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DNA质粒DNA的提取西安医学院生化教研室DNA质粒DNA的提取西安医学院生化教研室质粒DNA的提取了解碱法提取质粒的原理;掌握碱法提取质粒的方法。实验目的质粒DNA的提取了解碱法提取质粒的原理;实验目的特点:超螺旋共价闭环结构,小的2-3kb,大的可达数百kb可插入外源DNA片段,≤15kb含有标记基因,可使宿主菌获得某些性状,如:amp抗性,tet抗性。分为紧密型和松弛型质粒质粒:存在于细菌染色体之外的、具有自我复制能力的环状双链DNA分子。特点:超螺旋共价闭环结构,小的2-3kb,大的可达数百kplasmidmapplasmidmapExperimentMaterialExperimentMaterial碱裂解法抽提质粒DNA的原理:——染色体DNA与质粒DNA变性与复性的差异质粒DNA的提取条件染色体DNA质粒DNApH=12.6变性不完全变性pH=中性不能复性复性离心沉淀(染色体DNA+RNA+蛋白-SDS复合物)存在于上清中碱裂解法抽提质粒DNA的原理:质粒DNA的提取条件染色体DN在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体DNA的双螺旋结构解开而变性,质粒DNA的氢键虽然断裂但两条互补链彼此缠绕,紧密结合在一起。当加入乙酸钾恢复至中性时,染色体DNA分子难以复性,而质粒DNA分子很快复性,离心时染色体DNA与细胞碎片一起被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清液中。这种方法是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体DNA的双螺旋结构质粒的超螺旋结构质粒的超螺旋结构培养细菌,收集与裂解细菌,质粒DNA的分离除去细菌染色体DNA、RNA和蛋白质。无水乙醇沉淀质粒DNA。实验原理质粒DNA的提取培养细菌,收集与裂解细菌,质粒DNA的分离实验原理质粒DNA主要试剂:solutionⅠ:50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris-Cl(pH8.0)
10mmol/LEDTAsolutionⅡ:0.2mol/LNaOH1%SDS(新鲜配制)solutionⅢ:3mol/L醋酸钾2mol/L醋酸TE缓冲液:10mmol/LTris-Cl(pH8.0)1mmol/LEDTA
主要试剂:(1)取1.5ml细菌培养液至epp管中,10000rpm离心1min。(2)弃上清,重复一次,倒扣在滤纸片上使液体流尽。(3)加入100μl溶液Ⅰ,用枪吹散重悬菌体,振荡器上剧烈振荡60s。(4)加入200μl溶液Ⅱ,快速温和颠倒epp管5次,以混匀内容物(千万不要振荡),室温放置3分钟。(5)加入150μl溶液Ⅲ,颠倒epp管5次,使沉淀混匀,放置3分钟。
实验步骤(1)取1.5ml细菌培养液至epp管中,10000rpm离(6)12000rpm离心5分钟,转移上清液至一新epp管中。(7)加入等体积的酚/氯仿(1:1)
,振荡混匀,12000rpm离心3分钟,吸取上清转移至另一新epp管中。(8)加入2倍体积的无水乙醇,振荡混匀,室温放置3分钟,12000rpm离心5分钟。(9)弃上清,加入1ml70%乙醇,漂洗沉淀一次,12000rpm离心2分钟。(10)弃上清,将管倒置于滤纸上使液体流尽,干燥10分钟。(11)加入20-50μl蒸馏水(按沉淀大小而定),溶解DNA,-20℃冰箱中储存。
(6)12000rpm离心5分钟,转移上清液至一新epp管超螺旋开环线性超螺旋开环线性实验步骤挑取单菌落接种到100mlLB液体培养基中(含amp)放入37℃振荡培养箱内培养过夜取1.5mL菌液加入epp管倒掉上清扣干,加入solutionI100uL离心10000rpm/1min质粒DNA的提取剧烈振荡打散菌体加入solutionII200uL,温和颠倒混匀放置3min重复一次实验步骤挑取单菌落接种到100mlLB液体培养基中(含amp实验步骤加入solutionIII150uL,立即混匀放置3min离心12000rpm,5min小心将含有质粒的DNA上清液移至另一epp管中(以下需轻微操作)加入等体酚/氯仿,振荡混匀离心12000rpm,3min质粒DNA的提取转移上清液至新epp管加入2倍体积冰冷无水乙醇,混匀室温放置3min实验步骤加入solutionIII150uL,立即混匀实验步骤离心12000rpm,5min弃上清液,加入1ml70%乙醇洗涤沉淀加入蒸馏水20-50uL溶解质粒,取5uL做酶切实验(液体尽量倒净并晾干)离心12000rpm,2min质粒DNA的提取实验步骤离心12000rpm,5min弃上清液,加入1mDNA质粒DNA的提取西安医学院生化教研室DNA质粒DNA的提取西安医学院生化教研室质粒DNA的提取了解碱法提取质粒的原理;掌握碱法提取质粒的方法。实验目的质粒DNA的提取了解碱法提取质粒的原理;实验目的特点:超螺旋共价闭环结构,小的2-3kb,大的可达数百kb可插入外源DNA片段,≤15kb含有标记基因,可使宿主菌获得某些性状,如:amp抗性,tet抗性。分为紧密型和松弛型质粒质粒:存在于细菌染色体之外的、具有自我复制能力的环状双链DNA分子。特点:超螺旋共价闭环结构,小的2-3kb,大的可达数百kplasmidmapplasmidmapExperimentMaterialExperimentMaterial碱裂解法抽提质粒DNA的原理:——染色体DNA与质粒DNA变性与复性的差异质粒DNA的提取条件染色体DNA质粒DNApH=12.6变性不完全变性pH=中性不能复性复性离心沉淀(染色体DNA+RNA+蛋白-SDS复合物)存在于上清中碱裂解法抽提质粒DNA的原理:质粒DNA的提取条件染色体DN在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体DNA的双螺旋结构解开而变性,质粒DNA的氢键虽然断裂但两条互补链彼此缠绕,紧密结合在一起。当加入乙酸钾恢复至中性时,染色体DNA分子难以复性,而质粒DNA分子很快复性,离心时染色体DNA与细胞碎片一起被沉淀出来,而质粒DNA则留在上清液中。这种方法是根据共价闭合环状质粒DNA与线性染色体DNA在拓扑学上的差异来分离它们。在碱性条件(pH12.5)下,线性染色体DNA的双螺旋结构质粒的超螺旋结构质粒的超螺旋结构培养细菌,收集与裂解细菌,质粒DNA的分离除去细菌染色体DNA、RNA和蛋白质。无水乙醇沉淀质粒DNA。实验原理质粒DNA的提取培养细菌,收集与裂解细菌,质粒DNA的分离实验原理质粒DNA主要试剂:solutionⅠ:50mmol/L葡萄糖25mmol/LTris-Cl(pH8.0)
10mmol/LEDTAsolutionⅡ:0.2mol/LNaOH1%SDS(新鲜配制)solutionⅢ:3mol/L醋酸钾2mol/L醋酸TE缓冲液:10mmol/LTris-Cl(pH8.0)1mmol/LEDTA
主要试剂:(1)取1.5ml细菌培养液至epp管中,10000rpm离心1min。(2)弃上清,重复一次,倒扣在滤纸片上使液体流尽。(3)加入100μl溶液Ⅰ,用枪吹散重悬菌体,振荡器上剧烈振荡60s。(4)加入200μl溶液Ⅱ,快速温和颠倒epp管5次,以混匀内容物(千万不要振荡),室温放置3分钟。(5)加入150μl溶液Ⅲ,颠倒epp管5次,使沉淀混匀,放置3分钟。
实验步骤(1)取1.5ml细菌培养液至epp管中,10000rpm离(6)12000rpm离心5分钟,转移上清液至一新epp管中。(7)加入等体积的酚/氯仿(1:1)
,振荡混匀,12000rpm离心3分钟,吸取上清转移至另一新epp管中。(8)加入2倍体积的无水乙醇,振荡混匀,室温放置3分钟,12000rpm离心5分钟。(9)弃上清,加入1ml70%乙醇,漂洗沉淀一次,12000rpm离心2分钟。(10)弃上清,将管倒置于滤纸上使液体流尽,干燥10分钟。(11)加入20-50μl蒸馏水(按沉淀大小而定),溶解DNA,-20℃冰箱中储存。
(6)12000rpm离心5分钟,转移上清液至一新epp管超螺旋开环线性超螺旋开环线性实验步骤挑取单菌落接种到100mlLB液体培养基中(含amp)放入37℃振荡培养箱内培养过夜取1.5mL菌液加入epp管倒掉上清扣干,加入solutionI100uL离心10000rpm/1min质粒DNA的提取剧烈振荡打散菌体加入solutionII200uL,温和颠倒混匀放置3min重复一次实验步骤挑取单菌落接种到100mlLB液体培养基中(含amp实验步骤加入solutionIII150uL,立即混匀放置3min离心12000rpm,5min小心将含有质粒的DNA上清液移至另一epp管中(以下需轻微操作)加入等体酚/氯仿,振荡混匀离心1
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