生物化学2课件

1、2 蛋白质的结构与功能2.1概述 2.2蛋白质的基本组成单位氨基酸2.3蛋白质的结构 2.4蛋白质结构与功能的关系 2.5蛋白质的重要性质、分离纯化与 鉴定2.1概述2.1.1 蛋白质的生物学意义和元素组成2.1.2 蛋白质的分类2.1.3 蛋白质在生产和生活中的利用 2.1.1 蛋白质的生物学意义和元素组成2.1.1.1 蛋白质的生物学意义 (1) 蛋白质生物学功能的多样性 酶的催化功能、控制生长和分化、代谢调节功能、运动功能、运输作用、免疫保护作用、接受和传递信息、贮存营养功能、结构支持作用。（2）蛋白质生物学功能的复杂性 某一功能的发挥往往受到多种因素的影响与调节。2.1.1.2 蛋白质

2、的元素组成一般含有：碳（5055） 、氮（1518）、氧（2023）、氢（68）、硫（04）。在某些蛋白质中，还含有一些微量元素如：磷、铁、铜、钼、碘、锌等。蛋白质元素组成的一个特点：各种蛋白质的氮含量比较恒定，平均值为16左右。 由于容易用凯氏定氮法进行测定氮的含量，因此，蛋白质的含量可由氮的含量乘以 6.25（100/16）计算出来。 2.1.2 蛋白质的分类2.1.2.1 根据蛋白质的构象2.1.2.2 按蛋白质功能分类2.1.2.3 按蛋白质的组成和溶解性分类2.1.2.1 根据蛋白质的构象分为纤维状蛋白质 和球状蛋白质 。 球状蛋白质(globular protein)：结构特点：近

3、似于球形或椭圆形，多数可溶于水或盐溶液中。许多具有生理活性的蛋白质如酶、转运蛋白、蛋白质类激素、免疫球蛋白等均属球状蛋白。纤维状蛋白质（fibroue protein）结构特点：多数为结构蛋白，结构很不对称，多数难溶于水。能耐受强的拉力。 如皮肤、肌键、软骨及骨组织中的胶原蛋白 ；毛发及皮肤中的角蛋白；存在于皮肤、动脉血管壁、结缔组织中的弹性蛋白。主要功能是给机体提供坚实的支架，连接各细胞、组织及器官。2.1.3 蛋白质在生产和生活中的利用2.1.3.1 在食品和饲料领域的应用2.1.3.2 在医药领域的应用2.2 蛋白质的基本组成单位氨基酸 2.2.1 氨基酸的结构2.2.2 氨基酸的分类2

4、.2.3 氨基酸的性质 2.2.1 氨基酸的结构蛋白质中常见的氨基酸有 21 种。除脯氨酸以外，这些天然氨基酸在结构上的共同点是：与羧基相邻的-碳原子上都有一个氨基，因而称为-氨基酸。硒代-半胱氨酸(seleno-cysteine) se-cys 2.2.2.2 非编码氨基酸 蛋白质中有一些不常见的稀有氨基酸，没有相应的三联体遗传密码，故称非编码氨基酸。这些氨基酸都是在生物体合成蛋白质分子后相应的编码氨基酸经羟基化、甲基化、磷酸化等修饰形成的衍生物。 例如：胶原蛋白和弹性蛋白中的 4-羟脯氨酸 和 5-羟赖氨酸；甲状腺球蛋白中的 二碘酪氨酸 和 L-甲状腺素；-角蛋白中的 胱氨酸 等。2.2.

5、2.3 非蛋白质氨基酸 在生物体内的各种细胞或组织还发现150多种不参与蛋白质组成的氨基酸，故称非蛋白质氨基酸，这类氨基酸多呈游离，但也有结合态的。大部分是蛋白质常见氨基酸衍生物，但也有D型和一些、或氨基酸。这些非蛋白质氨基酸不存在于蛋白质中，多是重要的代谢物前体或代谢中间产物。如瓜氨酸和鸟氨酸是精氨酸的前体，氨基丁酸是一种神经递质。 氨基酸两性解离示意图：氨基酸的等电点：对某种氨基酸来讲，当溶液在某一特定的pH时，氨基酸以两性离子的形式存在，正电荷数与负电荷数相等，净电荷为零，在电场中，既不向正极移动，也不向负极移动。这时，溶液的pH，称为该氨基酸的等电点，用p表示。 氨基酸的等电点的作用：

6、 在一定的实验条件下，等电点是氨基酸的特征常数。 当氨基酸处于等电点状态时，其溶解度最小，容易发生沉淀；不同氨基酸，由于R基团结构的不同，有不同的等电点。利用这一特性可以从各种氨基酸的混合物溶液中分离制取某种氨基酸。 （一）氨基酸的构型:除 甘氨酸 以外，其余 20 种氨基酸的 C都是不对称碳原子（手性），因而每一种氨基酸都有D-型 和 L-型两种构型。天然蛋白质中的几乎所有的氨基酸都是 L-型氨基酸。某些微生物和植物体中含有 D-型氨基酸。2.2.3.2 氨基酸的光学活性与吸收光谱甘氨酸的结构式参与蛋白质组成的氨基酸在可见光区都没有光吸收；在紫外光区只有色氨酸、酪氨酸和苯丙氨酸有吸收光的能力

7、。其最大吸收波长()分别为280、275、257nm。 是利用紫外分光光度计，在280nm波长处，测定蛋白质浓度的基础。 （二）吸收光谱2.3 蛋白质的结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.2 蛋白质的三维结构2.3.1 蛋白质的一级结构2.3.1.1肽和肽键2.3.1.2 天然活性肽2.3.1.3 一级结构的测定步骤 蛋白质结构层次 肽键（peptide bone）：是连接多肽链中氨基酸残基的唯一共价键。多肽链（polypeptide chain） ：由许多氨基酸残基通过肽键彼此连接而成的线状聚合体，称为多肽链。氨基酸残基（amino acid residue）多肽链上的每个氨基酸，由于形

8、成肽键而失去了一分子水，成为不完整的分子形式。这种不完整的氨基酸被称为氨基酸残基。 肽单位平面结构和二面角 （一）肽单位平面结构的特征肽单位的特征： 1肽键具有部分双键的性质，不能自由旋转。 肽键的键长是0.1325nm，比 CN 单键（键长0.147nm）短些，比C=N 双键（ 键长 0.127nm ）长些。 2肽单位是刚性平面结构。 这就是说，肽单位上的 6 个原子都位于同一个刚性平面上，称为酰胺平面。 3在肽单位上，其 CO 和 NH 都是反式排布。（二）二面角（dihedral angle） 肽平面 1围绕 C2N1 单键旋转，其旋转的角度用表示；肽平面 2 也可以围绕 C2C2 单键

9、旋转，其旋转的角度用表示。由于 和 这二个转角决定了相邻二个肽平面在空间上的相对位置，因此，习惯上将这二个转角称为二面角。二面角决定多肽链主链骨架的构象。 N1C 2C22.3.1.2 天然活性肽 谷胱甘肽 脑啡肽 短杆菌肽S 肽类激素2.3.1.3 一级结构的测定步骤测序一般要求样品均一，纯度应在97%以上，允许误差在10%左右。1. 测定蛋白质的分子质量和多肽链的数目2.拆开蛋白质分子的多肽链3.断开多肽链内的二硫键4.分析每一条多肽链的氨基酸组成5.鉴定多肽链的N末端和C末端残基6.把多肽链裂解成两套以上大小不等的较小片段7.测定各肽段的氨基酸序列8.重叠各肽段，重建完整多肽链的一级结构

10、顺序9.确定半胱氨酸残基间形成的SS二硫键位置蛋白质一级结构的表示法 蛋白质的一级结构，通常根据参与组成多肽链的氨基酸残基种类，按照其排列顺序，从N末端氨基酸残基开始，依次命名。举例：甲硫脑啡肽中文氨基酸残基命名法：酪氨酰甘氨酰甘氨酰苯丙氨酰甲硫氨酸三字母符号表示法：TyrGlyGlyPheMet单字母符号表示法：YGGFM肽键H2NCOHCH3SCOOHNHCCOHNHCCOHNHCCOHNHCHHCH2CHCH2OHCH2CH22.3.2 蛋白质的三维结构 2.3.2.1稳定蛋白质构象的作用力2.3.2.2蛋白质的二级结构2.3.2.3 蛋白质的超二级结构和结构域2.3.2.4 蛋白质的三

11、级结构2.3.2.5 蛋白质的四级结构（二）蛋白质的三维结构 蛋白 质的三维结构指的是蛋白质分子中全部原子和基团相互间的立体关系，包括全部原子和基团的排列、分布及肽链的走向。又称为蛋白质的高级结构、空间结构或构象，可分为二级、超二级、结构域、三级和四级结构。2.3.2.1稳定蛋白质构象的作用力非共价键维持，如：氢键、范德华引力、疏水作用力、离子键。二硫键、配位键参与维持构象。 2.3.2.2二级结构概念： 指多肽链主链在一级结构的基础上，某些肽段借助氢键进一步的盘旋或折叠，从而形成有规律的构象。维系二级结构的作用力是氢键。主要类型：（一）-螺旋 （二）-折叠片 （三）-转角 （四）无规卷曲（一

12、）-螺旋 (-helix) 即一个氨基酸残基的NH与前面第四个氨基酸残基的CO形成氢键。 氢键的取向与螺轴几乎平行。-螺旋构象允许所有的肽键都能参与链内氢键的形成。因此，-螺旋构象是相当稳定的，是最普遍的螺旋形式。（二）-折叠片又称为-折叠，二条-折叠股平行排布，彼此以氢键相连。为了在相邻主链骨架之间形成最多的氢键，避免相邻侧链间的空间障碍，各主链骨架同时作一定程度的折叠，从而产生一个折叠的片层。其侧链近似垂直于相邻二个平面的交线，交替地位于片层的两侧。 （三）回折(reverse turn) 在多肽链中，经常出现180转弯的结构，此结构就是回折。通常有-转角和-转角两种形式。（四）无规卷曲没

13、有规律性的多肽链主链骨架的构象，就是无规卷曲。球蛋白分子中，往往含有较多的无规卷曲；无规卷曲往往有利于多肽链形成灵活的、具有特异生物活性的构象。超二级结构的概念 在蛋白质分子结构中经常存在由相邻的二级结构单元（主要是螺旋和折叠片）组合在一起，形成有规则的、空间上能够辨认的二级结构组合体，充当三级结构的构件，称为超二级结构。 常见的超二级结构的组合形式 有、等三种组合形式。另外还有、C结构也可见到。C中的C代表无规卷曲。2.3.2.3蛋白质的超二级结构和结构域（1）超二级结构（2）结构域概念多肽链在二级结构的基础上，进一步卷曲折叠成为相对独立、近似球形的松散连接的三维实体。是三级结构的局部折叠区

14、。 结构域这一层次的发现，与蛋白质的功能是分不开的。很多结构蛋白的活性中心都位于结构域之间，由于结构域之间常常只有一段肽链相连，形成所谓“铰链区”（hinge region），使结构域容易发生相对运动。结构域之间的这种柔性（flexibility）有利于如酶和抗体活性的发挥。 2.3.2.4三级结构（tertiary structure）概念： 多肽链在二级结构、超二级结构和结构域的基础上，主链构象和侧链构象相互作用，进一步盘曲折叠形成特定的球状分子结构，称作三级结构。 或者说三级结构是指多肽链中所有原子的空间排布。2.3.2.5 四级结构概念：由两条或两条以上具有三级结构的多肽链聚合而成的有

15、特定三维结构的蛋白质构象称为蛋白质的四级结构。四级结构中所含的每个具有三级结构的球状蛋白质称为亚基（subunit）或单体（monomer），游离的亚基无生物活性。四级结构涉及亚基的种类和数目以及各亚基在整个分子中的空间排布，包括亚基间的接触位点和相互作用关系，而不包括亚基本身的构象。由少数亚基聚合而成的蛋白质，称为寡聚蛋白 （Oligomer protein），根据亚基数目的不同，可以将寡聚蛋白分为二聚体、三聚体、四聚体等，根据亚基种类的不同，可以分别以、命名不同的亚基。由几十个，甚至于上千个亚基聚合而成的蛋白质，称为多聚蛋白（polymer protein）。烟草花叶病毒示意图：烟草花叶病

16、毒的外壳蛋白四级结构：亚基呈螺旋状排布。 蛋白质的结构层次一级结构(primary structure)；二级结构（secondary structure）；超二级结构（supersecondary structure）；结构域（structural domain）；三级结构（tertiary structure）；四级结构（quarternary structure） 蛋白质结构层次 ：2.4 多肽、蛋白质的结构与功能的关系 2.4.1蛋白质一级结构与功能的关系2.4.2 蛋白质构象与功能的关系2.4.1蛋白质一级结构与功能的关系2.4.1.1一级结构与同源蛋白质的物种差异 和生物进化2.4

17、.1.2一级结构变异与分子病2.4.1.3 一级结构断裂与功能激活2.4.1.1一级结构与同源蛋白质的物种 差异和生物进化在不同生物体中行使相同或相似功能的蛋白质称同功能蛋白质，它们的氨基酸序列具有明显的相似性，这种现象称为序列同源，有明显序列同源的蛋白质也称同源蛋白质。 从不同物种提取得到的同源蛋白质中许多的氨基酸残基是完全相同的，称不变残基，它们决定了蛋白质的空间结构与功能。而其它氨基酸残基有相当大的变化，称为可变残基，它们的差异体现了种属特异性。 因此，对不同生物来源的同功能蛋白质的一级结构进行比较研究： 1 . 可以帮助我们了解哪些氨基酸对蛋白质的活 性是重要的，哪些是不重要的。 2

18、. 可为生物进化提供新的可靠依据。 不同生物来源的细胞色素C一级结构比较对 50 多种不同生物来源的细胞色素C 的一级结构的104个氨基酸进行比较，发现 35 个氨基酸在各种生物中是保守的。2.4.1.2一级结构变异与分子病 分子病是由于基因突变导致蛋白质一级结构突变，使蛋白质功能下降或丧失，而产生的疾病被称为分子病。镰刀型红细胞贫血病 由血红蛋白分子亚基N末端序列的一级结构改变引起的。正常红细胞和镰刀状红细胞的扫描电镜图谱？2.4.1.3 一级结构断裂与功能激活许多具有一定功能的蛋白质，在动物体内通常以无活性的前体形式产生和贮存。它们这些前体在机体需要时，经过某种蛋白酶的限制性水解，切去部分

19、肽段之后，才变成有活性的蛋白质。如参与蛋白质消化的各种蛋白酶、参与血液凝固的血纤维蛋白、凝血酶和凝血因子，参与代谢调节的激素蛋白等。激活（activation）：使前体变成活性蛋白质的过程，被称为激活。2.4.2 蛋白质构象与功能的关系 蛋白质分子的生物功能直接由其特定构象所决定，空间结构的变化必然引起功能改变。 变构调节活性 有些蛋白质在完成其生物功能时空间结构往往发生一定变化，改变分子的性质，以适应生理功能的需要，称变构或别构作用。血红蛋白有两种构象，一种是对氧亲和力低的T态，另一种为对氧亲和力高的R态。 变性丧失活性 维系其高级结构的次级键体系可能被扰乱。血红蛋白 -亚基-亚基（ - s

20、ubunit） 血红素 （ haem）血红蛋白的变构现象（变构时的亚基移动） 血红蛋白和肌红蛋白的氧合曲线不同，前者是 S 形曲线，后者是双曲线。 -亚基可与氧结合，而-亚基由于存在空间位阻，几乎不与氧结合。当-亚基与氧结合后，发生三级结构的变化，此变化使相邻的-亚基发生三级结构的变化，与氧结合使血红蛋白结合氧的能力在短时间内迅速上升，从，而使曲线程S 形。氧饱和度（%）2.5.1 蛋白质的重要性质2.5.2 蛋白质分离纯化的原则与方法2.5 蛋白质的重要性质、分离纯化与鉴定2.5.1.1 蛋白质的两性解离与等电点2.5.1.2 蛋白质的胶体性质与沉淀2.5.1.3 蛋白质的变性与复性2.5.

21、1.4蛋白质的呈色反应 2.5.1 蛋白质的重要性质2.5.1.1 蛋白质的两性解离与等电点 在蛋白质分子中，有许多可解离的基团，除了肽链末端的 -氨基和 -羧基以外，还有各种侧链基，如：Asp和 Glu 的侧链羧基，Lys 的-氨基、Arg 的胍基、His 的咪唑基、Cys 的巯基、Tyr 的酚基。因此，蛋白质是多价的两性电解质。蛋白质的等电点（isoelectricpoint）概念：当溶液在某个 pH 时，使蛋白质分子所带正电荷数与负电荷数恰好相等，即净电荷为零，在直流电场中，既不向阳极移动，也不向阴极移动，此时，溶液的 pH 就是该蛋白质的等电点，用 pI 表示。在等电点时，蛋白质比较稳

22、定，溶解度最小。因此，可以利用蛋白质的等电点来分别沉淀不同的蛋白质，从而将不同的蛋白质分离开来。不同的蛋白质有不同的等电点 。 2.5.1.2蛋白质的胶体性质与沉淀（一）蛋白质的胶体性质 球蛋白溶液具有亲水胶体的性质。这种亲水胶体溶液是比较稳定的。其稳定因素有两个： （1）球状大分子表面的水化层； （2）球状大分子表面具有相同的电荷，由于同性 电荷的相互排斥，使得大分子不能互相结合 成较大的颗粒。盐溶盐析蛋白质的沉淀方法1盐析 2加酸或碱沉淀蛋白质 3有机溶剂沉淀蛋白质 4重金属盐沉淀蛋白质 5生物碱试剂沉淀蛋白质 6抗体对蛋白质抗原的沉淀 2.5.1.3 蛋白质变性与复性（一） 蛋白质变性 定义：天然蛋白质在变性因素作用之下，其一级结构保持不变，但其高级结构发生了异常的变化，即由天然态（折叠态）变成了变性态（伸展态），从而引起了生物功能的丧失，它的物理、化学性质也发生改变。这种现象被称为变性（denaturation）。 引起变性因素：物理因素和化学因素。 变性表现： 1物理性质的改变：溶解度 2化学性质的改变：易被蛋白酶消化 3生物功能的改变 变性机理：破坏了蛋白质分