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文档简介
1、内参基因的概念和作用内参即是内部参照,它们在各组织和细胞中的表 达相对恒定,在检测基因的表达水平变化时常用它来 做参照物。其作用是校正上样量、上样过程中存在的 实验误差,保证实验结果的准确性。借助检测每个样 品内参的量就可以用于校正上样误差,这样半定量的 结果才更为可信。一般要选择一个在处理因素作用的 条件下不会发生表达改变的基因作内参。在进行基因研究的过程中,实时反转录PCR也和传 统的mRNA定量方法如Northern b lot技术等一样, 要求使用参照基因以校正转录效率和cDNA用量,弥 补制备过程中样本纯度和浓度的差别,使不同样本之 间目的基因的比较成为可能,以期获得真实可靠的结 果
2、。大多数分析方法中这些差别可通过与内参照比较 处理消除。最普通的内参照是内源性参照基因,也叫管 家基因。管家基因:又称持家基因(house-keeping genes) 生物体各类细胞中都表达,其产物是对维持细胞基本 生命活动所必需的蛋白质编码的基因。如微管蛋白基 因、糖酵解酶系基因与核糖体蛋白基因等。是为维持 细胞基本生命活动所需而时刻都在表达的基因。管家基因表达水平受环境因素影响较小,而是在 个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续 表达,或变化很小。它的表达只受启动序列或启动子 与RNA聚合酶相互作用的影响,而不受其他机制调 节。管家基因高度保守并且在大多数情况下持续表 达,因此管
3、家基因常被用于分子技术一多位点基因分 析内参基因通常是各种看家基因,在细胞内组成稳 定性表达,有助于保持细胞的功能。理想的内参基因 应该满足以下条件:1,不存在假基因(Pseudogene), 以避免基因DNA的扩增;2,高度或中度表达,排除低 表达;3,稳定表达于不同类型的细胞和组织(如正常 细胞和癌细胞),而且其表达量是近似的,无显着性 差别;4,表达水平与细胞周期以及细胞是否活化无 关;5,其稳定的表达水平与目标基因相似;6,不受任 何内源性或外源性因素的影响,如不受任何实验处理 措施的影响.近年来的研究发现:这些常用内参基因均存在缺 陷,在不同类型的细胞和组织细胞增殖和器官发育 的不同阶段体外培养各种实验条件等情况下它们的 表达量通常变异较大。正确的选择内参基因,很大程 度上依赖所研究的细胞或组织,不同的试验需要寻找 适合各自试验体系的特异性稳定表达的内参基因。然 而,合适内参基因的选择,需要在各种类型的细胞或组 织和各种试验条件下进行比较选择。理想的内参基因 应在各种试验条件下,各种
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