处理。共同商定分析方案：现场工作人员或临床医务工作者要和实验室人员多沟通，对现场情况、所收集样本的情况、现场工作的方向等进行讨论，确定检验的方向以及是否需要定量，据此制定分析工作方案共同讨论对结果进行分析解释第三十七页，共41页。提高实验室诊断率采样（流行病-实验室）检验（实验室）报告（流行病-实验室）第三十八页，共41页。常规分离鉴定染色液培养基检测试剂条、试剂盒阴性、阳性、试剂对照实验室管理和质量控制第三十九页，共41页。1湖南省HFMD疫情概况试剂比对实验HFMD实验室质量控制市售的试剂盒同一厂家不同批号产品质量之间存在有差异；不同的厂家产品质量之间存在有差异；检测的标本是临床标本可能会对试验结果有影响；实验室人员流动性大，技术人员不稳定，上报结果出错。实验过程中对于临界值的标本判断有差异及实验过程中的污染问题。

标本编号地市上送结果省CDC复核结果

A试剂B试剂C试剂D试剂E试剂1CA16CA16CA16CA16CA16CA162CA16CA16CA16EVCA16CA163CA16CA16CA16EVCA16CA164EV71EV71EV71EV71EV71EV715EVEVEVEVEVEV6CA16CA16CA16CA16CA16CA167EV71EV71EV71EV71EV71EV718EVEVEVEVEVEV9EVEVEVEVEVEV10EVEVEVEVEVEV11EV—————12EVCA16CA16EVCA16CA1613EVEVEVEVEVEV14EVEVEVEVEVEV15CA16CA16CA16CA16CA16CA1616CA16CA16CA16CA16CA16CA1617EV71EV71EV71EV71EV71EV7118EV71EV71—EV71—EV7119EVEVEVEVEVEV20EVEVEVEVEVEV第四十页，共41页。实验室检测实验室检测人员准备