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1、利用微卫星分析p 家禽的遗传多样性摘 要 当前,微卫星技术研究为我国的家禽饲养方面提供了科学保障,在研究家禽分子生物学的领域得到社会各界的关注,也是微卫星为家禽分子生物学领域的热点。为了研究分析p 广东地区饲养家禽的品种分类的进化、种群遗传的多样性,利用微卫星来进行分析p ,能够有效进行基因鉴定和系谱分析p ,并评估鸡群之间的遗传距离。微卫星通过卫星标记,计算每个等位基因的频率,然后再以等位基因的频率为基础来研究鸡群品种内的遗传变异及家禽品种间的遗传距离。【关键词】:p 微卫星;家禽;分子生物学;遗传多样性中图分类号:S813.1 文献标志码:B 文章编号:1673-890_(20_)33-0
2、2微卫星是近几年来应用最多的一种分子标记。近年来,随着科学技术的发展,利用微卫星分析p 家禽的品种的遗传多样性也已经成为最主要的研究方法。微卫星的实验使人们对牲畜生物学的分析p 和研究迈进了一个新的高度。其以少数的核苷酸DNA序列,本身具有的高度保守性及位点多态性的特征1。所以在具体的实验中,可以利用微卫星的这种保守性,在一个微卫星的物种研究结果运用到另一物种研究的结果,继而更快、更准确的找到该物种里的更多的微卫星位点。微卫星的另外一种多态性是目前我国微卫星多数的实践呈现,并且实验分析p 证明了微卫星的核心序列的重复越大,变异性也大,等位基因数也越多。1 采取样本1.1 取样方式在实验中的采取
3、样本是实验的基础,而最常见的就是采集血样进行研究。但是采样是否含有代表性直接的影响到实验的结果。我国牲畜养殖业历史悠久,由于每个地方性的气候类型不一样,再加上人们的生活习惯有着明显的差异,是我国的牲畜业也体现出来复杂,品种多样,特征不同的各种家禽2。据我国数据统计现存的牲畜品种数量大约就有576种,其中的地方品种就有426个,还有经过改良培育的品种有73个。在这些牲畜品种由于人们的饲养习惯的不一样,各地区环境差异,这些品种完全处于人们自发、粗放的养殖方式。然后就不可避免地造成种族杂交乱配、同种异名和同名异名的现象。所以面对采样就有着选择性难题,首先就必须要选择地区代表性的牲畜品种代表以及保种效
4、果较好的牲畜类型3。1.2 选择和控制采样的数量由于家禽的多样性,再加上物种遗传的多样性,分异性,基因的不同而造成每个个体之间表现的差异,所以采样必须要达到一定的数量以后才会包含所有的基因类型,这样才具有实验的意义,才能够真实地反应整个群体的遗传结构4。例如,在对河南斗鸡进行试验时,就可以反映出这个问题来,河南斗鸡试验采样了2次,而且都来自同一个群体,A采样数量60个,B采样数量30个,别的条件均相符合,在进行微卫星分析p 时结果就不一样。从表1中看出,由于采集的样本数量不同,A实验体和B实验体微卫星实验出的的基因杂含度及多态性的信息含量就不一样,从而造成这2个群体有着明显的遗传距离的假象,而
5、在群体分类中就不能将它们划分到一种物种里面去,所以一般在家禽遗传多样化的研究中应该科学的选取样本的数量来进行实验和研究,来实现研究结果的真实性。2 引物设计选择根据家禽基因的图谱来进行引物设计,由某一段的碱基因序列而设计,所以不同的引物,它们的染色体片段不同,即在选择进行PCR扩增时候,引物的选择就面对种类类型和个数数量的问题。引物的种类的区分可以根据引物所扩增出的基因片段及不同的染色体,根据基因的区别来选择丰富多态性的引物,其体现着群体的变异程度,多样性,类型差异等可以最大程度地体现所检测群体中比较高的杂合度及多态信息含量。相反,如果选择的引物多态性差,所检测引物的杂合度、多态信息含量就低5
6、。在利用微卫星进行实际的实验研究中表明,标本的数量对于研究家禽品种的遗传多样性、杂合度及品种间的遗传距离等对实验结果的准确性、精密性有着非常重要的影响。在利用微卫星资料来进行的计算机模拟中证明,标记的数目甚至比所研究物种的数量还重要。在实验中引物的个数越多,其包含的基因数量就越多,从而就可以明显体现出品种遗传的多样性特征。3 数据分析p 通过微卫星实验得出的数据,能体现家禽遗传的多样性,而如何进行数据的分析p ,一般凝胶条带分析p 是最为常见的一种统计方法。其不一样的条带就反映出不一样的基因类型,从而得出的基因频率是进行遗传参数计算的基础。由于DNA的不纯就会使凝胶上存在着很多的杂带。杂带一旦
7、出现,使用微卫星所检测的基因丰富,给目的带和判断带来挑战,微卫星的共显性是不管是显性或是隐形都会在凝胶上表现出来,影响了结果的判定。4 统计软件不统一近些年,随着科技和信息技术的发展,生物实验依赖科技的成果来进行分析p 使得实验的结论更具有权威和准确性。所以,很多生物学研究的软件也应运而生。同时,有些已经被运用到生物试验中去,微卫星为家禽遗产多样性研究中体现着重要的意义。但不同的生物学软件计算出来的数据可能就会有所不同,得到的遗传参数也就不一致。所以,在运用微卫星来分析p 家禽遗产多样性的研究中,掌握好微卫星的复杂性和特性以便更好地位生物实验服务。5 结语在近几年微卫星研究的分析p ,通过微卫
8、星对家禽种类遗传的多样性时,在实验过程中影响数据计算的结果的因素很多,外部环境也很受制约。所以如果要保证实验结果的准确性、精密性及有效性,就要尽量的去保证样本的选择及数量要有地区的代表性,保种工作做的比较好的实验群体。再有就是引物的选取要分散在不同的染色体中,其所包括着不同的基因片段而有着不同,引物个数的选取更为重要,所以对引物个数的控制也很必要。在保证实验条件充分的情况下,科学的运用生物学软件进行统计分析p 而得出的实验数据,如果能够保证以上几种条件,利用微卫星分析p 家禽品种的遗传多样性就会更有可信度和说服力。如何更好地让微卫星技术为家禽的遗传学研究做出更大的贡献,去研究和发现微卫星更多的使用价值,值得大家为之努力。【参考文献】:p 1曲鲁江.中国地方鸡种分子遗传多样性研究D.北京:中国农业大学,20_4.2屠云洁,陈宽维,沈见成,等.利用微卫星标记分析p 四川8个地方鸡品种遗传多样性J.遗传,20_5(5):724-728.3关佳佳.浦东鸡微卫星DNA遗传多态性及其与部分生产性
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