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文档简介
1植物分子生物学实验技术2主要内容第一部分核酸的分离制备第二部分PCR技术第三部分主要分子标记第四部分基因克隆3(美)DvekslerGSandDieffenbachCW.黄培堂俞炜源陈添弥等译现代生物技术译从PCR技术实验指南科学出版社(英)ClarkMS主编顾红雅瞿礼佳主译植物分子生物学实验手册高等教育出版社施普林格出版社郑成木主编植物分子标记原理与方法湖南科学技术出版社BrownTA.魏群等译国外优秀生命科学教材译从基因克隆和DNA分析高等教育出版社参考书目:4第一部分:核酸的分离制备abc???5第一部分:核酸的分离制备DNA提取是一切分子生物学研究最基础的技术,高质量的DNA是用于PCR和酶切分析等系列后续操作的重要保证发展了多种DNA提取方法,可从植物叶片、愈伤组织、组培苗、果实、韧皮部等多种组织器官中提取DNA;但不同植物、同种植物材料的不同来源、部位、形态以及不同化学成分、组织结构特点差异,导致DNA
提取时需要选择不同的方法或作一些特殊处理
从富含多糖、多酚、单宁、色素及其他次生代谢物质的木本植物中提取DNA的方法难度就相对大于大多数禾谷类及蔬菜类植物(1)多酚被氧化成棕褐色(2)多糖、单宁等物质与DNA会结合成粘稠的胶状物,获得的DNA常出现产量低、质量差、易降解,影响了DNA质量和纯度,不能被限制性内切酶酶切,严重的甚至不能作为模板进行PCR扩增1.DNA在分子生物学研究中的重要性62.提取DNA应满足的基本原则不同的研究对DNA的要求不一致,但一般应满足:(1)排除蛋白、糖类和脂类等物质的污染,DNA纯度应满足下游操作需要用于RFLP、AFLP应满足酶切要求用于PCR的不含PCR的干扰甚至抑制物
(2)所得DNA应当完整电泳检测得到清晰、完整、可重复、无降解的条带保证DNA一级结构的完整
(3)足够量的DNA
有的实验要求量多(标记)7(1)破坏(消化)细胞壁、释放内容物在破壁时也会剪切DNA,在完整性和产量间折衷考虑分离总DNA破壁方法液氮中快速冷冻、研磨成细粉末分离核DNA或细胞器DNA破壁方法更温和的方法、以免过早破坏内膜系统、含渗透剂的缓冲液4oC匀浆
(2)破坏细胞膜使DNA释放到提取缓冲液中通常靠SDS或CTAB去污剂来完成,保护DNA受核酸内源酶降解缓冲液通常含EDTA,可螯合大多数核酸酶所需要的辅助因子-镁离子3.基本原理8(1)植物材料的采集及前处理
尽可能使组织材料保持水分而保鲜(用湿纱布包裹,放置于密闭的冰盒等)野外远距离采集样本时,尽可能采用冷冻保存(如放置于液氮中)
不具备冷冻条件时无水CaSO4的瓶子分别保存使其迅速干燥,可将材料保存数月,返回后尽快提取DNA
对具有大量次生代谢物(如丹宁、酚类、醌类等)的植物材料,尽可能采集幼嫩组织,冷冻保存、短时间内提取DNA
植物组织化学保存法乙醇、丙二醇处理法导致DNA剧烈降解(不推荐)
样品长期保存液氮处理后贮存在-80℃冰箱或直接储放于液氮中
在与提取缓冲液接触前防止冰冻样品在空气中融化导致酚类易被氧化
实验室发苗、田间取叶片(清洗去除灰尘、泥土以及菌孢子等)
饥饿处理减少淀粉含量、遮光处理产生黄化苗4.基本步骤9(2)组织(细胞)破碎物理方法溶涨和自溶;化学方法生物酶降解液氮快速冷冻处理后研磨(推荐)或在提取缓冲液中研磨(不推荐)(3)释放DNA
释放DNA到CTAB或SDS类去污剂中、65oC保温处理(4)纯化和浓缩:去除残渣、沉淀DNA
释放出的DNA中含有大量的RNA、蛋白质、多糖、丹宁和色素等杂质需用氯仿、苯酚处理后变性、沉淀除去,RNA可用RNase除去。通常采用4oC离心的方法,产生分层,去掉植物残渣、留上清液部分沉淀通常采用异丙醇(1volume)、酒精(2volume)等(5)洗涤去掉部分色素和盐等,通常采用70%酒精和100%无水乙醇4.基本步骤10(6)DNA纯度和浓度检测
0.8%琼脂糖凝胶电泳或紫外分光光度计检测琼脂糖凝胶电泳法(常用)
DNA样品在紫外线照射下发出的红色荧光强度与DNA的含量成正比使用标准浓度的DNA样品作对照,可以估计出被测DNA的浓度紫外分光光度计检测
DNA在260nm处有一个明显的吸收峰估计浓度在A2601OD相当于双链DNA浓度50µg/mL
根据A260/A280比值估计DNA纯度纯DNA的A260/A280=1.8±0.1,RNA的比值为2.0左右。
>1.8可能有RNA未除去
<1.8可能有酚和蛋白质之类的杂质4.基本步骤11(7)DNA保存备用通常用pH8.0的TE(Tris-EDTA)缓冲液(推荐)或超纯水于4℃或-20℃(推荐)冰箱保存、避免反复冻融,1-2年一般没问题也可短时保存于100%无水乙醇中(几天)
较长期保存可放置于-70℃超低温冰箱,可保存5年以上4.基本步骤125.提取缓冲液对植物总DNA提取的影响与作用
现代分子生物学的发展导致DNA分离技术层出不穷,DNA已经可以从诸如化石、标本、木乃伊等极端材料中分离出来,也可以从痕量材料获得DNA
无论什么材料,针对不同来源和特点,调整设计相应的提取缓冲液及不同的技术方案是十分重要和必需的在实际应用中可针对不同情况对具体实验方案的各个部分进行不同组合。缓冲液的成分应根据分离对象的不同而变化,缓冲液的pH值、保护剂和表面活性剂都要根据不同样品进行优化13
表面表面活性剂:十二烷基磺酸钠(SDS):是一种阳离子强表面活性剂,通常与蛋白酶K和抗氧化剂、螯合剂一起使用十六烷基三甲基溴化铵(CTAB):是一种在高盐下能与核酸结合形成可溶、稳定的复合物,低盐浓度下可沉淀的表面活性剂酶抑制剂乙二胺四乙酸(EDTA):可用于抑制金属离子依赖性的酶(螯合Mg2+
、Ca2+)的活性牛血清白蛋白(BSA)
:可使一些降解酶的表面变性精胺及其他多胺:降低核酸酶的影响氰化物:降低重金属氧化酶的影响5.提取缓冲液对植物总DNA提取的影响与作用14保护剂还原型巯基成分:
如β-巯基乙醇、谷胱苷肽、半胱氨酸、二硫苏糖醇等一些硫醇类物质,通常可用于保护DNA免受醌类物质、二硫化物、多酚氧化酶等物质的损害抗坏血酸、维生素C:
降低醌类物质的影响活性炭、硫代硫酸钠、亚硫酸钠、重过亚硫酸钠、硼砂等:
防止多酚类物质氧化聚乙烯吡咯烷酮(PVP):
减少酚类、醌类及丹宁类物质的影响5.提取缓冲液对植物总DNA提取的影响与作用15酚类杂质
对植物中次生产物酚类物质的去除,普遍是在提取液中加入适量的抗氧化剂和螯合剂,防止多酚氧化褐变在提取DNA过程中加入巯基乙醇、半胱氨酸、二硫苏糖醇、谷胱甘肽及抗坏血酸等巯基试剂,抑制氧化反应,避免褐化在样品液氮研磨及提取缓冲液中加入高分子螯合剂PVP(聚乙烯吡咯烷酮)或PVPP(聚乙烯聚吡咯烷酮)等能络合多酚和萜类物质离心或氯仿抽提出去,有效的防止多酚物质氧化成醌类,避免溶液变褐而具有抗氧化作用在提取液中加入适量的PVP或PVPP能提高DNA的纯度,其用量视杂质的多少而定(1-6%),PVP同时能有效去除多糖。因此将PVP和巯基乙醇配合使用并调整用量,能够有效地防止多酚污染
6.DNA提取过程中杂质去除16多糖类杂质
植物组织中富含多糖,其许多理化性质与DNA很相似,因此很难将它们分开。常用方法是根据溶解性先沉淀多糖
(1)在氯仿处理后的上清液中,加2%CTAB
分离缓冲液(2)在DNA未溶出之前,先用一些缓冲液洗去多糖如100mmol/LTris-HCl,pH8.0;5mmEDTA;0.35mol/LSorbitol(山梨醇)洗几次(3)提高NaCl浓度至2.5mol/L或加NH4COOH
使终浓度为10mmol/L或0.5mLDNA液中加0.125mL4mol/LNaCl和0.625mL13%PEG8000(冰浴1h)或用水饱和乙醚,1.2-1.5mol/LNaCl
溶液将大部分多糖去除,再用2倍乙醇沉淀DNA可大大提高效率(4)高浓度KCH3COOH
有利于除去多糖
6.DNA提取过程中杂质去除17(5)DNA沉淀重悬于30%乙醇,4℃过夜先沉淀多糖,离心取上清加乙醇至80%重新沉淀DNA(6)常温25oC异丙醇过夜沉淀DNA可减少杂质污染(7)在提取缓冲液中1/2体积的氯苯,氯苯与多糖的羟基作用而去除多糖
(8)如果材料较少或要求较高,则可考虑用柱层析方法,使用对DNA具有特异性吸附的树脂来纯化DNA曾有文献提到选用WizardPurificationKit,PRC-5柱,SephacrylS-1000或S-500,QiagenGenomictip500/G,或者CsCl梯度离心纯化DNA(9)调节取样时期可减少粗提产品中多糖含量,生长幼苗暗室暗化处理,黄化叶提取DNA可有效地防止多糖污染6.DNA提取过程中杂质去除18植物色素成分去除植物色素分布:在植物中广泛存在种类:脂溶性和水溶性色素两类脂溶性色素多为四萜类衍生物不溶于水,难溶于甲醇,易溶于乙醇、乙醚和氯仿等叶绿素、叶黄素、胡萝卜素、番红花素和辣椒红素等其中胡萝卜素不溶于乙醇。水溶性色素:主要为花色甙类,又称花青素,普遍存在于花中可溶于水与乙醇,不溶于乙醚与氯仿等有机溶剂,色泽随pH改变
可以采用非可溶性PVP(polyvinylpyrrolidone)研磨样品,PVP能络合多酚类物质,不但能较彻底防止氧化作用,而且能有效的去除多糖和色素在DNA浓缩之前,再用CTAB处理1-2次;或采用乙醇等有机溶剂洗涤加入抗氧化剂,防止酚类物质褐化6.DNA提取过程中杂质去除19液氮:组织破碎、裂解细胞EDTA,Tris/HCl:缓冲体系使溶液pH不会变化太大,DNA在这一体系中呈稳定态,EDTA螯合Mg2+或Mn2+离子,抑制DNase的活性,防止DNA被DNase降解异丙醇/酒精:沉淀DNA;DNA溶于水,不溶于酒精,在用乙醇沉淀DNA时常加入单价的阳离子NaCl或NaCH3COOH,Na+中和DNA分子上的负电荷,减少DNA分子之间的同性电荷相斥力,而易于聚集沉淀
RNase:
消化RNA。PVP(polyvinylpyrrolidone,聚乙烯吡咯烷酮):抗氧化作用,络合酚类物质和萜类物质,防止酚类物质氧化而发生褐变,也可有效的去除多糖和色素,色素是PCR反应中的强抑制剂,一定要除掉7.DNA提取过程中各试剂的主要作用20β巯基乙醇和抗坏血酸钠:抗氧化剂,有效地防止酚氧化成醌,避免褐变,使酚类物质容易从基因组DNA去除蛋白酶K:是一种切割活性较广的丝氨酸蛋白酶,切割脂族和芳香族氨基酸的羧基端肽键,用于生物样品中蛋白质的一般降解。将蛋白质降解成小肽或氨基酸,使DNA分子分离出来NaCl:提供一个高盐环境,使DNA充分溶解于液相中异戊醇:(1)在抽提DNA时,为了混合均匀,必须振荡混匀数次,这时在混合液内易产生气泡,气泡会阻止相互间的充分作用。加入异戊醇能降低分子表面张力,减少泡沫产生。一般采用氯仿:异戊酵=24:1或酚:氯仿:异戊醇=25:24:1(不必先配制,可在临用前把一份酚加一份24:1的氯仿与异戊醇即成)(2)同时异戊醇有助于分相,使离心后的上层水相,中层变性蛋白相以及下层有机溶剂相维持稳定7.DNA提取过程中各试剂的主要作用21苯酚/氯仿:(1)苯酚/氯仿是非极性分子,水是极性分子,当蛋白水溶液与酚或氯仿混合时,蛋白质分子之间的水分子就被挤去,使蛋白失去水合状态而变性。经过离心,变性蛋白质的密度比水的密度为大,因而与水相分离,沉淀在水相下面,从而与溶解在水相中的DNA分开。而酚与氯仿有机溶剂比重更大,保留在最下层(2)酚是强烈的蛋白质变性剂,用苯酚处理匀浆液时,由于蛋白与DNA联结键已断,蛋白分子表面又含有很多极性基团与苯酚相似相溶。蛋白分子溶于酚相,而DNA溶于水相同时抑制了DNase的降解作用,能有效使蛋白质变性而除去,酚形成的有机相也可破坏蛋白质的胶体稳定性,从而蛋白质不会分布在水相中,避免了对核酸的污染7.DNA提取过程中各试剂的主要作用227.DNA提取过程中各试剂的主要作用(3)氯仿有强烈的脂溶性,去除脂类杂质,也有使蛋白质变性的作用(4)作为表面变性的酚与氯仿,在去除蛋白质的作用中,各有利弊酚的变性作用大,但与水相有一定程度的互溶,大约10-15%的水溶解在酚相中,损失了这部分水相中的DNA
氯仿的变性作用不如酚效果好,但氯仿与水不相混溶,不会带走DNA
(5)在抽提过程中混合使用酚与氯仿效果最好经酚第一次抽提后的水相中有残留的酚,由于酚与氯仿是互溶的,可用氯仿第二次变性蛋白质,此时一起将酚带走。也可以在第二次抽提时,将酚与氯仿混合(1:1)使用
238.常用植物总DNA提取方法及主要原理传统的DNA提取与纯化方法
CTAB和SDS法:在裂解细胞的基础上,多次苯酚氯仿等有机溶剂抽提使蛋白质变性沉淀于有机相,而核酸保留在水相,达到分离核酸的目的,加入RNA酶除去核酸中的RNA,加入异丙醇、乙醇等沉淀DNA,用70%乙醇漂洗沉淀,除去分离过程中残留的有机溶剂和盐离子,以免影响核酸溶解和抑制后续步骤的酶促反应,最后用TE溶解DNA备用DNA提取的新方法螯合树脂、特异性DNA吸附膜、离子交换纯化柱及磁珠或玻璃粉吸附等基础上形成的DNA提取新方法248.常用植物总DNA提取方法及主要原理CTAB法及主要原理CTAB----Hexadecyltrimethylammoniumbromide;Cetrimoniumbromide;CTABr;Palmityltrimethylammoniumbromide/十六烷基三甲基溴化铵分子式C19H42NBr
分子量364.10;白色或浅黄色结晶或粉末,低温时易沉淀
一种阳离子去污剂,在低离子强度时(0.1-0.5mol/LNaCl),沉淀核酸与酸性多聚糖,而蛋白质和中性多聚糖仍留在溶液里,在高离子强度时(>0.7mol/LNaCl),可与蛋白质和酸性多聚糖以外的多聚糖形成复合物,不能沉淀核酸
因此,CTAB可从大量产生黏多糖的植物以及某些革兰氏阴性菌(包括大肠杆菌的某些株)制备纯化的DNA,这种去污剂加入调节至高离子强度的细菌和细胞裂解液中(>0.7mol/LNaCl),经过连续的酚/氯仿有机溶剂抽提,去除CTAB/黏多糖/蛋白质复合体,异丙醇/无水乙醇沉淀上清即可将DNA分离出来
CTAB还有提高DNA互补链复性速率及稳定已形成的DNA双螺旋的作用
CTAB法的主要特点是应用范围较广25CTAB法
组分
用量终浓度CTAB
20g2%(W/V)1mol/LTris-HCl,pH8.0100mL0.1mol/L0.5mol/LEDTA,pH8.0200ml0.1mol/LNaCl
81.8g1.4mol/Lβ-巯基乙醇(用前加)
0.2%(V/V)2×CTAB缓冲液(1000mL)8.常用植物总DNA提取方法及主要原理26(1)2g幼嫩植物组织加液氮并迅速研磨成细粉,置入50mL离心管中缴入预热治65℃的10mL的2×CTAB缓冲液,轻摇混匀(2)65℃水浴2h,轻摇混匀(3)冷却至室温,加入等体积的氯仿-异戊醇(24:1),轻轻上下颠倒混匀直至上清液呈牛奶状(4)4000×rpm离心10min(5)取上清液,加入等体积冰冷的异丙醇沉淀,挑出DNA(6)用70%和100%乙醇各洗一次(7)将DNA溶于适量的TE(pH8.0)中,加入RNA酶(终浓度100g/L)(8)电泳检测或用紫外分光光度计检测DNA的浓度和质量CTAB法提取植物DNA步骤8.常用植物总DNA提取方法及主要原理278.常用植物总DNA提取方法及主要原理SDS法及主要原理SDS-Sodiumlaurylsulfate/十二烷基硫酸钠结构式:CH3(CH2)11OSO3Na;分子量:288.39,白色至微黄色粉末,微有特殊气味
一种阴离子去垢剂,在高温(55-65℃)时裂解细胞,使染色体离析、蛋白变性,形成SDS/蛋白质/多糖复合物,释放出核酸,提高盐(KCH3COOH或NH4CH3COOH)浓度并降低温度(冰浴),使SDS-蛋白质复合物转变为溶解度更小的钾盐形式,使蛋白质及多糖杂质沉淀更加完全,离心后除去沉淀;上清液中的DNA用酚/氯仿抽提,乙醇沉淀水相中的DNASDS法操作简单,温和,可提取到高分子量的DNA,但产物含糖类杂质较多28SDS法组分
用量终浓度SDS
20g2%(W/V)1mol/LTris-HCl,pH8.5100mL0.1mol/L0.5mol/LEDTA,pH8.0100ml0.05mol/LNaCl
5.84g0.1mol/L蛋白酶K
0.05mg/mlSDS缓冲液(1000mL)Sharpetal.(1992)TheorApplGenet.8.常用植物总DNA提取方法及主要原理29SDS法提取植物DNA步骤(1)3-5g幼嫩植物组织加液氮并迅速研磨成细粉,置入50mL离心管中缴入预热治65℃的20mL的SDS缓冲液及100μl蛋白酶K(终浓度0.05mg/ml),轻摇混匀(2)65℃水浴2h,轻摇混匀(3)冷却至室温,加入等体积的酚/氯仿,轻轻上下颠倒混匀(4)3000×rpm离心20min(5)取上清液转入到另一离心管中,加入等体积氯仿,混匀后3000×rpm离心20min(6)取上清液转入到另一离心管中,加入0.6倍体积异丙醇,轻摇混匀,静置一段时间后,挑出DNA,用70%和100%乙醇各洗一次,气干(7)将DNA溶于适量的TE(pH8.0)中,加入RNA酶(终浓度100g/L),37℃保温1-3h(8)加入等体积酚/氯仿,轻摇混匀,3000×rpm离心15min,取上清(9)加入等体积氯仿,轻摇混匀,3000×rpm离心15min,取上清(10)加入1/10体积的3MNaCH3COONa(pH5.2),混匀后加入2倍体积的95%乙醇,挑出DNA,用70%和100%乙醇各洗一次,气干(11)加入适量TE(pH8.0)溶解DNA(12)电泳检测或用紫外分光光度计检测DNA的浓度和质量8.常用植物总DNA提取方法及主要原理308.常用植物总DNA提取方法及主要原理离液盐作用变性蛋白和核酸改变水的结构、帮助核酸结合到硅胶膜上溶解多聚糖胶磁珠分离法硅膜吸附法31磁珠法主要原理通过细胞裂解液裂解细胞,游离出的核酸分子被特异吸附到含硅胶膜的磁性颗粒表面,而蛋白质等杂质不被吸附而留在溶液中
在磁场作用下使磁性颗粒与液体分开,回收磁珠-DNA混合物,再用洗脱液洗脱即可以得到纯净的DNA8.常用植物总DNA提取方法及主要原理32硅膜吸附法主要原理在离液盐的作用下,水的结构发生改变,帮助核酸结合到硅胶膜上,而在无离液盐的作用下,则将核酸进行洗脱8.常用植物总DNA提取方法及主要原理339.RNA提取RNA实验的关键是分离得到全长的RNA实验失败的主要原因是核糖核酸酶(RNA酶)的污染RNA酶广泛存在而稳定、一般反应不需要辅助因子。可耐受多种处理而不被灭活,如煮沸、高压灭菌等2.RNA的纯度和完整性又可直接影响RNA分析的结果,少量RNA酶就会引起RNA在制备与分析过程中的降解难点:一、严格控制外源性RNA酶的污染
外源性的RNA酶:操作人员的手汗、唾液等,灰尘等。外源性RNA酶可污染器械、玻璃制品、塑料制品、电泳槽等
二、最大限度地抑制内源性的RNA酶
各种组织和细胞中含有大量内源性的RNA酶RNA提取的难点341.杜绝外源酶的污染
严格戴好口罩,手套
实验涉及离心管、Tip头、移液器、电泳槽、实验台面等要彻底处理
试剂/溶液,尤其是水,必须确保RNase-Free
2.阻止内源酶的活性
选择合适的匀浆方法和裂解液
控制好样品的起始量
3.明确自己的抽提目的
任何裂解液系统在接近样品最大起始量时,抽提成功率急剧下降。
RNA抽提成功的唯一经济的标准是后续实验的一次成功,而不是得率防止RNA酶污染的措施9.RNA提取35防止RNA酶污染的措施
1.
设置RNA操作专用实验室,所有器械等应为专用2.所有玻璃器皿在使用前于180℃高温烘烤6hr或更长时间3.
塑料器皿可用0.1%DEPC水浸泡或用氯仿冲洗(注意:有机玻璃器具因可被氯仿腐蚀,故不能使用)4.
有机玻璃的电泳槽等,可先用去污剂洗涤,双蒸水冲洗,乙醇干燥,再浸泡在3%H2O2
室温10min,然后用0.1%DEPC水冲洗,晾干5.
配制的溶液应尽可能的用0.1%DEPC,在37℃处理12hr以上。然后用高压灭菌除去残留的DEPC。不能高压灭菌的试剂,应当用DEPC处理过的无菌双蒸水配制,然后经
0.22μm滤膜过滤除菌6.
操作人员戴一次性口罩、帽子、手套,实验过程中手套要勤换9.RNA提取36焦磷酸二乙酯(DEPC)一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂。通过和RNA酶的活性基团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性异硫氰酸胍目前认为是最有效的RNA酶抑制剂,在裂解组织的同时也使RNA酶失活,既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用
氧钒核糖核苷复合物由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形成过渡态类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。
RNA酶的蛋白抑制剂(RNasin)从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白。RNasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活其它SDS、尿素、硅藻土等对RNA酶也有一定抑制作用常用的RNA酶抑制剂。
9.RNA提取371.样本前处理
选择新鲜、幼嫩、生长旺盛的组织处于生长旺盛的时期收集细胞、新鲜血液,不得超过4小时液氮或加入RNase抑制剂保存,避免反复冻融,推荐使用专门的RNA样品储存液储存2.细胞裂解
异硫氰酸胍/酚-TRNzol总RNA提取试剂胍盐/β-巯基乙醇—RNAprep系列RNA提取试剂盒独特配方—RNAplant植物RNA提取试剂3.RNA的纯化及获得
纯化后不应存在对酶(如逆转录酶)有抑制作用物质排除有机溶剂和金属离子的污染蛋白质、多糖和脂类分子等的污染降低到最低程度排除DNA分子的污染10.RNA提取流程38几种RNA提取方法1.TRIzol法
TRIzol的主要成分:异硫氰酸胍和酚
异硫氰酸胍:解偶剂,一类强力的蛋白质变性剂,可溶解蛋白质,主要作用是裂解细胞,使细胞中的蛋白,核酸物质解聚得到释放
酚:有效的变性蛋白质,但是它不能完全抑制RNA酶活性
TRIzol中还加入了8-羟基喹啉、β-巯基乙醇等来抑制内源和外源RNase。
原理:TRIZOL试剂是直接从细胞或组织中提取总RNA的试剂在破碎和溶解细胞时能保持RNA的完整性。加入氯仿后离心,样品分成水相层和有机层。RNA存在于水相层中。收集上面的的水相层后,RNA可以通过异丙醇沉淀来还原9.RNA提取391.样品处理:
称取50-100mg幼嫩叶片(新鲜或-70℃及液氮中保存的组织均可)置1.5ml离心管中,加入1mlTrizol充分匀浆,室温静置5min2.加入0.2ml氯仿,振荡15s,静置2min3.4℃离心,12000g×15min,取上清4.加入0.5ml异丙醇,将管中液体轻轻混匀,室温静置10min5.4℃离心,12000g×10min,弃上清6.加入1ml75%乙醇,轻轻洗涤沉淀。4℃,7500g×5min,弃上清7.
晾干,加入适量的DEPCH2O溶解(65℃促溶10-15min)测O.D值定量RNA浓度提取RNAA260/A280
值在1.6-1.8之间;产率植物叶片100-200μgRNA/gTRIzol法提取流程9.RNA提取40植物组织基因组DNA水相有机相RNA氯仿纯化pH5.7离心加入裂解液(TRNzol-A+)
研磨9.RNA提取实验流程图412苯酚法
细胞内大部分RNA均与蛋白质结合在一起,以核蛋白的形式存在。因此,提取RN
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