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文档简介
1、SDS-PAGE一. 实验原理SDS 是一种阴离子表面活性剂,在蛋白质溶液里加入 SDS 和巯基乙醇后,巯基乙醇能使蛋白 质分子中的二硫键还原, SDS 能使蛋白质的氢键、疏水键打开并结合到蛋白质分子上,形成蛋白 质-SDS 复合物。在一定条件下,SDS 与大多数蛋白质的结合比例为 1.4:1。由于十二烷基磺酸根 带负电,使各种蛋白质的 SDS-复合物都带上相同密度的负电荷,它的量大大超过了蛋白质原有的 电荷量,因而掩盖了不同种类蛋白质间原有的电荷差别。SDS 与蛋白质结合后,还引起了蛋白质构象的改变。蛋白质-SDS 复合物的流体力学和光学性质表明,它们在水溶液中的形状,近似于雪 茄烟形的长椭
2、圆棒,不同蛋白质的 SDS 复合物的短轴长度都一样,约为 1.8nm ,而长轴则随蛋白 质的 Mr 成正比的变化。基于上述原因,蛋白质 -SDS 复合物在凝胶电泳中的迁移率,不再受蛋白 质原有电荷和形状的影响,而只与椭圆棒的长度有关, 也就是蛋白质 Mr 的函数。二. 试剂器材30%凝胶贮液(100mL):称取试剂Acr 29.2g和Bis 0.8g置于100mL烧杯中, 向烧杯中加入约60mL双蒸 水,充分搅拌溶解后加双蒸水定容至 100mL,置于棕色瓶内 4C贮存,每过 1-2 个月应重新配制;注意:丙稀酰胺具有很强的神经毒性,并可通过皮肤吸收, 其作用有积累性,配制时应戴手套和口罩等。分
3、离胶缓冲液(1.5 mol/L Tris-HCI,pH 8.8,100mL):称取 Tris 18.2g 溶于约 80mL 双蒸水,用 6mol/L 的HCI 调整 pH 值至 8.8,加双蒸水定容到 100mL,4C贮存;堆积胶缓冲液(0.5 M Tris-HCl,pH 6.8,100mL):称取 Tris 6.00 容于约 80mL 双蒸水,用 1mol/L 的HCl 调整 pH 值至 6.8,加双蒸水定容到 100mL,4C贮存;电泳缓冲液(1L):称取试剂 Tris 3.03g 和甘氨酸 14.40 置于 500mL 烧杯中, 向烧杯中加入约 400mL 双蒸 水充分溶解,再加入 10
4、%SDS 溶液 1.0mL,以双蒸水定容至 1L 伯然 pH 值为 8.3,无需再调),4C贮 存,可重复使用 5-6 次;2 劝卩样缓冲液(10mL):取下列试剂置于 10mL 塑料离心管中0.5mol/L Tris-HCl 缓冲液(pH6.8)2.0mL10%SDS 溶 液4.0mL甘油2.0mL巯基乙醇2.0mL分离胶缓冲液(mL)10.0溴酚蓝0.02g混匀后 1mL 分装,-70C可贮存 6 个月;10%AP:称取(NH4)2SO31.0 g,溶于 10.0mL 双蒸水中,分装成每份 1mL, -20C贮存;TEMED :分装成每份 1mL,4C避光贮存;水饱和正丁醇 (100mL)
5、:在玻璃瓶中加入 50mL 双蒸水和 50mL 正丁醇, 振摇。 上层相即水饱和正丁 醇,室温下可长期保存。染色液(100mL):称取考马斯亮蓝 R-250 0.25g 加入双蒸水 40.0mL、甲醇 50.0mL 和乙酸 10.0mL,搅拌溶解后滤纸过滤除去不溶颗粒;脱色液(1L):分别取甲醇 50mL 和乙酸 75mL,加双蒸水 875mL 稀释。其他器材:容量瓶(1L、100ml、10ml)、烧杯、离心管(15ml、1.5ml)、移液器、移液器吸头、干燥器、涡旋振荡器和废液缸等。分离胶配方(100mL,4 块胶)贮液分离胶中丙烯酰胺的终浓度(%)8.09.010.011.012.013.
6、014.015.016.017.018.0凝胶贮液(mL)26.6730.0033.3336.6740.0043.3346.6750.0053.3356.6760.00分离胶缓冲液(mL)25双蒸水(mL)46.5343.2039.8736.5333.2029.8726.5323.2019.8716.5313.2010%SDS (mL)1.010%AP (mL)0.75TEMED (mL)0.05 (抽气后添加)堆积胶配方(40mL,4 块胶)堆积胶中丙烯酰胺的终浓度()贮液3.04.05.0凝胶贮液(mL)4.005.366.66将凝胶浸泡在染色液中,置于摇床上染色4hr,染色液可回收重复利
7、用双蒸水(mL)25.3624.0022.7010%SDS(mL)0.410%AP(mL)0.2TEMED(mL)0.04 (抽气后添加)三操作步骤样品处理:在密封的螺盖微量离心管中, 用 2X加样缓冲液按 1:1 稀释蛋白质样品溶液, 于 100C煮沸 3- 5min,分子质量标准品也经上述处理。凝胶制备:将玻璃板用蒸馏水清洗干净,再用 75%的酒精去脂,干燥后固定在灌胶支架上;配制 12%的分离胶,加入 TEMED 前抽真空 10min 以除去丙烯酰胺溶液中的空气;加入TEMED 后轻轻振荡混匀,迅速注入安装好的玻璃板的间隙中,给堆积胶留出约1cm 的空间。在丙烯酰胺溶液上覆盖一层水饱和的
8、正丁醇,以防止空气扩散到凝胶中抑制聚合作用,并保证凝胶 表面水平;在室温条件下,凝胶应在 30min-50min 内聚合完成。凝胶聚合后凝胶和上层液相之间 可见折射率的变化;倒掉覆盖层并用蒸馏水清洗凝胶顶部数次,并用滤纸条吸净残留的蒸馏水,注意勿破坏凝胶 表面;制备堆积胶并迅速注入分离胶上,立即插入干净的梳子,不要混入气泡,以一定的角度将 梳子插入堆积胶能减少气泡的产生。堆积胶聚合后小心移去梳子,避免破坏加样孔,用蒸馏水小 心清洗加样孔,以除去未聚合的丙烯酰胺。加样:将凝胶固定在电泳装置上,电泳上槽内加入电泳缓冲液没过加样孔,并检查有无渗漏。倾斜整个装置以赶走凝胶下面可能留有的气泡;按预定顺序
9、加样,每孔加入20 L,在对照孔中加入分子质量标准品 6-7 L,如有空置的加样孔,加入等体积的 1X加样缓冲液。电泳:将电泳装置与电源相连,正极接下槽、负极接上槽进行电泳,样品在堆积胶阶段电压为80V,而在分离胶阶段电压调整为 120V。直到溴酚蓝到达分离胶的底部后,关闭电源,断开电 极。从电泳装置上卸下玻璃板,用小铲子剥下凝胶后切除一角以标注凝胶方位。染色:脱色:染色结束后,将凝胶浸泡在脱色液中,置于摇床上脱色过夜,其间更换脱色液3 次.记录:将显示蛋白条带的凝胶用凝胶成像仪拍照,记录试验结果,并根据分子质量标准品计算目标 蛋白的分子量。四.注意事项:SDS 与蛋白质的结合按质量成比例,蛋白质含量不可以超标,否则SDS 结合量不足。用 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法测定蛋白质相对分子量时,必须同时作标准曲线,并且SDS-PAGE 测定分子量有 10%误差。有些蛋白质由亚基(如血红蛋白)或两条以上肽链(a-胰凝乳蛋白酶)组成的,它们在巯基乙醇和SDS 的作用下解离成亚基或多条单肽链。因此,对于这一类蛋白质, SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳法 测定的只是它们的
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