Omnic软件利用指南

1、Omnic 软件利用指南1 Omnic 与系统Omnic 是 Nicolet 公司的在 PC 机利用最普遍的窗口软件平台上运行的红外软件，从开始在 上运行的版本的到目前的，现行的的操作系统Windows98/Me/NT/2000/XP 都支持。 EZ-Omnic是简化的软件，一方面价钱比较低，同时加倍简明，容易把握，尽管功能比较简单，仍能够知足先当部份用户的需求。利用的仪器通信接口有：LTP(并行口 ) 或 PCI 卡，部份早一些的仪器利用 ISA 卡。2文件结构Omnic 以上版本的缺省的文件别离存在于三个目录中：C:My DocumentsOmnic, 在其子目录中分门别类地寄存数据与参数

2、等文件，如Spectra 存光谱， Param 中存设置参数 ,Quant 存定量方式；C:ProgramFilesOmnic, 存有驱动与程序文件等,系统的卸载命令在它的子目录Uninstall中； C:MyDocumentOmnicLib, 寄存谱库，包括购买和自建的谱库。软件安装的应用程序除Omnic 外还有 Bench Diagnostics,这是一个在系统发生故障时进行判定的重要命令， 能够检查从接口卡到仪器的各个重要部件。它们与 PDF 文件一路置于 ThermoNicolet 程序组中，3启动 Omnic 软件利用以下方式之一启动Omnic 红外软件系统：1在 Windows98

3、 等的桌面上双击（或）2从 SrartProgramThermo Nicolet Omnic( 或从 Srart Program)3其他，如Win98 中的快捷方式启动。4 Omnic 显示面板：1 Omnic 是一种与窗口软件充分兼容的软件，能够显示一个或多个显示窗口，当显示多个窗口时能够选择平铺（ Tile ）或层迭（ Cascade）方式，但其中只有一个是活动窗口（被选中的）。光谱图能够在窗口间拖动、复制与粘贴，而且能够把复制的光谱图直接粘贴到其他应用程序的文本文件中，为发表文章或书写报告带来方便。2在每一个显示窗口中，能够显示一个到多个光谱图，最后加入的光谱是自动被选中的，缺省颜色是红

4、色。 有些对光谱进行进一步处置时需要或能够同时处置多个光谱。 需要有多个被选中的光谱时，通过按住 Ctrl 或 Shift 键操作鼠标来增减被选中光谱。题目框在光谱窗口的上面，题目内容为人工输入，或依照利用的需要，通过“选项”中所设定的方式中适被选择自动生成。4按“信息按钮”或双击“题目框”中的题目，打开“选中”光谱的搜集和数据处置记录的窗口，在其中的注释（ Comment）等假设干框中，能够输入文字信息，这些信息能够随同谱图一路打印，其它的记录为非编辑内容。5当显示多个光谱图时，按“题目框”右边的箭头，显示出所有谱图的题目表。用鼠标击题目表 （选中） 后，用键盘上的箭头键能够改变被选中的光谱

5、， 同时能够编辑被选中的光谱的题目。按住 Ctrl 或 Shift 对题目表或窗口中的光谱点击鼠标左键，能够增加或减少一个或多个被选中的光谱。6 图标工具是用来概念鼠标功能的：选择，7“取景窗”中显示有完整的光谱图（被选中的）范围，坐标，峰高，峰面积，标注。，并指明光谱在窗口中的显示范围。通过鼠标及与的联合利用，能够改变光谱在窗格中光谱的水平方向显示区间，另外Omnic软件还有几种调整显示范围的方式。8快捷工具图标的利用使操作更为便利。5数据搜集设置从 Collect 下选 Experiment Setup ，就打开了它的窗口，从当选择与搜集有关的条件和参数。也能够挪用现有的参数组文件 (.e

6、xp) 或保留调整选择好的条件。Collect 选项卡中能够选择：扫描次数 Number of Scans分辨率Resolution光谱格式Final Format ，矫正Correction文件治理File Handling背景治理Background Handling环境干扰补偿Automatic Atmospheric Suppresion光谱预览 Preview Data Collection ，在搜集光谱之前需要核实或调整样品时选用，这一功能关于显微及某些附件应历时超级有效。选项卡，从中能够检查红外干与信号强度并包括：增益 Gain，调整红外干与信号强度，一样将Max 调到 28V速

7、度Velocity ，取决于检测器和应用（速度及响应）光阑Aperture ，取决于光谱分辨率、光强的调整（也能够利用衰减屏）光谱范围Spectral Range，可依照需要变更样品位置Sample Compartment ，关于红外的系统，在指定它后，一系列其它参数都可由软件自动配套完成设置。Quality 选项卡，通过适当设定需要检查的各个因素及其程度等，系统在搜集进程中即时指示并记录相关因素的状态，用于保证光谱质量。利历时注意，因素及其（量化）程度选择必需适当， 不然软件不能提供正确的提示。 Use Spectral Quality Checks 决定是不是利用此项功能。选项卡中的参数选

8、择中：Zero Filling用以改善谱图曲线的持续性。Apodization变迹 (切趾 )函数，在分辨率与信躁比之间衡量。其中Boxcar 应用于高分辨率，Blackman-Harris 应用于高信躁比，而 Happ-Genzel 最经常使用，它兼顾了信躁比和分辨率。 Sample Spacing 采样距离， 1 自 15798CM-1 始， 2 自 7899CM-1 始， 4 从 3949 CM-1 始记录光谱数据。Phase Correction 相位矫正。Low (High) Pass Filter低 (高 )通滤波器转折频率。5. Diagnostic选项卡：电源 , 氦氖激光器

9、, 红外光源 , 电子部件 , 分束片与检测器。 上面五个是诊断图标，被点击时显示出相应信息，但没有Bench Diagnostic 中给出的充分，其中的“”和“”别离指示正常和不正常。当 View reference detector 被选时，窗口中的红外干与图就被参考检测器的干与信号取代，其强度一样在12V 以上。此信号用于干与图峰位操纵、Nexus 中的湿度检查和IR 检测器的故障判定。Align, 对干与仪进行自动准直，将仪器调整并维持运行在最正确状态。需人工调整干与仪的系统，如 G 系列和大部份 Impact ，没有此项功能。c) Reset Bench, 光学台重置（复位） 。d)

10、 Verify Smart Accessory,有功能的系统中，对智能附件进行确认（识别）。Configure Bench, 光学台系统设置，输入光源、分束器、检测器和与运算机通信的地址参数等。对有功能的系统软件会自动设置，一样不需要人为调整，除非有特殊用户元件。Check Desiccant, 干燥状态检查 (Nexus 系列 ) 。依照结果，决定干燥剂需要改换与否。在 Omnic 软件中（不含 EZ ），利用 Match Spectrum Setting ，按选定光谱图的实验条件设置有关数据搜集的所有参数，确保光谱的可比性。Spectral Quality Reference用来评判仪器状

11、态。6背景与样品数据文件的搜集依照上面的顺序，用Collect Background 和 Collect Sample 的指令进行数据搜集。在背景治理 Background Handling 当选择前两项之一时，背景要依照所提示的顺序搜集。选择第三项时，后面输入的数值确实是设定的背景有效利用分钟数， 到时候软件会提示需要从头搜集背景。7显示、打印与存盘1 选择光谱：搜集好的光谱能够以重迭(Overlay) 或分层(Stack)的方式显示到指定的窗格中。最后加入或被点击的光谱图是红色，即“选中的”。2 显示范围（坐标） ：其大小能够通过a) Display Limits输入数值，拖动鼠标， c)

12、 取景窗(X 轴 )， d)View菜单中Full, Common, Match ，Offset-Scale(Y 轴 )， e) Roll/Zoom Window工具 等等来调整。3 利用 Find Peaks 或 标峰位置， 用“图标工具” 进行峰高、 峰面积测量与标注等等操作。4 通过打开 (Open)、剪切 (Cut) 、删除 (Clear)、拷贝 (Copy) 、粘贴 (Paste)、保留光谱图 (Save, Save As)和保留光谱图组 (Save Group) 进行文件治理。5 显示设置 (Display Setup)： a) 显示项目，注释方式及项目， c) X 轴格式，是不是

13、对低波数范围扩展或以波长为单位， d)分层 (Stack)显示光谱的个数， e) 所要显示有关采样信息的选项。6 打印：关系统设置在a) 依照显示直接打印，Edit Option 当选择。依照报告模板(Report Template)打印。显示与打印的有8数据的分析处置1转换：透过 (Transmittance) 与吸收 (Absorbance) 之间的转换。 Other Conversions 其它转换， 包括漫反射、光声光谱、反射率的对数和X 轴的波数 /波长转换。2数据处置Reprocess 再处置，须存有干与图、单光束光谱图。Baseline Correct/Automatic 基线校

14、正 / 自动基线校正：基线校正须对吸收图操作，自动基线校正关于基线不是简单倾斜的图的校正结果较差。Other Corrections其它校正，包括：K-K 、 ATR. 、 H2OBlank/Straight Line使空白 / 直线生成Subtract 差谱和 CO2校正。Fourier Self-Deconvolution自去卷积，以改善峰重迭Smooth/Automatic 滑腻 /自动滑腻，以紧缩噪声，但分辨率会有不同程度下降 Change Data Spacing 改变数据点的距离，用以不同分辨率间的比较和处置Derivative导数光谱Spectral Math 数学运算Multi

15、ply乘 (某一系数 )Add 相加 (两个光谱 )Normalize Frequency频率标准化Normalize Scale Y 坐标标准化3 Analyze 分析Find Peaks 峰查找，点击鼠标设定阈值，灵敏度那么与标峰多少有关。Noise 噪声水平测量Average 平均值测量Statistical Spectra 统计光谱，取得多个光谱的平均值与误差LibrarySetup 谱库设置，选择谱库途径/谱库，成立谱库组，选择检索类型、内容、概念光谱检索范围、结果保留及显示的个数。Search 光谱检索，在LibrarySetup 当选择的算法有：专家检索或相关值、绝对值、平方、导

16、数和平方导数。IR Spectral Interpretation 光谱解析点击下的 就会显现右边的窗口， 说明可能的对应结构信息。QC Compare QC 比对，通过将样品图与QC 库中标准品图比较并以数字形式的结果说明它们的一致性，用于从原材料到产品的分级分类、品质鉴定，达到量化的质量操纵要求。比对的光谱范围取决于三个因素：a) 显示的范围，QC Library光谱范围， c) Library Setup中概念的光谱范围。Library Manager 谱库治理，查看谱库信息，成立和删除谱库等在 EZ Omnic 系统中，没有Library Manager ，代之以 Create Lib

17、rary 和 View Library 。九. 报告（ Report）Report 是 Omnic 软件特有的一种数据输出形式。通过模板(Template)的选用和编辑，利用者能够以各类形式打印、存储报告。报告存储在Notebook 中，以便用各方面信息进行查询(检索) 。Template 挪用、编辑模板和新模板创建。Preview/Print Report预览、打印报告或另选模版。New Notebook新建 Notebook 。Add to Notebook将报告加入Notebook 。View Notebook查询、阅读和打印Notebook 和在Notebook 中检索某些相关信息。十

18、窗口 (Window)选择窗口及其排列，成立新的窗口。New Window建新窗口。Tile Windows窗口平铺。Cascade Windows 窗口层迭。十一帮忙 (Help)Omnic 软件的功能丰硕多样，利用进程中， 单击鼠标右键或按F1 键等启动灵活的在线帮忙。在帮忙菜单中提供大量的系统的信息，有仪器整体的介绍，系统的 FT-IR 理论，样品测试的操作进程，软件利用， 附件的介绍和利用等等。 还有当系统有故障时的提示，对硬件的诊断，等等。十二其他1软件系统设置(Configuration)在软件的实际利用中，有些需要和要求可是不同的，这些不同的要求，能够通过不同设置的挪用或修改来实

19、现。软件系统设置的挪用与存储，是从 Omnic 中的 File Open Configuration 与 Save ConfigurationAs 来进行。 Edit Option, Edit Menu, Edit Toolbar等是对设置进行修改调整。下面是一些实例：a). 修改初始的文件途径：Edit Option ，在 File tab 的 Derictories 框当选择， 例如关于光谱文件目录，选择框中 Initial spectra ，再点击右边的 Select Path ，选择新的途径后，单击OK确认。关于 Use initial directory/Uselast direct

20、ory 的选择能够将软件运行当中的光谱文件途径维持在初始或前面利用过的途径上。. 选择标注方向： Edit Option ，在 View tab 的 Annotation 框当选择，最后单击 OK 确认。c). 光谱打印线的粗细： Edit Option ，改变在 Print tab 的 Spectra 框中 Line thickness的数值，数值越大线条越粗。d). 选择输入 H2O 和 CO2 的参考光谱： Edit Option ，单击在 Process tab的 Corrections 框中 H2O 或 CO2 右边的 Browse 键，以后在打开的 Open 窗框当选取相应的光谱文

21、件，单击OKe).确认。实际利用中要注意搜集光谱的参数和条件，须与实际测量样品的一致（除选择显示窗格中缺省的光谱范围：Edit Option ，在 Window tab 的 X-Axis Limitscans）。框中直接键入数值。2文件的存储Omnic 软件提供的光谱存储有单光谱与光谱组（即多光谱文件*.spg）两种形式，而对单光谱有提供了多种属性的选择， 除 *.spa 外，经常使用的还有 *.spc 等。*.spc 是分峰软件 Peaksolve 所用形式， *.csv 那么是将文件贮存为数组，其每行含有的两个数字别离代表波数和强度，供 Omnic 系统之外的软件利用。 *.jdx 文件是

22、一种更 “高级”的文本文件， 它有效地利用运算机的存储空间，成为在国际会议上普遍采纳的“标准”格式。*.csv 文件 (Comma-Separate Values)+003,+003, A Peak in Polystyrene film+003, +003,+003, +003,+003,+003,+003,+003,+003,+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000+003,+000从数据文件利用与

23、治理方便的角度动身，应考虑多成立子目录，利用 即可在当前目录中直接成立新子目录，如此就能够够将不同时刻、 批号、样品的不同种类或来源等等区别开，存到不同的途径当中。3 Toolbor的利用和编辑为了加倍方便地进行操作，Omnic软件中提供有大量的工具键，用鼠标单击就直接执行对应的功能。关于当前Toolbar 中排列着的部份，能够通过Edit Edit Toolbar ，增加或删除其中的工具键，用鼠标直接从ButtonLibrary 当选取所要添加的兼拖入中间的Current Toobar即可。关于工具键的大小、显示内容和排列的方向、位置，利用者可在该窗口的右边选择。有上部的 Add item

24、是添加已编制好的宏程序或外部命令等用的。4 Log ( 日记 )的利用Omnic 软件提供了一种记录功能： Log ，它以流水帐的形式记录各类操作的结果，作为文本文件贮存，利用 RTF 作为缺省的扩展名。通过 Open Log 和 Close Log 来启动和终止。5 Edit 中其他功能Cut 减切， Copy 拷贝， Paste粘贴， Paste Image 影象粘贴， Clear 删除， Select All 全选， Delete Annotation 标注删除。Copy( 和 Cut) 操作将选中的光谱数据复制到剪贴板，供Paste用。 Paste 的对象不单单是光谱显示窗口，而且能够

25、是Word 、 Excel 等各类 Omnic 软件之外的应用程序。如此就给仪器利用人员提供了方便， 将打印成效十全十美的光谱图依照需要的比例、 大小直接融入文章和报告当中。6登录的选用与取消在需要对进入Omnic 进行爱惜性限制时，请选择为口令。需要取消或由于忘记口令时，打开在Enable Omnic Log-In ，输入字符假设干作文件，将CUSTOMERINFO中的 UseLogin=1 改成等于 0，用 Save 命令回存。Omnic 软件实际应用应用一：克服环境中H2O 与 CO2 的干扰：CO2 的吸收峰比较窄，而且位置(2350CM-1 周围 )通常不与样品光谱信息重迭，因此可结

26、合区间工具与 Straight Line功能结合将其排除。H2O 的扣除那么是通过光谱差减，Omnic 软件不但提供专门对的H2O 与 CO2 进行矫正处置功能，而且能够通过适当的设置，在数据搜集进程中直接自动矫正，取得良好的成效。具体步骤是：1 在与正式样品光谱搜集完全一致的条件下，向样品室内加入适量气体H2O 或 CO2，别离搜集到强度适中的 H2O 和 CO2 的光谱图， 存到运算机系统。 背景的搜集最好是在吹扫后进行。 如先采纳背景方式二，即样品搜集终止后，经适当吹扫后搜集背景，再将背景方式改成三，向光路中少量吹气， 搜集第二个样品光谱， 如此取得的两个谱图中具有的CO2 和 H2O相对强度不同。 （能够通过彼此差谱 Subtract，别离取得 H2O 和 CO2 的参考光谱。）2 将存好的 H2O 和 CO2 的参考光谱在 Option 中输入：Edit Option ，单击在 Process tab 的 Corrections框中 H2O 或 CO2 右边的 Browse 键，以后在打开的 Open 窗框当选取相应的光谱