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文档简介

1、陕西师大生物化学与分子生物学教案绪论一、生物化学与分子生物学的概念及其研究内容生物化学与分子生物学是研究生物体的物质组成和生命过程中的化学变化的一门科学。或者说生物化学与分子生物学是研究生命现象中的物质基础和化学变化的一门科学。二、生物化学与分子生物学的研究方法生物化学与分子生物学的研究从观察一个具体的生命现象开始,通过抽提、过滤、离心、色谱(层析)等生化技术分离出某种未知的生化物质(生化组分)比如一个新的未知蛋白组分,新基因片段,或新的次生代谢物,然后进行分析。1.结构与性质:采用系列测定、X-射线衍射、波谱,质谱、圆二色性等技术分析其结构和功能,结构是功能的基础,有其结构必有其功能。2功能

2、:生理、病理、信号转导、抗病、抗旱、耐水肥、肥胖等生命现象的化学机制。3.代谢及其细胞调控:表达的时空特异性,该物质何时产生与消亡,在什么组织表达?从哪儿来最终到哪儿去,其代谢受什么调控?(潜伏、激活、沉默)。4.改造和利用:根据对这些生命现象分子机制的认识进行:(1)基因治疗:血友病、癌症、肥胖等。(2)生化药物(基因工程药物):红细胞生成素、胰岛素、干扰素等。(3)转基因动植物:抗虫、抗病、抗病毒作物,动植物生物反应器等。三、生物化学与分子生物学的发展史生物化学的启蒙阶段可以追溯到人类文明的早期。18世纪一些从事化学研究的科学家,如拉瓦锡、舍勒等人和一些药剂师、炼丹师转向生物领域,生物化学

3、开始形成学科。同时生物学逐渐产生了生理化学、遗传学、细胞学等分支学科。19世纪末,从生理化学中分离出生物化学,20世纪中后期又从生物化学中分离出分子生物学并与经典遗传学结合为分子遗传学,并促进了发育生物学、生物信息学、结构生物学等学科的发展。生物工程严格讲应是生物技术与工程学的杂交学科。1.静态生物化学时期(1920年以前)研究内容以分析生物体内物质的化学组成、性质和含量为主。2.动态生物化学时期(1950年以前)这是一个飞速发展的辉煌时期,随着同位素示踪技术、色谱技术等物理学手段的广泛应用,生物化学从单纯的组成分析深入到物质代谢途径及动态平衡、能量转化,光合作用、生物氧化、糖的分解和合成代谢

4、、蛋白质合成、核酸的遗传功能、酶、维生素、激素、抗生素等的代谢,都基本搞清。3.机能生物化学时期(1950年以后)真正意义上的现代的生命化学。蛋白质化学和和核酸化学成为研究重点。生物化学研究深入到生命的本质和奥秘:运动、神经、内分泌、生长、发育、繁殖等的分子机理。1953年,DNA双螺旋结构、近代实验技术和研究方法奠定了现代分子生物学的基础,从此,核酸成了生物化学研究的热点和重心。4.生物化学发展的重大事件17761778年,瑞典化学家舍勒(Sheele)从天然产物中分离出: 甘油(glycerol);苹果酸(malic acid,苹果);柠檬酸(citric acid,柠檬);尿酸(uric

5、 acid,膀胱结石);酒石酸(tartaric acid,酒石)。1937年,英国生物化学家克雷布斯(Krebs)发现三羧酸循环,获1953年诺贝尔生理学奖。1953年,沃森克里克(WatsonCrick)确定DNA双螺旋结构,获1962年诺贝尔生理、医学奖。1955年,英国生物化学家桑格尔(Sanger)确定牛胰岛素结构,获1958年诺贝尔化学奖。1980年,化学奖:桑格尔和吉尔伯特(Gilbet)设计出测定DNA序列的方法,获1980年诺贝尔。1984年,化学奖:Bruce Merrifield(美国),建立和发展蛋白质化学合成方法。1994年,生理和医学奖:Alfred G.Gilma

6、n(美国),发现G蛋白及其在细胞内信号转导中的作用。化学奖:1、Rechard J.Roberts(美)等,发现断裂基因,2Karg B. Mallis(美)发明PCR方法,3Michaet Smith(加拿大)建立DNA合成用与定点诱变研究。1996年,生理和医学奖:Petr c. Doherty(美)等,发现T细胞对病毒感染细胞的识别和MHC(主要组织相容性复合体)限制。1997年,生理和医学奖:stanley B.prusiner(美)发现一中新型的致病因子感染性蛋白颗粒“pnion”(疯牛病)化学奖:1. paul D.Boyer(美)等,说明ATP酶促成机制,2.Jens c. sk

7、on(丹麦)发现输送离子的Na+K+_ATP酶。1998年, 生理和医学奖:Rolert F. Furchgott(美国),发发现NO是心血管系统的信号分子。四、生物化学与二十一世纪生命科学展望1.生物化学与分子生物学是二十一世纪生命科学的带头学科。学科热点:基因组、蛋白质组、生物克隆2.推动农业科学原始农业:采集与狩猎,游牧式传统农业:原始的种植业,畜牧业现代农业:化肥,农药;绿色革命(杂种优势),生物防治,分子育种。分子农业(工厂化农业):离开土地,细胞水平甚至是分子水平的生化加工业,仿生学原理。植物:光合作用 固定化细胞培养,叶绿体光合器。动物:细胞培养。3.促进环保科学生物净化:生物传

8、感:酶,细胞,指示植物4.促进轻工业发酵工业:抗生素、氨基酸。食品工业与饲料工业:酶,添加剂,香味剂,制革与造纸工业:生物电子学:DNA储存器。5.促进医药科学生化药物:疫苗,基因工程药物:基因治疗:五、 生物化学的机遇与挑战1.机遇:研究手段和研究方法的出现2.挑战:许多重大的理论问题没有解决光合作用生物能学基因表达与调控六、参考书籍1.王镜岩等,生物化学,高等教育出版社,2002,第3版;2.周海梦等,Lehninger生物化学原理 (第3版中译本),2005,高等教育出版社;3.郑集等,普通生物化学,高等教育出版社,1998年第3版;4.Garrett,and Grisham,Bioch

9、emistry(影印版), 2002,高等教育出版社;5.罗纪盛等,生物化学简明教程,高等教育出版社,1999,第3版;6.朱玉贤 李毅,现代分子生物学,高等教育出版社,1998,第3版;7.Robert F.Weaver, Molecular biology(影印版),2001,科学出版社;8.杨建雄,生物化学与分子生物学实验技术教程,2002,科学出版社,第1版;9.赵永芳,生物化学技术原理与应用,科学出版社,2002,第3版;10.陈钧辉等,生物化学习题解析,科学出版社,2002,第2版;11.张楚富,生物化学解题指导与测验,高等教育出版社,2004,第1版;12.杨建雄,生物化学学习指

10、导与习题祥解,陕西师范大学出版社,2005,第1版.杂志;中国科学 科学通报 Annu. Rev. Biochem.网站:生命科学(生物化学)第一章 第一单元 糖类第二章 一、糖类的概念糖类物质是多羟基(2个或以上)的醛类(aldehyde)或酮类(Ketone)化合物,以及它们的衍生物或聚合物,可分为醛糖(aldose)和酮糖(ketose),还可根据碳层子数分为丙糖(triose),丁糖(terose),戊糖(pentose)、己糖(hexose)。最简单的糖类就是丙糖(甘油醛和二羟丙酮)由于绝大多数的糖类化合物都可以用通式Cn (H2O)n表示,所以过去人们一直认为糖类是碳与水的化合物,

11、称为碳水化合物。现在已经这种称呼并恰当,只是沿用已久,仍有许多人称之为碳水化合物。二、糖的种类根据糖的结构单元数目多少分为:(1)单糖:不能被水解称更小分子的糖。(2)寡糖:26个单糖分子脱水缩合而成,以双糖最为普遍,意义也较大。(3)多糖:同多糖:淀粉、糖原、纤维素、半纤维素、几丁质(壳多糖);杂多糖:糖胺多糖类(透明质酸、硫酸软骨素、硫酸皮肤素等)。(4)结合糖(复合糖,糖缀合物,glycoconjugate):糖脂、糖蛋白(蛋白聚糖)、糖-核苷酸等。(5)糖的衍生物:糖醇、糖酸、糖胺、糖苷三、糖类的生物学功能(1) 提供能量。植物的淀粉和动物的糖原都是能量的储存形式。(2) 物质代谢的碳

12、骨架,为蛋白质、核酸、脂类的合成提供碳骨架。(3) 细胞的骨架。纤维素、半纤维素、木质素是植物细胞壁的主要成分,肽聚糖是细胞壁的主要成分。(4) 细胞间识别和生物分子间的识别。细胞膜表面糖蛋白的寡糖链参与细胞间的识别。一些细胞的细胞膜表面含有糖分子或寡糖链,构成细胞的天线,参与细胞通信。红细胞表面ABO血型决定簇就含有岩藻糖。四、单糖(一)单糖的结构1.单糖的链状结构确定链状结构的方法(葡萄糖):a.与Fehling试剂或其它醛试剂反应,含有醛基。b.与乙酸酐反应,产生具有五个乙酰基的衍生物。c.用钠、汞剂作用,生成山梨醇。最简单的单糖之一是甘油醛(glyceraldehydes),它有两种立

13、体异构形式(Stereoismeric form),这两种立体异构体在旋光性上刚好相反,一种异构体使平面偏振光(Plane polarized liyot)的偏振面沿顺时针方向偏转,称为右旋型异构体(dextrorotary),或D型异构体。另一种异构体则使平面偏振不的编振机逆时针编转,称左旋异构体(levorotary,L)或L型异构体。像甘油醛这样具有旋光性差异的立体异构体又称为光学异构体(Cptical lsmer),常用D,L表示。以甘油醛的两种光学异构体作对照,其他单糖的光学异构构与之比较而规定为D型或L型。差向异构体(epimer):又称表异构体,只有一个不对称碳原子上的基因排列方

14、式不同的非对映异构体,如D-等等糖与D-半乳糖。链状结构一般用Fisher投影式表示:碳骨架、竖直写;氧化程度最高的碳原子在上方。2.单糖的环状结构在溶液中,含有4个以上碳原子的单糖主要以环状结构。单糖分子中的羟基能与醛基或酮基可逆缩合成环状的半缩醛(emiacetal)。环化后,羰基C就成为一个手性C原子称为端异构性碳原子(anomeric carbon atom),环化后形成的两种非对映异构体称为端基异构体,或异头体(anomer),分别称为a-型及b-型异头体。环状结构一般用Havorth结构式表示:用FisCher投影式表示环状结构很不方便。Haworth结构式比Fischer投影式更

15、能正确反映糖分子中的键角和键长度。转化方法: 画一个五员或六员环 从氧原子右侧的端基碳(anomerio carbon)开始,画上半缩醛羟基,在Fischer投影式中右侧的居环下,左侧居环上。构象式:Haworth结构式虽能正确反映糖的环状结构,但还是过于简单,构象式最能正确地反映糖的环状结构,它反映出了糖环的折叠形结构。3.几种重要的单糖的链状结构和环状结构(1) 丙糖:D-甘油醛 二羟丙酮(2) 丁糖:D-赤鲜糖 D-赤鲜酮糖(3) 戊糖:D-核糖 D-脱氧核糖 D-核酮糖 D-木糖 D-木酮糖(4) 己糖:D-葡萄糖(a-型及b型) D-果糖(5) 庚糖:D-景天庚酮糖4.变旋现象在溶液

16、中,糖的链状结构和环状结构(a、b)之间可以相互转变,最后达到一个动态平衡,称为变旋现象。从乙醇水溶液中结晶出的D-glucose称为-D-(+)Glucose(20D=+113°),从吡啶溶液中结晶出的D-glucose称为-D-(+)glucose(20D=+18.7°)。将a-D-(+)葡萄糖与b-D-(+)葡萄糖分别溶于水中,放置一段时间后,其旋光率都逐渐转变为+52.7°C。原因就是葡萄糖的不同结构形式相互转变,最后,各种结构形式达到一定的平衡,其中a型占36%,b型占63%,链式占1%。5.构型与构象构型:分子中由于各原子或基团间特有的固定的空间排列方

17、式不同而使它呈现出不同的较定的立体结构,如D-甘油醛与 L-甘油醛,D-葡萄糖和L葡萄糖是链状葡萄糖的两种构型,a-D-葡萄糖和b-D-葡萄糖是环状葡萄糖的两种构型。一般情况下,构型都比较稳定,一种构型转变另一种构型则要求共价键的断裂、原子(基团)间的重排和新共价键的重新形成。构象:由于分子中的某个原子(基团)绕C-C单键自由旋转而形成的不同的暂时性的易变的空间结构形式,不同的构象之间可以相互转变,在各种构象形式中,势能最低、最稳定的构象是优势对象。6.构型与旋光性旋光性是分子中具有不对称结构的物质的一种物理性质。显然,构型不同旋光性就不同。但构型是人为规定的,旋光性是实验测出的。因此,构型与

18、旋光性之间没有必然的对应规律,每一种物质的旋光性只能通过实验来确定。(二)单糖的物理化学性质1.物理性质旋光性:是鉴定糖的一个重要指标甜度:以蔗糖的甜度为标准溶解性:易溶于水而难溶于乙醚、丙酮等有面溶剂2.化学性质(1)变旋在溶液中,糖的链状结构和环状结构(a、b)之间可以相互转变,最后达到一个动态平衡,称为变旋现象。三者间的比例因糖种类而异。只有链状结构才具有下述的氧化还原反应。(2)糖醛反应(与酸的反应)Molish反应Molish反应可以鉴定单糖的存在。Seliwannoff反应据此区分酮糖与醛糖。还可利用溴水区分醛糖与酮糖。(3)氧化反应氧化只发生在开链形式上。在氧化剂、金属离子如Cu

19、2+、酶的作用下,单糖可以发生几种类型的氧化:醛基氧化:糖酸(aldonic acid)伯醇基氧化:醛酸(uronic acid)醛基、伯醇基同时氧化:二酸(alduric acid)能被弱氧化剂(如Fehhing试剂、Benedict试剂)氧化的糖称为还原性糖,所有的单糖都是还原性糖。单糖氧化形成的羟基可以进一步形成环状内酯(Lactone)。内酯在自然界中很普遍,如L-抗坏血酸(L-ascorbio acid),又称Vc (Vitamcn c),就是D-葡萄糖酸的内酯衍生物。式量176.1,它在体内是一种强还原剂。豚鼠(guinea pig)、猿(ape)和人不能合成Vc,从能合成Vc的肝

20、脏微粒体中分离到合成Vc的三种酶,人和猿缺乏gulonolactone oxidase)。缺乏抗坏血酸将导致坏血病(scurvy),龄龈(gum)、腿部等开始出血,肿胀,逐渐扩展到全身,柑橘类果实(citrus frait)中含有丰富的Vc。(4)还原反应单糖可以被还原成相应的糖醇(Sugar alcohol)。D-葡萄糖被还原成D-葡萄糖醇,又称山梨醇(D-Sorbitol)。糖醇主要用于食品加工业和医药,山梨醇添加到糖果中能延长糖果的货架期,因为它能防止糖果失水。用糖精处理的果汁中一般都有后味,添加山梨醇后能去除后味。人体食用后,山梨醇在肝中又会转化为果糖。(5)异构化在弱碱性溶液中,D-

21、葡萄糖、D-甘露糖和D-果糖,可以通过烯醇式相互转化(enediol intermediate),D-葡萄糖异构化为D-甘露糖后,由于其中的一个手性碳原子的构型发生变化,又称差向异构化(epimerization)。(6)酯化生物体中最常见也是最重要的糖酯是磷酸糖酯和硫酸糖酯。磷酸糖酯及其衍生物是糖的代谢活性形式(糖代谢的中间产物)。硫酸糖酯主要发现于结缔组织的蛋白聚糖中(Proteo glycan),由于硫酸糖酯带电荷,因此它能结合大量的水和阳离子。葡萄糖的核苷二磷酸酯,如UDPG参与多糖的生物合成。(7)糖苷化单糖环状结构上的半缩醛羟基与醇或酚的羟基缩合失水成为缩醛式衍生物,通称为糖苷(g

22、lycosides)。(8)糖脎反应(亲核加成)糖脎反应发生在醛糖和酮糖的链状结构上。糖脎易结晶,可以根据结晶的形状,判断单糖的种类。(三)重要的单糖1.三碳糖2.四碳糖3.五碳糖4.六碳糖(四) 重要的单糖衍生物1.糖醇2.糖醛酸单糖的伯醇基被氧化成-COOH。动物体内有两种很重要的糖醛酸:a-D-葡萄醛酸(a-D-glucuronic acid)和差向异构物b-L-艾杜糖醛酸(-L-iduronate),它们在结缔组织中含量很高。葡萄糖醛酸是肝脏内的一种解毒剂,它与类固醇、一些药物、胆红素(血红蛋白的降解物)结合增强其水溶性,使之更易排出体外。3.氨基糖(糖胺,amino sugar, g

23、lycosamine)单糖的一个羟基(通常是C2位)被氨基取代。常见的氨基糖有D-葡萄糖胺(D-glucosamine)和D-半乳糖胺(D-galactosamine)。氨基糖的氨基还经常被乙酰化形成N-乙酰糖胺。4.糖苷单糖的半缩醛羟基与其它分子的醇、酚等羟基缩合,脱水生成缩醛式衍生物,称糖苷Glycoside。半缩醛部分是Glc,称Glc糖苷。半缩醛部分是Gal,称Gal糖苷。糖苷可分为:O糖苷、N糖苷、S糖苷。糖苷物质与糖类的区别:糖是半缩醛,不稳定,有变旋;苷是缩醛,较稳定,无变旋。糖苷大多数有毒,其中不少有药理作用。5.脱氧糖重要的有6-脱氧D-甘露糖,L-岩藻糖(L-fucose)

24、和2-脱氧D-核糖。岩藻糖常见于一些糖蛋白中,如红细胞表面ABO血型决定簇。五、寡糖寡糖是指含有210个单糖单元的糖类。双糖在自然界中丰富存在,它是人类饮食中主要的热源之一。在小肠中,双糖必须在酶的作用下水解成单糖才能被人体吸收。如果这些酶有缺陷的话,那么人体摄入双糖后由于不能消化它就会出现消化病。未消化的双糖进入大肠,在渗透压的作用下从周围组织夺取水分(腹泻,diarrhea),结肠中的细菌消化双糖(发酵)产生气体(气胀和绞痛或痉孪)。最常见的双糖消化缺陷是乳糖过敏,就是由于缺乏乳糖酶(Lactose),解决办法就是乳糖酶处理食物或避免摄入乳糖。1.麦芽糖(maltose, malt sug

25、ar)它是直链淀粉的水解中间物(a-麦芽糖),在自然界中似乎并不存在天然的麦芽糖。结构:a-麦芽糖(葡萄糖-a,a(1-4)-葡萄糖苷);b-麦芽糖葡萄糖-a, b(1-4)-葡萄糖苷。性质: 变旋现象,在水溶解中形成a、b和开链的混合物; 具有还原性; 能成脎。异麦芽糖:a(1-6)键型,支链淀粉和糖元的水解产物。2.蔗糖植物的茎、叶都可以产生蔗糖,它可以在整个植物体中进行运输,也是光合产物的运输形式之一。结构:a-葡萄糖,b-果糖 a,b(1-2)糖苷键,无异构体。蔗糖葡萄糖-a,b(1-2)-果糖苷。性质: 无变旋现象; 无还原性; 不能成脎。3.乳糖顾名思义,主要存在于哺乳动物的乳汁中

26、结构:b-半乳糖-b(1-4)糖苷键-a(或b)-葡萄糖。两种异构体。a-Lactose半乳糖-b,a(1-4)-葡萄糖苷,b-lactose半乳糖-b,b(1-4)-葡萄糖苷。性质: 有变旋现象; 具有还原性; 能成脎。4.纤维二糖(cellobiose)纤维素的降解产物和基基本结构单位,自然界中不存在游离的纤维二糖。结构:两分子b-葡萄糖,b-(1,4)糖苷键。纤维二糖葡萄糖-b(1,4)-葡萄糖苷。性质: 具有变旋现象; 具有还原性; 能成脎。5.海藻糖两分子-D-Glc,在C1上的两个半缩醛羟基之间脱水,由-1.1糖苷键构成。6.棉子糖(三糖)非还原性三糖。六、多糖多糖是由多个单糖分子

27、缩合脱水而形成的。由于构成它的单糖的种类、数量以及连接方式的不同,多糖的结构极其复杂而且数量、种类庞大。多糖是重要的能量贮存形式(如淀粉和糖原等)和细胞的骨架物质(如植物的纤维素和动物的几丁质),此外多糖还有更复杂的生理功能(如粘多糖和血型物质等)。大部分的多糖类物质没有固定的分子量。多糖的大小从一定程度上可以反映细胞的代谢状态。例如:当血糖水平高时(如饭后),肝脏就合成糖原(glycogen)这时就分子量可达2´107,当血糖水平下降时,肝脏中的酶类就水解糖原,把葡萄糖释放到血液中。多糖在水溶液中只形成胶体,虽然具有旋光性,但无变旋现象,也无还原性。多糖可以分为均一性多糖(由同一种

28、单糖分子组成)和不均一性多糖(由两种或两种以上单糖分子组成)。(一)同多糖自然界中最丰富的均一性多糖是淀粉和糖原、纤维素。它们都是由葡萄糖组成。淀粉和糖原分别是植物和动物中葡萄糖的贮存形式,纤维素是植物细胞主要的结构组分。1.淀粉植物营养物质的一种贮存形式,也是植物性食物中重要的营养成分。(1)直链淀粉许多a-葡萄糖以a(1-4)糖苷键依次相连成长而不分开的葡萄糖多聚物。典型情况下由数千个葡萄糖线基组成,分子量从150000到600000。结构:长而紧密的螺旋管形。这种紧实的结构是与其贮藏功能相适应的。遇碘显兰色(2)支链淀粉在直链的基础上每隔2025个葡萄糖残基就形成一个a-(1-6)支链。

29、不能形成螺旋管,遇碘显紫色。淀粉酶:内切淀粉酶(-淀粉酶)水解-1.4键,外切淀粉酶(-淀粉酶)-1.4,脱支酶水解-1.6键。2.糖元与支链淀粉类似,只是分支程度更高,分支更,每隔4个葡萄糖残基便有一个分支。结构更紧密,更适应其贮藏功能,这是动物将其作为能量贮藏形式的一个重要原因,另一个原因是它含有大量的非原性端,可以被迅速动员水解。糖元遇碘显红褐色。3.纤维素结构:许多b-D-葡萄糖分子以b-(1-4)糖苷键相连而成直链。纤维素是植物细胞壁的主要结构成份,占植物体总重量的1/3左右,也是自然界最丰富的有机物,地球上每年约生产1011吨纤维素,经济价值:木材、纸张、纤维、棉花、亚麻。完整的细

30、胞壁是以纤维素为主,并粘连有半纤维素、果胶和木质素。约40条纤维素链相互间以氢键相连成纤维细丝,无数纤维细丝构成细胞壁完整的纤维骨架。降解纤维素的纤维素主要存在于微生物中,一些反刍动物可以利用其消化道内的微生物消化纤维素,产生的葡萄糖供自身和微生物共同利用。虽大多数的动物(包括人)不能消化纤维素,但是含有纤维素的食物对于健康是必需的和有益的。4.几丁质(壳多糖)N-乙酰-b-D-葡萄糖胺以b(1,4)糖苷链相连成的直链。5.菊糖(inulin)多聚果糖,存在于菊科植物根部。6.琼脂(Ager)多聚半乳糖,是某些海藻所含的多糖,人和微生物不能消化琼脂。(二)杂多糖杂多糖种类繁多。有一些杂多糖由含

31、糖胺的重复双糖系列组成,称为糖胺聚糖(glyeosaminoglycans,GAGs),又称粘多糖。(mucopoly saceharides)、氨基多糖等。糖胺聚糖是蛋白聚糖的主要组分,按重复双糖单位的不同,糖胺聚糖有五类:1、透明质酸2、硫酸软骨素3、硫酸皮肤素4、硫酸用层酸5、肝素6、硫酸乙酰肝素七、结合糖(glycoconjugate)糖与非糖物质共价结合形成的复合物称结合糖(复合糖,糖缀合物),包括糖脂(glycolipids),糖蛋白与蛋白聚糖、肽聚糖(peptidoglycan),糖-核酸。(一)糖蛋白糖蛋白是由短的寡糖链与蛋白质共价相连构成的分子。其总体性质更接近蛋白质。糖与蛋

32、白质之间以蛋白质为主,其一定部位上以共价健与若干短的寡糖链相连,这些寡糖链常常是具分支的杂糖链,不呈现重复的双糖系列,一般由210个单体(少于15)组成,未端成员常常是唾液酸或L-岩藻糖。1.组成-D-葡萄糖(Glc) -D-甘露糖(Man) -D-半乳糖(Gal)-D-木糖(Xyl) -D-阿拉伯糖(Ara) -L-岩藻糖(Fuc) 葡萄糖醛酸(GlcuA) 艾杜糖醛酸(IduA) N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAG) N-乙酰半乳糖胺(GalNAC) N-乙酰神经氨酸(NeuNAC) 即唾液酸(Sia)2.糖链与蛋白的连接方式糖蛋白的糖肽连接键,简称糖肽键。糖肽链的类型可以概况为:N-糖苷键型

33、:寡糖链(GlcNAC的-羟基)与Asn的酰胺基、N-未端的a-氨基、Lys或Arg的W-氨基相连 O-糖苷键型:寡糖链(GalNAC的-羟基)与Ser、Thr和羟基赖氨酸、羟脯氨酸的羟基相连。 S-糖苷键型:以半胱氨酸为连接点的糖肽键。 酯糖苷键型:以天冬氨酸、谷氨酸的游离羧基为连接点。3.糖蛋白中糖链的结构糖蛋白中的糖链变化较大,含有丰富的结构信息。寡糖链往往是受体、酶类的识别位点。(1)N-糖苷键型(N-连接)N-糖苷键型主要有三类寡糖链: 高甘露糖型,由GlcNAc和甘露糖组成; 复合型:除了GlcNAc和甘露糖外、还有果糖、半乳糖、唾液酸; 杂合型,包含和的特征。A.高甘露糖型:中国

34、地仓鼠卵细胞膜;B. N-乙酰半乳糖型;C. 混合型:卵白蛋白的一种糖链(2)O-糖苷键型(O-连接)没有五糖核心。如人血纤维蛋白溶酶原,人免疫球蛋白IgA等。4.糖蛋白的生物学功能(1)糖蛋白携带某些蛋白质代谢去向的信息糖蛋白寡糖链末端的唾液酸残基,决定着某种蛋白质是否在血流中存在或被肝脏除去的信息。脊椎动物血液中的铜蓝蛋白:肝细胞能降解丢失了唾液酸的铜蓝蛋白,唾液酸的消除可能是体内“老”蛋白的标记方式之一。红细胞:新生的红细胞膜上唾液酸的含量远高于成熟的红细胞膜。用唾液酸酶处理新生的红细胞,回注机体,几小时后全部消失。而末用酶处理的红细胞,回注后,几天以后,仍能在体内正常存活。(2)寡糖链

35、在细胞识别、信号传递中起关键作用淋巴细胞正常情况应归巢到脾脏,而切去唾液酸后,结果竞归巢到了肝脏。在原核中表达的真核基因,无法糖基化。糖蛋白可以是胞溶性的,也可以是膜结合型的,可以存在于细胞内在也可存在于细胞间质中。糖蛋白在动植物中较为典型,脊柱动物中糖蛋白尤为丰富,金属转运蛋白(转铁蛋白)、血铜蓝蛋白,凝血因子、补体系统、一些激素,促卵泡素(Follicle- stimulating hormone, FSH,前脑下垂体分泌,促进卵子和精子的发育)、RNase、膜结合蛋白(如动物细胞膜的Na+-K+-ATPase)、主要组织相容性抗原(major histocompatibility ant

36、igen,细胞表面上介导供体器官与受体器官交叉匹配的标识)。绝大多数糖蛋白的寡糖是糖蛋白的功能中心。有些糖蛋白的糖对于糖蛋白自身成机体起着保护作用或润滑作用,如牛的RNaseB(糖蛋白)对热的抗性大于RNaseA,大量的唾液酸能增强唾液粘蛋白的粘性从而增强唾液的润滑性。南极鱼抗冻蛋白的糖组分能与水形氢键,阻止冰品的形成从而提高了抗冻性。糖蛋白在细胞间信号传递方面着更为复杂的作用。Hiv的靶细胞结合蛋白GP120是一个糖蛋白,能与人类靶细胞表面的CD4受体结合从而附着在靶细胞表面,如果去掉GP120的糖部分则不能与CD4受体结合从而失去感染能力。细胞表面的糖蛋白形成细胞的糖萼(糖衣)、参与细胞的

37、粘连,这在胚和组织的生长、发育以及分化中起着关键性作用。(二)蛋白聚糖(oroteoglycans)由糖胺聚糖与多肽链共价相连构成的分子,总体性质与多糖更为接近。糖胺聚糖链长而不分支,呈现重复双糖系列结构,其一定部位上与若干肽链相连。由于糖胺聚糖具有粘稠性,所以蛋白聚白又称为粘蛋白、粘多糖蛋白质复合物等。1.蛋白聚糖中的糖肽键在蛋白聚糖中已知有三种不同类型的糖肽键:(1)D-木糖与Ser羟基之间形成的O-糖肽键,主要存在于硫酸软骨素、硫酸皮肤素、硫酸类肝(GlcUA13Gal13Gal14Xyl1 Ser )、肝素等。(2)N-乙酰半乳糖胺与Thr或Ser羟基之间形成的O-糖肽键,如骨骼硫酸角

38、质素(GalNAc l 6 GalNAcser/Thr)。(3)N-乙酰葡萄糖胺与Asn之间形成的N-糖肽键,如角膜硫酸角质素(GlcNAc-N-Asn)2.糖白聚糖的生物学功能糖白聚糖主要存在于软骨、键等结缔组织和各种腺体分泌的粘液中,有构成组织间质、润滑剂、防护剂等多方面的作用。(三)肽聚糖(peptidoglycan)是细菌细胞壁的主要成分,草兰氏阳性细菌胞壁所含的肽聚糖占干重的50-80%,草兰氏阴性细菌胞壁所含的肽聚糖占干重的110%糖链由N-乙酰葡萄糖胺和N-乙酰胞壁酸通过-1.4糖苷键连接而成,糖链间由肽链交联,构成稳定的网状结构,肽链长短视细菌种类不同而异。1.四肽及连接方式四

39、肽中N端的Ala上-NH2与M中乳酸的羧基连接。2.五聚Gly及连接方式(1)五聚Gly的N端NH2与四肽C端Ala上的羧基连接。(2)五聚Gly的C端羧基与另一个四肽的Lys-NH2连接。溶菌酶能水解G-M间的-1.4糖苷键,使细胞壁出现孔洞,基至解体,从而杀死细菌。人的眼泪中存在大量的溶菌酶,某些噬菌体在感染宿主时也可分泌溶菌酶。鸡蛋中也含大量的溶菌酶。某些抗生素(如青霉素)能抑制肽聚糖的生物合成第二单元 脂类 Lipids一、脂类的概念不溶于水而能被乙醚、氯仿、苯等非极性有机溶剂抽提出的化合物,统称脂类。脂类包括油脂(甘油三脂)和类脂(磷脂、蜡、萜类、甾类)。二、分类(1)单纯脂:脂肪酸

40、与醇类形成的酯,甘油酯、鞘脂、蜡(2)复合脂:甘油磷脂、鞘磷脂。(3)萜类和甾类及其衍生物:不含脂肪酸,都是异戊二烯的衍生物。(4)衍生脂:上述脂类的水解产物,包括脂肪酸及其衍生物、甘油、鞘氨醇等。(5)结合脂类:糖脂、脂蛋白三、脂类的生物学功能脂类的生物学功能也多种多样:生物膜的结构组分(甘油磷脂和鞘磷脂,胆固醇、糖脂);能量贮存形式(动物、油料种子的甘油三酯);激素、维生素和色素的前体(萜类、固醇类);生长因子;抗氧化剂; 化学信号(如DAG );参与信号识别和免疫(糖脂);动物的脂肪组织有保温,防机械压力等保护功能,植物的蜡质可以防止水分的蒸发。四、脂肪酸及其衍生物(一)脂肪酸绝大多数的

41、脂肪酸含有偶数个碳原子,形成长而不分支的链(也有分支的或含环的脂肪酸)。不饱和脂肪酸有顺式和反式两种异物体。但生物体内大多数是顺式结构。不饱和脂肪酸中,反式双键会造成脂肪酸链弯曲,分子间没有饱和脂肪酸链那样结合紧密。因此,不饱和脂肪酸的熔点低。脂肪酸(主要是豆蔻酸与棕榈酸)可以与蛋白质共价相连,形成脂酰蛋白(acyloted protein),脂酰基团能促进膜蛋白与疏水环境间的相互作用。1、必需脂肪酸(essential fatty acids)植物和细菌可以利用乙酰CoA合成所需的全部脂肪酸。哺乳动物既可从食物中获得大部分脂肪酸,也可以合成饱和脂肪酸和一些单不饱和脂肪酸,但是,哺乳动物不能合

42、成多不饱和脂肪酸(如亚油酸和亚麻酸),称为必需脂肪酸。亚油酸和亚麻酸必须从植物中获取。花生四烯酸可由亚油酸在体内合成。2、皂化值(评估油的质量)完全皂化1克油脂所需KOH的毫克数,称皂化值。可用来评估油脂的质量。3、酸值(酸败程度)中和1克油脂中的游离脂肪酸所消耗的KOH毫克数。4、碘值(不饱和键的多少)100克油脂吸收碘的克数。(二)类二十烷酸也称类花生酸(eicosanoid),包括前列腺素类(prostaglandin),凝血恶烷类(thromboxane)和白细胞三烯类(leucotriene)是一大类由许多哺乳动物组织产生的激素类的物质。它们只在产生的器官中起作用,所以称为自泌调控分

43、子,而不是激素。大多数的类二十烷酸是花生四烯酸的衍生物。花生四烯酸也称5,8,11,14-二十碳四烯酸(eicosatetraenoio acid),是由亚油酸合成后加上一个二碳单位、引入两个双键而生成的。1.前列腺素类前列腺素类是花生四烯的衍生物。有一个环戊烷结构,C11、C15位点各有一个-OH。PGE在C9位上有一个C=O(carbonyl group),PGF在C9上有一个-OH。角注数学表明分子中双键的数目,PG2类前列腺素是人类中最重要的前列腺素。前列腺素参与许多生理过程的调节控制,促进炎症反应,参与生殖过程(如排卵、受孕和分娩时子宫的收缩),参与消化。2.凝血恶烷类(thromb

44、oxanes)凝血恶烷类也是花生四烯酸的衍生物。与其他类二十烷酸不同的是凝血恶烷类有环醚结构。凝血恶烷A2(TxA2)是该类化合物中最重要的一种,它主要由血小板产生,促进血小板凝聚和平滑肌收缩。3.白细胞三烯(leucotriene,LT)是花生四烯酸的羟基脂肪酸衍生物。最初是在白细胞中发现的,并且有三烯结构,故名白细胞三烯。LTC4、LTD4和LTE4是过敏性反应的慢反应物质的组分,在炎症反应起积极作用,促进白细胞趋向破坏组织。五、脂酰甘油因为不带电荷,有时也称中性脂(neutral fats),包括简单三脂酰甘油和混合三脂酰甘油。六、磷脂磷脂是重要的两亲物质,它们是生物膜的重要组分、乳化剂

45、和表面活性剂(表面活性剂是能降低液体,通常是水的,表面张力,沿水表面扩散的物质)。磷脂有两类:甘油磷脂和鞘氨醇磷脂。甘油磷脂由甘油、脂肪酸、磷酸和一分子氨基醇(如胆碱、乙醇胺、丝氨酸或肌醇)组成。鞘氨醇磷脂只是以鞘氨醇代替了甘油。(一) 甘油磷脂天然存在的甘油磷脂都是L-构型。1.结构与分类依照氨基醇的不同可分以下几类: (1)、 (1)磷脂酰胆碱(卵磷脂,PC):极性头为HO-CH2CH2-N+(CH3)3(胆碱),主要存在于大豆等植物材料,脑、精液、肾上腺、红细胞,蛋卵黄(810%)等动物组织。可控制肝脂代谢,防止脂肪肝的形成。(2)、 (2)磷脂酰乙醇胺(脑磷脂)(PE):极性头为HO-

46、CH2CH2-N+H3(乙醇胺)。(3)、 (3)磷脂酰丝氨酸(PS):极性头为丝氨酸,参与血液凝固。(4)、 (4)磷脂酰肌醇(PI):极性头为肌醇,存在于哺乳类的细胞膜中,其衍生物参与细胞信号转导。(5)、 (5)磷脂酰甘油(PG):在细菌的细胞膜中含量丰富,是心磷脂的极性头部。(6)、 (6)二磷脂酰甘油(心磷脂):主要存在于心肌线粒体和细菌的细胞膜。2.甘油磷脂的性质1.极性:含极性头、非极性尾。2.带电性(可用于分离纯化)。(二)鞘磷脂 高等动物组织中含量较丰富。1.组成:一个鞘氨醇;一个脂肪酸;一个磷酸;一个胆碱或乙醇胺。2.结构与性质鞘磷脂极性头部分是磷脂酰胆碱或磷脂酰乙醇胺。鞘

47、脂类含有一个长的氨基醇,是动植物生物膜的重要组分。除了动物细胞膜外,鞘磷脂在神经细胞的髓鞘中含量最丰富。鞘磷脂结构与甘油磷脂相似,因此性质与甘油磷脂基本相同。3.鞘氨醇已发现约30种,基本结构为2-氨基-4-十八碳烯-1.3-二醇,可还原为二氢鞘氨醇。4.神经酰胺鞘脂类的核心结构是神经酰胺(ceramide),由鞘氨醇氨基以酰胺键与长链(1826C)脂肪酸的羟基相连。在鞘磷脂中,神经酰胺1位的-OH被磷酸胆碱(phosphorylcholine)或磷酸乙醇胺(phosphorylethanolamine)的磷酸基因酯化。七、结合脂类(一)糖脂(glycolipid) 1.糖脂的结构包括甘油醇糖

48、脂和N-脂酰神经鞘氨醇糖脂(神经酰胺糖脂)。神经酰胺糖脂也称鞘糖脂。在鞘糖脂中,单糖、双糖或寡糖通过O-糖苷键与神经酰胺相连,重要的鞘糖脂有脑苷脂(cerebroside)、硫脑苷脂(sulfatide)和神经节苷脂(ganglioside)。(1)脑苷脂(中性糖鞘脂类):是单糖与神经酰胺形成的糖脂,是非离子型的。半乳糖脑苷脂(galatocerebroside)几乎全部存在于脑的细胞膜中。脑苷脂被硫酸化后称为硫脑苷脂,在生理pH下带负电荷。(2)神经节苷脂(酸性糖鞘脂类):寡糖链(带有一个或多个唾液酸残基)与神经酰胺形成的鞘糖脂称为神经节苷脂,最初是从神经组织中分离到的,在其它组织中也有分布

49、。神经节苷脂的命名含有M、D、T和角注数字,M、D、T分别表示含有一个、两个、三个唾液酸,数字表示在糖链上的位置。在脑灰质和胸腺中含量高。中枢神经系统某些神经元膜的特征性脂,可能与通过神经元的神经冲动传递有关。人的神经系统细胞膜至少有15种神经节苷脂,它们的生物功能尚未完全了解。2.糖脂的生物学功能糖脂的功能还不十分清楚,有些动物细胞膜上的糖脂分子能与细菌毒素以及细菌细胞结合,起受体的作用。(1)维持细胞结构的刚性。(2)抗原的化学标记,如血型抗原。人的A、B、O血型差异在于糖链末端残基。现在临床上正研究用酶促降解B抗原或A抗原的末端残基Gal或GalNAc,从而增加O抗原的血液来源。(3)细

50、胞分化阶段可鉴定的化学标记,可能与糖链的长短有关。(4)调节细胞的正常生长,与正常细胞转化成肿癌细胞有关。肿瘤Cell的神经节苷脂糖链比正常Cell的短。(5)授予细胞与其它生物活性物质的反应性倾向。(6)鞘脂贮积病(sphingolipld storage disease, sphingolipidose)溶酶体贮积病是由于降解某种特定代谢物的酶发生遗传性缺陷造成的。一些溶解体贮积病与鞘脂代谢有关,也称鞘脂贮积病,常见的就是Tay-sochs神经节苷GM2贮积病,这是由于降解它的b-hexosaminidaseA(b-氨基己糖苷酶)缺陷造成的。当细胞积累GM2时就溶胀最终死亡,Tay-Sac

51、hs综合症(失明,肌肉萎缩,抽搐,精神错乱),通常在出生数月后表现出来。diseasesympternAccumulating spluingolipidEnzyme deficiencyTay-sachs diseaseBlindnessMuscle weaknessSeizuresMental retardationGanglioside GM2b-hexosaminidoseAGaucheris diseaseMental retardations,Liver and spleen enlargementEresion of cong bonesGlucocerebosileb-gluc

52、osidaseNiemann-Pick diseaseMontal retardutionsphingomyelinsphingomylinase(二) 脂蛋白(lipoprotein)1.血浆脂蛋白根据密度来分类:(1)乳糜微粒,密度非常低,从小肠运输甘油三酯和胆固醇脂到组织肌肉和adipose组织。(2)极低密度脂蛋白VLDL(0.951.006g/cm3),在肝脏中生成,将脂类运输到组织中,当VLDL被运输到全身组织时,被分解为三酰甘油、脱辅基蛋白和磷脂,最后,VLDL被转变为低密度脂蛋白。(3)低密度脂蛋白(LDL,1.0061.063g/cm3),把胆固醇运输到组织,经过一系列复杂的

53、过程,LDL与LDL受体结合并被细胞吞食。(4)高密度脂蛋白(HDL,1.0631.210g/cm3),也是在肝脏中生成,可能负责清除细胞膜上过量的胆固醇。当血浆中的卵磷脂:胆固醇酰基转移酶(Lecithin cholesterol acyltransferase, LCAT)将卵磷脂上的脂肪酸残基转移到胆固醇上生成胆固醇脂时,HDL将胆固醇脂动输到肝。肝脏将过量的胆固醇转化为胆汁酸。2.脂蛋白与动脉粥样硬化(atherosclerosis)动脉粥样硬化是一个慢性病,在此过程中,粥样物质逐渐沉积在动脉的内壁上,这些沉积物称为Plaque(蚀斑),在plaque形成过程中,平滑肌细胞、巨噬细胞和

54、各种细胞残渣逐渐聚集。当巨噬细胞中吞食了大量脂类物质(主要是胆固醇和胆固醇脂)它们就成为粥样化细胞。最后,粥样硬化斑钙化(calcify)突入动脉腔,阻止血液流动,大脑、心、肺等器官就会缺氧和营养。冠状动脉粥样硬化病是最常见的一种,由于缺氧和营破坏了心肌。Plaque中的胆固醇大部分是来自粥样细胞吞噬的LDL。因此,毫不奇怪,高水平的血浆LDL与冠状动脉粥样症直接相关(LDL含有大量的胆固醇及胆固醇脂),其它相关因素还包括高脂类饮食、吸烟、抑郁和缺少运动,高水平的血浆HDL与代几率的冠状动脉病有关。肝细胞是唯一具有HDL受体的细胞。可粥样化的细胞具有LDL受体,当LDL与受体结合后这些细胞就通

55、过胞吞作用吞食LDL。在正常情况下,进入细胞中的LDL释放出的胆固醇和其它脂类可用于细胞结构和代谢上的需要。通常情况下LDL受体功能是高度调控的,吞入相对大量的LDL后,LDL受体合成就降低。巨噬细胞却不同,LDL受体的合成并不降低,粥样硬化斑中的巨噬细胞含有高水平的LDL受体,而且对氧化破坏的LDL仍有亲和力。抗坏血酸(Vc)和VE都是抗氧化剂,能抑止粥样斑的形成。八、萜类和固醇类化合物可以统称为类异戊二烯类(isoprenoid),是由乙酰-CoA经由异戊二烯焦磷酸生成的。(一)萜类一些真核蛋白质合成后经过异戊二烯化,常见的异戊二烯基团就是farnesyl和geranylgeranyl g

56、roup。 (二)固醇类结构:含有环戊烷多氢菲母核的一类醇、酸及其衍生物。包括:固醇、固醇衍生物。1.胆固醇(二氢胆固醇、7-脱氢胆酸、胆固醇酯)以游离或酯的形态存在于一切动物组织中,植物中没有。是最早由从动物胆石中分离出的固醇。(7)、 (1)结构C3 羟基,C10和C13各一个甲基,C5与C6间一个双键,C17异辛烷。(2)性质 白色、斜方晶体;醇基可与脂酸成酯(棕榈酸、硬脂酸、油酸);双键可加氢。(8)、 (3)分布及功能a. 70千克人体含140克左右,1/4在脑及神经组织中,肝、肾含量较多。肾上腺、卵巢等合成固醇激素的腺体含量也较多,可达15%。血清中含量升高,会增加患心血管疾病的可能性。b. 胆固醇是生物膜的重要成分,羟基极性端分布于膜的亲水界面,母核及侧链深入膜双层,控制膜的流动性,阻止磷脂在相变温度以下时转变成结晶状态,保证膜在低温时的流动性及正常功能。c. 胆固醇是合成胆汁酸、类固醇激素(肾上腺皮质激素、雌激素、雄激素)、维生素D等生理活性物质的前体。胆汁酸(在肝中合成)参与肠道脂类吸收2.植物固醇不能被动物吸收和利用。主要有豆固醇(大豆中

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