相位层析显微镜

1、相位层析显微镜摘要：本文介绍了在多个角度使用相移激光干涉显微术得到定量的活细胞或组织折射率的三维分布的技术。我们展示细胞和多细胞组织的层析成像，和基于时间变化的细胞的结构。我们的结果可以定量分析样品带来的在高分辨率显微镜下的像差，而且，在组织散射中也有很多的应用。关键词：激光干涉显微术；折射率；三维分布。引言高分辨率光学显微镜不仅受到光的衍射性质的局限，并且由于样品的光学不均匀性，其分辨率也受很大的影响。如果能够精确的测量由折射率变化造成的像差，自适应光学1和反褶积技术2可以很好的用来纠正样品所引起的像差。但是，所有的修正手段或技术都需要样品折射率的三维定量分布场。折射率展示了其在分析细胞结构

2、的一个独特视角，在分析细胞或组织的光散射效应，单分子光镊，流式细胞仪，全内反射显微镜，光与细胞或组织相互作用等的各个研究领域中，样品的折射率分布均有重要的应用。传统的细胞折射率测量技术只能得到单细胞的平均折射率，而且忽略了亚细胞结构带来的空间变化。此外，测量样品需要浸泡在不同折射率的折射率液中，并且需要使用相衬显微镜3进行观察。这一过程极其繁琐，而且受到一些限制：由于测量细胞需要浸泡在折射率液中，必须选择合适的折射率液从而不使细胞的形貌产生改变。最近，已经报道了使用显微镜原理精确测量样品平均折射率的技术4,5，其能够定量精确测量由于样品带来的相移。但是三维空间的折射率分布测量还没有实现。一个测

3、量三维折射率的技术是基于测量不同投影方向的折射率，其类似于X射线断层扫描，测量各个投影方向的吸收系数。空间折射率的投影测量已经通过几种可以定量测得相位的显微镜技术4,6,7实现。还有更早的两项研究使用光束旋转8或是样品旋转9的方式得到了样品的断层扫描图像。但是在使用光束旋转的实验中，折射率的定量测量资料没有给出8而在需要样品旋转的实验中，则必须将样品浸泡在丙三醇中并且需要将样品放进微管进行旋转测量9。研究内容我们提出了一种高分辨率定量测量样品三维折射率的技术，这项技术可以测量悬浮的或者是在基底上的细胞，亦可以测量多细胞样品，且不需扰动样品或是将样品浸在特殊的媒介物中。装置（图1）是基于马赫-曾

4、德外差干涉仪10，可以使参考光产生频移，从而使马赫-曾德外差干涉仪产生基于时间变化的定量相位图像。氦氖激光器的光束（波长为633纳米）被分束镜分成了两束：一束为物光，另一束为参考光。在油浸聚光透镜与物镜之间放置的是一个倾斜的扫描全反镜，其是用来调节入射光进入样品的角度。在参考光路中，激光光束经过两个声光调制器（AMO），使激光的频率移动1250赫兹。第二个分束镜的作用是将物光与参考光移动到同一光路中，使之在像平面上形成干涉条纹。对于每个入射角度，互补金属氧化物半导体摄像头（CMOS）（Photron 1024PCI）拍摄4张图片，速度为5000帧图像/秒。两连续帧之间，物光相位与参考光相位的差

5、是Pi/2。随后使用相移干涉术对相位图像进行计算处理（补充方法已经放在网络上）。图1 相位显微断层扫描术。BS1和BS2分别代表分束镜1和分束镜2；GM代表扫描全反镜；L1代表焦距为250毫米的透镜；BF代表聚光透镜的后向焦平面；L1代表焦距为200毫米的透镜。通过样品的激光束（物光）使用激光的原有频率，在图中用红色表示，经过频移的激光用作参考光，在图中用蓝色表示。图中呈现了一个使用宫颈癌细胞作为样品测量的典型干涉花样。对于近场光波入射折射率差异较小的薄样品时，入射场的相位等于折射率与光在样品内的传播距离乘积的线积分，其是一个相当好的近似。因此，相位图像可以简单的认为描述了投影方向的折射率。类

6、似于X射线层析的各个投影方向的吸收率。（参见网络上本文的补充说明图1，为一幅相位几何投影图。）为了从投影相位图片重建三维断层折射率，我们应用基于选择性后向投影法的程序11。我们对光束入射的方向的每一个元胞采用了离散反随机变换，其中x指坐标中的倾斜方向，指物光方向与物镜光轴之间的夹角。为了弥补的成像和入射的方向，我们首先让x除以cos。入射角度通过聚光器和物镜的数值孔径限制于|<60度。为了减小投影衰减效应，我们应用迭代约束法。(补充方法和补充软件在网络上）为了验证我们仪器的测量准确程度，我们首先测量了浸在稍低折射率油溶液里的颗粒直径为10微米的聚苯乙烯颗粒折射率断层图片。（Polysci

7、ences，在波长为633纳米时折射率为1.588；Cargille，在波长为633纳米时折射率为1.559）断层图片显示：颗粒内部的折射率和周围包裹的液体（油溶液）的折射率的差为delta n=0.0285 ± 0.0005，符合颗粒与油溶液两者折射率差为0.029的条件。我们还使用了折射率从1.55到1.59各种不同的油溶液进行相似的实验，结果都很好的符合了条件。通过测量与颗粒和油溶液界面都垂直的延长线上的折射率分布，我们估计我们设计的层析技术的横向（x-y方向）空间分辨率约为0.5毫米；纵向（z方向）空间分辨率约为0.75毫米。下一步，我们使用在培养基中的宫颈癌细胞作为样品成像

8、。我们从培养基中分离出细胞，将分离出的部分细胞放在盖玻片基板上。对单细胞的三维折射率断层分析（参见图2a，b和补充视频1，均已在网络上）和XY方向基底上，在高度z分别为12，9.5，8.5，7.5，6.5和5.5微米的同一水平面的断层分析（参见图2c到2h）表明：折射率分布相当不均匀，从1.36到1.40不等。同时可以发现在断层图像（图2e，2f）和相应的明视野图像（图2i，2j）之间，有很明显的相似。其描绘了细胞边界，细胞核边界，同时也描绘了核仁的大小和形状。图2 宫颈癌细胞的断层折射率分布图。（图a） 宫颈癌细胞的三维渲染图像。上半球的最外层的细胞被省略为了显示出其内部结构。核仁用绿色标出

9、。部分折射率高于1.36的细胞浆用红色标出。图中立方体边框的边长为20微米。（图b）图a的顶视图。（图c-图h）样品切片在不同高度的断层图像。图c中的比例尺为10微米。色条表示在波长为633纳米时的折射率大小。（图i，图j）分别是对应图e和图f的明视野图像。我们注意到远离核仁的原子核的折射率（折射率在1.355到1.365之间）小于一部分细胞浆的折射率（折射率在1.36到1.39之间）.而核仁的折射率，其范围处于1.375到1.385之间，要普遍大于其他原子核的折射率。这个结论与经常被应用的结论“原子核的折射率都大于细胞其他部分的折射率”恰恰相反12。我们使用传统的HEK 239细胞，B35神

10、经母细胞瘤细胞，大鼠海马神经细胞作为样品，也得到了类似的结论。所用的样品细胞都包含有很多细小的细胞浆颗粒，其折射率都较大。它们可能是脂质，溶酶体，液泡或其他细胞器。下一步，我们使用折射率断层扫描的方法检测活细胞的生理变化。局部应用醋酸可能会导致子宫颈地区变白，这被广泛用于确定癌前病变的可疑地点。可以说明，细胞核蛋白的凝固可能增大细胞核和细胞浆之间的折射率对比度13。为了探讨低浓度醋酸对细胞结构的影响，并解释醋酸使组织漂白的机制，我们将宫颈癌细胞的培养环境从自然培养环境改变为使培养基中含有0.38乙酸的环境，并使用我们的断层显微镜记录细胞折射率断层图片（图3a，3b）。光学层析图片可以在不足10

11、秒之内得到，从而能够测量由外部扰动造成的相对迅速的细胞变化。我们观察到细胞核核仁的折射率从1.36上升到1.39，而细胞内其它非均质性的折射率也急剧增加。这说明了同时增加散射与酸漂白会导致细胞核仁与细胞其它组织的折射率差异增大，同时使细胞的折射率分布变得不均匀。三分钟后将含醋酸的培养基更换为正常培养基，细胞的折射率空间分布差异变小了一些，但是与基准值仍有较大差距（图3c）。图3 醋酸对宫颈癌细胞的影响和线虫的影像（图3a-图3c）。 （a）宫颈癌细胞在培养皿中x-y方向的层析图像。（b）在含有浓度为0.38醋酸的培养皿中三分钟后的层析图片。（c）将培养皿换成正常的中性培养皿，三分钟后的层析图片

12、。图像中的比例尺为10微米。（d）x-y方向线虫的层析图像。线虫的前端在右方。图像中的比例尺为50微米。色条代表在波长为633纳米条件下的折射率。为了对多细胞有机体进行层析成像，我们选择了线虫类中的新杆状线虫进行实验。我们将线虫和10毫米长的叠氮化钠平行放置在一个线虫类的培养基缓冲区中并使用相同的方法对样品进行层析成像。我们采用了重叠断层图片的数据重构方式并将实验所得到的数据生成图片（图3d和在网络上的补充图2）。图中，几个内部结构均清晰可见，其中包括很明显的咽部和消化道结构。最后，我们使用了在光学黏稠剂中悬浮的聚苯乙烯颗粒来讨论对厚样品物体拍摄断层图片获取其折射率的方法。对于这些样品，投影近

13、似不再有效。其表现在得到的层析重建图像中的聚苯乙烯颗粒有严重的扭曲及离焦效应（已经在网络上的补充图3）。但是，通过改变聚焦于样品上的焦点，理论上可能获得任何样本深度的准确层析图（已经在网络上的补充图3和图4）。一个厚样品的三维层析图可以通过对样品不同深度层析后重建图像得到（参见补充方法）。总结最后是我们的总结，我们设计了一种定量测量活细胞和组织折射率的层析技术。由层析显微放大技术重建三维样品的图像的方法可以补充其它图像显示技术，如苏木精技术和曙红染色技术。折射率数据可以用来研究细胞和组织的光散射特性，也可以用来研究在显微放大中样品带来的像差。表征和改正这些像差对现代超分辨技术如STED14，结

14、构照明15可能产生特别重要的影响。参考文献1. Booth, M.J., Neil, M.A., Juskaitis, R. & Wilson, T. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 99,57885792 (2002).2. Kam, Z., Hanser, B., Gustafsson, M.G., Agard, D.A. & Sedat, J.W. Proc. Natl. Acad.Sci. USA 98, 37903795 (2001).3. Ross, K. Phase Contrast and Interference Microscopy f

15、or Cell Biologists.(Edward Arnold Publishers, London, 1967).4. Rappaz, B. et al. Opt. Express 13, 93619373 (2005).5. Lue, N. et al. Opt. Lett. 31, 27592761 (2006).6. Dunn, G.A. & Zicha, D. J. Cell Sci. 108, 12391249 (1995).7. Park, Y.K., Popescu, G., Badizadegan, K., Dasari, R.R. & Feld, M.S. Opt. Express 14,82638268 (2006).8. Lauer, V. J. Microsc. 205, 165176 (2002).9. Charriere, F. et al. Opt. Lett. 31, 178180 (2006).10. Fang-Yen, C. et al. Opt. Lett. 32, 15721574 (2007).11. Kak, A. & Slaney, M. Principles of Computerized Tomographic Imaging.(Academic Press, New Yor