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文档简介

1、植物病原细菌学实验分析实验一植物病原细菌常用培养基 的制作与灭菌1.了解细菌培养基的种类; 2.掌握常用细菌培养基的配方和制作方法;。一、实验目的 二、实验内容和操作方法 (1)配方:牛肉膏3,蛋白胨 10,NaCl 5,琼脂 20,蒸馏水 1000 L。(NA):分离和培养最常用(2)配制过程:将牛肉膏、蛋白胨、 NaCl 溶于蒸馏水后,调节,加入琼脂溶化后分装于三角瓶和试管。(一)培养基的配制2. Hugh和Leifson(HL)培养基:细菌的好氧性和厌氧性测定蛋白胨 2.0 g 氯化钠 5.0 g 磷酸氢二钾 0.2 g 琼脂 3.0 g 蒸馏水 1000.0 ml 溴百里酚兰(酒精溶液

2、 1.5 ml)待培养基融化,并调pH后,装于试管中,每支试管装9 ml 灭菌。培养基凝固后,用接种针蘸细菌悬浮液针刺接种,一直刺到管底。分别在培养2、4和7 d后观察记录。 好氧性细菌,只在开管的上部生长;兼性厌氧性细菌,则在开管的上下部都能生长;厌氧性细菌,则只能在开管的下部和闭管中生长。(1)配方:NH4H2PO4,氯化钾0.2,MgSO4.7H2,蒸馏水1000 L,溴百里酚兰(1.6%酒精溶液)1.5 mL; 1%碳素化合物。培养基:碳素化合物产酸试验 单糖(葡萄糖、半乳糖);双糖(麦芽糖、乳糖);多糖(淀粉);醇(甘露醇)。 有的细菌不产酸和气,有的只产酸不产气,少数植物病原细菌既

3、产酸又产气(3)分装:将上述培养基分装于试管中,每管10 mL左右。如果测定气体产生,加上杜氏发酵小玻管后灭菌。产酸时培养液变黄,产碱时变蓝,产气则小玻管内培养液被部分排出,出现空隙。(2)配制过程:将NH4H2PO4、氯化钾、MgSO4.7H2O溶于蒸馏水,调节后加入溴百里酚兰,最后加入碳素化合物(也可分别灭菌后加入)4. MR和VP试验:对葡萄糖的分解能力(1)配方:蛋白胨5,葡萄糖5,磷酸氢二钾5,蒸馏水 1000 L。(2)配制过程:将蛋白胨、葡萄糖、磷酸氢二钾溶于蒸馏水,调节 ,每管分装5mL即可。5. 硝酸盐还原(1)配方:硝酸钾1.0,蛋白胨5.0,酵母膏3.0,蒸馏水1000L

4、, (2)配制过程:将硝酸钾、蛋白胨、酵母膏称好后,溶解于蒸馏水后,调节 pH。6. 半胱氨酸培养液:测定产H2S能力(1)配方:蛋白胨10,硫酸钠0.1g,g,蒸馏水1000L。(2)配制过程:将半胱氨酸、蛋白胨、硫酸钠称好后,溶解于水中,调节 即可。7. 吲哚试验(1)配方: 蛋白胨,磷酸氢二钠,葡萄糖,蒸馏水1000L。(2)配制过程:将蛋白胨等称好后,溶解于蒸馏水,调节即可。8. 明胶液化g,蛋白胨5.0,明胶10-12%,蒸馏水1000L。(2)配制过程:将牛肉浸膏、蛋白胨溶解于蒸馏水中,调节后,将明胶溶解于此溶液中,即可分装于试管中。 9. 淀粉水解试验(1)配方: 牛肉浸膏3.0

5、 g,蛋白胨,淀粉1.5 g,琼脂15-20 g,蒸馏水1000 L。(2)配制过程:将牛肉浸膏、蛋白胨、淀粉称好后,溶解于蒸馏水中,加入称好的琼脂,待融化后调节。10. 石蕊牛乳反应 (1)配方: 脱脂牛乳1000 L , 石蕊液(4%)15-20 mL。(2)配制过程:提前配制石蕊液(二)培养基的灭菌 上述培养基应按培养基配方中规定的条件及时进行灭菌。普通培养基为1212030min,以保证灭菌效果和不损伤培养基的有效成份。培养基经灭菌后,如需要作斜面固体培养基,则灭菌后立即摆放成斜面,斜面长度一般以不超过试管长度的1/2为宜;半固体培养基灭菌后,垂直冷凝成半固体深层琼脂。明胶培养基灭菌1

6、2-15分钟。石蕊牛乳培养基间歇灭菌3次,每次通蒸汽20-30 分钟。灭菌方法 灭菌是指杀死或消灭一定环境中的所有微生物,灭菌的方法分物理和化学灭菌法两大类。本实验主要介绍物理方法的一种,即加热灭菌。 加热灭菌包括湿热和干热灭菌两种。通过加热使菌体内蛋白质凝固变性,从而达到杀菌目的。高压蒸汽灭菌法 高压蒸汽灭菌用途广,效率高,是基于水的沸点随着蒸汽压力的升高而升高的原理设计的。当蒸汽压力达到2时,水蒸气的温度升高到121,经2030min,可全部杀死锅内物品上的各种微生物和它们的孢子或芽孢。一般培养基、玻璃器皿以及传染性标本和工作服等都可应用此法灭菌。 操作方法和注意事项如下: 加水 打开灭菌

7、锅盖,向锅内加水到水位线。注意水要加够,防止灭菌过程中干锅。 装料、加盖 灭菌材料放好后,关闭灭菌器盖,采用对角式均匀拧紧锅盖上的螺旋,使蒸汽锅密闭,勿使漏气。 排气 打开放气阀。用电炉加热,待水煮沸后,水蒸气和空气一起从排气孔排出,当有大量蒸汽排出时,维持5min,使锅内冷空气完全排净。 升压、保压和降压 当锅内冷空气排净时,即可关闭排气阀,压力开始上升。当压力上升至所需压力时,控制电压以维持恒温,并开始计算灭菌时间,待时间达到要求(一般培养基和器皿灭菌控制在121,20min)后,停止加热,待压力降至接近“0”时,打开放气阀。 注意不能过早过急地排气,否则会由于瓶内压力下降的速度比锅内慢而

8、造成瓶内液体冲出容器之外。 干热灭菌法 通过使用干热空气杀灭微生物的方法叫干热灭菌。一般是把待灭菌的物品包装就绪后,放入电烘箱中烘烤,即加热至160170维持12h。 干热灭菌法常用于空玻璃器皿、金属器具的灭菌。凡带有胶皮的物品,液体及固体培养基等都不能用此法灭菌。 1 细菌(NA)和真菌(PDA)常用培养基的配方和制 作过程有何异同点?2 试述高压蒸汽灭菌的操作方法和注意事项。三、作业实验二 植物病原细菌的分离 和致病性测定二、实验内容和操作方法 (1)首先要选择典型、新鲜病组织;(2)以灭菌剪将病斑剪下,略带健康组织,大小约1公分左右,放在灭菌载玻片中央,加无菌水1d。加上灭菌盖玻片,静置

9、约10min左右,观察是否有云雾状自破口处涌出(一)细菌溢现象观察 (1)斑点型:如棉花角斑病。A. 剪取新鲜的典型病斑,约1cm见方。(二)植物病原细菌的分离1. 细菌悬浮液的配制(不同症状类型分离材料的选择和表面消毒)B.表面消毒:将切取的组织块在70乙醇中浸一下立即取出,然后用表面消毒剂进行表面消毒,可以采用升汞,152min或的次亚氯酸盐如漂白粉(1:9稀释液)2minC.消毒后用灭菌水洗涤3次,将病组织放在另一个培养皿的灭菌水中,剪破中心或以灭菌玻璃棒研碎病组织静置2030分钟,等细菌游出。(2)萎蔫型如茄青枯病将茎部剪成12寸长,表面用70酒精轻拭,在火焰上表面消毒,以灭菌刀纵剖,

10、选择轻微变色病部,以灭菌刀切出薄片或以解剖针挑出病健交界处组织(可以不再消毒),加灭菌水浸泡20-30分钟。如果茎部较粗,也可以在表面消毒后用解剖刀横断茎部,用夹子或手紧压茎部横断面,挤出溢脓或汁液。(3)肿瘤组织 软瘤比较容易分离;木质瘤可以磨碎后接种在向日葵、番茄等幼株上长出瘤后再分离。由于细菌位于表皮细胞和木质部之间,因此应用酒精棉花擦拭表面,在火焰上表面消毒,再在灭菌皿中实行解剖后以灭菌玻棒将其捣碎,静置浸泡24h。 (4)腐烂组织较简单,选择近病部交界处以接种环挑取少量腐烂组织,稀释。(5)种子带菌的分离选择病种子,以0.1升汞液表面消毒12min,灭菌水洗涤,再将此种子在70酒精中

11、浸几分钟,洗涤23次,取出放在研钵中磨碎,离心取上清液。 2. 分离方法A.倒平板:注意培养基的温度不能太高,否则冷凝水太多,细菌在水中游动而影响单个分散菌落的形成。 (1)平板划线分离法:被普遍采用B.用接种环蘸取上述配制好的菌悬液,在已凝固的平板培养基表面划线 如果菌液浓度大,培养皿转动角度减小,增加划线的次数划4条线后,将接种环灭菌,培养皿转动90,从第2条线开始划45条线(2)培养皿稀释分离法0原液1取1环菌液0.5L灭菌水2混匀后取1环3混匀后取1环4混匀后取1环5混匀后取1环3.培养一般放置在 2830温箱中倒置培养,时间23 d。将冷却至45左右的培养基倒入装有稀释菌液的培养皿中

12、,轻轻转动培养皿,使菌液和培养基混匀,待其凝固后培养。4.细菌的纯化 挑取分离出的典型单菌落平板划线培养(2皿),如此重复12次,最后,在均匀一致的平板中,挑取典型菌落移植在斜面培养基上培养,长成后在4环境中保存菌种。1. 配制107-108CFU/mL的细菌悬浮液,菌龄48小时左右;(二)致病性测定 2. 指示植物的选择:一般用烟草,在假单胞和黄单胞菌属上较适用。3. 接种方法:用注射器将细菌液从烟草下表皮注入叶肉细胞间。用灭菌水作阴性对照,同属HR阳性的菌株作阳性对照。4. 培养条件:接种后的植物应保持在25,相对湿度较高(85%)的条件下。5. 结果观察:在2448h表现枯斑为阳性反应,

13、3d左右出现黄斑为阴性反应。三 作业:1.简述本实验中植物病原细菌的分离步骤及其操作注意事项2. 烟草过敏性反应试验能够确定细菌的致病性吗?为什么?实验三植物病原细菌的形态观察1.了解革兰氏染色鉴定的快速鉴定方法;2.掌握革兰氏染色和鞭毛染色的方法;3.掌握细菌培养性状的描述特征。 一、实验目的 二、实验内容和操作方法 (一)革兰氏染色 (1)试剂A. 结晶紫草酸铵染剂:溶液:g,酒精(95%)20mL 混合溶液和,过滤,贮藏于试剂瓶中,24h后使用。溶液:g,蒸馏水80mLC.复染剂原液:番红O 2.5g,95%酒精100mL复染剂:原液10mL,蒸馏水90mLB. g,碘化钾2g蒸馏水30

14、0mL。 将碘和碘化钾在研钵中研和,慢慢加水并继续研和直至碘和碘化钾溶解,然后加水稀释到300mL,盛入棕色试剂瓶,放暗处备用。(2)染色程序A. 配制细菌悬浮液:菌龄16hB. 在干净的载玻片上涂片、风干,不要加热,然后在火焰上通过2次,固定玻片。C. 结晶紫染色1分钟,水洗数秒钟,吸干。D. 碘液处理1分钟,水洗,吸干。E. 用95%酒精褪色约30秒。水洗,吸干F. 番红O复染10秒,水洗,吸干G. 加1滴香柏油,在油镜下镜检,红色为革兰氏阴性菌,紫色为革兰氏阳性菌。2.氢氧化钾溶解试验(1)试剂:3氢氧化钾(2)方法:取12滴3氢氧化钾溶液置于干净的玻片上,用牙签取新鲜细菌培养物与氢氧化

15、钾混合,充分搅拌1020秒,如果液滴变粘稠并可拉出丝状物体,表示测试菌为革兰氏阴性菌,反之则为革兰氏阳性菌。(二)鞭毛染色(西萨基尔法) (1)媒染剂:单宁酸10g,ALCL3.6H2O 18g,ZnCL2 10g,g,60%酒精40mL 在研钵中加入酒精和上述各种成分,充分研磨后,再加入其余的酒精。使用前用蒸馏水稀释2倍,染色时过滤,滤液直接滴在涂片上。溶液:g,酒精(95%)10mL 溶液和分别配制后混合。溶液:苯酚(结晶)5g,蒸馏水95mL(2)染液:2. 染色步骤(1)载玻片准备:选用新的或没有伤痕的,先用洗洁精浸泡洗涤,用清水洗净后,再放入酸酒精(硫酸与酒精等量混合)中浸泡24-4

16、8h,取出后用清水洗净,再用蒸馏水洗,沥干水后,浸泡在95%酒精中备用。(2)配制细菌悬浮液,菌龄很重要,一般适温培养16-24h。用吸管沿试管壁缓缓加入无菌水5mL,静置30分钟左右,配成菌悬液。(3)涂片:取浸在酒精中的载玻片,在火焰上烧去酒精,平放,用吸管吸取细菌悬浮液(以上层为好)在载玻片的一端滴一滴,然后将载玻片稍稍倾斜,使菌悬液从一端缓缓流向另一端,使涂片自然风干。(4)媒染剂过滤后,直接将滤液滴在涂片上,处理5-7分钟(5)用水轻轻洗去染媒剂,甩去载玻片上剩余的水,在空气中干燥后,再加苯酚品红染剂染色5分钟。(6)水洗,在空气中干燥后,加1滴香柏油,在油镜下观察鞭毛的数量和着生位

17、置。1.革兰氏染色反应和鞭毛染色在植物病原细菌鉴定中有何作用?为什么?2.细菌鞭毛染色对菌龄的要求比较严格,在操作过程中也要注意动作的轻柔,为什么?3 观察和记录NA平板上的细菌菌落性状、菌体形状、运动性和革兰氏染色结果。三 作业实验四 植物病原细菌生理生化测定1. 掌握无菌操作技术;2. 了解各种生理生化性状测定常用试剂的配制方法;3. 掌握各种生理生化性状的观察方法。 一、实验目的 二、实验内容和方法 1.产酸和产气试验(一)碳素化合物的利用1)接菌培养:一般每5 mL培养液接种0.1mL 108 CFU/ml菌悬液,适温下培养3-4周。2)结果观察:产酸:培养液变为黄色产碱:培养液变为蓝

18、色CK:培养液为草绿色变色产气:杜氏发酵小玻管出现空隙CK:杜氏发酵小玻管不出现空隙产气(1)配方:NH4H2PO4,氯化钾0.2,MgSO4.7H2,蒸馏水1000 L,溴百里酚兰(1.6%酒精溶液)1.5 mL; 1%碳素化合物。Ayers培养基:碳素化合物产酸试验 单糖(葡萄糖、半乳糖);双糖(麦芽糖、乳糖);多糖(淀粉);醇(甘露醇)。 有的细菌不产酸和气,有的只产酸不产气,少数植物病原细菌既产酸又产气(3)分装:将上述培养基分装于试管中,每管10 mL左右。测定气体产生时,加上杜氏发酵小玻管后灭菌。(2)配制过程:将NH4H2PO4、氯化钾、MgSO4.7H2O溶于蒸馏水,调节后加入

19、溴百里酚兰,最后加入碳素化合物(也可分别灭菌后加入) 3)MR试验结果观察:取上述培养液5ml,加甲基红试剂23滴,呈明显红色为阳性,呈黄色为阴性。2.甲基红(MR)和VP(产3-羟基丁酮)试验1)接菌培养:一般每5mL培养液接种8CFU菌悬液,适温下培养1周。2)甲基红试剂配制:甲基红溶解于300ml的95%酒精中,然后用蒸馏水稀释至500ml。 4)VP试验结果观察:每毫升加0.1mL40%KOH溶液, 置48-50水浴处理2h,充分摇动后观察结果。在4h内出现红色者为阳性反应。 测定亚硝酸,每试管加试剂A和试剂B各1ml如呈红色,表示有亚硝酸根。1)接菌:在培养液中接菌后培养1周(二)氮

20、素化合物的分解2)Griess-Llosvary试剂测定法 试剂A:对氨基苯磺酸,5mol/L醋酸(冰醋酸加水)1000ml 试剂B:二甲基-萘胺6ml,5mol/L醋酸1000ml1.硝酸盐还原1)醋酸铅滤纸条的制备:将滤纸剪成5mm50mm的小条浸在5%醋酸铅溶液中,空气中干燥后,在120烘箱中灭菌1h。2)接菌:将细菌接种于试管中的培养液中后,用上述制备的滤纸条夹在棉花塞和试管壁之间,使纸条悬在培养液面上,但不要碰到培养液,25培养2周。3)结果观察:纸条变黑表示有硫化氢产生,为阳性反应。2.硫化氢产生1)草酸滤纸条的制备:将滤纸剪成5mm50mm的小条浸在饱和草酸溶液中,空气中干燥后,

21、在120烘箱中灭菌1h。2)接菌:将细菌接种于试管中的培养液中后,用上述制备的滤纸条夹在棉花塞和试管壁之间,使纸条悬在培养液面上,但不要碰到培养液,适温培养1周。3)结果观察:纸条变淡红色表示有吲哚产生,为阳性反应。3.吲哚产生1)接菌:采用穿刺法接菌后,放在适温中培养1-3周。以不接菌试管为对照。(三)大分子化合物的利用2)结果观察:将经过培养的接菌试管取出后,放在4冰箱中,看其是否凝固,如不凝固,则说明明胶分解而导致液化,为阳性反应。1.明胶液化A.酸的产生:石蕊牛乳变成粉红色,表示从乳糖产酸1)接菌:将培养基接种细菌于28培养1-3周,以不接种的石蕊牛乳做对照。2)结果观察:2.石蕊牛乳

22、反应B.凝固:产酸达到发生凝块,如产气凝块断裂; 凝乳酶的作用而凝固,凝块收缩与乳清分离。C.胨化:牛乳变清,往往从表层开始D.碱的产生:石蕊牛乳变蓝色,胨化时常呈碱性E.石蕊还原:石蕊变为无色 在平板上加碘液后,培养基为深兰色,菌落周围有无色透明圈者为阳性。1)接菌:将细菌接种于淀粉琼脂平板上,适温下培养24-48小时。2)结果观察:3. 淀粉水解试验四、细菌的好氧性和厌氧性测定蛋白胨 2.0 g 氯化钠 5.0 g 磷酸氢二钾 0.2 g 琼脂 3.0 g 蒸馏水 1000.0 ml 溴百里酚兰(酒精溶液 1.5 ml)待培养基融化,并调pH后,装于试管中,每支试管装9 ml 灭菌。培养基

23、凝固后,用接种针蘸细菌悬浮液针刺接种,一直刺到管底。分别在培养2、4和7 d后观察记录。 好氧性细菌,只在开管的上部生长;兼性厌氧性细菌,则在开管的上下部都能生长;厌氧性细菌,则只能在开管的下部和闭管中生长。1)试剂:1%二甲基对苯二胺盐酸盐或1%四甲基对苯二胺盐酸盐。(五)其他生理生化试验2)测定方法:1.氧化酶试验A. Kovacs:在培养皿内放一张滤纸,滤纸上加3-4滴试剂使其湿润,用牙签挑取24h菌苔涂在滤纸上,60秒内变成紫色为阳性反应,60秒后或不便色为阴性。B.滤纸条法:用滤纸条蘸少许菌苔,加1d试剂,立即呈粉红色为阳性1)试剂:3%过氧化氢2)测定方法:挑取固体培养基上培养24

24、-48h的菌苔,置于干净玻片上,滴加过氧化氢。2.过氧化氢酶(接触酶)试验3)结果观察:在半分钟内有大量气泡产生的为阳性,不产生气泡的为阴性。三 作业:1 若有吲哚和硫化氢产生,其实验的试管口上的滤纸条会发生什么样的颜色变化,为什么?2 在石蕊牛乳不能和其他细菌培养基一起灭菌,为什么?反应中会出现多种不同的反应,试分析其发生的原因? 3 观察和记录细菌氧化发酵试验、MR试验以及接触酶试验结果。实验五 植物病原细菌的PCR分子鉴定 1 了解PCR反应的原理;掌握PCR反应的操作方法。一、实验目的 二、PCR扩增 聚合酶链式反应(Polymerase Chain Reaction,简称PCR)1、

25、PCR技术的基本原理类似于DNA的天然复制过程,其特异性依赖于与目标序列两端互补的寡核苷酸引物。PCR由变性-退火-延伸三个反应步骤构成:模板DNA的变性:模板DNA经加热至94左右一定时间后,使模板DNA双链或经PCR扩增形成的双链DNA解离,使之成为单链(以便它与引物结合,为下轮反应作准备);模板DNA与引物的退火(复性):模板DNA经加热变性成单链后,温度降至55左右,引物与模板DNA单链的互补序列配对结合;引物的延伸:DNA模板-引物结合物在TaqDNA聚合酶的作用下,以dNTP为反应原料,靶序列为模板,按碱基配对与半保留复制原理,合成一条新的与模板DNA 链互补的半保留复制链,重复循

26、环变性-退火-延伸三过程,就可获得更多的“半保留复制链”,而且这种新链又可成为下次循环的模板。每完成一个循环需24分钟, 23小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。2 The procedure of PCR5533d.NTPsTaqPrimers5353535353535353componentdenaturation535353535353(94) extension53535353353TaqTaq55repeatedanneal(72) (50) 53535353553353532 cycles4 copies3 cycles8 copies535353535353535353535

27、3355353535310反应缓冲液(含Mg2)5.0 ldNTP混合物,10 mmol/L1.0 l上游引物,20 mol/L1.0 l下游引物,20 mol/L1.0 l模板DNA1.0 lTaq plus DNA聚合酶,5 U/l0.5 l加双蒸水至终体积为50 l 3 反应体系 取一0.5 ml PCR薄壁管,依次加入以下试剂: M 1 2 3 43kb2kb0.8% agrose gel electrophoresis of full length PCR product from Y160M: DNA marker; 1: Y160; 2:positive control; 3 4

28、: CK-引物量: 每条引物的浓度1umol或10100pmol,以最低引物量产生所需要的结果为好,引物浓度偏高会引起错配和非特异性扩增,且可增加引物之间形成二聚体的机会。酶及其浓度:目前有两种Taq DNA聚合酶供应, 一种是从栖热水生杆菌中提纯的天然酶,另一种为大肠菌合成的基因工程酶。催化一典型的PCR反应约需酶量2.5U(指总反应体积为100ul时),浓度过高可引起非特异性扩增,浓度过低则合成产物量减少。4 PCR反应操作注意事项:dNTP的质量与浓度 dNTP的质量与浓度和PCR扩增效率有密切关系,dNTP粉呈颗粒状,如保存不当易变性失去生物学活性。dNTP溶液呈酸性,使用时应配成高浓

29、度后,以1M NaOH或1M Tris。HCL的缓冲液将其PH调节到,小量分装, -20冰冻保存。多次冻融会使dNTP降解。在PCR反应中,dNTP应为50200umol/L,尤其是注意4种dNTP的浓度要相等( 等摩尔配制),如其中任何一种浓度不同于其它几种时(偏高或偏低),就会引起错配。浓度过低又会降低PCR产物的产量。dNTP能与Mg2+结合,使游离的Mg2+浓度降低。模板(靶基因)核酸模板核酸的量与纯化程度,是PCR成败与否的关键环节之一。Mg2+浓度Mg2+对PCR扩增的特异性和产量有显著的影响,在一般的PCR反应中,各种dNTP浓度为200umol/L时,Mg2+浓度为为宜。Mg2+浓度过高,反应特异性降低,出现非特异扩增,浓度过低会降低Taq DNA聚合酶的活性,使反应产物减少。PCR反应条件的选择PCR反应条件为温度、时间和循环次数。温度与时间的设置: 基于PCR原理三步骤而设置变性-退火-延伸三个温度点。变性温度与时间: 变性温度低,解链不完全是导致PCR失败的最主要原因。一般情况下,9394lmin足以使模板DNA变性,若低于93则需延长时间,但温度不能过高,因为高温环境对酶的活性有影响。此步若不能使靶基因模板或PCR产物完全变性,就会导致PCR失败。退火(复性)温度与时间:重要因素。变性后温度快速冷却至4060,可使引物和模板发生结合

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