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文档简介

1、第四章 图谱的编辑与输出第四章图谱的编辑与输出Vector NTI主程序中的图谱窗口有内建作图和图形编辑功能,我们可以依照 自身的需求进行绘图,图形可以进行输出成为个人的美术作品。将光标点击图谱窗口之后可以见到下列指令:这些指令中有一些和上一章序列窗口有类似的功能,在此便不加以重述19第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出视图谱大小和形状:能够改变图形的形状,把序列变成圆形或是直线,圆形的图形适用于表现质体序列的形状;直线适用于表现单一股序列形状。图谱大小用来放大缩小图片,可以依照个人喜好调整。图谱被程序标上限制酶的切位必须要移除。在上方An alysih RestrictionA

2、nalysisRestriction site中点选Remove ALL再按OK就可以了。接着就可开始编辑图形了。我们要在序列标示特定标记时,先将光标移至图谱窗口,接着按下山指令会出现图4.1:图4.1编辑图形设定tiomi Map斑馬魚海大基因7C TGCGTGCATAZGCA 匸 GT 義TGTTTACCCCT AT CAST Z 匚丁GA TAGTCAGGAGT TCCCGCCTG(ZA AGGGCGGACGG CTGCGCGCGCC GACGCGCGCIC CTTCCGGTGCAGAGGAAGGTCTCCTTCCACTAAGTTGTA1120 bp.CCTCAjG在窗口中左边是程序已经

3、内建好的图形, 每一个图形代表着序列种种不同的生物功能;右边我们可以编辑图形的范围和命名,设定好以后按0K就可以了图4.2选择所要编辑的图形#第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出接着编辑的图形就会出现在图谱窗口:JST region图4.3选择斑马鱼海大基因,所出现的图形画面色降醐审* 丽吟 Cbftas Qjd M Ahsii Awnbk Tools Window 週pE討到酋切j 山母爭尊贷嚼一£風臥我""0 ®醪;&色窗曲:閒圉匿回* h 创妙赛#F-i qqq穽|却=护财斑氏慈辉大基因住 I二| General &e

4、scriptxHi L J tandaffdl Fields 3 为 CommentsL 二J AnriotatKHisIJ Feature Map斑馬魚海大基因101AjTTTAlAAATCTT1ACC2ATCTjCCTTCS3ACT:TCAAKCMTCTCKC2jT2:T:TC:GCTGTETCSAC:CTTCiml/wAHAlrtl 1 丄1A - J J wL-w 1 >JrLJ a. J A<?丄 U占卜 Jw盘 j 必 Iri J 1 u-hw 1jljviralr JnLrl n.w 1 2Lbi.nu.1 j201CSATjaS-TCTM:fti£TCCT

5、T芯TITHTTI7:CaiCCAA7S.7CCTCTj3-:TC:TT:a:GFTT吕弗匚兀弗71工弗时A弗HTABAftCTTCCAC?STTZTCkGi二云三二二二二詆22“乂苫CAAJlCZTZ2TJ;Z :T_二2T匚匕:2二二TCiiGSTG:3 01kCS-CCS-TGT TH亡兰Ct芬 TGETG亡工:亡益心宾效亡石丫匚弐g苗芷Gg二由GgtCTAH: CTGGHgTTGraGCACA A&3GMGACC ACJlAC5:TT:GTTTIGC:TS益TTT;石离調亡CTTGCCACTTCjGASOT: 5mCC2AAITTCT:AAKG£若要修改内建的图形显示

6、方式,可以点选巨二按钮(图4.4),针对个人喜好 进行设定:图4.4 Graphics Display Setup,为修改图形显示的工具JST region21第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出Graphics Di明lay Setup+j| Leucine Zipper DomainLociLTRMature PeptideMisc. Bhdhg SitsMi?c. DifferenceMisc. F&afcuieMisc. Maik«Mic. RecombinaJionMi?c. SignalMisc. Structure 和戶|4*|4 口 部匚/ Sh

7、ow LabelSignal Label)Show SymbolShwt | t| 厂 Longv| AutoSlvle:-1 More.A#第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出按下OK就可已更改为欲设定的图形(图4.5):图4.5修改后的结果#第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出斑馬魚海大基因1120 bp#第四章 图谱的编辑与输出CGCC2T2T TCCCCCTGGTGTTGCGAAGCAAAACGGACAGTTCGCCTAAACCCGTGSACCACGjTGAA&CICCAGCTGGGC皆G7孔二JI JiGWSCGEJU;:GTTTTGCUTGT二曲

8、皆UWGTTJiITTWGGCACUTGGT皆U:丑匚TTCWEAGETUGACC#第四章 图谱的编辑与输出关于图形的大小和文字的更变,我们可以按住Ctrl后按下丄按钮,接着就 可以调整图形和文字(图4.6):图4.6调整图形的大小及文字的变更23第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出按下亠按钮可以点选图谱窗口中任1120 bp我们还可以更进一步进行完整的编辑,何的图形或文字进行编辑(图4.7):图4.7更进一步的对图形进行编辑JST regionProperties.A)ATGS: ' "-|电QGKI磯為巒1#第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出

9、StykRedefine Ehap电 4'Sle by Example£ppy Style P 碗 StyleBiiftfe to FrontCCTTmT二 AAAGAA:2iA AATCSSGTk TTGTZi丄肌Send to Beck亠二丄一M匸二jAL丄A2各盒二二二鱼亡二二 XL二二2各工匸二話亡養二亡益養2二匸亡二匸匚二空亡T CT2CG*点选图形或文本块后可以进行上下拖移和改变形状的功能;按下鼠标右键可以更改格式,点选Properties后可选择许多不同表示方法(图4.8):#第四章 图谱的编辑与输出图4.8点选Properties进行格式的编辑JST regi

10、onL w严严.-ri423. -r 匚r i l -r fG:25第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出按下确定就可以完成编辑(图4.9)。图4.9禾U用Properties进行编辑后的结果#第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出如果是在文本块下按鼠标右键,并点选Properties可以进行对文字的编辑(图4.10):图4.10利用Properties进行文字的编辑#第四章 图谱的编辑与输出DL_三Itjl a 1 CXXl:G GTAA;TS2CTTC;CTATCCGA GAATCCCTGC CTTCATTGAT CTACCTGTGG TTCAGASAGC AATG

11、;按下确定就可以完成编辑(图4.1。图4.11 Properties文字编辑的结果在最旁边有个回形针的按钮(图4.12),点选之后可以输入相关的文字作为批 注。所输入的文字也可以进行相关的调整:图4.12为图形增加文字批注JST regionKCUF XMLToS site斑馬魚海大基因1120 bp按下OK就会显示在图谱窗口上(图4.13),所输入的文字批注也会在文字窗口 中出现。NOTE :想要删除图形或是文字的话可以点选欲删除的区块,按下鼠标右键或是 进入Edit内选择Delete Feature Form FMqp再按确定就可以了。图形的输出:在画好图片后,要如何从Vector NTI

12、中输出呢?我们只要执行 指令(图4.14)就可以将图形复制,操作方式同上一章所述图4.14将编辑好的图形输出27第四章 图谱的编辑与输出#第四章 图谱的编辑与输出JST regionKCUF XMLToS siteL12O bp图形输出后可以进行再编辑,以复制到PowerPoin为例子(图4.15),输出的图形为群组图案,我们只要取消群组图案后就可以编辑图形和文字了。图4.15输出到PowerPoint的图形结果Microsoft Po-werPoiiit 订團轄2A 业 PDP瞇田鶴 乞画创矗”田.尺亠®= y = lift |E :E A a'国ifiit 也新投矗片迪,

13、哲"(Btens® JflAfl)格式© 工耳(I)投恚片放映回説明| B / U S;'鬲 Times New Rommi*新細明體fr Arialr Comic Sans M.S4b Arial Unicode MS t Bata ng1 1 1 1 1 gp|, 1.1-0. I.12.1 - I . r ! . ! 46- I . ! . I I . !, 2ft ! . IKGUF XP.1L' Esuotadanfl如此一来我们就有一张漂亮的序列图形,可以应用在报告或论文写作上了29第四章 图谱的编辑与输出1 J 1丄 1 lrri'nJiCJ L-kJL y&ShwLL-1 jC L-1 UJ/Ll 1 Jnl t-X-Ji CO

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