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文档简介
蛋白质的生物合成
(翻译)
ProteinBiosynthesis,Translation第十五章蛋白质的生物合成,即翻译,就是将核酸中由4种核苷酸序列编码的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质一级结构中20种氨基酸的排列顺序。参与蛋白质合成的主要物质
ProteinBiosynthesisSystem
第一节20种氨基酸(AA)作为原料酶及众多蛋白因子,如IF、eIF
ATP、GTP、无机离子参与蛋白质生物合成的物质包括
三种RNAmRNA(messengerRNA,信使RNA)rRNA(ribosomalRNA,核蛋白体RNA)tRNA(transferRNA,转移RNA)mRNA上存在遗传密码mRNA分子上从5至3方向,由AUG开始,每3个核苷酸为一组,决定肽链上某一个氨基酸,称为三联体密码(tripletcoden)。起始密码(initiationcoden):AUG
终止密码(terminationcoden):
UAA,UAG,UGA
一、mRNA是合成蛋白质的直接模板
(信使RNA)遗传密码表从mRNA5端起始密码子AUG到3端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架(openreadingframe,ORF)。1.通用性(universal)蛋白质生物合成的整套密码,从原核生物到人类都通用。已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细胞的叶绿体。密码的通用性进一步证明各种生物进化自同一祖先。
遗传密码的特性2.连续性(commaless)编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读,密码间既无间断也无交叉。基因损伤引起mRNA阅读框架内的碱基发生插入或缺失,可能导致框移突变(frameshiftmutation)。3.简并性(degeneracy)遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅有一个密码子外,其余氨基酸有2、3、4个或多至6个三联体为其编码。mRNA中密码的阅读方向为
5,
3,4.方向性二、tRNA是氨基酸的搬运工具反密码环氨基酸臂tRNA的三级结构示意图氨基酸+tRNA氨基酰-tRNAATP
AMP+PPi氨基酰-tRNA合成酶氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNAsynthetase)
氨基酸的活化氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(proofreadingactivity)。氨基酰-tRNA的表示方法:Ala-tRNAAla
Ser-tRNASerMet-tRNAMet
摆动性(wobble)转运氨基酸的tRNA的反密码需要通过碱基互补与mRNA上的遗传密码反向配对结合,但反密码与密码间不严格遵守常见的碱基配对规律,称为摆动配对。U摆动配对目录密码子、反密码子配对的摆动现象tRNA反密码子第1位碱基IUGACmRNA密码子第3位碱基U,C,AA,GU,CUG一种氨基酸可由多种tRNA运输三、rRNA是蛋白质合成的场所原核生物真核生物核蛋白体小亚基大亚基核蛋白体小亚基大亚基S70S30S50S80S40S60SrRNA16S-rRNA5S-rRNA23S-rRNA18S-rRNA28S-rRNA5S-rRNA5.8S-rRNA蛋白质rpS21种rpL36种rpS33种rpL49种
不同细胞核蛋白体的组成核蛋白体的组成目录原核生物翻译过程中核蛋白体结构模式:A位:氨基酰位(aminoacylsite)P位:肽酰位(peptidylsite)E位:排出位(exitsite)目录蛋白质生物合成过程
TheProcessofProteinBiosynthesis
第二节翻译的起始(initiation)翻译的延长(elongation)翻译的终止(termination)整个翻译过程可分为:翻译过程从阅读框架的5´-AUG开始,按mRNA模板三联体密码的顺序延长肽链,直至终止密码出现。一、肽链合成起始指mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核蛋白体结合而形成翻译起始复合物
(translationalinitiationcomplex)。真核生物:Met-tRNAiMet原核生物:fMet-tRNAifMet
起始肽链合成的氨基酰-tRNA原核、真核生物各种起始因子的生物功能
原核生物70S起始复合物形成核蛋白体大小亚基;mRNA在小亚基定位结合;fMet-tRNAifMet的结合;起始因子IF。IF-3IF-11.核蛋白体大小亚基分离目录AUG5'3'IF-3IF-12.mRNA在小亚基定位结合目录S-D序列IF-3IF-1IF-2GTP3.起始氨基酰tRNA(fMet-tRNAimet)结合到小亚基AUG5'3'目录IF-3IF-1IF-2GTPGDPPi4.核蛋白体大亚基结合,起始复合物形成AUG5'3'目录IF-3IF-1AUG5'3'IF-2GTPIF-2-GTPGDPPi目录二、肽链合成延长指根据mRNA密码序列的指导,次序添加氨基酸从N端向C端延伸肽链,直到合成终止的过程。肽链延长在核蛋白体上连续性循环式进行,又称为核糖体循环(ribosomalcycle),每次循环增加一个氨基酸,包括以下三步:进位(entrance)成肽(peptidebondformation)转位(translocation)延伸过程所需蛋白因子称为延长因子(elongationfactor,EF)原核生物:EF-T(EF-Tu,EF-Ts)EF-G真核生物:EF-1、EF-2原核延长因子生物功能对应真核延长因子EF-Tu促进氨基酰-tRNA进入A位,结合分解GTPEF-1-αEF-Ts调节亚基EF-1-βγEFG有转位酶活性,促进mRNA-肽酰-tRNA由A位前移到P位,促进卸载tRNA释放EF-2肽链合成的延长因子又称注册(registration)(一)进位指根据mRNA下一组遗传密码指导,使相应氨基酰-tRNA进入核蛋白体A位。
目录延长因子EF-T催化进位(原核生物)
目录TuTsGTPGDPAUG5'3'TuTsGTP目录(二)成肽是由转肽酶(transpeptidase)催化的肽键形成过程。(三)转位延长因子EF-G有转位酶(translocase)活性,可结合并水解1分子GTP,促进核蛋白体向mRNA的3'侧移动。fMetAUG5'3'fMetTuGTP目录进位转位成肽真核生物肽链合成的延长过程与原核基本相似,但有不同的反应体系和延长因子。另外,真核细胞核蛋白体没有E位,转位时卸载的tRNA直接从P位脱落。
真核生物延长过程
三、肽链合成的终止当mRNA上终止密码出现后,多肽链合成停止,肽链从肽酰-tRNA中释出,mRNA、核蛋白体等分离,这些过程称为肽链合成终止。
终止相关的蛋白因子称为释放因子(releasefactor,RF)一是识别终止密码,如RF-1特异识别UAA、UAG;而RF-2可识别UAA、UGA。二是诱导转肽酶改变为酯酶活性,相当于催化肽酰基转移到水分子-OH上,使肽链从核蛋白体上释放。释放因子的功能原核生物释放因子:RF-1,RF-2,RF-3
真核生物释放因子:eRF原核肽链合成终止过程UAG5'3'RFCOO-目录多核糖体循环——使蛋白质合成高速、高效进行。目录电镜下的多核糖体循环现象目录翻译后加工和输送PosttranslationalProcessing&ProteinTransportation第三节从核蛋白体释放出的新生多肽链不具备蛋白质生物活性,必需经过不同的翻译后复杂加工过程才转变为天然构象的功能蛋白。主要包括肽链一级结构的修饰高级结构修饰靶向输送一、一级结构的修饰(一)肽链N端的修饰(二)个别氨基酸的修饰(三)多肽链的水解修饰二、高级结构的修饰(一)亚基聚合
(二)辅基连接(三)疏水脂链的共价连接蛋白质合成后需要经过复杂机制,定向输送到最终发挥生物功能的细胞靶部位,这一过程称为蛋白质的靶向输送。
三、蛋白质合成后的靶向输送•蛋白质的靶向输送(proteintargeting)所有靶向输送的蛋白质结构中存在分选信号,主要为N末端特异氨基酸序列,可引导蛋白质转移到细胞的适当靶部位,这一序列称为信号序列(信号肽)。
•信号序列(signalsequence)
分泌蛋白的靶向输送真核细胞分泌蛋白等前体合成后靶向输送过程首先要进入内质网。
信号肽(signalpeptide)各种新生分泌蛋白的N端有保守的氨基酸序列称信号肽。信号肽的一级结构信号肽引导真核分泌蛋白进入内质网目录蛋白质生物合成的干扰和抑制
Interference&InhibitionofProteinBiosynthesis第四节蛋白质生物合成是很多天然抗生素和某些毒素的作用靶点。它们就是通过阻断真核、原核生物蛋白质翻译体系某组分功能,干扰和抑制蛋白质生物合成过程而起作用的。可针对蛋白质生物合成必需的关键组分作为研究新抗菌药物的作用靶点。同时尽量利用真核、原核生物蛋白质合成体系的任何差异,以设计、筛选仅对病原微生物特效而不损害人体的药物。抗生素(antibiotics)是微生物产生的能够杀灭或抑制细菌的一类药物。抗代谢药物指能干扰生物代谢过程,从而抑制细胞过度生长的药物,如:6-MP。
某些毒素也作用于基因信息传递过程。一、抗生素类抗生素作用点作用原理应用四环素族(金霉素新霉素、土霉素)链霉素、卡那霉素、新霉素氯霉素、林可霉素红霉素梭链孢酸
放线菌酮嘌呤霉素原核核蛋白体小亚基原核核蛋白体小亚基原核核蛋白体大亚基原核核蛋白体大亚基原核核蛋白体大亚基真核核蛋白体大亚基真核、原核核蛋白体抑制氨基酰-tRNA与小亚基结合改变构象引起读码错误、抑制起始抑制转肽酶、阻断延长抑制转肽酶、妨碍转位与EFG-GTP结合,抑制肽链延长抑制转肽酶、阻断延长氨基酰-tRNA类似物,进位后引起未成熟肽链脱落抗菌药抗菌药抗菌药抗菌药抗菌药医学研究抗肿瘤药抗生素抑制蛋白质生物合成的原理
嘌呤霉素作用示意图四环素族氯霉素链霉素和卡那霉素嘌呤霉素放线菌酮目录二、其他干扰蛋白质生物合成的物质毒素(toxin)干扰素(interferon)白喉毒素
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