三维荧光数据平行因子分析(PARAFAC)

1、 三维荧光数据平行因子分析(PARAFAC)基于Matlab子软件SOLO简介：Aqualog生成的激发一发射矩阵得到了充分的校正和处理，可以使用我们合作伙伴Eigenvector,Inc.的Solo软件包中的多元工具箱进行即时分析。本章解释与PARAFAC相关的操作，这些操作用于评估混合组件的因子和数量。本文描述PARAFAC工具，从导入文件开始，通过预处理和编辑数据、拟合和评估模型，以及生成报告。此外，我们还举例说明了如何使用分裂半分析验证函数比较数据集的内部一致性，以及如何评估总荧光的无效性来量化应用了EEM归一化的模型的分数。您可以使用Solo软件包，通过Aqualog软件的常规收集和

2、导出方案以及示例队列工具来评估数据。有关Solo软件包的理论和操作的详细说明，请访问/software/solo.htm网站。HULI$-1-fulvicacidTryptmph朋帕HUI-l$-3-t1CJnjicecldTyro&lne-liKe睥上的初d輩洒SIMCHO-IK曲5C550KfrMC-MMtK如IMOMK4X彳弹血*5SCExcitationwavelength(nm)VVavelengthi(nm)Fig.7Spectralpropertiesofthe4fluorophoresidentifiedbythtPARAFAC第一部分：使用PARAFAC注意:虽然理论上您可以

3、尝试使用PARAFAC分解包含许多组件的混合物，但HORIBA建议实际最多只能分解六个组件。1启动PARAFAC建模方法1.1在主机桌面上，双击Solo+MIA或Solo图标。软件可能需要一段时间来加载。耐心等待，直到Solo+MIA工作区浏览器窗口出现:FiledrtViewAnalyze-HelpFigEraserNewJenciDnl医罔HCUfTfirilFfrldfifD,Program口1口戸|!112品口rAnrrt詁nr站WCKitSpflWCurre-rrtWorkspaceVariablesUtlKVtluAAnalji?ToshTopics(doubterdkktoope

4、n)白奄FAVORITTESirttingStarted:LDartaSrtEditorkUg-u-PCA-卩ri松亡和川Componefiit詮Ll*TrendToolIt：黛TOOLS団盘DECOMPOSTJON应HEGRESS-IDIVJS吊CLUSTERING压胡dASEiFICATlON由JCESIQWOFEXPERIMENTS辻BATCHANALYSIS宙手TRANSFORJM京BOTHEftg-THELPwHEIGENGUIDEWLIMEVIK05RMadelGachc理Cache:preferGATEVie*(*=NotAveaable)HSCffltliBSettingsan

5、dMir*:NdCachedBataAvailableEi2lDwtoDe/raXTEtGEMVEmORREWEAHUHM师POINTED1.2在分析工具区域，单击DECOMPOSITION打开副标题双击PARAFAC-ParallelFactorAnalysis开始分析StartingANALYSIS窗口暂时出现:然后Analysis-PARAFAC(NoModel窗口出现:0UIhamPrepcocessinj1LoadcalibrationdataCalibrateApply/Validate3.ChooseConView:aTat4eNumberCmpanenitBPerctniVnn

6、ancepluredPARaFajCModelF?的？wModslCdnmpareModelscakrMdelRebuildh1MMtdkmodelUs*Mwlel8.LoadTestData叭悯域HelppfnNfffhcrMt4珂44CViWTPy1(4阳04HfiniRBdMorirporlKInWBmodnPaneNiHherMunorarrtHelnDurrrerTltyludiM冏関曲肝ifflotfdQfrniOAKlH耳丹中IMFIcAdraMaCTMTFFileMTF)AITASFHI#(ASFAIF.BKHAJTPiONURA|(PDRAn$lytiiC4lSpedr#lO

7、pvicS.(ASD1IaJico(W#ndV7)EirukerQPUS-FileBrukerXRPDRawFileCRAW)CytoSpwrCYTFile(CYT1ENVIFormal(HDR)GramsThermoGalarbcFite(&PC.DHB)Gu-idedW-aveFileCSCAN.AUTQSCAN!-HrtachiEEMFikL-TXT)HORIBAR*fn*nFil#(LSS.LSM.NGS.NGC.TSf.TVf)MORIBAA-IEEM/Aqu#lQgPDATHORIBAA-IEEM/AqualogAtKorfaancrFiles(A1B5.DAT)JascoEEMI

8、File(CSV)JCAMP(&X.JDX.JCMLJCAMP)netCDFExjmfromMSS-oftwae(CDF)OmracrSPA轩怙(PA)2.2单击ImportData，子菜单出现。单击HORIBAAqualogFile(DAT文件类型SelectFiletoOpen窗口出现0707BLANK0718BLANKBLANK-12.4浏览并选择要分析的所有*.dat文件，然后单击Open按钮注意:您应该使用为示例Q方法输出文件夹分配的文件夹。注意:如果在这个文件夹中还Ft舷圉片J音乐宴面Windows(C;)Themes2019/9/411:312019/9/42?:512019/9

9、/422；30201/9/422皿2019/9/421;552010/9/421:432019/9/421r492019/9/421502019/9/421:502019/9/421:512019/9421:521-HORlBAA-TEEM/Aqua1ogt7打幵CQ有其他.dat文件（例如*ABS.dat）,那么单击右上角的搜索字段并输入*pam.dat。然后LoadingAqualogFiles窗口出现在LoadingAqualogFiles窗口完成后，EVRITip窗口出现。QEVRITipN,cvershewsgoin.(三三jCertaintypsofpreprocessingare

10、notcompalitilelAiithnwaydataandhavebeenremovedfromtheIbtofpossiblepreprocessingstepsforthecurrenldata昭Thistip网illbeshownonlyoncepersession)2.5点击OK.此时淡蓝色的X按钮变成深蓝色，您将在窗口左下角看到一条消息，数据已加载，但不存在模型”。pply/ValidateA葫buildMtodeBlAnalysisPARAFAC-NoModel)-MultipleAqualogFilesIA：甌80爆AnalysisFlowchartDllbr舐2Choose

11、PreprocessingVrewi3Cboos-eComponnlE-4BuMPfretntVthfACtCBpur*dbyPARAFACModalModlCcHnpareModels6ChangeCompownl&ckmod-tlUseModelflLodTes(DataDemoD4ldFrtC%ModtlJFrtt%d利Unique-FitC%X)DfllAhulxni邮*M闻nwdtl罄隔皿5dIhcprcTDCfungondodhcrflplwfliiAmPrei5ioc#s4*聞Tocb曲冋町aMcap削色4iweeltctasmWwer2nHie5taluspare味血cbjib

12、eviewedardedtedbycbckr*g(mifraTCandM*Yj&pn*茂Ofhpz-毋斗wji+gCacheNaCachedLFil.EditPrpFc*G-Anjly-GicIFL-tfincTgl石HlpFigBrowctr5QT*即cNumberCamponenti:-clcmod雷Iolernod*lC4km&d*lcalcEod.l在模型分析之前有一些操作。第一个推荐操作是依次单击Edit、Options、MethodOptions(PARAFAC)此时，InitializingOptions窗口将立即出现然后是Options/Preferences窗口Options

13、/PreferenceiResetUs#-Level曰Displayblockdltailsstandard曰AlgorithmEiconstraintsconstraints_Modlc-l1x1structconstraints_lModlZ1m1structcontriint1j1KHLructcam说明】FactoryResetOkCancel3.1在激发一发射矩阵(EEM)数据的并行因子分析中，必须保证三种PARAFAC分析模式都受非负值的约束。选择constraints_Model1，它对应于PARAFAC组件的得分。3.2单击lxlstruct获取constraints_Mode

14、l1FJOptions./PrelerencesUserLevelUserLevel3.3单击选项卡,然后InitializingOptions窗口暂时再次出现，然后Options/Preferences窗口发生变化,显示一个下拉菜单Constraints,type=unrestricted:BOptions/PrefererKesIUiserLevel日CDnstraintstypg|urKCiri&raiirHKjurKCirstrainednannegativityunlnwdalihiyuirftodality_noftohorthogonalftyeo-lumnorthagon曲It

15、ypeunconstrained-dounconstrainedfitofA,nQnniegatrvrty,-Ais创Imonnegative：uFiimodality-AuninrodalcolumnsANDfr&nntgfftivity；-Ais.Orthogond(A曲豐I)-,tolurnrwQrtlhQgrQnal,-Aha?QriJwDgonialt&lunh-l(AA=diagonal);unrrrtodaliiyiwriion1-A.hasunimodalcelumnsonly-nononneatkitykimposedFaeloryOkCancel3.4单击unrestric

16、ted以显示其他约束选项的下拉菜单。3.5选择nonnegativity。3.6单击Ok。3.7对constraints_Model2（对应于发射光谱）和constraints_Model3（对应于激发光谱）重复上述步骤3.1-3.5。3.8单击Ok关闭Options/Preferences窗口。4.数据前处理（RF1/RF2/Normalize）以下算法使用其他拉曼蒙版以及一阶和二阶瑞利线来编辑蒙版区域。此方法对于处理溶剂与折射率不匹配的实验数据也很有用。点击Preprocess一X-blockCustomblockLoadPrepwcesuniHumtierCarV-blockClutLc

17、rAna1yiil-PARArACJ4oModel)-MultipleAq呵ogFFiltEditRefineloo-liHdpFig&rov*serCmtaiTL.PlotData石口何込丄阳倉?FepraewlData*Auta&caileZetCurrentAxDefauh1忡口fitMnCenterPreprocessingX-block窗口出现。Q怕pr&acG怦X-HecfeAnAlttbl4riansJirTunohs-AMniiiA也附JLIPiR申:卒CmiwTi-i5nw55iQn山F山呷一B50infrAuloic艸臣引料曲Lsnl別討9皓5”ElMftbntiAiiia

18、mMC丹hak*FttotEEMF蚪护耐MDifTUhzNiEMSC(mnnlM9C(nwiafi：HSf-UlJAaDlankSutjli日亡Lidr*!.(flO-ftB)仃Half-WidthVFirstOn&rRsyleihF毗即16(nmn)jSgiCndOrderRayfleighFitLr32(nmrRanterFifftgr(1st&2ndCnm)RamanShift.:3332(l/cm：1SiOrderShift)|1JUBIJBUUHBBBHBIIIIII11II|J1RepteceWith-IMiarigValues；LskwZsr4.zoratoub-Rdyleigt

19、iwaoilfl-ngllif：OK匚呂HelpFirstOrderR旳他ghFilter了SecondOrdfRayleighFiller我RanunFilerHaWdthW(nm)20(nm)ioo)dRamssiStirfl:332(1/crft)LovlZemAssignzerolasuti-Rayl&ighwaMdengths/IJz叫Halp选择激活：FirstOrderRayleighFilter,SecondOrderRayleighFilter首先FirstOrderRayleighFilter设置为16nm(5nm),这个值需要等于或超过Aqualog实验中选择的瑞利掩蔽值

20、。SecondOrderRayleighFilter设置为32nm(10nm),这个值需要是一介瑞利蒙版值的两倍。对于“Replacewith”：选择“MissingValues”。可以尝试内插值替换，以确定哪个函数提供最可靠的拟合和验证。对于“RamanFilter”，请使用默认的3382cm-14.4当所有需要的过滤器都设置正确，点击OK，EEMFilterSettings窗口关闭。注意:激活这些屏蔽过滤器适用于您选择的整个数据集，而不仅仅是窗口中可见的图。4.5在可用方法列表中，双击Normalize以显示NormalizeSettings窗口：4.6点击OK您已激活的筛选器现在出现在列

21、在PreprocessingX-block窗口右侧的SelectedMethods列表中。单击OK,运行Fliters,PreprocessingX-block窗口关闭。定要检查确定按钮和不关闭窗口，因为预处理将不应用。5.编辑校准X-block数列5.1右击蓝色键CalibrateX-blockM血0；匚-PARAIFAC(NoModuli-MukiplaAqulocjFilrcFileEdtPveproc&5AnalysisRefineToolsHelpFiQBfOfcV&er軀囲鱼I曲l匚harXDeliaha;&besnioa-dedbulnomaetlaastaSetttieprtp

22、rDCEismqandalheroptioria(frc-mlneFrepracfi-siEindTc-Dtemsrua)dndlcaltralie-enuhUElickcknnI/nJieriEcnintheSilutmpan).Etoiacurheviewedurdedr-dtrycbckngcneTandktiricf-naLoadDataImportDataNewD-3133PlotD2aLitj*EditlataTransform匚re-ateFromX匚口lumnsVSplrlintoCalibrationALjgnuent諒曲VelidatoflSaw-coke口del-calc

23、model-calcmodel-call：model-calcmodelAnatys-is-IPlawchart1Loadcshbrsliondata2ChcosePreprocessing3ChooseCurnponents4BuildModelRgyiewModel5.FZ的庖卅Campana6-ChangeGamponents7.RetwildModelUseMchAbIBLoadTs-sl:&ApplModel困Cschepb3CacheSetting.工NoCachedE田曰DemoData5.2下拉菜单点击EditData，会打开MultipleAqualogFiles-DataS

24、etEditor窗口，显示Data标签。5.3点击Mode3Labels5.4在这个特定的数据集中，我们看到在240nm以下的激发模式下有很高的吸光度值。在这种情况下，我们通过取消选中“包含”中的复选框来标记此数据范围。（右边的一列柱方框）。5.5右击左边编号列中的深灰色区域，可以显示下拉菜单：5.6点击ExcludeSelected,所选数据现在将被排除在分析之外。注意，数据仍然保留在数据集中。5.7重复上述步骤5.3-5.6以排除模式2标签中的数据（发射轴）和模式1标签（已加载的数据集）分析。5.8点击File-close或者右上角关闭，来关闭MultipleAqualogFiles-Da

25、taSetEditor窗口。6.选择“组分”数量6.1我们在本次模型中选择4个组分，输入到NumberComponentsfield中:除了上述两步(6.2和6.3)之外，还可以双击与要建模的组分数量对应的行。耐心等待。iMlir-jXn:;hr”：Mrcs252.U-i=.Z!_i.Dr-ii.IiIjiL-2:iS-Frt-ZIi-I7.rp=.?：ih“IApfl/VaidaftIWnuiRCtlkbaiTi丄uk.ErjandaljiApjlJfr/VJij-daEiaEffllihraf:!:旳RfiMtMiHMUktRflHi戲MmIeI*亡Mo阳8I口JdTHh!口“Aruiii

26、ijEHewLk-tiflrtS沁WFjiJACJ.wn|Cmhr:ftwiIIiNIAlJfrVni*vhHibend*；i#a*E2DemnDrta主hWlipNgdl旳Filb5OkawCoopHitJkLKjiuEiftFt1SDe1VIO8i:epBv-flJbyMHiFiClicce*runfcIlknit4diki,iis4d:ikrnMiiIlkmrfdiakmi*l:ikrnNrliah*e由时ilkm?4dM4MWEZh、屈十血屯yM岁I：屮Kas险ijLIS6畔削油“MilMHr3.Lu&SACneMWinff*iE出firproctflfralyuchmJooia|ft

27、pligAiPVM!Youcanviewdetailsbyclickingdie5.ReviewResulltsbultunhorbyulicjkintheViewhlOdelDetailsbutlun6ii)tlietoolbiir.-icwruiiLAaL.-.er-畅|二.*.1BEt5呷记谄trAJQ.Dbi(|MutipliAqualFitaRLkiquc注00?VKRi|,4lUarl*j,i21-9121JWL!JSll.PRtftUuiniJn-i9J3l.曲ITIL8.1可以通过单击5“査看结果”(ReviewResults)按钮查看详细信息，或单击工具栏中的“查看模型详细信

28、息”(ViewModelDetails)按钮。图1:PARAFAC窗口显示每个图的缩略图:1.参数(Parameters)1.1LoadingM1加载ScatterM1散射InfluenceM1影响Variationpercomponent每个组分的变化2.残差Residuals2.1ResSumSq.M1ResidualNormalProbability残差正态概率2.3Averageresiduals平均残差Residual残差3.Data4.辅助Auxiliary4.1CoreConsistency核心一致性可能要查看的最佳参数集是“参数”(Parameters)列中的“加载Ml”(Lo

29、adingsM1)。这些分数与每种成分的浓度成正比。在此数据集中，这些成分已被识别为绿色的酪氨酸样成分，红色的色氨酸样成分，蓝色的黄腐酸样成分以及蓝绿色的腐殖酸样成分。8.2左键单击左上方“加载Ml”(LoadingsMl)缩略图中的白色背景，以查看“加载”参数的连续缩略图(M2,然后是M3,然后再次是Ml)。Left-clickonlhewhitebadkgroutidintheLoadingsM1thumbnailintheupperlefltoviewsucccssiviEthumbrKiih(M2.,thenM3hthenM1again.)oftheLoadingsparameter.

30、同样，左键单击“参数”(Parameters)列中“散布和影响”(ScatterandInfluence)缩略图中的白色背景，然后在残差列(Residuals)单击Res.SumSq.Ml,将在相应的M1，M2和M3缩略图之间切换。8.3右键单击任何缩略图中的白色背景，例如“加载M1”(LoadingsMl)，以在单独的窗口中查看图形的放大版本。右键单击时，将显示“此图在单独的窗口中”(Thisplotinseparatewindow)消息：Right-clickinthewhitebiickgrucndinanythumbnail,forexampleLoadingstoewanenlarg

31、edversionofthegniphin臥separatewindow.Whenyouright-click,tkeThisplotinseparatewindowmessage8.4单击该消息以打开可见的图和随附的“图控件”(PlotControls)窗口作为单独的窗口：加载M1的放大图显示了四个成分的得分与样本数量的关系。ISV羣丄|L2；I旳8.5在“绘图控件”(PlotControls)窗口菜单栏上，单击“View”。8.6单击“表格”(Table)以显示绘制数据的表格。OntliePlotControlswindowmenubarclickView.ClickTabl-frtosh

32、owa.tableofthe_-plotteddata.-_PkytCorrtrIVpcwPlolfigttnovw*,_TabicXSampINumbEn-LabelsCtrl*TCf-JCtri*LClassesEKdludedDftaCtdl*-ECcirnpraGp5DeclvtterL曲亡IfCtri*ICICui-APlotAiisLinesDiagonal111lineAuto-ScaleCtiri-FAdjuistAwesSubplotuplicntcFigureCtrf*CDockContrals百etting“161.2198412S03EG21.37505329B7E-0

33、Joisisogs-STiE-osm.dL62692553L-039.12S44412924E-031.017745006956E-029.S555129121E9E-039.74B0967O6E2E-C31.4020511165E-021.Q6483517S191E-02l.C9S396?iC5E-021.3712G5L5jE-021.292：436531：-021.255Q652fi71BE-02111S2347479E-O21.355065.3a65E-0ZL.4O2D95557QO41-021.3636e2SS793E-021.391931153B6E-021,36509526270-

34、02l,27il0231112E-02lS31115O7543E-021,47521132893E02i.3609L4339B2E-02=954453.7756271.104267=5.673H-G075.531H20319269259rZ19Q3905,952306311.1959733.079994764.24278687raPlottedUa?aFtltEdit出ewFigBrowExaminetheCoreConsistencythumbnailinliteAuxiliarycolumn.Threecomponentstogethermakeup100%ofdiemixture,wit

35、hnolinexplainedleftovers,soitisagoodfit.Qpm1事弘A1W：违idAquittjifctoaH9ldBiipdivdAuwiiarvP-aranielerwIhitaConrlDnsMencf!5科厲hiRaudMJiivEftIA和邮甘AJ-、”:包2D置信区间为绿线(95)和红线(99)：9.3检查“辅助”(Auxiliary)列中的“核心一致性”(CoreConsistency)缩略图。三个成分加在一起构成混合物的100，没有无法解释的残留物，因此非常适合。9.4检查“残差”(Residuals)列中的“残差”(Residuals)缩略图。这些是数

36、据减去模F3twn、X,”一-,liudNjffdPiMjWf型的图，应该很好地拟合才能随机出现。Res.Sum.Sq.M1缩略图显示异常值。9.5通过单击右上角的=来关闭图1：PARAFAC(Figure1:PARAFAC)窗口。9.6要查看样本中的各个组件，请在“分析”(Analysis)窗口中单击“绘制2D加载曲面”(Plot2DLoadingSurfaces)按钮Toseeiheindtviduatcompartenuinthesample,intheAndyshwindowdiet血亡Plot2DLoadingbuttonFJAralyjis-PiSAtFiuC4trr-MuhipJ

37、eml旳HJk一凰融Jp细筐世i-亜IDIutEIjLcjidirigSuLBi&IiVtodeJCalibrate同时出现两个窗口：绘图控制(PlotControls)窗口加载表面(LoadingSurfaces)窗口grajrcwM-aid斜聲njlaLiunnitMJt；-Thcplotcanberotatedfo吕hewtheam,caxesviewsasseenintheAqualugyjiiphwnidcw.ByclickingonadiilerenicoiuponeiitinthePlotControlswiridow+youcun!*ccthtitcomponentviewin

38、thesximcurieiitatioai.在3D旋转(3DRotate)模式下，将出现3D旋转指示器。可以旋转绘图以显示与光谱仪图形窗口中相同的轴视图。通过在“绘图控制”(PlotControls)窗口中单击其他组件，您可以以相同方向查看该组件视图。xpcrtl-igijreSpawnSleitcViewMSPorntMSWordtpbc-ardOpisnfteportFolderDockThisWindowAJIFtgumQnAuto-dockLktfFiKiureCopyFigurePkflfSatMtfiijure-Them4用“廟讯世&wM!rFiauneThjmbndkHndFig

39、ureMLoadingSurfacesfile|Fig&rser|PldiGLO匸2加空U.UJThesefigurescunbeexportedinelvarietyofwaysbyclickingonFigBrowser,ExportFigureintheLoadingSurfaceswindow,and通过单击“图片浏览器”(FigBrowser),在“加载曲面”(LoadingSurfaces)窗口中的“导出图形”(ExportFigure),然后选择一个选项，可以通过多种方式导出这些图形。自动导出到MSPowerPoint或MSWord。通过单击文件，另存为(File,SaveAs)

40、，可以将图形保存为多种图形格式：ByclickingonFile,SaveAs.theplotcobesavedin討numberof事aptiic若Ifomuits:/ap*TL_OweJPnnrtFTcr.Ctd-P9.9通过单击右上角的互卫来关闭“绘图控件”(PlotControIs)和“加载曲面”(LoadingSurfaces)窗口。10.检验残差10.1在分析窗口中，单击PlotDataEstimateandResiduals按钮,Zmtyi5-PARAFAjE岔耳-Muhipk：AqualogFilesfileEdrtPiepmoewIWieTdAHb(pFgDrowvModel

41、p_I|/Auply/Yailidmag|TheDisplayDatawindow:DisplaaDispldf口耐JR&cimtnMledDLa(Z_has)Refill(Eord_uQn”Re匚DnstruclEdDdla(X_haAJRisiduti(EorQ_conjJT嘉iD耐凶CaneelCancel10.2选择要显示的数据，然后单击OK按钮。FittingPRARFAC的窗口会立即出现PlotControls窗口和Figure1:Data+DataEstimate+Residuals-PARAFACNcompMultipleAqualogFiles窗口会出现(N=组分数量)。默认

42、数据集显示在：Figurel,窗口显示的是PlotControls窗口的列表中的第一个。注意:单击(Figure1:)图1右下角的图标:工具栏以扩展工具栏用以显示更多的图标。XEntfsift(rfn|应iE!迹訓九佃咖*rg18*1?佃RQ01UrtyH_ft-li-innhiiir事口厂&dFileFqBiTT*rM-PiKXJ!昌也址述|紬匕竺玉印堅型莅壁鲨邂缠區0川BflRum丄；DadiC!iEatrnraRah-duu-P4RAF/E4ccnpMjLphAqjiiagG1?1dFTflTAAmTTIIPFM曲iWW450360300EKMafliwm250醫EdnAI沁邓S亡Iww

43、eTHMbwfiuticns10.3在Plot控件X和Y列表中选择set(s),然后单击Select按钮，图即可更改为所需的数据集。*10.4为方便查看，单击Figure1：图1右下角的图标,toolbar然后单击EditAllSettings按钮。初始化InitializingOptions窗口会即刻出现。随后出现Options/Preferences选项/首选项窗口。10.5将plottype更改为contour，然后单击Ok按钮。fittediocm:okirHrdunnuitirr凭*1啊2仃！nniik5vn*saliJDeFd-u：DfyOkJiul图即可切换到俯视图“topvie

44、w。Fiune1;Dabfl+Dab*E?naieu-dLMCPNb上MaT瓦L310.6通过单击右上角的红色X按钮来关闭PlotControls和Figure1:Data+DataEstimate+Residuals-PARAFACNcompMultipleAqualogFiles窗口。第二部分：执行对半分析(Split-HalfAnalysis)如果一个数据集中有四个以上的样本，可以使用此函数oPerformSplit-HalfAnalysis执行对半分析)即将数据集分为两个部分，并且将每个半集与另一个半集进行比较，也将每个半集与整个数据集进行比较。这是对数据一致性的检查。1将数据集加载到

45、PARAFAC窗口进行分析。数据集必须包含四个以上的数据点。2在PARAFAC窗口中，单击执行对半分析(PerformSplit-HalfAnalysis）按钮软件即会执行对半分析，PerformingSplitHalfAnalysis进程的进度条会出现Ii=E31PsrfarmngSplrlHaHICIdmIsCaiKcfl1当分析完成时，一系列的图表将出现在SplitHalfAnalysisResults分析结果窗口中相似性度量是检查每个数据集与另一个数据集的匹配程度的参数。在这里，相似度是97.6%。第三部分：总荧光TotalFluorescence在PARAFAC中，我们已经标准化了/

46、归一化数据集。现在我们回到(TotalFluorescence.)总荧光。1编辑数据VmwtLthodPrepnaceLnUlOCilfM/Lnal/iisPAilAFAC啊口ModelMultiple山quaiogFitetftrfineToolsHelpFijBrpwrrtpr-occss|ArwlysisIPKatPreprocKsedDatzsI*feBr&advlSavePrcfiHScesiedDataCIUlTtfCuDn.CunrwrtAsD卅ult1.1单击菜单栏中的Preprocess,将出现下拉菜单1.2单击X-block,子菜单出现选择Custom.Preprocess

47、ingX-block窗口即可出现在SelectedMethods列表中，选择Normalize.1.5单击Remove按钮，则Normalize已从SelectedMethods所选方法列表中删除1.6双击EEMFiltering行，显示了EEMFilterSettings(EEM过滤器设置)窗口:8600400SODCancelMissingValuesBlankSuWraction3332(1/cirn.1stOrderShift)300ReplaceWithMissingValuesFirstOrderRayleighFilter|SecondOrderRayleighFilter.IR

48、amanFiller(1st&2mdlOrderRamanShiftLdwZeifl-阳豊IE(nm)20J32伽）ID.J10nm)Half-Width1.7单击缺省值MissingValues以显示下拉菜单.1.8在菜单中选择InterpolatedValues（插入的值EEMFilterSettnnqaOKJCancelHekp1.9单击OKPreprocessingX-block窗口即会出现Lfcaw-,-Li*Piferi6EMFmnfltlZlKMLRBOfl*aQl.bp叫nirLogiS-x：M心琢ffhMCTKWF卞屮也話更出盼亦黑JraiHU-=R*wPWt-m-H4).聞

49、WMEutouFFMl.io单击ok保存预处理数据2.1在菜单栏点击Preprocessed，出现一个下拉菜单。HAnalis-PARAFA匚(No-IModll-Multiple-AqualogFilesAleEditPreprocessAnalysRefineTools-HelpSgBrcwrs*X-clockY-HockCluttrrPlotPneprarestedData11Apply/VslidaiteCdbZi口nAnelya-ia.Flowchart1.Lkm)calibratondata2ChoosePreprocessing:gentryxDAIti-8CacheSettin

50、gsan由ODemoDzrta6HumbcranPreprocffSiedC)ata，X-blarkPcnccnlVangnceCophiV-block3ChooseComponents4BuildModelReviewModelKtUrC96Model)簟balid吕：ionX-block乩RevimResulte-Y-blockralemod?lc-alc-modelcacmodelCompareMedelsBChange匚口mponentscjIcmodel7RebuildModelcakmodelUaeModelitem:PARAFACitem;Multipleitem:PARAFAC

51、itemsMuldple.8LoadTestData9.AppJyModelToFileRefreshHelpSaveIDabsnas-brenlDae-dbutnomD-delFJtntx.SetthHproprccesungan-dotheropbons(fromihePreprcces&srniTa&ls-iTieiiusiandlcBibraiearrcdel(dickanHodlericuninBig伯I咱pane)D1bcan网弼用駅Jerndedl耐叩det.insDntnbXarKjjcrrmn寻选择SavePreprocessedData，出现一个子菜单。选择X-block。

52、Save窗口出现:重整数据。3.1在Solo_MIA工作区浏览器的右上方面板中，双击MultipleAqualogFiles。DSolaWorkspw?Br3wwrXReEditVivwArLfllte斤gBi曲NewVerMn1qlanifqCunwr*Fdar靖土取或1.55戸致妊“矽浜EXfSitSaPgJMlDdfil”ifi*旳siwT口口1$Topks-idmibleclicktoopen_lXFAVORITES0MaSetEdilor*Gttt两SiMedPCA-PrincipjilCcmprarberftArlyss-tfrTre-ndTm4eiXtocxs-I&DECOMPQSTlO漏沾M-aurHy-MCR.-MuHivariate-CurveRewlutioriPaRAKAjCPrJIdFadoArilysisiSPCfl-站rcipilAalyGEUSIMPLISMA-Purrty-REGRESSIOMCLU&TEAiMClASSlflCATiOlMDESIGNOFEXPERIMENTSSATCHANALYSISTRANIFORMWorkspace(CuirFtfll；Works.pactVuriffehfllaBjtIi-e!(1时4丄.1啊卩订書CllEKhlfliJata