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文档简介
1、- 1 - 分子生物学 1. DNA 的一级结构:指 DNA 分子中核苷酸的排列顺序。 2. DNA 勺二级结构:指两条 DNA 单链形成的双螺旋结构、三股螺旋结构以及四股螺旋结构。 3. DNA 勺三级结构:双链 DNA 进一步扭曲盘旋形成的超螺旋结构。 4. DNA 的甲基化:DNA 的一级结构中,有一些碱基可以通过加上一个甲基而被修饰,称为 DNA 的甲基化。甲基化修饰在原核生物 DNA 中多为对一些酶切位点的修饰,其作用是对 自身 DNA 产生保护作用。真核生物中的 DNA 甲基化则在基因表达调控中有重要作用。真 核生物 DNA 中,几乎所有的甲基化都发生于二核苷酸序列 5 -CG-3
2、 的 C 上,即 5 -mCG-3 . 5. CG 岛:基因组 DNA 中大部分 CG 二核苷酸是高度甲基化的,但有些成簇的、稳定的非甲基 化的CG 小片段,称为 CG 岛,存在于整个基因组中。“CG岛特点是 G+C 含量高以及大部 分 CG 二核苷酸缺乏甲基化。 6. DNA 双螺旋结构模型要点: (1) DNA 是反向平行的互补双链结构。 (2) DNA 双链是右手螺旋结构。螺旋每旋转一周包含了 10 对碱基,螺距为 3.4nm. DNA 双链说形成的螺旋直径为 2 nm。每个碱基旋转角度为 36 度。DNA 双螺旋分子表面 存在一个大沟和一个小沟, 目前认为这些沟状结构与蛋白质和 DNA
3、 间的识别有关。 (3) 疏水力和氢键维系 DNA 双螺旋结构的稳定。DNA 双链结构的稳定横向依靠两条链 互补碱基间的氢键维系,纵向则靠碱基平面间的疏水性堆积力维持。 7. 核小体的组成: 染色质的基本组成单位被称为核小体,由 DNA 和 5 种组蛋白 H1,H2A,H2B,H3 和 H4 共同 构成。各两分子的 H2A,H2B,H3 和 H4 共同构成八聚体的核心组蛋白, DNA 双螺旋缠绕在 这一核心上形成核小体的核心颗粒。核小体的核心颗粒之间再由 DNA 和组蛋白 H1 构成 的连接区连接起来形成串珠样结构。 & 顺反子(Cistron ):由结构基因转录生成的 RNA 序列亦
4、称为顺反子。 9. 单顺反子( monocistron ):真核生物的一个结构基因与相应的调控区组成一个完整的基 因,即一个表达单位,转录物为一个单顺反子。从一条 mRNA 只能翻译出一条多肽链。 10. 多顺反子 (polycistron): 原核生物具有操纵子结构,几个结构基因转录在一条 mRNA 链上,因而转录物为多顺反子。每个顺反子分别翻译出各自的蛋白质。 11. 原核生物 mRNA 吉构的特点: (1) 原核生物 mRNAfc 往是多顺反子的,即每分子 mRN 带有几种蛋白质的遗传信息。 (2) mRNA 5端无帽子结构,3 端无多聚 A 尾。 (3) mRNAr 般没有修饰碱基。
5、12. 真核生物 mRNA 吉构的特点: (1) 5端有帽子结构。即 7甲基鸟嘌呤三磷酸鸟苷 m7GpppN。 ( 2) 3端大多数带有多聚腺苷酸尾巴。 (3) 分子中可能有修饰碱基,主要有甲基化。 (4) 分子中有编码区和非编码区。 14. tRNA 的结构特点 (1) tRNA 是单链小分子。 (2) tRNA 含有很多稀有碱基。 (3) tRNA 的 5 端总是磷酸化,5末端核苷酸往往是 pG. (4) tRNA 的 3 端是 CCA- 0H 序列。是氨基酸的结合部位。 - 2 - (5) tRNA 的二级结构形状类似于三叶草, 含二氢尿嘧啶环 (D 环)、T 环和反密码子环。 (6)
6、tRNA 的三级结构是倒 L 型。D 环和 T 环在 L 的拐角上。 15 rRNA (1) rRNA 是细胞内含量最丰富的 RNA 它们与核糖体蛋白共同构成核糖体,后者是蛋 白质合成的场所。 (2) 核糖体和 rRNA 一般都用沉降系数 S 表示大小。原核生物核糖体的沉降系数为 70S, 由 50S 和 30S 两个大小亚基组成, 30S 小亚基含有 16SrRNA 和 21 种蛋白质。50S 大亚基含有 23S 和 5SrRNA 以及 34 种蛋白质。真核生物沉降系数为 80S,由大小 亚基组成。 40S小亚基含有 18SrRNA和30多种蛋白质。 60SrRNA含有5S、5.8S 和 2
7、8SrRNA 以及大约 45 种蛋白质。 16. 核酶(ribozyme ):某些 RNA 分子能催化自身或其他 RNA 分子进行化学反应,即具有酶 样的催化活性,这类具有催化活力的 RNA 称为核酶。核酶分为 3 类:(1)异体催化的剪 切型。(2)自体催化的剪切型 (3)内含子的自我剪切型。 17. 核内不均一 RNA(hnRNA :真核生物转录生成的 mRNA 前体即为 hnRNA 这类 mRNA 前体 必须经过一系列的加工处理才能变成成熟的 mRNA 加工过程的主要环节包括:(1) 5 端 加帽 (2) 3端加尾 (3)内含子的切除和外显子的连接 ( 4)分子内部的甲基化修饰 ( 5)
8、核苷酸序列的编辑作用。 18. miRNA 是一种单链小分子 RNA 广泛存在于真核生物中,是一组不编码蛋白质的短序列 RNA 其特点就是高度的保守性、时序性和组织特异性。研究表明 miRNA 可能决定组织和 细胞的功能特异性,也可能参与了复杂的基因调控,对组织的发育起重要作用。 19. siRNA:小干扰 RNA 是人工合成的短的双链 RNA 它可抑制细胞内特定基因的表达,导 致转录后基因失活。siRNA 是 RNAi 的重要工具。 20. 反义 RNA 碱基序列正好和有意义 mRNAT 补的 RNA 称为反义 RNA 这类 RNA 也是单链 RNA 可与mRNAi 己对形成双链,最终抑制
9、mRNA 乍为模板进行翻译, 这是反义 RNA 主要的 调控功能。 21. 顺式乍用元件( cis-acting element ):真核生物基因中的调控序列被称为顺式乍用元 件 , 包括:启动子和上游启动子元件,增强子,反应元件, Poly(A) 加尾信号。 22. 增强子(enhancer ):是一段短的 DNA 序列,其中含有多个作用元件,可以特异性与转 录因子结合,增强基因的转录活性。增强子可以位于基因的任何位置,增强子的功能与 其位置和方向无关。 23. 基因:是核酸分子中贮存遗传信息的遗传单位,是指贮存有功能的蛋白质多肽链或 RNA 序列信息及表达这些信息所必需的全部核苷酸序列。一
10、个基因不仅仅包括编码蛋白质肽 链或 RNA 的核酸序列,还包括保证转录所必需的调控序列及位于编码区 5 端上游的非 编码序列,内含子和位于编码区 3端下游的非编码序列。 24. 基因组:泛指一个细胞或病毒的全部遗传信息。在真核生物体中, 基因组是指一套完整 单倍体 DNA 和线粒体 DNA 的全部序列,既包括编码序列,也包括非编码序列。 25. 病毒基因组包括:单链正股 RNA 单链负股 RNA 双链 RNA 双链DNA 和单链正股 DNA 26. SARS 冠状病毒属于:单链正股 RNA 病毒。逆转录病毒属于:单链正股 RNA 病毒。 27. 逆转录病毒基因组包括三个结构基因: gag、po
11、l- 3 - 和 env。分别编码:核心蛋白、逆转录 酶和膜蛋白 。 28. 操纵子( operon ) : 是指数个功能上相关联的结构基因串联在一起,构成信息区,连同 其上游的调控区(包括启动子和操纵序列)和下游的转录终止信号所构成的基因表达单 位,所转录的 RNA 为多顺反子。 29. 质粒:是存在于细菌染色体之外的、具有自主复制能力的环状双链 DNA 分子。 30. 质粒的不相容性:具有相同复制起始位点和分配区的两种质粒不能共存于一个宿主菌, 这种现象称为质粒的不相容性。 31. 转座因子:既可移动的基因成分,是指能在一个 DNA 分子内部或两个 DNA 分子之间移动 的 DNA 片段。
12、原核生物的转座因子包括: 插入序列、转座子和 Mu噬菌体。 32. 插入序列 : 是一类较小的没有表型效应的转座因子, 由一个转位酶基因及两侧的反向重 复序列组成。 33. 转座子:是一类较大的可移动成分, 除有关转座的基因外,至少带有一个与转座作用无 关的并决定宿主菌遗传性状的基因 。 34. 断裂基因: 真核生物的结构基因, 由若干个编码区和非编码区互相间隔而又连续镶嵌而 成,去除编码区再连接后,可翻译出由连续氨基酸组成的完整蛋白质这些基因称为断裂 基因。 35. snRNA 核内小 RNA 分子中尿嘧啶含量最丰富。 snRNA 和核内蛋白质组成小分子核糖核 蛋白体,作为 RNA 剪接的场
13、所。 36. 启动子:能够被 RNA 聚合酶识别并结合并起始转录的核苷酸序列。典型的启动子包括 TATA 盒,CAAT 盒和 GC 盒。 37反应元件:一些信息分子的受体被细胞外信息分子激活后,能与特异的 DNA 序列结合, 调控基因的表达。这些特异的 DNA 序列实际上也是顺式元件,由于能介导基因对细胞外 的某种信号产生反应,被称为反应元件。 38. 基因家族:指核苷酸序列或编码产物的结构具有一定程度同源性的一组基因。 39. 端粒 DNA 重复序列:TTAGGG微卫星 DNA 常见重复单位(AC)和(TG)。 40. 卫星 DNA 是出现在非编码区的串联重复序列。其特点是具有固定的重复序列
14、,该重复 单位首尾相连形成重复序列片段,通常存在于间隔 DNA 和内含子中。卫星 DNA 可分为大 卫星 DNA 小卫星 DNA 和微卫星 DNA 41. 端粒:以线性染色体形式存在的真核基因组 DNA的末端都有一种特殊的结构, 端粒。该 结构是一段 DNA 序列和蛋白质形成的一种复合体,仅在真核细胞染色体末端存在。端粒 的功能主要有:保护线性 DNA 的完整复制,保护染色体末端及决定细胞的寿命等。 42. Alu 家族:序列中有限制性内切酶 Alu 的酶切位点。 重复单位是 300bp. 属短散在核元件, 为灵长类基因组所特有。 43. 假基因:是指与某些有功能的基因结构相似,但不能表达基因
15、产物的基因。 44人类基因组的四张图谱: 遗传图、物理图、序列图和转录图 。遗传图指基因或 DNA 标记 在染色体上以遗传距离表示的相对位置。物理图指基因或 DNA 标记间的实际距离。序列 图指人类基因组的全部核苷酸序列,也是最详尽的物理图。转录图指基因图谱。 45. 端粒酶:由三部分组成,端粒 RNA 端粒酶逆转录酶,端粒酶协同蛋白。端粒酶兼有提 供 RNA 莫版和催化逆转录酶的功能。端粒酶通过一种爬行模型的机制维持染色体的完整。 46. 半保留复制:子代细胞的 DNA 一股单链从亲代完整的接受过来,另一股单链则完全重 新合成,两个子细胞的 DNA 都和亲代 DNA 碱基序列一致,这种复制方
16、式称为半保留复制。 - 4 - 47. 半不连续复制: 顺着解链方向生成的子链,复制是连续进行的,这股链称为领头链。另 一股链因为复制方向与解链方向相反,不能顺着解链方向连续延长,必须等模板链解开 至足够长度,然后从 5-3生成引物并复制子链。延长过程中,又要等待下一段有足 够长度的模板再次生成引物而延长。这股不连续复制的链称为随从链。领头链连续复制 而随从链不连续复制,这就是复制的半不连续复制。 48. 冈崎片段: 随从链的复制由于与解链方向相反, 必须待母链解开足够长度后才开始生成 引物接着延长。复制中形成的不连续复制片断就是冈崎片段。 49. 滚环复制:是某些低等生物或染色体外的 DNA
17、 的复制形式。环状 DNA 外环打开,伸出环 外作母链复制,内环不打开一边滚动一边复制。最后,一个双链环就滚动复制成两个双-5 - 链环。 50. TT 二聚体:在紫外线照射下,相邻的两个 DNA 分子上的嘧啶碱基之间共价结合而成的。 51. 着色性干皮病:是由于 DNA 损伤修复有缺陷而造成的一种遗传性疾病, 患者有较高的皮 肤癌发病倾向。对该病的研究,发现了一些与切除损伤部位有关的蛋白质, 称为 XP 蛋白。 52. 切除修复:DNA 损伤修复的一种方式。通过切除损伤部位,剩下的空隙由 DNA-pol I催 化 dNTP 聚合而填补,最后由 DNA 连接酶结合裂隙。切除损伤在原核生物需 U
18、vr 蛋白类, 真核生物需 XP 蛋白类。 53. 光修复:生物体内有一种光修复酶,被光激活后能利用光所提供的能量使紫外线照射引 起的嘧啶二聚体分开,恢复原来的非聚合状态,称为光修复。 54. DNA 损伤的修复类型: 光修复、切除修复、重组修复和 SOS 修复。 55. 重组修复时,recA 蛋白被激活,使得 LexA 蛋白被水解。 56. 突变的分子改变类型: (1) 错配:DNA 分子上的碱基配对又称点突变。 (2) 缺失,插入和框移:缺失和插入都可以导致框移突变。 框移突变是指三联体密码的 阅读方式改变,造成蛋白质氨基酸排列顺序发生改变,其后果是翻译出的蛋白质可 能完全不同。 (3)
19、重排:DNA 分子中较大片断的交换,称为重组或重排。 57. 点突变分为:转换和颠换。转换是指由一种嘧啶变成另一种嘧啶, 或一种嘌呤变成另一 种嘌呤。颠换是指由嘧啶变成嘌呤,或由嘌呤换为嘧啶。 58. 突变的意义: (1) 突变是进化、分化的分子基础。 (2) 只有基因型改变的突变。 (3) 致死性的突变。 (4) 突变是某些疾病的发病基础。 59. D 环复制:是线粒体 DNA 的复制形式。复制时需合成引物。 MtDNA 为双链,第一个引 物以内环为模板延伸。至第二个复制起始点时,又合成另一个反向引物,以外环为模板 进行反向的延伸,最后完成两个双链环状 DNA 勺复制。 60. 逆转录酶有三
20、种活性: (1) RNA 指导的 DNA 聚合酶活性。 (2) DNA 指导的 DNA 聚合酶活性。 (3) RNA 酶 H ( RNaseH 活性。 61. RNA 复制:是指某些病毒在宿主细胞中以自身 RNA 为模板,以宿主细胞中的 4 种 dNTP 为原料,按 5 -3方向催化合成互补的 RNA 链,此过程称为 RNAM制。 62. 逆转录:是指以 RNA 为模板,禾U用宿主细胞中 4 种 dNTP 为原料,按 5 -3方向催化 合成与RNA 互补的 DNA 链的过程。 63. 逆转录病毒复制过程: (1) 逆转录酶以 RNA 为模板,催化 dNTP 聚合生成 DNA 互补链,产物是 R
21、NA/DNA 杂化双 链。 (2) 杂化双链中的 RNA 被逆转录酶中有 RNAB活性的组分如 RNaseH 水解. (3) 利用单链 DNA 为模板,由逆转录病毒催化合成第 2 条 DNA 互补链。 64. Klenow 片断具有:DNA 聚合酶活性和 3 -5核酸外切酶活性。 65. DNA pol I的功能:对复制中的错误进行较读,对复制和修复中出现的空隙进行填补。 66. DNA 复制的保真性依赖的机制: (1) 遵守严格的碱基配对规律。 ( 2)聚合酶在复制延长中对碱基的选择功能。 ( 3)复制出错时有即时的较读功能。 - 6 - 67. 引发体:解螺旋酶,DnaC 蛋白,弓I物酶和
22、 DNA 起始复制区域组成。 68. 拓扑异构酶作用: (1) 拓扑酶 I切断 DNA 双链中的一股,使 DNA 解链旋转中不致打结,适当时候又把切 口封闭,使 DNA 变为松弛状态。反应不需 ATP (2) 拓扑酶 II在无 ATP 时,切断处于正超螺旋的 DNA 分子双链某一部位,断端通过切 口使超螺旋松弛;在利用 ATP 功能的情况下,松弛状态的 DNA 又进入负超螺旋状态,断 端在同一酶催化下连接恢复。 69复制和转录的异同: 相似之处: ( 1 )都是酶促的核苷酸聚合反应。 (2) 都以 DNA 为模板。 (3) 都需依赖 DNA 的聚合酶。 (4) 聚合过程中都是核苷酸之间形成磷酸
23、二酯键。 (5) 都从 5-3方向延伸聚核苷酸链。 ( 6 )都遵从碱基配对规律。 区别: ( 1 )模板。复制:两股链均复制。转录:不对称转录。 (2) 原料。复制:dNTR 转录:NTP (3) 酶。 复制:DNA 聚合酶。转录:RNA 聚合酶。 (4) 产物。复制:子代双链 DNA(半保留复制)。转录:mRNA, rRNA, tRNA. (5 )碱基配对。复制: A-T,C-G。转录:A-U, G-C, T-A。. 70. 真核生物 RNA 聚合酶转录产物和对鹅膏蕈碱的反应。 (1) RNA-pol I :转录产物: 45S-rRNA 对鹅膏蕈碱的反应:耐受。 (2) RNA-pol I
24、I : 转录产物: hnRNA 对鹅膏蕈碱的反应 : 极敏感。 (3) RNA-pol III : 转录产物: 5S-RNA, tRNA, snRNA. 对鹅膏蕈碱的反应:中度敏感。 71. 转录:以 DNA 一条链为模板,以四种 NTP 为原料,在 DNA 旨导的聚合酶作用下,按照碱 基互补原则( A-U,T-A,G-C )合成 RNA 链的过程。 72. 不对称转录:转录时因为(1) DNA 分子双链一股链用作模板指引转录,另一股链不转 录。 ( 2) 模板链并非总是在同一条链上。故称为不对称转录。 73. 原核生物聚合酶组成:由四种亚基组成a 五聚体的蛋白质。其中a 2 3 3 亚 基称
25、为核心酶。b因子辨认起始点。a决定哪些基因被转录。B起催化作用。B起结 合 DNA 模板(开链)作用。 74. 操纵子:转录是不连续、分区段进行的。每一转录区段可视为一个转录单位,称为操纵 子。操纵子包括若干个结构基因及其上游的调控序列。 调控序列中的启动子是 RNA 聚合 酶结合模板 DNA 的部位,也是控制转录的关键部位。 75. 电子显微镜下观察到的羽毛状的图形说明: 在同一 DNA 莫板上,有多个转录同时在进行。 在 RNA 链上观察到的小黑点是多聚核蛋白体。转录和翻译都在高效率的进行。 76. 转录空泡:由酶-DNA-RNA 形成的转录复合物。 77. 依赖p因子的转录终止: P因子
26、是由相同亚基组成的六聚体,它是原核生物转录终止因子。可结合转录产物 RNA 3 端的多聚 C 特殊序列,还有 ATP 酶和解螺旋酶活性。p因子与转录产物 RNA 3 端 的多聚 C 结合后,P因子和 RNA 聚合酶都发生构象改变,从而使 RNA 聚合酶停顿,解螺 旋酶活性使 DNA 和 RNA 杂化双链拆离,转录产物从转录复合物中释放。 - 7 - 78. 非依赖p因子的转录终止: RNA 链延长至终止区时,转录出的碱基序列随即形成 茎环结构 。这种二级结构是阻止 转录继续向下游推进的关键。 其机制有两方面: 一是茎环结构在 RNA 分子形成可能改变 RNA 聚合酶的构象。由于酶构象的改变导致
27、酶一模板结合方式的改变,可使酶不再向下 游移动,于是转录停顿。其二,转录复合物(酶 DNA-RNA 上有局部的 RNA/DNA 杂化 双链。RNA 分子和 DNA 分子都要形成自己的双链,杂化链形成的机会不大,本来不稳定 的杂化链更不稳定,转录复合物趋于解体。接着一串寡聚 U 是使 RNA 链从模板脱落的促 进因素,因为所有的碱基配对中以 U 和 A 的配对最不稳定。 79. TFII 的功能: TFIID : TBP( TATA 结合蛋白)结合 TATA 盒。TAF (TBP 辅助因子)辅助 TBP-DNA 结合。 TFIIA :稳定 IID-DNA 复合物。 TFIIB :促进 RNA-p
28、ol II 结合及作为其他因子结合的桥梁。 TFIIF: 解螺旋酶 TFIIE : ATPase TFIIH: 蛋白激酶活性。 80. 转录起始前复合物(PIC):是真核生物转录因子之间先互相辨认结合,然后以复合体的 形式与 RNA 聚合酶一同结合于转录起始前的 DNA 区域而成。 81. 真核生物 mRNA 专录终止及加尾修饰 真核生物 mRNA 专录终止后,紧接着发生加尾修饰。过程如下:在模板链上转录终止点上 游约百个或上千个核苷酸处常有一组共同的序列 AATAAA 此序列后接着相当多的 GT 序 列。这些序列称为转录终止的修饰点。转录越过修饰点后, mRNA 在修饰点被切断,随 即加入
29、poly A 尾及帽子结构。下游的 RNA 虽然继续转录,但很快被 RNA 酶降解。因此 有理由相信,帽子结构是保护 RNA 免受降解的,因为修饰点以后的转录产物无帽子结构。 82. 外显子:在断裂基因及其初级转录产物上出现,并表达为成熟 RNA 的核酸序列。 83. 内含子:隔断基因的线性表达而在剪接过程中被除去的核酸序列。 84. 人类最庞大的一个基因是: 抗肌萎缩蛋白基因 。 85. 剪接体:是由 snRNP 与 hnRNA 结合,使内含子形成套索并拉近上下游外显子距离的复合 体。剪接体是 mRNAI 接的场所。剪接过程的化学反应称为 二次转酯反应。 86. mRNA 编辑:通过对 mR
30、NA 中的加工,使遗传信息在 mRNA 水平上发生改变。 87. tRNA 的转录后加工: (1) tRNA 前体的剪接。先由核酸内切酶进行催化进行剪切反应,再由连接酶将外显子 连接起来。 ( 2)加上 3端 CCA-OH。 ( 3)化学修饰。包括: 甲基化反应 ,使某些嘌呤变成甲基嘌呤。 还原反应 ,使某些尿嘧啶还原成双氢尿嘧啶( DHU)。 转位反应,尿嘧啶核苷转变为假尿嘧啶核苷() 。 脱氨反应 ,某些腺苷酸脱氨成为次黄嘌呤核苷酸( I )。 88. rRNA 的转录后加工 (1) rRNA 前体的剪接。45S-rRNA 经剪接后,分出属于小亚基的 18S rRNA,余下的部 分再剪接成
31、 5.8S,28S rRNA。rRNA 成熟后,就在核仁上装配,与核蛋白体蛋白质 一起形成核蛋白体,输出胞浆。 (2)化学修饰 . 主要是甲基化反应。 - 8 - 89. 开放阅读框架(ORF:从 mRN/5 端起始密码子 AUG 到 3端终止密码子之间的核苷酸 序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架。 90遗传密码的特点: ( 1) 连续性 。编码蛋白质氨基酸序列的各个三联体密码连续阅读。 ( 2) 简并性 。除甲硫氨酸和色氨酸外,其他氨基酸都有 2 个或多个密码子为之编码,密 码子中第三位碱基是可以不同的,这称为密码子的简并性。 (3)通用性 。蛋白质生物合成的
32、整套密码,从原核生物到人类都通用。 ( 4)摆动性 。反密码与密码之间不严格遵守常见的碱基配对规律,尤其是密码子的第三 位碱基对反密码子的第一位碱基,即使不严格配对也能辨认配对,这种现象称为 摆动配对。 91原核生物翻译起始复合物形成: ( 1)核蛋白体亚基分离。核蛋白体大小亚基分离。 IF-1,IF-3 与小亚基结合,促进大小 亚基分离。 (2) mRNAh小亚基定位结合。原核生物 mRNA 在小亚基定位涉及两种机制。 其一,在各 种原核 mRNA 起始 AUG 上游约 8 13 核苷酸部位,存在 4 9 个核苷酸的一致序列, 富含嘌呤碱基如 AGGAGG 称为 S-D 序列。而原核小亚基
33、16S rRNA 的 3 端有一 段富含嘧啶的段序列如 UCCUC,C 通过与 S-D 序列碱基配对使 mRNAf 小亚基结合。 S-D 序列又称核蛋白体结合位点( RBS。其二,mRNAh紧接 S-D 序列后的小核苷 酸序列可被核蛋白体小亚基蛋白 rpS-1 识别结合。 (3) 起始氨基酰tRNA 的结合。起始 fMet-tRNA 严七和 GTP 结合的 IF-2 起,识别结合 对应小亚基 P 位的 mRNA 起始密码 AUG 起始时 A 位被 IF-1 占据,不与任何氨基 酰tRNA结合。 (4) 核蛋白体大亚基结合。上述结合 mRNA fMet-tRNA 严七的小亚基再与核蛋白体大亚 基
34、结合, 同时 IF 2 结合的 GTP 水解释能, 促使 3 种 IF 释放, 形成由完整核蛋白 体、 mRNA起始氨基酰tRNA 组成的翻译起始复合物。此时,结合起始密码 AUG 的 fMet-tRNA ifMet占据 P 位,而 A 位空留,对应 mRNAt AUG 后的下一组三联体密 码,准备相应氨基酰tRNA 的进入。 92肽链的延长。 (1)进位。核糖体 A 位上 mRN 嶠码子所规定的氨酰tRNA 进入核糖体 A 位上称为进位。 这一过程需延长因子 EF T 的参与。延长因子有三种: 1 . EF-Tu.功能:协助氨基酰tRNA 进入核糖体。与氨基酰tRNA 以及 GTP 吉合 形
35、成EF-Tu-GTP-氨基酰-tRNA,将氨基酰-tRNA 转运到核糖体的 A 位。 2 . EF-Ts.功能:促进 EF-Tu-GTP 的再生。EF-Tu-GTP 在参加一轮核糖体循环后转 变为EF-Tu-GDP, EF-Ts 使 EF-Tu-GDP 再转变成 EF-Tu-GTP,后者可被再利用。 3 . EF-G.功能:促进肽酰-tRNA 移位。促进 mRNA 肽酰-tRNA 由 A 位移到 P 位,促 进 tRNA的释放。 (2) 成肽。在转肽酶的催化下,P 位上的肽酰基与 A 位上的氨基酰基成肽, 成肽反应在 A 位进行,卸载的 tRNA 仍在 P 位。 (3)转位。在转位酶的催化下,
36、新生肽链-tRNA 连同 mRNA 从 A 位移到 P 位,而卸载的 tRNA 移入E 位。A 位空留并对应下一组三联体密码。 93. 终止因子:又称释放因子(RF)其功能是识别 mRNAk 的终止密码子,终止肽链的合成 并释放出肽链。原核生物中释放因子是 RF-1,RF-2,RF-3. RF-1 识别密码子 UAA 及 UAG RF-2 能识别UAA 及 UGA RF-3 结合 GTP 并能促进 RF-1,RF-2 与核糖体 结合。 94. 原核肽链终止过程:肽链延长到 mRN/终止密码在核蛋白体 A 位出现,终止密码子不能 被任何氨基酰-tRNA 识别进位。RF-1,RF-2 进入 A 位
37、,识别结合终止密码。 RF-1 - 9 - 或 RF-2 任一释放因子结合终止密码后都可触发核蛋白体构象改变, 诱导转肽酶转 变为酯酶活性。使新生肽链与结合在 P 位的 tRNA 间酯键水解,将合成的肽链释出。 再促使 mRNA卸载 tRNA 及 RF 从核蛋白体脱离。 RF-3 有 GTP 酶活性,能介导 RF-1,RF-2 与核蛋白体的相互作用。 95. 分子伴侣: 分子伴侣是细胞中的一类保守蛋白质,可识别肽链的非天然构象, 促进各功 能域和整体蛋白质的正确折叠。细胞中至少有两类分子伴侣家族:热休克蛋白和 伴侣素。 96. 蛋白质合成后的加工: (1)新生肽链的折叠 。 (2)一级结构的修
38、饰。包括:肽链 N 端的修饰,个别氨基酸的修饰,多肽链的水解修饰。 ( 3) 空间结构的修饰 。包括: 亚基聚合 ,辅基连接 , 疏水脂链的共价连接 。 97. 起始因子 : (1) IF-1. 能促进 IF-2 、IF-3 的活化。 (2) IF-2. 促进 fMet-tRNA 严七与30S 小亚基结合的作用,并具有 GTP 酶活性。 (3) IF-3.功能是使 30S 亚基从不具活性的核糖体释放,辅助 mRNAf 小亚基结合,并阻 止大小亚基重新聚合。 98. 信号假说机制: 这一假说认为,分泌性蛋白初级产物的 N-端有信号肽结构。在分泌性蛋白合成中,信 号肽一出现, 就被信号肽识别粒子与
39、其受体对接蛋白结合, 促使膜通道开放,信号肽带 动合成中的蛋白质沿通道穿过膜, 信号肽在沿通道折回膜内时, 被位于膜外侧的信号肽 酶切断,使成熟的蛋白质释放到细胞外。 99. 抗生素类作用位点: 四环素类:作用于核蛋白体小亚基,抑制氨基酰 -tRNA 与小亚基结合。 链霉素、卡那霉素:作用与核蛋白体小亚基,改变构象引起读码错误。 氯霉素:作用与核蛋白体大亚基。抑制转肽酶,阻断延长。 红霉素:作用与核蛋白体大亚基。抑制转肽酶,妨碍转位。 放线菌酮:作用与真核核蛋白体大亚基。抑制转肽酶,阻断延长。 嘌呤霉素:作用与真核、原核核蛋白体。属氨基酰 -tRNA 类似物,进位后引起未成熟肽 链脱落。 10
40、0. 白喉毒素作用机制 : 可使真核生物延长因子 eEF-2 发生 ADP 糖基化而失活。 干扰素作用机理 : ( 1 )诱导特异蛋白激酶活化,该活化的激酶使真核主要的起始因子 eIF2 磷酸化失活, 从而抑制病毒蛋白质的合成。 (2)干扰素与双链 RNA 共同活化 2 -5A合成酶,2 -5A可活化核酸内切酶 RNaseL 后者使病毒 mRNA 降解,阻断病毒蛋白质合成。 101. 管家基因:有些基因产物对生命全过程都是必不可少的。这类基因在一个生物个体的 几乎所有细胞中持续表达,通常称为管家基因。管家基因的表达水平受环境因素影响很 小,而是在个体各个生长阶段的大多数、或几乎全部组织中持续表
41、达,或变化很小。这 类基因表达称为 基本(或组成性)基因表达 。 102. 诱导:可诱导基因在一定环境中表达增强的过程称为诱导。 阻遏:可阻遏基因表达产物水平降低的过程称为阻遏。 103基因表达调控的生物学意义: ( 1)适应环境、维持生长和增殖。 (2)维持个体发育与分化。 - 10 - 104原核生物转录的影响因素: ( 1)启动子。启动子决定转录的效率和方向。 (2)a因子。 ( 3)阻遏蛋白具有负调控作用。 ( 4)正调控蛋白促进基因的转录。 (5) 倒位蛋白通过 DNA 重组倒位而调节基因表达。 倒位蛋白是一种位点特异性的重组 酶。 (6) RNA 聚合酶抑制物可与 RNA 吉合并抑
42、制转录。 ( 7)衰减子。 105 .衰减子(attenuator ):细菌中 mRNA 专录和翻译是偶联在一起的。这一特点使细菌中 的一些操纵子的特殊序列可以在转录过程中控制转录水平。 这些特殊序列称为衰减子。 106 .乳糖操纵子 ( 1)乳糖操纵子的吉构: 含有 Z、Y、A 三个结构基因,分别编码半乳糖苷酶、透酶和乙酰基转移酶。 此外,含有一个操纵基因 0, 一个启动序列 P, 个 CAP 结合位点和一个基因 I。丨基 因编码一种阻遏蛋白,与操纵基因 0 结合。启动序列 P、操纵序列 0 和 CAP 吉合位点 组成乳糖操纵子的调控区。 (2) 阻遏蛋白的负性调控作用: 1. 当有乳糖存在
43、时,乳糖通过半乳糖苷酶变为半乳糖, 再经透酶进入细胞内。 真正的诱导剂是半乳糖而不是乳糖。乳糖可与阻遏蛋白结合,导致阻遏蛋白与操纵序 列 0 解离,启动基因转录。 2. 当没有乳糖存在时, 没有诱导剂与阻遏蛋白结合, 阻遏蛋白与操纵序列 0 结合, 发挥负性调控作用,基因不转录。 (3) CAP 的正性调控作用: 1. 当没有葡萄糖及 CAMP 浓度较高时, CAMP 和 CAP 吉合紧密, 此时 CAP 结合在 CAP 结合位点,刺激 RNA 转录活性。 2 .当有葡萄糖存在及 CAMP 浓度较低时,CAMP 和 CAP 结合受阻,因此 lac 操纵子 表达下降。 ( 4)协调调节: 1 .
44、当葡萄糖存在,乳糖存在时:尽管乳糖作为诱导剂和阻遏蛋白结合,使阻遏蛋 白与操纵序列 O 解离。但由于 CAMP 浓度较低,cAMF 和 CAP 吉合受阻,基因处于关闭 状态。 2 .当葡萄糖存在,乳糖不存在时:此时无诱导剂存在,阻遏蛋白与 DNA 结合。而 且由于葡萄糖的存在,CAP 也不能发挥正性调控作用,基因处于关闭状态。 3 .当葡萄糖和乳糖都不存在时: CAP 可以发挥正性调控作用, 但由于没有诱导剂, 阻遏蛋白的负调控作用使基因仍处于关闭状态。 4 .当葡萄糖不存在,乳糖存在时:此时 CAP 可以发挥正性调控作用,阻遏蛋白由 于诱导剂的存在而失去复调控作用,基因被打开,启动转录。 1
45、07色氨酸操纵子调控机制: (1) 当细胞内色氨酸增多时,结构基因转录受到抑制。衰减子转录物有 4 段特殊序 列。片段 1 和 2, 2 和 3, 3 和 4 能配对形成发夹结构,形成发夹能力的强弱依次为片 段 1/2片段 2/3片段 3/4。片段 3/4 所形成的发夹结构之后紧接着寡尿嘧啶,是不依 赖P因子的转录终止信号。 (2) 当细胞内有色氨酸存在时,形成色氨酰- tRNA,核糖体编译可通过片段 1 并通 -11 - 过片段 2,核糖体在到达片段 3 之前就从 mRNA 兑落。在这种情况下,片段 1/2 和片段 2/3 都不能形成发夹结构,只有片段 3/4 形成发夹结构,即形成转录终止信
46、号,从而 导致 RNA 聚合酶作用停止。 (3) 当细胞内没有色氨酸存在时,色氨酰- tRNA 缺乏,核糖体停留在两个相邻的色 氨酸密码子的位置上, 片段 1/2 不能形成发夹结构,片段 2/3 之间形成形成发夹结构, 则片段 3/4 之间就不能形成转录终止信号,后面的基因得以转录。 108. SD 序列:mRNA 起始密码子前的一段富含嘌呤核苷酸的核糖体结合位点。 109. 原核翻译水平的调控: (1) SD 序列是影响翻译的重要因素。 (2) mRNA 勺稳定性是调控翻译的方式之一。 (3 )翻译产物也可以对相应 mRNA 勺翻译进行调控。 (4) 小分子 RNA 可以抑制特定 mRNA
47、勺翻译。 110. 真核生物基因表达在 DNA 水平的调控主要通过下列几种方式: (1) 染色质丢失。 (2) 基因扩增。 (3) 基因重排。 (4) DNA 甲基化。 (5) 染色质结构可影响基因表达。 111 .反式作用因子:真核细胞内有大量的序列特异的 DNA 结合蛋白,其中一些蛋白的主要 功能是使基因开放或关闭,称为反式作用因子。 112 .转录起始复合物形成的步骤: (1) TFIID 结合 TATA 盒。 (2) RNA- pol 识别并结合 TFIID DNA 复合物。 (3) 其他转录因子与 RNA- pol 结合,转录起始部位的 DNA 解链,形成转录起始复合物。 113.
48、反式作用因子的特点: (1) 一般具有三个功能结构域: DNA 结构域、转录活性域和结合其他蛋白的结合域。 (2) 能识别并结合基因调控区中的顺式作用元件。 (3) 对基因表达有正性和负性调控作用,即激活和阻遏基因的表达。 114. 锌指结构:是指在结合 DNA 结构域中含有较多的半胱氨酸 (Cys)和组氨酸(His)的区域, 借肽链的弯曲使 2 个 Cys 和 2 个 His 或 4 个 Cys 与一个锌离子络合成的指状结构。 115. 同源结构域:许多反式作用因子结合 DNA的结构域中有一段相同的保守序列。是由 60 个左右的氨基酸组成的螺旋一回折一螺旋结构的区域,称为同源结构域。 116
49、. 亮氨酸拉链:有些反式作用因子结合 DNA 吉构域中有一段约 30 个氨基酸组成的核心序 列,每隔6 个氨基酸有规律的出现 1 个亮氨酸残基,能形成两性a -螺旋。在螺旋的一 侧是排列成行的亮氨酸,具有疏水性,称为亮氨酸拉链区。两个亮氨酸拉链区的单体 以疏水作用形成亮氨酸拉链。 117. 反式作用因子 DNA 结合域的结构模式: (1) 锌指结构。 (2) 同源结构域。 (3) 亮氨酸拉链。 (4 )螺旋环螺旋结构。 (5) 碱性a螺旋。 -12 - 118. 转录活化结构域结构模型: (1) 酸性a螺旋结构域 (2) 富含谷氨酰胺结构域 (3) 富含脯氨酸结构域。 119. mRNA 勺选
50、择性剪接方式 (1 )外显子选择方式可保留或部分保留外显子。 (2 )内含子选择方式可删除或部分删除内含子。 (3) 互斥外显子是指两个外显子不能同时被保留。 (4) 内部剪切位点造成内含子或外显子的部分序列被切除或保留。 120. 翻译起始的调控 (1 )阻遏蛋白的调控作用。 (2) 翻译起始因子的功能调控。 (3) 5 AUG 寸翻译的调控作用。 (4) mRNAE 编码区长度对翻译的影响。 121 翻译后水平的调控 (1) 新生肽链的水解。 (2) 肽链中氨基酸的共价修饰。 (3 )通过信号肽分拣、运输、定位。 122. 同源重组:是指发生在同源序列间的重组,它通过链的断裂和再连接,在两
51、个 DNA 分 子同源序列之间进行单链或双链片段的交换。又称基本重组。 123. Holliday 模型: (1) 两个同源染色体 DNA 排列整齐 (2) 一个 DNA 的一条链断裂,并与另一个 DNA 对应的链连接,形成 Holliday 中间体。 (3) 通过分支移动产生异源双链 DNA (4) Holliday 中间体切开并修复,形成两个双链重组 DNA 即片段重组体和拼接重组体。 124. 细菌的基因转移:细菌中,可以通过 接合、转化、转导和细胞融合 四种方式,在不同 DNA 分子间发生共价连接,即基因转移。 125. 接合作用:当细胞或细菌通过菌毛相互接触时,质粒 DNA 可以从一
52、个细胞(细菌)转 移导另一个细胞(细菌),这种类型的 DNA 专移称为接合作用。 126. 转化作用:通过自动获取或人为的供给外源 DNA 使细胞或培养的受体细胞获得新的 遗传表型,这就是转化作用。 127. 转导作用:当病毒从被感染的细胞(供体)释放出来,再次感染另一细胞(受体)时, 发生在供体细胞和受体细胞之间的 DNA 转移及基因重组即为转导作用。自然界常见的 例子就是噬菌体感染宿主时伴随发生的基因转移。 当噬菌体感染宿主时会有两种结局, 一是溶菌生长途径,|二是溶源菌生长途径。 12 8.特异位点重组:由整合酶催化,在两个 DNA 序列的特异位点之间发生的整合称为位点 特异的重组。 1
53、29. 重组 DNA 常用的工具酶 1 .限制性核酸内切酶:识别特异序列,切割 DNA 2 . DNA 连接酶 -13 - 3 . DNA 聚合酶 I。具有完整的 5 -3聚合,3 -5外切活性,以及 5 -3外切活性。 用枯草杆菌蛋白酶可将 DNA 聚合酶 I裂解成两个片段,大片段称为 Klenow 片段。具有 5 -3聚合,3 -5外切活性,无 5 -3外切活性。 Klenow 片段用途: (1 )在 cDNA 克隆中,第二股链的合成。 (2) DNA 序列分析。 (3) 补齐双链 DNA 的 3 端。 (4) 通过补齐 3端,使 3端标记。 4 .逆转录酶。 5 碱性磷酸酶。能去除末端磷
54、酸基。 6 末端转移酶。在 3/羟基末端进行同聚物加尾。 7 多聚核苷酸激酶。催化多聚核苷酸 5 羟基磷酸化,或标记探针。 130. 限制性核酸内切酶:就是识别 DNA的特异序列,并在识别位点或其周围切割双链 DNA 的一类内切酶。 131. 回文结构:大部分 II类限制性核酸内切酶识别 DNA 位点的核苷酸序列呈二元旋转对称, 通常称这种特殊结构顺序为回文结构。 132. C 值: 基因组的大小常以其 DNA 含量表示。单倍体基因组中的全部 DNAS称为C值。 133 .作为克隆载体的质粒应具备: (1 )分子量相对较小,能在细菌中稳定存在,有较高的拷贝数。 (2) 具有一个以上的遗传标志。
55、 (3) 具有多个限制性内切酶的单一切点,便于外源基因的插入。 134. 常用作克隆的载体:质粒、入噬菌体、 M13 噬菌体、粘性质粒、病毒载体、酵母人工 染色体和细菌人工染色体。 135. DNA 克隆:应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质与载体结合成一具有自我 复制能力的DNA 分子一一复制子,继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基 因的转化子细胞,再进行扩增、提取获得大量同一 DNA 分子,即 DNA 克隆。又称基因 克隆。实现基因克隆所采用的方法及相关工作称为基因工程或重组 DNA 技术。 136. 基因克隆的步骤: (1) 目的基因的获取。 1 .化学合成法。 2 .基因
56、组 DNA 文库。 3 . cDNA 文库。 4 . PCR (2) 克隆载体的选择和构建。 (3) 外源基因和载体的连接。 1 .粘性末端连接。 2 .平端连接。 3 .同聚物加尾连接。 4 .人工街头连接。 (4) 重组 DNA 导入受体细胞。 1 .转化:是指将质粒或其他外源 DNA 导入处于感受态的宿主菌, 并使其获得新的表型 的过程。 -14 - 2 .感染:入噬菌体、粘性质粒和真核细胞病毒为载体的重组 DNA 分子,在体外包装成 具有感染能力的病毒或噬菌体颗粒,然后才能感染适当的细胞,并在细胞内扩增。 3. 转染:转染是转化和感染两个词构成的新词,指真核细胞主动摄取或被动导入外源
57、DNA 片段而获得新的遗传表型的过程。常用方法有:电穿孔法、磷酸钙共沉淀法和脂 质体融入法等。 (5) 重组体的筛选。 1 .遗传学方法 2 免疫学方法 3 .核酸杂交法 4 . PCR 技术 5 .酶切鉴定 (6) 克隆基因的表达 137. 真核细胞转染的方法: (1)磷酸钙共沉淀法 (2) 电穿孔法 (3) DEA1葡聚糖法 (4) 脂质体介导基因转染 (5) 显微注射法 138. 重组 DNA 技术应用 (1) 疾病基因的发现和克隆 (2) 生物制药 (3) 基因诊断 (4) 基因治疗 (5) 遗传病的预防 139. 细胞间信息物质(第一信使):凡由细胞分泌的调节靶细胞生命活动的化学物质
58、统称细 胞间信息物质。包括:神经递质、内分泌激素、局部化学介质和气体信号 。 140. 细胞内信息物质:在细胞内传递细胞调控信号的化学物质称为细胞内化学物质。 141 .第二信使:通常将 Ca2+、cAMR cGMR DAG IP3、Cer、花生四烯酸及其代谢产物这类 在细胞内传递信息的小分子化合物称为第二信使。 142. 第三信使:负责细胞核内外信息传递的物质称为第三信使。是一类可与靶基因特异序 列结合的核蛋白,能调节基因的转录,因此又称为 DNA 结合蛋白。 143. 膜受体分为: 环状受体、G 蛋白偶联受体、单次跨膜a螺旋受体 和具有鸟苷酸环化酶 活性的受体。 144. 胞内受体包括四个
59、区域: 高度可变区、DNA 结合区、铰链区和激素结合区。 145 .受体与配体结合的特点: 高度专一性、高度亲和力、可饱和性、可逆性和特定的作用 模式。 146 .膜受体介导的信息转导途径 (1)cAMP 蛋白激酶途径。 1. CAMP 的生成与降解。一些激素如肾上腺素、胰高血糖素等作用于相应的受体后,活化相 应的受体,活化的受体可催化 Gs 的 GDP 与 GTP 交换,导致 Gs 的a亚基与丫解离, 释放出 a s GTP a s GTP 可导致 AC 活化,使得 ATP 转变为 cAMP 细胞内 cAMP 浓度升高。 -15 - cAMP 在细胞内的浓度除与 AC 活性相关,还和磷酸二酯
60、酶活性有关。 2. cAMP 的作用机制。cAMP 对细胞的调节作用是通过激活 cAMP 依赖性蛋白激酶系统来实现 的。PKA 是一种由四聚体组成的别构酶( C2R2).其中 C 为催化亚基,R 为调节亚基。每个调 节亚基上有两个cAMF 结合位点,催化亚基有催化底物蛋白质特定丝 /苏氨酸残基磷酸化的功 能。调节亚基与催化亚基结合时, PKA 呈无活性状态。当 4 分子 cAMP 与两分子调节亚基结 合后,调节亚基脱落,游离的催化亚基具有蛋白激酶活性。 3. PKA 的作用。PKA 被 cAMP 激活后,能在 ATP 存在的情况下使许多蛋白质特定的丝 /苏氨酸 残基磷酸化,从而调节细胞的物质代谢和基
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