蛋白质组中心 质谱数据分析_第1页
蛋白质组中心 质谱数据分析_第2页
蛋白质组中心 质谱数据分析_第3页
蛋白质组中心 质谱数据分析_第4页
蛋白质组中心 质谱数据分析_第5页
已阅读5页，还剩6页未读， 继续免费阅读

下载本文档

版权说明：本文档由用户提供并上传，收益归属内容提供方，若内容存在侵权，请进行举报或认领

文档简介

1、蛋白质质谱鉴定流程样品酶解酶解片断一级质谱PMF肽指纹图谱串联质谱对库检索序列数据库成功鉴定PSMs及后筛选De-novo 序列分析未知蛋白肽指纹图谱（PMF）鉴定 PMF（Peptide Mass Fingerprinting）是根据一级质谱（MS）所测酶解片段的精确分子质量鉴定蛋白质的一种方法。 一般采用MALDI-TOF仪器进行。因为MALDI质谱图中的离子一般只带一个电荷，比较容易计算。 其原理就是利用了蛋白序列数据库中的多肽质量的信息与实际测得的质量信息进行对比而实现鉴定。优点与缺点优点： 是用一级质谱鉴定蛋白质的经典方法，算法简单，速度快缺点： 质量相近的多肽增加匹配难度 无法实现

2、混合蛋白的鉴定二级质谱鉴定 质谱仪选择一级质谱中的一个峰，让这些峰所代表的离子高速撞击质谱仪中的惰性气体，使其肽键断裂，并对库搜索鉴定蛋白质。 常用MALDI-TOFTOF仪器进行。优点与缺点优点： 鉴定准确度更高，可以得到蛋白的序列 可以实现多个蛋白的鉴定缺点： 增加了一步操作 算法更复杂，而且需要更多的操作经验串联质谱结果报告从一级质谱图里选出部分峰做二级质谱一级质谱图二级质谱图蛋白点编号蛋白名称蛋白GI号串联质谱匹配的序列理论等电点理论分子量串联质谱离子得分可信度串联质谱结果报告蛋白的选择 一般protein score大于60分的结果或者单个肽段得分超过30的结果就比较可信。 对于一次鉴定得到多个蛋白得分均超过60分的以得分最高的最为可信。 也可用根据protein score 的C.I.%来判断，该参数是一个可信度的评价，一般以超过95%作为鉴定结果可靠的标准。蛋白信息查询 一般根据蛋白名称可以了解该蛋白的大致功能 使用该蛋白的GI号码可以到NCBI数据库进一步查的该蛋白的信息 对于未知蛋白，可以采用BLAST或者其它功能预测软件预测该

人人文库> 全部分类> 教育资料 > 课件下载

温馨提示

  • 1. 本站所有资源如无特殊说明，都需要本地电脑安装OFFICE2007和PDF阅读器。图纸软件为CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.压缩文件请下载最新的WinRAR软件解压。
  • 2. 本站的文档不包含任何第三方提供的附件图纸等，如果需要附件，请联系上传者。文件的所有权益归上传用户所有。
  • 3. 本站RAR压缩包中若带图纸，网页内容里面会有图纸预览，若没有图纸预览就没有图纸。
  • 4. 未经权益所有人同意不得将文件中的内容挪作商业或盈利用途。
  • 5. 人人文库网仅提供信息存储空间，仅对用户上传内容的表现方式做保护处理，对用户上传分享的文档内容本身不做任何修改或编辑，并不能对任何下载内容负责。
  • 6. 下载文件中如有侵权或不适当内容，请与我们联系，我们立即纠正。
  • 7. 本站不保证下载资源的准确性、安全性和完整性, 同时也不承担用户因使用这些下载资源对自己和他人造成任何形式的伤害或损失。

最新文档

评论

0/150

提交评论