标准解读
《GB/T 27538-2011 动物流感检测 A型H1N1流感病毒中HA、NA的焦磷酸测序检测方法》是一项国家标准,旨在规范A型H1N1流感病毒血凝素(Hemagglutinin, HA)和神经氨酸酶(Neuraminidase, NA)基因片段的检测流程。该标准适用于动物流感病毒样本中的A型H1N1亚型鉴定及HA、NA基因序列分析。
根据此标准,首先需要从疑似感染A型H1N1流感病毒的动物体内采集适当的生物样本,如呼吸道分泌物或组织样本等。接着,利用RT-PCR技术对这些样本进行处理,以扩增目标区域——即HA与NA基因的部分序列。扩增产物随后通过特定的方法纯化,并作为模板用于后续的焦磷酸测序步骤。
焦磷酸测序是一种高通量DNA测序技术,能够快速准确地读取短链DNA片段的信息。在本标准中,它被用来测定经过RT-PCR扩增后的HA与NA基因片段的具体序列。通过对获得的序列信息进行比对分析,可以确定待测样品是否含有A型H1N1流感病毒特有的HA与NA基因特征,并进一步了解其遗传变异情况。
整个过程包括了样本准备、核酸提取、RT-PCR扩增、产物纯化以及最终的焦磷酸测序等多个环节,每个步骤都有详细的操作指南和技术要求,确保实验结果的准确性与可重复性。此外,该标准还提供了质量控制措施,比如使用已知序列的标准品作为对照,以验证整个检测系统的有效性。
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....
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- 现行
- 正在执行有效
- 2011-11-21 颁布
- 2012-03-01 实施
文档简介
ICS11220
B41.
中华人民共和国国家标准
GB/T27538—2011
动物流感检测A型H1N1流感病毒中
HANA的焦磷酸测序检测方法
、
Animalinfluenzadetection—MethodofpyrosequencingforHAandNAin
influenzavirusAH1N1
()
2011-11-21发布2012-03-01实施
中华人民共和国国家质量监督检验检疫总局发布
中国国家标准化管理委员会
GB/T27538—2011
前言
本标准按照给出的规则起草
GB/T1.1—2009。
本标准由中华人民共和国农业部提出
。
本标准由全国动物防疫标准化技术委员会归口
(SAC/TC181)。
本标准起草单位中华人民共和国山东出入境检验检疫局中国检验检疫科学研究院
:、。
本标准主要起草人徐彪梁成珠凌宗帅张太翔岳志芹高宏伟孙涛方绍庆林祥梅韩雪清
:、、、、、、、、、、
朱来华张鹤晓单虎
、、。
Ⅰ
GB/T27538—2011
动物流感检测A型H1N1流感病毒中
HANA的焦磷酸测序检测方法
、
1范围
本标准规定了焦磷酸测序技术用于型流感病毒及其墨西哥变异株中的和核酸
AH1N1HANA
序列检测方法
。
本标准适用于型流感病毒通用及型流感病毒墨西哥变异株的核酸检测
AH1N1AH1N1。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的凡是注日期的引用文件仅注日期的版本适用于本文
。,
件凡是不注日期的引用文件其最新版本包括所有的修改单适用于本文件
。,()。
分析实验室用水规格和试验方法
GB/T6682
出入境动物检疫采样
GB/T18088
实验室生物安全通用要求
GB19489
动物疫病实验室检验采样方法
NY/T541
基因检验实验室技术要求
SN/T1193
3缩略语
下列缩略语适用于本文件
。
三磷酸腺苷
ATP:(adenosinetriphosphate)
脱氧核糖核酸
DNA:(deoxyribonucleicacid)
焦碳酸二乙酯
DEPC:(diethylpyrocarbonate)
磷酸盐缓冲生理盐水
PBS:(phosphatebelancedsolution)
焦磷酸测序
Pyrosequencing:
反转录聚合酶链式反应
RT-PCR:(reversetranscriptionpolymerasechainreaction)
核糖核酸
RNA:(ribonucleicacid)
Taq酶Taq聚合酶
:DNA
4原理
焦磷酸测序是通过测序引物和扩增单链模板杂交与聚合酶硫酸化酶荧
PCRDNA,DNA、ATP、
光素酶三磷酸腺苷双磷酸酶和底物荧光素孵育逐一加入四种
、(APS)、,dNTPs(dATP,dTTP,dCTP,
如与模板配对此与引物的末端形成共价键释放焦磷酸基团硫酸化酶在
dGTP),,dNTP,(PPi);ATP
存在的情况下催化焦磷酸形成驱动荧光素酶介导的荧光素向氧化荧光素转化氧化荧
APSATP,ATP,
光素发出与量成正比的可见光信号光信号由电荷耦合检测器收集并由软件转化为峰
ATP;(CCD)。
每个光信号的峰高与反应中掺入的核苷酸数目成正比和未掺入的由三磷酸腺苷双磷酸
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