第十章微生物的分类与鉴定_微生物学

1、第十一章第十一章 微生物微生物的分类和鉴定的分类和鉴定微生物横跨整个生物界的四个界，微生物横跨整个生物界的四个界，有十几万个种。有十几万个种。 所谓所谓分类分类，是指对大量的微生物进行逐一的观，是指对大量的微生物进行逐一的观察、分析与描述的基础上，按照它们的察、分析与描述的基础上，按照它们的个体形态个体形态、培养特征培养特征、生理生化特性生理生化特性和和细胞化学组份细胞化学组份等一系列等一系列性状的异同和主次，并根据它们的亲缘关系和应用性状的异同和主次，并根据它们的亲缘关系和应用的方便，加以分门别类。的方便，加以分门别类。 所谓所谓鉴定鉴定，是对某一具体的微生物的性状进行，是对某一具体的微生物

2、的性状进行细致的观察和测试，参照一定的，用对比的方法来细致的观察和测试，参照一定的，用对比的方法来确定该微生物的分类地位。确定该微生物的分类地位。第一节第一节 通用分类单元通用分类单元微生物横跨整个生物界的四个界，微生物横跨整个生物界的四个界，有十几万个种。有十几万个种。 一、分类单元一、分类单元界界门门纲纲目目科科属属种种二、种二、种（species） 微生物的微生物的种种（species，又译，又译物种物种）是一个）是一个基本分类单元，它是一大群表型特征高度相似、基本分类单元，它是一大群表型特征高度相似、亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有着明亲缘关系极其接近、与同属内的其他物种有着明显

3、差异的一大群菌株的总称。显差异的一大群菌株的总称。三、种以下的分类单元三、种以下的分类单元亚种亚种（subspecies，subsp.，ssp.）变种变种（variety，var.）型型（form）类群类群（group）菌株菌株（strain）小种小种（race）相相（phase）态态（state）（一一）亚种亚种（subspecies，subsp.，ssp.） 是种的进一步细分单元，一般指其某一明显是种的进一步细分单元，一般指其某一明显而稳定的特征与模式种不同的种。而稳定的特征与模式种不同的种。（二二）变种变种（variety，var.） 变种是亚种的同义词，因易引起混乱，故变种是亚种的同义

4、词，因易引起混乱，故国际细菌命名法规国际细菌命名法规（19751975）已规定它在命）已规定它在命名法中没有地位，且不主张使用。名法中没有地位，且不主张使用。 在亚种以下的在亚种以下的“型型”（formform）曾用于表示细）曾用于表示细菌菌株，但目前已废除。目前尚在使用的是以菌菌株，但目前已废除。目前尚在使用的是以“型型”作后缀使用，例如生物变异型（作后缀使用，例如生物变异型（biovarbiovar）、）、化学型（化学型（chemoformchemoform）等。）等。（三三）型型（form） 是一个在分类上没有地位的普通名词，它可是一个在分类上没有地位的普通名词，它可非正式地指定一组具有

5、某些共同性状的生物。非正式地指定一组具有某些共同性状的生物。（四四）类群类群（group） 菌株又称品系（在病毒中则称毒株或株），菌株又称品系（在病毒中则称毒株或株），表示任何由一个独立分离的单细胞（或单个病毒表示任何由一个独立分离的单细胞（或单个病毒粒子）繁殖而成的纯种群体及其一切后代。粒子）繁殖而成的纯种群体及其一切后代。（五五）菌株菌株（strain） 又称品种、宗或生产小系等，它的涵义很乱，又称品种、宗或生产小系等，它的涵义很乱，在真菌学中常相当于生理型，在动物学中常指生态在真菌学中常相当于生理型，在动物学中常指生态型，而在发酵工业中，则常指自生产中选育出来的型，而在发酵工业中，则常指

6、自生产中选育出来的自发突变菌株。自发突变菌株。（六六）小种小种（race）一般指自然存在的微生物交互变异中的一定阶段。一般指自然存在的微生物交互变异中的一定阶段。（七七）相相（phase） 通常指微生物的菌落变异状态，如粗糙、光通常指微生物的菌落变异状态，如粗糙、光滑或粘液状等。滑或粘液状等。（八八）态态（state）第二节第二节 微生物的命名微生物的命名 每一种微生物都有一个自己的名字，名字有每一种微生物都有一个自己的名字，名字有俗名俗名（common name）和和学名学名（scientific name）两种。两种。俗名俗名（common name） 指普通的、通俗的、地区性的名字，具有

7、指普通的、通俗的、地区性的名字，具有简明和大众化的优点，但往往涵义不够确切，简明和大众化的优点，但往往涵义不够确切，易于重复，使用范围局限。易于重复，使用范围局限。俗名俗名学名学名结核杆菌结核杆菌结核分枝杆菌结核分枝杆菌（Mycobacterium tuberculosis）绿脓杆菌绿脓杆菌铜绿假单胞菌铜绿假单胞菌（Pseudomonas aeruginosa）金葡菌金葡菌金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌（Staphylococcus aureus）红色面包霉红色面包霉粗糙脉孢菌（粗糙脉孢菌（Neurospora crassa）白念菌白念菌白色假丝酵母（白色假丝酵母（Candidaalbicans

8、）学名学名（scientific name） 指一个菌种的科学名称，它是按照指一个菌种的科学名称，它是按照国际国际细菌命名法规细菌命名法规命名的、国际学术界公认并通命名的、国际学术界公认并通用的正式名字。用的正式名字。 一、双名法一、双名法（binominal nomenclature） 双名法指一个物种的学名由前面一个双名法指一个物种的学名由前面一个属名属名（generic name）和后面一个和后面一个种名加词种名加词（specific epithet）两部分两部分组成。组成。属名的词首须大写，属名的词首须大写，种名加词的字首须小写（包括由人名或地名等种名加词的字首须小写（包括由人名或地名

9、等专用名词衍生的）。专用名词衍生的）。若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用若所分离的菌株只鉴定到属，而未鉴定到种，可用sp来表示。来表示。例如，例如，Bacillus sp例例1：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌）：大肠埃希氏菌（简称大肠杆菌）Escherichia coli（Migula）Castellani et Chalmers 1919例例2：枯草芽孢杆（简称枯草杆菌）：枯草芽孢杆（简称枯草杆菌）Bacillus subtilis（Ehrenberg）Cohn 1872例例1：苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种：苏云金芽孢杆菌蜡螟亚种Bacillus thuringiensis （subsp）g

10、alleria例例2：椭圆酿酒酵母（或酿酒酵母椭圆变种）：椭圆酿酒酵母（或酿酒酵母椭圆变种）Saccharomyces cerevisiae （var）ellipsoideus由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，由于细菌分类单元的划分缺乏一个易于操作的统一标准，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，为了减少因采用不同标准界定分类单元所造成的混乱，细菌系统分类也像其他生物分类一样采用细菌系统分类也像其他生物分类一样采用“模式概念模式概念”种和亚种指定模式菌株（种和亚种指定模式菌株（type strain）；）；亚属和属指定模式种（亚属和属指定模式种（type specie

11、s）；）；属以上至目级分类单元指定模式属（属以上至目级分类单元指定模式属（type genus）；）；模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。模式菌株应送交菌种保藏机构保藏，以便备查考和索取。第三节第三节 各大类微生物的各大类微生物的分类系统纲要分类系统纲要微生物横跨整个生物界的四个界，微生物横跨整个生物界的四个界，有十几万个种。有十几万个种。一、细菌的分类一、细菌的分类 1. 1. 细菌分类的依据细菌分类的依据（1）形态特征）形态特征在显微镜下观察的个体形态特征在显微镜下观察的个体形态特征在各种培养基上表现的的群体形态特征在各种培养基上表现的的群体形态特征（2）生理生化特性）生理生

12、化特性（3）生态特征）生态特征（4）血清学反应）血清学反应美国宾夕法尼亚大学的美国宾夕法尼亚大学的细菌学教授伯杰（细菌学教授伯杰（D.Bergey，1860-1937）2.伯杰氏鉴定细菌学手册伯杰氏鉴定细菌学手册（Bergeys Manual of Determinative Bacteriology） 1957年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际年第七版后，由于越来越广泛地吸收了国际上细菌分类学家参加编写（如上细菌分类学家参加编写（如1974年第八版，撰稿人年第八版，撰稿人多达多达130多位，涉及多位，涉及15个国家；现行版本撰稿人多达个国家；现行版本撰稿人多达300多人，涉及近多人，涉及

13、近20个国家），所以它的近代版本反映个国家），所以它的近代版本反映了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐确立了了出版年代细菌分类学的最新成果，因而逐渐确立了在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。在国际上对细菌进行全面分类的权威地位。伯杰氏系统细菌学手册伯杰氏系统细菌学手册（Bergeys Manual of Systematic Bacteriology） 伯杰氏手册是目前进行伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定细菌分类、鉴定的最重要的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所需做的实验的具体方法。的特征及进行鉴定所需做

14、的实验的具体方法。（20世纪世纪80年代末期）年代末期）新版手册分新版手册分4 4卷：卷：第一卷：第一卷：一般医学和工业方面重要的一般医学和工业方面重要的革兰氏阴性细菌革兰氏阴性细菌。第二卷：第二卷：放线菌以外的放线菌以外的革兰氏阳性细菌革兰氏阳性细菌。第三卷：第三卷：故细菌、蓝细菌及其他革兰氏阴性细菌。故细菌、蓝细菌及其他革兰氏阴性细菌。第四卷：第四卷：放线菌。放线菌。伯杰氏系统细菌学手册伯杰氏系统细菌学手册（Bergeys Manual of Systematic Bacteriology）第八版有中文版，把细菌分十九个部分。第八版有中文版，把细菌分十九个部分。二、霉菌的分类二、霉菌的分类

15、 1. 1. 霉菌的分类原则霉菌的分类原则丝状真菌划分各级分类单位的基本原则：丝状真菌划分各级分类单位的基本原则：以以形态特征形态特征为主，为主，生理生化生理生化、细胞化学细胞化学和和生态特征生态特征为辅。为辅。2. 2. 真菌的分类系统真菌的分类系统1950年年Martin的的4纲分类系统纲分类系统1973年年Ainsworth的分类系统的分类系统 Martin是根据真菌营养体的形态特征和繁殖方式的是根据真菌营养体的形态特征和繁殖方式的不同将之分为不同将之分为4个纲。个纲。藻状菌纲：藻状菌纲：菌丝体菌丝体无无分隔，或者不形成真正的菌丝体。分隔，或者不形成真正的菌丝体。子囊菌纲：子囊菌纲：菌丝

16、体菌丝体有有分隔，有性阶段形成子囊孢子。分隔，有性阶段形成子囊孢子。担子菌纲：担子菌纲：菌丝体菌丝体有有分隔，有性阶段形成担孢子。分隔，有性阶段形成担孢子。半知菌纲：半知菌纲：菌丝体菌丝体有有分隔，未发现有性阶段。分隔，未发现有性阶段。 Ainsworth从从1966年起，就把真菌界分为两大门年起，就把真菌界分为两大门（粘菌门粘菌门和和真菌门真菌门），并把真菌门再分成五个亚门。），并把真菌门再分成五个亚门。目前，该系统已为各国广大真菌分类学者所普遍采目前，该系统已为各国广大真菌分类学者所普遍采用，影响较大。用，影响较大。三、酵母菌的分类三、酵母菌的分类 酵母菌的分类普遍采用荷兰的酵母菌的分类普

17、遍采用荷兰的LoddovLoddov在在19701970年提出的分类系统。年提出的分类系统。 在这个分类系统中，以是否形成各类有性孢子在这个分类系统中，以是否形成各类有性孢子作为分类的起点，作为分类的起点，属以上的分类主要依据形态；属以上的分类主要依据形态；种的划分主要依据生理特性。种的划分主要依据生理特性。在这个系统中有三个亚门在这个系统中有三个亚门属以上的分类主要依据形态；属以上的分类主要依据形态；种的划分主要依据生理特性。种的划分主要依据生理特性。能形成能形成子囊孢子子囊孢子的酵母属于的酵母属于子囊菌亚门子囊菌亚门，共有，共有4个科个科22个属个属139种酵母；种酵母；能产生能产生冬孢子冬孢子和和担孢子