最全官方Fragstats4.2教程

1、最全官方Fragstats 4.2教程一、使用说明1.数据格式Fragstats能够支持多种数据格式，但 4.2以及后续版本将使用Geo TIFF grid作为主要的 数据格式(图1)。Data type selectionData typeRaw ASCII gridRaw 8-brt integer gridRaw 好bit integer q© Raw 32-bit hteger grid ESRI gnd Geo TIFF grid (上。VTP binary terrain format grid Qbt)ESRI header labelled grid (.bil)ER

2、DAS Imagine grid (.img)PCRaster grid (.map)SAGA GIS binary format grid (,sdat；* I 11r卜图12 .数据命名以及存放路径导入数据的名称和路径不能包含汉字和空格，且存放于二级目录，例如：D:1231987.tif3 .背景问题背景值默认设置为999,但你完全可以在理解其意义的前提下依照自己喜好进行调整。 简单来说，背景即你分析过程中想要自动忽略的某种地表类型一一由于资料缺乏而无法归类、 或者你单纯想将其作为背景值处理的地表类型。值得注意的是，当设定为正值时，背景像元 值被视作目标景观内部值；当设定为负值时，背景像元

3、被视作目标景观外部值。内部背景作 为目标景观的一部分不仅会为整个景观面积作出贡献，并且会因此而改变许多指数值；外部 背景不会被视作目标景观的一部分，只会对影像边缘的连接性产生影响。在景观计算中，需 要注意背景的影响。这是景观指数误差中很大的一部分。比如说，我们拿到的遥感图像，校正好后，边界裁剪后，一般不是规则的矩形。在边边角角存在没有信息的像元。图像分类后， 没有信息的像元也是作为分类的一种的。因此，需要对其进行去除。这个操作可以在Arcgis下操作。4 .下载地址/landeco/research/fragstats/downloads/fragstat

4、s_downloads.html二、操作步骤2.1 打开 Fragstats首先，从开始菜单或双击桌面图标打开 Fragstats 。如果你的电脑上已安装10.0及以 下版本的ArcGIS ，那么Fragstats打开时将有明显延迟（有时长达30s）,这是由于Fragstats 在验证ArcGIS的使用许可（license ）。请务必保持耐心（图2）。图22.2 新建模型接下来你需要创建一个Fragstats模型用于对斑块的景观结构进行分析。一个Fragstats 模型简单来说就是为Fragstats进行了全副参数化，即为其配备了分析所需的全部参数。点 击工具条上的New，按钮或从File的下

5、拉菜单中选择New选项，即可创建一个空白模型（图3）图32.3 导入数据接下来需要输入一个数据进行分析。具体操作为：点击Add a layer ,打开如下（图4）输入数据对话框。导入数据后软件会从其头文件中自动读取行列数及栅格大小，之后这些参 数在对话框中就会变为灰色，无法更改。唯一可以更改、也需要多加留意的是背景值。图4说明：Row/column count :行/列值计数，Background value :背景值， Cell size :输入像元长度（米）， Band：选取分析波段，用于多波段数据源2.4 设置分析参数点击用户界面左侧选框的 Analysis Parameters 按钮。

6、在这里你可以选择使用 4邻域或 8邻域的邻域法则，本教程采用默认的8邻域法及No sampling（不采样）设置。在NoSampling 选项下勾选Patch, Class, Landscape三种指数。请注意三种指数至少勾选其一，同时注意只需勾选你想要计算的指数类型即可，多勾选或者不勾选，软件将会报错。止匕外，在No sampling下面还有一个生成斑块ID号的附加选框（Generate Patch ID File ）。 如果勾选这一选框，Fragstats就会为每一个栅格分配一个ID号。即1号斑块内的所有栅格的ID值都为1,2号斑块内的所有栅格的ID值都为2,以此类推Input Is/er

7、s Ana lysis p an metersGeneral optionsIK巨 4 cell reighborhcod rule» Use 8 cel neighborhood rule,_ Automatically save resultsSirnpling stratagv。Nq samplingBrowse勾选相关选项，最后 时才会进行运算±_ Patch metry. Class metrii7 l 3Tld£C己口自csmetricsGenerate patch ID ffe2.5景观指数选择指数一共有三个级别，path、class、landsca

8、pe。不同级别对应不同的指数，对应着不 同的生态学意义。所以选择指数的时候，一定要清楚所选择的指数对应的级别。首先，在用户界面的右上方选框内勾选斑块级别的景观指数。点击 Patch metrics 并勾选不同指标下 的景观指数。你可以按照需要选择某些指数，或者直接选择“ select all ”亦可。注意：如 果在聚集度(Aggregation )指标下选择了 邻近系数(proximity index )或相似系数 (similarity index),那么你还需要为其指定搜索半径一一计算这两个指标需要搜索半径。计 算相似系数还需要指定相似性权重表(见图6)。点击可以指定需要的搜索半径，如：1

9、000.00 07HTL n-PtHFOast nierK?ffl5416CT 31|De-SBiKt =jrwl 以车由on©m 弓匕Cte* Pn谴/建 UrhJkSp*UM"!"二*咚 口fl/忧岫(0pEburtunflP£)丁 Eudtiran rirF-sr F-eflrr.nr Dunrcia:ewu1/"PpcitW Index 糟I")5MbeH0接下来，点击Class metrics 可以选择类型级别下不同指标内的景观指数。与上述方 法相同，你可以按照需要选择某些指数，或者直接选择“ select all ”亦可。

10、注意，在面积- 边缘(Area-Edge)指标下，如果你勾选了总边缘长度(Total Edge)或边缘密度(Edge density) 这两个指数，那么你需要对如何处理每种背景或边界细加考虑。缺省情况下，背景不作为真 实边缘，但你也可以选择把所有背景都作为边缘，或把某部分背景作为边缘。点击即可对缺省值进行修改。注意：由于(本文)输入的景观自带包界，且不包含任何背景，因此这 个问题不会出现。同样的，如果在聚集度指标(Aggregation )下勾选了连通系数(connectance index),那么你还需要对什么是“连通”设定一个阈值。点击即可设定阈值，单位为米，如：500。(见图7)图7最后

11、，点击Landscape metrics可以选择景观级别下不同指标内的景观指数。与 上述方法相同，你可以按照需要选择某些指数，或者直接选择“ select all ”亦可。注意： 在多样性指标下如果选择了相对拼块多度 (Relative Path Richness ),那么你还需要给定最 大地表分类数(或斑块类型数)。点击即可给定该值，例如本例中设定为 6。(见图8) 图82.6 保存模型接下来你可能需要将此设置好的模型进行保存，备作以后使用。一般来说对现有的文件进行修改会比从零开始设置要容易得多。记得在设置参数的过程中时不时地点击Save或Saveas对模型进行保存。2.7 运行模型接下来要

12、做的就是运行模型。直接点击Run按钮，或从“ Analysis ”的下拉菜单里就可以打开运行窗口。运行窗口里面包含分析类型（本例中选择的是No sampling ）以及斑块、类型及景观各个级别内勾选的指数数目。如果这些信息无误，那么点击Proceed按钮就可启动运行，否则点击Cancel再对模型设置进行调整。在本例中，一共有75个斑块级别指数、109个类型级别指数以及116个景观级别指数参与了计算，这是因为我全选了所有级别的指 数（见图9）。Run propertiesAnalysis type: No sampingCurrent fie:Patch leveli 75 metricsCta

13、ss levd; 109 metricsLandscape IeveI: 116 metricsjProgress informationProceed Caned图92.8 查看结果注意到用户界面右下角的运行日志（Activity log ）。如果计算顺利，那么你Run tec：£atcTLJTdStipft可以PIOTWEAUAWEA_C5DPtRJHHRlMl_raDewwnG¥RAn_SI l1iIkrad.25040.3 54d。5附口呐口14t3.60J42.610014for电厘：QMllSaCM36uK5334157350X300B3S1M351143564

14、797zaJEC在事15ItntitD.2500-0.Q4KJOD-QOiX35.DM0<1.2517日志4打fg口 TSAO*Q4崎4gQQg底.糊9我.如95窕fcmS:魄mv-OJOW7g0。的1】皿】瓯旧工Q.W9中6J374fr通*就 卿"叩LTOOM现找 U.MNTgQgQUN将9 IlttW5177.51M用。刈厂-04473计S y盘旧就 怕Z索MiMUM-AMUMCO；Q 时 0叫泗9OMI207.4117*1乐皿30.U12口五乳算停1057七Tie蒙7前加口苒HM-OOtO郁一期与1JHI.1214力皿，11E就西刷5MM23搜1"31而.林如2

15、5UM35L突*，螳"1皿髭止1171hn喊工却0-O.04IMSODUQiJQ-120. WI94>.4a55再上的时间,叫 5m %1113螯Em0.5M0SOU OOilO1烈如§ZS.0K0R酉1丁14112licrest2.75004LQ29780D,0D«j0-114.9&1965.37W0.1713以H5LPfcxesC0,Z50Q-0,Q4M-20D。叩0-126, «492S.0W0<1/2517及整加129kroH1.00的umoo.11S.044053.Q7S2-0.1Q5&dw ?l.体所用时间。点击右

16、上角的 Results按钮就可以在斑块、类型和景观级别下分别查看对应的景观格局指数（见图10）。图102.9 保存结果选才? "save run as ”则将表格保存为fragstats的专有格式（见图11）*.patch :保存patch表格信息*.class :保存class表格信息*.land :保存landscape表格信息*.adj ：保存数据源信息H Lu?34LID r TYPE F CA , PZ_IlMD r PD , SEPT r TE r ED , JLK巨口 HN r5口 , rOriE5TCK，. £,1r望匕 工3mjsqo ,is,48 5a

17、, "i-t&i ,0.6392 ,3B,30G3 , S3550C . COCO ,41.1B94 ,3rM YQ .Z233.7736rg 19.4 ,9I, 171口餐和麒弑箝13工诅3塌金,urtoan $1&84E.S030 tf6，aS13 ,751 PD.6392 .1.3959 , 25737QC,C0C0 .11.33BL f10.3225 U25.9T77r90 6211 ,遂掂 P 口F。，注,二qgx f工号箝 *1”科,1.37S9 , S139SC.00a0 .24,731： ,11.3376 .石】$505r94,3249 ,尸r叼匚,1

18、3136.0000 ,K-1S71 fJ361r1.0401 p。血59 , 82799Mg。口 .2 3.2«32 ,13.6112/6a524fi .黏 J593 .79>240r#239f.25OO /.6”f0i2903 /0.0187 ,70B600.0000 .3.1217 .3.32 13.1S16 .6D,1562 .3.50B0E:1id 1,jmX r wter *11031,5000.*®8B P口.3(333 r2. SI04 f 1075200.0000 #« .736 ,1« .Q34J p247.6318f口中m口 f

19、ea4os2i(图112.10 在excel中打开表格打开后进入导入数据向导窗口（见下图）在excel中选打开文件，文件类型选“所有文件”文本分列向导判定您的数据具有固定列竞。若一切谀置无误，请单击“下一步”，否则请选择最合适的数据类型。原始数据类型请选择最合适的文件类型：展分离符号通；-用分隔字符，如逗号或制表符分隔每个字段。陶越漉'-每列字段加空格利齐导入起始行®:上 句 文件原格式Q）：936 ；简体中文（G32312）赖览文件 E. £ragstatsresultslugrid. class：jjLID , TYPE , CA . PLAND , NP , PD , LPI , TE , ED , AREA.Mff , AREA.SD , CO 2jE:fracsiaixlupriai.tif , fortH , 132760.7500 ,58. 4861 .E： frags tats lugriii. tif , urban ,15848. 5000 .6. 9819 ,14)E: fragstatslugrill. ti£ , open ,32822. 2500 ,14. 4594 ,28“ iI取消 T一步© > I翔口文本导入向导3步骤之2港设置分列数据斫包含的分隔符号。在预览窗口内司看到分列的效果。E连续分隔