生物化学生化amino

1、胺 基 酸 1 胺基酸基本構造 2 胺基酸分類 3 胜肽 4 胺基酸的離子性質：4.1解離度 4.2等電點一級構造蛋白質的四級構造四級構造二級構造三級構造Nelson & Cox (2000) Lehninger Principles of Biochemistry (3e) p.129胺基酸COO-R group胺基酸基L-Form Amino AcidaH = GlycineCH3 = AlanineH N3+HJuang RH (2004) BCbasics胺基酸有鏡像異構物aa鏡 像化性相同、物性 (旋光度) 不同立體構造不同 (算是異構物)Juang RH (2004) BCbasi

2、csLeuL-C-C-CONH2-C-CONH2-C-COOH-C-C-COOH-H-CH3-C-OH-C-SH-C-C-S-CPPro-C-C C N N+ -C-C-C-C-NH3+-C-C- -OH-C-N雙和線環狀線中央線南港線中山線西北線AliphaticAmideAcidicImino,CircularBasicSulfurHydroxyAromatic-C-C-C-N-C-N N+= C-C-C-C C-C-C-C C C-C C C C HN C-COOH a-C-C OHGlnQAsnNAspDGluEPheFArgRLysKHisHGlyGAAAlaVValI IleYTy

3、rSerSThrTMetMCysC 胺基酸地下鐵道圖 TrpWNon-polarPolarJuang RH (2004) BCbasics OHPOLARNON-POLARTyrHisGlyAcidicNeutralBasicAspGluGlnCysAsnSerThrLysArgAlaValIleLeuMetPheTrpPro胺基酸的極性分類極性或非極性，是蛋白質性質之所繫。Juang RH (2004) BiochemistryGlyAlaValLeuIlePheTyrTrpCysMetSSStryer (1995) Biochemistry (4e) p.20各式胺基酸的大小樣式齊全雙硫鍵

4、劇烈轉折Pro CysSH CysSH Cys S Cys SCystineStryer (1995) Biochemistry (4e) p.25, 32兩種胺基酸對蛋白質構造影響很大CysteineBio-Lab 廣告 Cell 83 (4), 1995-+SS有大有小有正有負有極性非極性 形形色色的胺基酸側基 NH2COOH1NH2COOH2NH2C NCOOHOH21兩個胺基酸分子頭尾連接起來胜肽鍵 的形成脫水CarbodiimideJuang RH (2004) BCbasicsNCCHNC 胜肽鍵 雖是單鍵卻有雙鍵性質O 胜肽鍵 周邊六個原子在同一平面上 前後兩個胺基酸的 -car

5、bon 在對角 (trans)C胜肽鍵 的特性sp2sp2Juang RH (2004) BCbasicsp 軌道電子共振使 胜肽鍵 具雙鍵特性 HCCNCOJuang RH (2004) BCbasics兩 胜肽鍵 平面的交接點為 a-碳以胜肽鍵平面連接成多肽長鏈注意 a-碳上面接有各種大小不等的基團Mathews et al (2000) Biochemistry (3e) p.136單位小分子 N-C-C-N-C-C-N-C-C-碳為中心 N-C-C-N-C-C-N-C-C兩端胺基酸 N-C-C-N-C-C-N-C-C胜鍵的定位 N-C-C-N-C-C-N-C-C如何檢視一段 胜肽Jua

6、ng RH (2004) BCbasics 腦啡 Enkephalin (YGGFM) 代糖 L-Aspartame (L-Asp-Phe-CH3) 短鏈荷爾蒙 Oxytocin, Vasopressin 抗生素 Gramicidin S (含 D-amino acid)色胺酸 (安眠效果) Tryptophan麩酸鈉 (味素) Sodium Glutamate具有生理功能的胜肽或胺基酸胺基酸Juang RH (2004) BCbasicsH3N+ CH C N CH C O CH3COO-CH2OOCH2HL-Aspartyl-L-phenylalanine methyl esterAspartameCampbell (1999) Biochemistry (3e) p.95阿斯巴甜腦啡與其受體結合後可以產生鎮痛效果麻啡可以模擬腦啡的作用因此有類似的效用牛頓雜誌 (1991) 第 164 期, p.48-49麻啡