数量遗传学基础精品ppt课件

2023/3/11第一节数量性状的遗传特征2023/3/12动物性状的分类质量性状：可心明确区分为若干类。如毛色，角的有无数量性状：变异是连续的，无法用形容词描述，只能通过度量。如产奶量，生长速度，体重，羊毛的粗细等。多基因：限制某个数量性状一组基因的一个基因。多基因性状：由很多基因相互作用限制的性状，其表型变异为连续数量。2023/3/13Shull(1908)玉米：纯系的变异比远交群小得多。利用今日的遗传学说明：一般玉米的基因型很困难，自交可以产生纯合基因型个体，因此，近交系的变异很低2023/3/14Nilsson-Ehle(1909)探讨谷类作物F2多数性状符合3:1个别64:1，AaBbCc,(1/2)6=1/64结论：有性繁殖可以产生大量的基因型。10个座位可以产生31060,000种基因型新的类型不是新的突变，而是由于稀有基因分别造成的（返祖）。2023/3/15Johannsen和PayneJohannsen(1903,1909)，纯系的变异不行遗传环境因素可引起数量性状的变异提出基因型和表型的概念Payne(1918)：果蝇刚毛数可以超过基础群最极端的表型很多动物和植物也有这样的现象选择可以使有利等位基因频率提高2023/3/16数量性状的多基因假说假定数量性状是由很多（effectivelyinfinite）效应无限小（infinitesimalsmall）的基因（多基因multiplegenesorpolygenes）限制，这些基因每个在不同的染色体上，每个基因产生一个单独的作用。2023/3/17数量性状表型值的剖分P=G+E，E=0P=A+D+I+ER=D+I+E，P=A+R2023/3/18其次节通径分析PathAnalysisWright(1921)2023/3/19通径分析利用两者之间的缘由，分析两种变量相互关系的方法。起初只是应用于分析影响小型哺乳动物骨骼变异的一般因素和特定生长因子。后来推广到很多方面：遗传学，农业经济学，生理学，生态学等。动物育种主要用来估计相关程度和计算近交系数。目的：变量之间相互因果关系确定下来后，就可以估计引起方差协方差来源（缘由）的相对大小。2023/3/110概念两个变量间的关系:因果关系:单箭头线，方向由因到果，称为通径线平行关系:双箭头线，称为相关线每条线的相对重要性称为系数通径线的系数称为通径系数相关线的系数称为相关系数2023/3/111概念猪的屠宰体重（Y），由一长速度（X1）和4月龄体重（X2）确定，而它们又是由饲养条件（X3）确定。右图省略X32023/3/112概念通径系数就是标准化的回来系数，多数状况下，为标准化的偏回来系数。通径系数下标中依变量在前，自变量在后，二者用点分开。留意通径系数没有单位。只有两个变量时，通径系数等于相关系数。2023/3/113通径系数的性质（一）性质一（独立缘由）dy.x1+dy.x2=1Py.x1=ry.x1,Py.x2=ry.x2假如缘由不完全，则确定系数之和小于１2023/3/114通径系数的性质（一）第13张幻灯片2023/3/115通径系数的性质（一）2023/3/116通径系数的性质（一）依据方差剖分原理：2023/3/117通径系数的性质（二）性质二（间接缘由）Py.X3=Py.x1Px1.x3,Py.x4=Py.x1Px1.x4dy.x1=dy.x3+dy.x42023/3/118通径系数的性质（二）由性质1（II）:2023/3/119通径系数的性质（三）2023/3/120通径系数的性质（三）共同缘由ry1y2=P2P2（左）ry1y2=rx2x3P2P3（中）ry1y2=P2P2+P3P3（右）2023/3/121通径系数的性质（四）ryx1=P1+r12P2+r13P3dy.x1+dy.x2+dy.x3=12023/3/122通径系数的性质（五）ry1y2=P2

P2+P3

P3+P2

r23

P3+P3

r23

P22023/3/123三、通径链的追溯规则通径方向，只能“先退后进”一条通径链最多只能变更一次方向通过一条相关线等于一次方向变更邻近通径必需以尾端与相关线相接一条通径链内至多只能有一条相关线不同的通径链可以重复通过同一条相关线在追溯两个结果的通径链时要避开重复和遗漏。2023/3/124第三节重复力2023/3/125概念重复力指的是家畜个体由一性状多次度量值之间相关程度的度量。时间上：猪产仔数，奶牛的产奶量，绵羊的产毛量，蛋鸡的产蛋数。空间上：果蝇翅长，作物种子的蛋白质含量。2023/3/126概念度量次数一般不只2次，因此可以用组内相关系数来度量。个体间变异越大，个体内变异越小，说明重复力越高2023/3/127概念一般环境方差：指的是时间上许久的或者空间上非局部的条件所造成的环境方差，它是个体方差的一部分。母畜泌乳量的凹凸对仔畜生长的影响特殊环境方差：短暂的或者局部条件所造成的环境方差，也就是个体内度量间的方差。某一年草地的好坏对羊毛生长的影响VE=VEg+VEs,VB=VG+VEg,VW=VEs2023/3/128重复力的估计方法以个体分组，以个体的各次度量值为组内视察值，接受单因素方差分析法，所得的组内相关系数即是重复力。2023/3/129例题母猪号胎次Kxx21234567891011621211211618857412062252101517132021231716201017230984584111431111915774874372066212722412617123192123192091402570241081112131314181881071511240241618191917196199137236543649521815365266851981319201481313710015282408715161416111720239139232124415181517241715211786111732983358151420151216218961013620682226121919182411151581332337合计101144923601小梅山母猪产仔数记录2023/3/130例题2023/3/131例题2023/3/132例题变异来源自由度平方和均方期望均方母猪间12621.663351.8053母猪内882191.208024.9001总和1012812.7813小梅山母猪产仔数方差分析表2023/3/133例题2023/3/134重复力的用途推断遗传力估计是否正确重复力为遗传力的上限确定须要重复度量的次数2023/3/135重复力的用途度量n次所能达到的精确度2023/3/136重复力的用途畜禽可能生产力(MPPA)2023/3/137重复力的用途多次度量育种值的估计2023/3/138第四节遗传力2023/3/139概念广义遗传力：H2=VG/VP狭义遗传力：h2=VA/VP实现遗传力：子代平均值种畜平均值全群平均值2023/3/140概念：遗传力的几种表述遗传力是育种值对表型值的确定系数h2=dP.A=VA/VP遗传力是育种值对表型值的回来系数遗传力是育种值和表型值的相关系数2023/3/141遗传力估计的原理和方法遗传力估计的原理2023/3/142遗传力估计的原理和方法一、公畜内女母回来或相关法:2023/3/143遗传力估计的原理和方法公畜内女母回来整理资料，以女儿的成果为y，母亲的成果为x；分别计算各公畜组的SSX,SSY,SPXY；将各公畜组的平方和及乘积和分别相加，得到公畜内平方和及乘积和SSX(S)=SSX,SSY(S)=SSY,SPXY(S)=SPXY计算公畜内女母回来和遗传力bDM(S)=bYX(S)=SPXY(S)/SSX(S),h2=2bDM(S)2023/3/144遗传力估计的原理和方法二、半同胞相关组内相关系数:单因素方差分析；系统分组留意当各组半同胞数量不同时的计算2023/3/145遗传力估计的原理和方法留意当各组半同胞数量不同时的计算2023/3/146遗传力估计的原理和方法三、全同胞相关（系统分组方差分析）理论上相等，事实上不相等。当这三个估计值相差太大时，应当补充资料，重新估计2023/3/147遗传力估计的原理和方法三、全同胞相关（系统分组方差分析）2023/3/148遗传力估计的原理和方法三、全同胞相关（系统分组方差分析）2023/3/149遗传力的显著性检验当接受公畜内女母回来当接受半同胞相关2023/3/150遗传力的显著性检验当接受全同胞相关2023/3/151提高遗传力估计精确度的方法女母回来法:半同胞相关法:n＝最宜家经含量，Ｓ＝公畜数，dfS=最小公畜自由度2023/3/152第五节遗传相关2023/3/153概念表型相关：表型值间的相关环境相关：家畜在发育过程中受共同环境影响而产生的相关遗传相关：性状育种值间的相关基因的多效基因座位之间的连锁选择造成的基因座位之间的连锁不平衡2023/3/154性状间的相关及其剖分2023/3/155遗传相关估计（一）亲子协方差法2023/3/1