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文档简介
1、MTHFR C677T , MTHFR A1298C, MTRR A66G基因检测操作流程实验流程一、操作步骤适用仪器:普通PCR仪样本要求:EDTA抗凝剂的静脉全血(100µl),室温保存不超过7天, 28保存不超过1个月,-20保存不超过3个月,反复冻融次数不超过5次;DNA的浓度应不低于5ng/l, A260/ A 280应在1.62.0之间。有血块的样本需经匀浆处理或用组织研磨仪研磨处理后再进行全血DNA的提取。检验方法:(试剂盒中的检本测卡、阳性/阴性对照卡上标识解释如下:M表示突变型,WT表示野生型,C表示质控线,T表示检测线。)A: 样本DNA的制备试剂盒准备工作:1、
2、清洗液BW-I:用50 ml量筒分别移取35 ml无水乙醇(分析纯)和35 ml异丙醇加入至清洗液BW-I试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。2、清洗液BW-II:用50 ml量筒移取49 ml无水乙醇加入至清洗液BW-II试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。3、蛋白酶K准备:取出蛋白酶K,室温解冻,涡旋混匀后备用。4、磁性微粒准备:将磁性微粒涡旋混匀,保证均一。实验操作步骤:1. 将20 l蛋白酶K溶液加入2 ml 离心管的管底。依次加入100 l全血、200 l裂解液BL,用涡旋振荡器混合15 sec(以下简称涡旋混匀),56 水浴2
3、0 min。2. 向步骤1裂解处理的样品中依次加入300 l结合液BI、25 l的磁性微粒(移取前必须充分涡旋混匀),涡旋混匀,室温静置5 min。磁性分离5 min,弃上清。3. 从磁性分离器上取出离心管,加入400 l清洗液BW-I,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清;重复本步操作,以400l清洗液BW-I重复清洗一次。4. 从磁性分离器上取出离心管,加入400 l清洗液BW-II,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清(期间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁),弃上清(尽可能弃去所有的清洗液BW-II)。5. 打开离心管盖,将其室温晾干5 min。6. 从磁性分
4、离器上取下离心管,向管中加入100 l 洗脱液ES,涡旋混匀,56水浴5 min。7. 将离心管置于磁性分离器上,磁性分离至上清澄清。将上清液(分离纯化得到的DNA溶液)转移到2 ml离心管中,直接用于下游实验或于-20 保存备用。B:PCR扩增液准备(1)每人份需做两个反应,取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT。(2)将试剂从-20取出平衡至室温,瞬时离心。在标有M的管中加入29µl 扩增液(M),在标有WT的管中加入29 µl扩增液(WT)。 (3)分别向以上M和WT各管中加入1µl反应液。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心待
5、用。C:待检测DNA样本的配制在上述标有M、WT管中分别加入3µl待测基因组DNA,分别再加入17µl ddH2O使终体积为50 µl。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心。D:PCR扩增将PCR管放入PCR仪中,按如下程序扩增:50 2min;95 5min; 94 30sec、60 30sec、 65 1min(26Cycles);65 10min; 4 Hold。取出PCR产物,28保存。E: 检测卡检测实验从密封袋中取出检测卡,将待测样本M与WT管中的PCR产物分别滴加在检测卡对应的样品垫处,待25 min对结果进行判读,20min后结果不可靠。F:质量控制(
6、1)检测结果中阳性对照应在阳性对照卡检测线(T线)出条带,阴性对照应在阴性对照卡检测线(T线)不出条带。正常检测时,应定期进行阳性对照品及阴性对照品实验。(2)阳性对照品实验:取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将20µl M阳性对照液、20µl WT阳性对照液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,再依次分别加入M扩增液29µl及1µl反应液、WT扩增液29µl及1µl反应液,按照步骤中DF完成,检测线(T线)及质控线(C线)均应出现条带。(3)阴性对照品实验:取两个无菌0.2ml PCR薄壁管,
7、在PCR薄壁管管盖上依次标有M、WT,将M扩增液29µl、1µl反应液及WT扩增液29µl、1µl反应液分别加入标有M、WT的PCR薄壁管中,再分别加入20µl阴性对照液,按照步骤中DF完成,质控线(C线)应出现条带,检测线(T线)应无条带出现。G:结果判读(如下图、下表)如上图一所示,以阳性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T线)有条带出现,作为阳性对照;以阴性对照液为模板进行PCR反应,对PCR产物进行检测,检测线(T线)无条带出现,为阴性对照。若阴性样本有条带出现,有可能加样时未及时更换吸头,有DNA污染,建议在操
8、作过程中,先配制阴性对照管并及时闭合PCR管盖。图二显示MTHFR 677CC表示正常野生型;图三显示MTHFR 677TT表示一对等位基因的第677位胞嘧啶(C)均变为胸腺嘧啶(T),即纯合突变;图四显示MTHFR 677CT表示其中一个等位基因的第677位胞嘧啶(C)变为胸腺嘧啶(T),即杂合突变;图五质控线(C线)无条带或质控线(C线)与检测线(T线)均无条带,即为无效检测。无效原因可能为操作不正确或试纸条已变质损坏。应再次仔细阅读说明书,并用新的检测卡重新检测。如果问题仍然存在,应立即停止使用该批号产品,并与厂家或供应商联系。 H:注意事项(1)实验室应该遵循PCR实验规范的要求分区操作,各区物品均为专用,不得交叉使用,加模板和引物的移液器不能混用,每次加样后均需更换吸头,推荐使用无核酶、带滤芯的吸头。各区的仪器、设备和工作服应独立使用。 (2)本试剂盒用于体外操作。用户切勿吸入试剂或直接接触皮肤。(3)使用本试剂盒前,请仔细阅读说明书,严格按照说明书的要求操作。打开包装后请尽快使用。(4)使用本试剂盒时,因PCR体系为50µl体系,应使用200µl的PCR扩增管进行操作。(5)本试剂盒备有“PCR组分加入确认单”,在【检测方法】中的步骤B(PCR扩
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