核酸含量测定PPT课件

1、型号：型号：GeneQuant pro 品牌：品牌：通用（GE）产地：产地：美国波长校准波长校准：启动后自动进行 波长范围：波长范围：230, 260, 280, 320,546,562, 595,600nm 核酸定量分析仪DNA/RNA计算器第1页/共24页用用 途途（1）核酸和引物样品扫描测定；（2）可检测低至20ng 的核酸样品（用7微升超微量比色杯），显示A260/280和A260/230比值作为核酸纯度检测的指标 ；（3）可采用在 595nm 的Bradford 法、546nm 的双缩脲法和562nm 的BCA 法进行蛋白检测，样品通过存贮的标准曲线进行测量，直线的线性回归结果可打印

2、出来；（4）OD600 细菌细胞培养测定；（5）计算寡核苷酸分子量，理论Tm值（用于PCR退火温度）。第2页/共24页l546nm双缩脲法/lowry法（Folin-酚法 ）l双缩脲法：在碱性条件下，蛋白质中的肽键与铜结合生成蓝紫色复合物，颜色深浅与蛋白质浓度呈正比。 llowry法的显色原理与双缩脲方法是相同的，只是加入了第二种试剂，即Folin酚试剂，以增加显色量，从而提高了检测蛋白质的灵敏度。在碱性条件下，蛋白质中的肽键与铜结合生成复合物。 Folin酚试剂中的磷钼酸盐磷钨酸盐被蛋白质中的酪氨酸和苯丙氨酸残基还原，产生深蓝色（钼兰和钨兰的混合物）。在一定的条件下，蓝色深度与蛋白的量成正比

3、。 l562nmBCA法l在碱性条件下，蛋白质将Cu2+ 还原为Cu+ ,Cu+ 与BCA 试剂形成紫色络合物，其吸光值与蛋白浓度成正比。l595nm考马斯亮兰法（Bradford法 ）l考马斯亮蓝G-250在游离状态下呈红色，最大光吸收在488nm；当它与蛋白质结合后变为青色，蛋白质-色素结合物在595nm波长下有最大光吸收，其光吸收值与蛋白质含量成正比。第3页/共24页lOD600 检测细菌培养液的浓度l利用细菌的吸光来测量细菌培养液的浓度，从而估计细菌的生长情况，所以通常用来指菌体细胞密度。l测量细菌培养液在600nm处的吸光值，得到的OD600的数值如果在0.6-0.8之间，表明细菌处

4、于旺盛生长的对数生长期，OD6003表明细菌已经饱和。l细菌的生长情况,可以通过测OD600来监测。细菌的生长比较好的时期是在OD600为1时，此时可以进行传代等研究。 第4页/共24页第5页/共24页比色杯第6页/共24页第7页/共24页第8页/共24页l参数设定参数设定lDNAlSet-uplSelect 修改参数lEnter确认第9页/共24页l设定空白设定空白l将空白溶液加入比色杯中lSet ref第10页/共24页l核酸含量和纯度测定l将待测核酸样品按照比例稀释后，加入比色杯中lDNA 或 enter第11页/共24页实验原理实验原理 核酸、核苷酸及其衍生物的分子结构中的嘌呤、嘧啶碱

5、基具有共轭双健系统（-C=C-C=C-），能够强烈吸收250-280nm 波长的紫外光。 核酸（DNA、RNA）的最大紫外吸收值在260nm 处。遵照Lambert-Beer 定律，可以利用紫外光吸收值的变化来测定核酸物质的含量。第12页/共24页Lambert-Beer 定律定律 光吸收基本定律光吸收基本定律 l当一束平行的单色光通过溶液时，溶液的吸光度 (A) 与溶液的浓度 (C) 和厚度 (b) 的乘积成正比。它是分光光度法定量分析的依据。 第13页/共24页l在不同pH 溶液中，嘌呤、嘧啶碱基互变异构的情况不同，紫外吸收光也随之表现出明显的差异，它们的摩尔消光系数也随之不同。所以，在测

6、定核酸物质含量时均应在固定的pH溶液中进行。实验原理实验原理第14页/共24页碱基的互变异构碱基的互变异构l嘌呤和嘧啶都有酮-烯醇式互变异构现象，一般生理pH条件下呈酮式。l互变异构会使碱基间发生错配，使A-C、T-G等 。l当胸腺嘧啶以正常形式（即酮基型）为模板时，配对的互补碱基为腺嘌呤；当前者变为烯醇型结构时，通过氢键配对的碱基可变为鸟嘌呤。第15页/共24页l采用紫外分光光度法测定核酸含量时，通常规定：l在260nm 波长下，10mm光径的比色杯中，光密度为1.0的DNA或RNA溶液的浓度为50或40g/ml 。因此，测定未知浓度的DNA（RNA）溶液在OD260nm的吸光度值，即可计算

7、测出其中核酸的含量。实验原理实验原理第16页/共24页DNA浓度计算 DNA浓度（浓度（g/mL）系数）系数Abs260l系数系数=光径光径稀释倍数稀释倍数第17页/共24页lOD230 表示样品中存在一些污染物，如碳水化合物、苯酚等，Tris，EDTA和其他缓冲液的盐在这个波长都有吸收；lOD320 表示检测溶液的混浊度和其他干扰因子，纯样品OD320一般是0，若溶液盐浓度越高，OD320的数值也越高。实验原理实验原理第18页/共24页lOD260/OD280的比值用于评估核酸样品的纯度l纯净的纯净的DNA OD260/OD2801.8l纯净的纯净的RNA OD260/OD2802.0l比较

8、纯净的核酸样品 OD260/OD230 2.0l若有小分子及盐离子存在，如核苷酸、氨基酸、酚等 OD260/OD230 2.0实验原理实验原理第19页/共24页植物基因组植物基因组DNA提取提取产品简介产品简介 本试剂盒适用于从多种植物的不同组织中快速提取基因组DNA，特别适用于多酚、多糖含量高的植物组织和植物干粉。离心柱中独特的硅基质材料和其配备的缓冲溶液能有效去除植物组织中多糖、多酚复合物和酶抑制剂，纯化过的基因组DNA可直接用作PCR模板、酶切、杂交等分子生物学实验。产品特点产品特点 简单快速：1 小时内即可获得超纯的基因组DNA。 纯度高、质量好：纯化过的基因组DNA 可直接用作PCR

9、 模板、酶切、杂交等分子生物学实验。产品应用产品应用 应用广泛，可应用于多种植物的多种组织 特别适合于多糖、多酚含量高的植物 特别适合于植物干粉保存条件保存条件: 室温第20页/共24页1 取大豆粉100mg，加入700l 65预热的GP1溶液，迅速颠倒混匀后，将离心管放在65水浴20min，水浴过程中颠倒离心管以混合样品数次；2 加入700l氯仿，充分混匀，12000rpm 离心5min；3 小心地将上一步所得上层水相转入一个新的离心管中，加入700l缓冲液GP2，充分混匀；4 将混匀的液体转入吸附柱CB3中，12000rpm 离心30s，弃掉废液；5 向吸附柱CB3中加入500l缓冲液GD

10、，12000rpm 离心30s，弃掉废液，将吸附柱CB3放入收集管中；操作步骤操作步骤第21页/共24页6 向吸附柱CB3中加入700l 漂洗液PW，12000rpm 离心30s，弃掉废液，将吸附柱CB3放入收集管中；7 向吸附柱CB3中加入500l 漂洗液PW，12000rpm 离心30s，弃掉废液；8 将吸附柱CB3放入收集管中， 12000rpm 离心2min，倒掉废液，将吸附柱CB3置于室温放置数分钟，以彻底晾干吸附材料中残余的漂洗液；9 将吸附柱CB3转入一个干净的离心管中，向吸附膜的中间部位悬空滴加50-200l 洗脱缓冲液TE，室温放置2-5min， 12000rpm 离心2min，将溶液收集到离心管中。操作步骤操作步骤第22页/共24页操作步骤操作步骤10. DNA浓度及纯度检测：（1）吸取20l DNA样品，用