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1、大量提取质粒DNA (CsCl密度梯度离心法)来源:2011-6-9 访问量:3520评论(0)分享1大量提取质粒DNA(CsCl密度梯度离心法)2010-7-7大量提取质粒DNA(CsCl密度梯度离心法)李渊越预约摇床、超速离心机。配TB培养基(1L锥形瓶中装250 ml培养液),并灭菌。质粒做好转化,并涂板。第一天早上,往TB中加入适量的Amp或Kana。挑菌,37 C摇床培养24 h,至OD600 到 10-15。检查以下药品:25% sucrose in 50 mM Tris-HC(pH8.0) 250mL、lysozyme 粉末1g、0.5 M EDTA(pH8.0) 50mL、RN
2、ase A(100 mg/ml) 150uL、Triton-lysis100mL、PEG8000300mL、 1xTE150mL、CsCl250g、正丁醇2 瓶、EB2mL。第二天早上,把菌液倒入离心瓶中,用Beckman J6-MI离心机以4,200 rpm, 20 min离 心。离心后,把上清倒干。在离心的时候,配Lysozyme 25mL。并将RNase置于室温。弃上清,以 20ml 25% sucrose in 50 mM Tris-HCl (pH8.0),重悬至菌完全分散。加入4ml新配制的lysozyme-EDTA-RNase溶液。混匀,室温静置10 min以上。在静置的同时,准备
3、好高速离心管,往里面各加入5ml Triton-lysis。将lysozyme-EDTA-RNase-DNA溶液倒入高速离心管中,使用JA-30.50 Ti转头, 100,000g, 15min。将上清倒入新管中(不要把沉淀倒出来),加入PEG8000使总体积至50mL (1/2体 积),颠倒混匀,于4 C中放置2h以上(过夜更好)。4,000 g 5 min,去上清,加入8.5ml TE,溶解至无沉淀。加入11.00 g (要精确到小数点后2位,便于配平)CsCl,溶解完全。在超离管中用200ul枪加入100ul EB(2mg/ml),将溶液通过20mL 一次性注射器移 入超离管中,用TE将
4、液面补平至近管口。补加TE至液面到超速离心管管口。称出每管重量,配平,封口。任选以下一种条件在20C下进行密度梯度离心:转头转速时间Type 70.1 Ti 70,000rpm 20hNVT65 60,000rpm 16hNVT65 65,000rpm 8h灭250mL以上的超纯水,并配好至少500mL灭菌水饱和正丁醇。超离后,取样品,用5 ml注射器加上12#针头,抽取EB带,(离心完可见两条EB带, 上面一条细浅的带为断裂的质粒DNA,应抽取下面一条粗浓的EB带)放入50ml管中。以灭菌水饱和正丁醇溶液萃取EB,直到溶液澄清无色。加入等体积TE (一定要加。若不加,在无水乙醇沉淀时,会沉淀
5、下部分CsCl)。加入2倍体积预冷的无水乙醇,混匀(如果不充分混匀,可能会导致离下的DNA是 透明的,容易随上清一起倒掉)。6,000rpm,20min,(注意方向)去上清(注意沉淀不会贴壁,不要倒掉)。加入450 pl (900ul)水,把50mL离心管平放(注意方向),溶解,直到溶解完全(约 需室温过夜)。用枪小心将液体吸入1.5mL离心管中(如450ul,可分成两管),加入十分之一体积的 3 M NaAc (pH5.2),再加入2倍体积预冷的无水乙醇,混匀,置于4C或-20C 15-30min。13,000 rpm离 心 10min。用1mL 70%预冷的乙醇洗沉淀一次,13,000rp
6、m离心10min。去上清,以1mL TE溶解完全,测定浓度。大量提取质粒DNA(CsCl密度梯度离心法)2010-7-7lysozyme-EDTA-RNase 溶液溶菌酶0.4 g0.5M EDTA (pH=8.0) 25mLRNase A (100mg/mL) 120uLH2O 25mL25%蔗糖:蔗糖25 g1 M Tris-HCl (pH 8.0) 5 ml过滤,加纯水定容至100 ml,置于4 C保存。0.5 M EDTA (pH 8.0):EDTA-Na-2H2O 186.1 gNaOH 约 20 g加800 ml纯水溶解完全后,调pH至8.0,定容至1 L,湿热灭菌,常温保存。Triton-lysis:10% Triton-100 5mL1 M Tris-HCl (pH 8.0) 15 mLH2O 100mL湿热灭菌,常温
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