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文档简介

1、质粒大量提取试剂盒(离心柱型)一、试剂盒组成、储存、稳定性试剂盒组成RNaseA(10mg/ml)溶液溶液溶液漂洗液W1漂洗液W2洗脱缓冲液EB吸附柱AC收集管(50ml)保存204室温室温室温室温室温室温室温5次(SP021)300µl30ml30ml40ml55ml65ml10次(SP022)600µl60ml60ml80ml110ml130ml第一次使用前按说明加指定量乙醇10ml5个5个20ml10个10个本试剂盒在室温储存18个月不影响使用效果。注意事项1第一次使用时,将试剂盒所带全部的RNaseA加入溶液后(终浓度100g/ml)置于4保存。如果溶液中RNase

2、A失活,提取的质粒可能会有混杂有微量RNA残留,这时可在溶液中补加RNaseA即可。2第一次使用前请先在漂洗液W2瓶中加入与W2相同体积无水乙醇,充分混匀,加入后请及时在方框打钩标记已加入乙醇,以免多次加入!3环境温度低时溶液中SDS可能会析出出现浑浊或者沉淀,可在37水浴加热几分钟,即可恢复澄清,不要剧烈摇晃,以免形成过量的泡沫。4避免试剂长时间暴露于空气中产生挥发、氧化、PH值变化,各溶液使用后应及时盖紧盖子。二、原理简介本试剂盒采用改进SDS-碱裂解法裂解细胞,然后离心吸附柱内的硅基质膜在高盐,低PH值状态下选择性地结合溶液中的质粒DNA,再通过去蛋白液和漂洗液将杂质和其它细菌成分去除,

3、最后低盐,高PH值的洗脱缓冲液将纯净质粒DNA从硅基质膜上洗脱。三、试剂盒特点1离心吸附柱内硅基质膜全部采用进口吸附膜,柱与柱之间吸附量差异极小,可重复性好。克服了国产试剂盒膜质量不稳定的弊端。2不需要使用有毒的苯酚,氯仿等试剂,也不需要乙醇沉淀。快速,方便,从100-200ml大肠杆菌LB(Luria-Bertani)培养液中,可快速提取0.5-1.5mg纯净的高拷贝质粒DNA,提取率达85%左右。3获得的质粒产量高,超螺旋比例高,纯度好,直接可以用于酶切、转化、PCR、体外转录、测序等各种分子生物学实验。四、注意事项(实验前必须首先阅读这部分!)1所有的离心步骤如未加另外说明均在室温完成,

4、使用转速可以达到至少5,000g,带50ml转头的台式离心机。2溶液、溶液、W1含有刺激性化合物,操作时要戴乳胶手套,避免沾染皮肤,眼睛和衣服。若沾染皮肤、眼睛时,要用大量清水或者生理盐水冲洗。提取的质粒量与细菌培养浓度、质粒拷贝数等因素有关。如果所提质粒为低拷贝质粒或大于10kb的大质粒,应加大菌体使用量,同时按比例增加、的用量,洗脱缓冲液应在70预热。可以适当的延长吸附和洗脱的时间,以增加提取效率。3得到的质粒DNA可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度与纯度。OD260值为1相当于大约50g/mlDNA。电泳可能为单一条带,也可能为2条或者多条DNA条带,这主要是不同程度的超螺旋构象

5、质粒泳动位置不一造成,与提取物培养时间长短、提取时操作剧烈程度等有关。本公司产品正常操作情况下基本超螺旋可以超过90%。4要知道质粒DNA确切分子大小,必须酶切线性化后,对比DNA分子量Marker才可以知道,处于环状或者超螺旋状态的的质粒泳动位置不确定,是无法通过电泳知道确切大小的。5洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保PH大于7.5,PH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20。质粒DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mMTris-HCl,1mMEDTA,PH8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀

6、释。6洗脱液EB不含有螯合剂EDTA,不影响下游酶切、连接等反应。也可以使用水洗脱,但应该确保PH大于7.5,PH过低影响洗脱效率。用水洗脱质粒应该保存在-20。质粒DNA如果需要长期保存,可以用TE缓冲液洗脱(10mMTris-HCl,1mMEDTA,PH8.0),但是EDTA可能影响下游酶切反应,使用时可以适当稀释。五、操作步骤*第一次使用前请先在漂洗液W2瓶中加入与W2相同体积的无水乙醇!*将RNaseA全部加入溶液中,混匀,每次使用后置于28保存。*将溶液放在冰上预冷。1取100-200毫升过夜培养的菌液,6000g,离心5-10分钟,弃上清,收集菌体,尽可能的倒干上清。处理超过50毫

7、升菌液可以离心弃上清后,在同一个50ml管内加入更多的菌液,重复步骤1,直到收集到足够的菌体。2用5ml溶液重悬菌体沉淀,移液器吹打或者涡旋振荡至彻底悬浮。如果有未彻底混匀的菌块,会影响裂解,导致提取量和纯度偏低。3加5ml的溶液,温和地上下翻转47次使菌体充分裂解,室温放置4分钟。温和地混合,不要剧烈震荡,以免基因组DNA剪切断裂!所用时不应超过5分钟!以免质粒受到破坏。此时菌液应变得清亮粘稠,如果菌体少,很快清亮粘稠后就可以做下一步,不是一定要准确的5分钟。如果未变得清亮,可能由于菌体过多,裂解不彻底,应减少菌体量。4.加7ml溶液,立即温和地上下翻转4-7次,充分混匀此时会出现白色絮状沉

8、淀。冰上静置10分钟,4,至少5000g离心10分钟(加大离心力可相应缩短离心时间),小心取上清,避免吸取到漂浮白色沉淀。加入溶液后应该立即混匀,以免产生SDS的局部沉淀,如果上清中还有微小白色沉淀,可再次离心后取上清。5.可选步骤:4,5000g再次离心10分钟,小心取上清。6.将上一步所得上清液加入吸附柱AC中(吸附柱放入收集管中),静置2分钟,5000g离心3分钟(为了保护膜最好慢启动),倒掉收集管中的废液。如果上清体积超过20ml,可以分多次过柱。7加入10ml漂洗液W1,5000g离心3分钟,弃掉废液。8加入12ml漂洗液W2(请先检查是否已加入无水乙醇!),5000g离心3分钟(为

9、了保护膜最好慢启动),弃掉废液。9重复操作步骤8一次。10将吸附柱AC放回空收集管中,最高速(最好大于8,000g)离心5-10分钟以干燥膜基质残留乙醇,用枪头吸除内圈压环和柱壁之间可能残留的乙醇,室温或者烘箱晾干几分钟。该步骤为彻底去除吸附柱中残留乙醇,残留乙醇抑制下游反应并且严重降低洗脱效率,降低质粒产量。如果洗脱产量低,则必须加做步骤11。11可选步骤:选择以下两种方法干燥柱子:.取下柱子放置于真空容器中,密封真空容器,提供真空15分钟;将柱子放置于65真空干燥箱或烘箱中,放置10-15分钟。12.取出吸附柱AC,放入一个干净的离心管中,在吸附膜的中间部位加1.5ml洗脱缓冲液EB(洗脱

10、缓冲液事先在65-70水浴中预热),室温放置2分钟,5000g离心3分钟。如果需要较多量质粒,可将得到的溶液重新加入离心吸附柱中,离心2分钟。洗脱体积越大,洗脱效率越高,如果需要质粒浓度较高,可以适当减少洗脱体积,但是最小体积不应少于1ml,体积过小降低质粒洗脱效率,减少质粒产量。六、疑难解答(Troubleshooting)出现的问题可能的原因培养基中忘加抗生素,非质粒转化细胞过度生长细菌培养时间太长,老化细菌开始裂解建议解决方法确保固体,液体培养基中都加入了适当的抗生素。接种适量的起始菌液于加了合适抗生素的培养基中培养12-16个小时质粒DNA产量低使用了低拷贝数质粒建议使用高拷贝数质粒,

11、低拷贝数质粒应该适当加大处理体积。细菌培养时间过短,菌液内细菌浓度过低细菌细胞裂解不完全细菌培养到A600吸光值为2 -4的时候收集菌体。使用建议的菌体处理量处理菌体,不要过量;涡旋或者吹打,确保菌体充分重悬于溶液中,不应该见到未散开的细菌团块;加入裂解液P2裂解后,应该是粘稠和透明的。质粒DNA产量使用分光光度计定量不准确洗脱效率不高分光光度计定量常常偏高,使用琼脂糖电泳/EB染色定量请阅读实验步骤10-12和注意事项6漂洗液W2中忘记加无水乙醇第一次实验时,在漂洗液W2中加入与W2相同体积无水乙醇未提取到质粒DNA质粒洗脱液含有较多乙醇,琼脂糖电泳/EB染色定量时质粒DNA漂出上样孔忘记做步骤10,乙醇抑制了酶切反应质粒DNA下游酶切不让残留乙醇挥发。能切开或者酶切不一些硅基质膜成分一起洗脱下来,抑完全制了酶切反应混杂有基因组DNA污染质粒DNA上缺口或者电泳上超螺旋带前出现变性质粒带产物中含有RNA污染第一次做实验时候,忘记将RNaseA加入溶液,RNaseA失活或者起始处理量过量第一次实验前确保将RNaseA加裂解步骤3时间过长在裂解时基因组被剪切打断了再离心一分钟,小心取上清使用,做步骤

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