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文档简介
1、尙博苑科技丄 BIO-TECHMascot检索软件在蛋白 质质谱鉴定中的应用目录生物质谱简介 Mascot 简介应用实例离子源(ionsource):使蛋白或多肽变成带电离子质量分析器(mass analyzer):将离子源中形成的离子按质荷比大小分开检测器(detecter): 实现离子信号检测常见类型:A:电喷雾电离(ESI)B:基质辅助激光 解吸电离(MALDI)常见类型:A:四级杆(Quadrupole)B:离子阱(Ion trap)C:飞行时间(TOF)常见类型:A:直接检测器B:电子倍增器C:闪烁检测器生物质谱简介 基本结构博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www
2、. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家生物质谱简介基本类型 MALDI-TOF 以及 MALDI-TOF/TOF:质谱类型:TOF质谱仪样品状态:固态优点:仪器结构简单,扫描速度快,高通量缺点:结果可靠性依赖于样品质量 LC-ESI-MS/MS:质谱类型:三级四级杆、离子阱、Q-TOF样品状态:液态优点:灵敏度高,结果更可靠缺点:低通量、价格贵生物质谱简介主要品牌美国应用生物系统(ABI):美国安捷伦科技(Agilent):美国布鲁克-道尔顿(BrukerDaltonics):美国戴安公司(Dionex):美国岛津(Shimadzu):日
3、本赛默飞世科技(Thernio Fisher):美国(原美国热电)沃特世科技(Waters):美国CScientiGc博苑科技 WAVAVBIO-TECH蛋白质组完整解决方案www.cloudscientific. com您身边的生物信息专家 生物质谱简介蛋白质质谱鉴定基本流程肽段混合物蛋白二级碎片 分子in於刖 Muscot Search Results7»« J« »r«»4>NV e«w«X>SWmk«u»m * 55 &4kJK Zaoycraomcr* Xo4
4、87;0 SO4P<&、«>*« «e Xs40«a 6x» motm m CK“*aU bcMt 仙 r3细hte搜索软件DNA/protein 数据库 °M«vcMm9wrv鉴定结果博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com°'2丫禽凸血c您身边的生物信息专家生物质谱简介蛋白质质谱检索常用软件博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您
5、身边的生物信息专家博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家软件名称MascotSEQUESTX! Tandem软件类型商业软件商业软件免费开源软件数据格式MGF、DTAPKLRAW、 DTADTA、PKL、MGF、mzXML说明:Mascot是目前使用最广泛的蛋白质鉴定检索软件、功能十分强大生物质谱简介蛋白质质谱检索常用软件 Mascot十大特性:通过一个整合的软件包,同时支持目前主流的三种检索算法通过特有的基于实概率的打分方法,支持标准统计显著性检验分 析可用于检索任何FASTA数
6、据库,包括蛋白质数据库、EST数据库 以及基因组数据库无须耗时即可建立检索目录,无论是否基于酶的特异性,对于特 异性的化学修饰或翻译后修饰的鉴定均非常灵活支持几乎所有常用的质谱仪输出的数据格式生物质谱简介蛋白质质谱检索常用软件 Mascot十大特性(续):通过高效率的代码可满足从单线程到多线程系统或集群的高通量 计算需求通过界面友好的客户端支持自动提交检索任务,无须用户编程支持所有的Web浏览器,提交概述性以及详细的结果报告,并且 配以详尽的在线帮助文档,以帮助用户理解分析结果目前已拥有一千多个学术及商业用户,被Frost & Sullivan誉为"质 谱数据检索的黄金标准”
7、由独立运营,充满活力的Matrix Science公司研发,该公司一直致 力于开发最先进的生物信息学软件Mascot简介 使用类型在线检索:免费,数据库总是最新的,检索速度快, 简单,只需将peak list文件导入即可,但文件大小受 限制本地检索:需要购买软件及安装数据库,但使用方便、 可以进行大规模的数据检索分析和数据库配置,功能 更加强大Mascot简介 检索方式 Mascot是一款强大的数据库检索软件,可以实现从质 谱数据到蛋白质的鉴定,其检索方式包括以下三种:Peptide Mass Fingerprint (肽指纹图谱检索)Sequence Query (部分序列比对)MS/MS
8、Ion Search (串联质谱检索)博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家Mascot简介肽指纹图谱鉴定原理:根据一个蛋白质酶切后的一组特异肽段分子量 信息进行比较从而进行蛋白鉴定优点:是蛋白质鉴定的经典方法,算法简单,速度 快,在串联质谱鉴定岀现之前应用广泛缺点:质量相近的多肽增加匹配难度,并且无法实现 混合蛋白的鉴定,不太适合数据库不完整的物种的蛋 白质鉴定,不能分析到翻译后修饰位点Mascot简介部分序列比对原理:釆用分子量联合部分氨基酸序列或者氨基酸组 成信息进行蛋白鉴定
9、优点:检索速度快,其“错误容忍”模式增强了序列标 签的匹配率缺点:常需要人工解析序列标签,对操作者的经验要 求严格同时耗费时间较长Mascot简介串联质谱鉴定原理:对一个或者多个未被解析的肽段MS/MS数据 进行对库比较从而进行蛋白鉴定优点:是目前应用最广的高通量鉴定蛋白质方法,鉴 定准确度更高,无需人工序列解析,可以实现混合蛋 白的鉴定缺点:增加了一步操作,算法更复杂,对仪器要求更 严格博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家Mascot简介一打分算法原理 基于MOWSE(MOle
10、cular Weight Search)算法的改进: MOWSE算法是基于非冗余蛋白质数据库OWL中肽分布频率 及可能性的算法采用基于可能性大小的打分算法能够提供一个直观的数值或 者图形来评价一个结果是否为显著值或是否可信。同时可以 对不同的搜库方式及数据库检索的结果直接比较 步骤将数据库中的每一个蛋白按10kDa大小归类对于每一个蛋白质,将理论酶切产生的肽段按lOODa大小作 为一个字节进行归类(每个氨基酸的平均分子量接近lOODa)以每10kD蛋白间隔为单位,分别计算间隔内所有蛋白质酶 切后每一个字节(lOODa)中的肽段的百分比(频率),就 是将一个字节中归类的肽段数除以该蛋白间隔中所有
11、肽段数 步骤(续):对于每个10kD中的蛋白质间隔,将每一个字节中的频率归 一化成与最大频率的字节值的比较在一定的质量误差范围内,将质谱获得的图谱中的质量数与 数据库中的每一个蛋白质理论酶切片段进行匹配,对于匹配 上的每个肽段片段提取频率分数,然后再将这些频率分数相 乘得到Pn值分数计算: Mascot算法是对MOWSE分数的一种重建,表示为:S = 10*Log(P),P:比对匹配的一个随机事件的可能性大小P=E*N1 , E二期望值,N二数据库中蛋白质数目的大小如果检索一个数据大小为1.5 X106个蛋白质数目的数据库,显 著差异值E=0.05,则对应与Mascot分数S=10*Log (
12、1/1.5 x 106)(0.05)=74.7说明:这个分数算法是PMF的分数算法,MS/MS ion search则采 用其它分数算法博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家Mascot简介一打分算法分数高低取决于数据库的大小与设定的E值,对于特定 的数据库和E值(如E=0.05),则可以算岀S。一般用确定 的E值来设定对应的阈值分数。如下图,E=0.05,则阴 影内结果表示为小于阈值分数的不可信结果In this example, scores less than74 are i
13、nsignificantMascot Score: 120 = lxlO'1275100博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com°'2丫禽凸血c您身边的生物信息专家Mascot简介一打分算法Probability Based Mowse Score博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com°'2丫禽凸血c您身边的生物信息专家 应用实例数据文件格式COll-Project:2hang lab. Spot Set: zhang lab
14、2009070i, Label: E15,Spot Id: 1569S8, Peak List Id: 1S9258, t<S Job Run Id: 12333(823.10269124088028却5却1781期0071035 123H1128打9055H25129235681晦仙71309.0431359.69871686.882813QM.77271276.2707162 8»014833F31828.0029229491M31837.897938546023187587于24271883.89183007QB22tW«.6727749611822175210
15、592852253 09H51702打M122W5 27342360.1809DRCTN IONSPEPHASS-iMS047CHARCE=1*TITLE=Label;E15r Spot Id; 150958. Peak_List Id: 159888, MSHS JobRun_Id: P233叽 Corenient:8612033113513395110.086331964.3894175101U.81982&1 13058916.77274330 P8B0896.90018 23W7005222H7232391659.08862639 W“623.35114b"餌佃257
16、7676S«47861 佃 BG2855.1509 Ji1667.7635856111851厅5861 033"2660.338*1861931H836.98755671.81891END IONSBEGIN IONSPEPMASS-13596987CIIARGE-1*TITLE-Label:E1S Spot_Id: 196958v Peak_Llst_Ids *159886 ItSItS Job_Run_Id: 12334. Coraraent:*- pp v_E 16124 866308062. txt记亨*匚回区文件© sws®)格式功殆肋on说明
17、:本文的所举实例均为采用Mascot搜索软件对ABI4800的 MALDI-TOF/TOF质谱仪获得的双向电泳蛋白点的串联质谱鉴定结果应用实例 检索页面博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家HOME-WHATS NEW-MASCOTiHELP; PRODUCTS-SUPPORT TRAINING:CONTACTMascot >
18、 MS丿MS Ions SearchMASCOT MS/MS Ions Search博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家Your name boyua-_:e::-Email bouan_L=ch博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身
19、边的生物信息专家Search title E15博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家Database(s)HSwissProtNCBInr con taminants cR4PMSDBEnzyme TrypsinAllow upto 1 v missed cleavagesQuantitation None博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家Taxonomy Hom
20、osapiens (human)v博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家FixedmodificationsCarbamidometh/I (C)Display all modifications VariableOxidation (M)0modificationsPeptide tol. ±50ppm 7 沪3° 0 w MS/MS tol. ±Peptide charge1+Acetyl (K)Acetyl (N-term)Acetyl (Pro
21、tein N-term) Amidated (C-term) flmidated (Protein C-term) Ammonia-loss (N-term C) Biotin(K)Biobn (N-term)Carbamyl (K)Carbamyl (N-term) Carboxymethyl (C)0:25 dTv|Monoisotopic 0 Average 0博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家应用实例检索输入 Your name:用户名,在网页检索时必须输入,本地 检索
22、时不要求输入 Email :电子邮件地址,进行检索时如遇网络无法链 接等情况,检索将会继续自动完成后并直接发送到电 子邮箱Search title:检索标题,检索完成后将会出现在结果 页面的顶部,可以留空博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家应用实例检索输入 Database: EST、MSDB、NCBInr、SwissProt>contaminants(cRAP) EST数据库被分解成几个小类:Environmental_EST,Fungi_EST等,EST库不能直接检索且
23、不能用于PMF数据检索 MSDB从2006年之后就不再有更新,现在一般不使用 Contaminants(cRAP)数据库很小,主要包括一下常见的污染蛋白质,如B SA和trypsin等 NCBIm-和SwissProt是目前最广泛应用的数据库,NCBIm是 一个综合性非兀余数据库,时常更新;SwissProt则建库质量 很高,特别适合做PMF的数据检索博苑厂7 七厂lb BIO-TECH蛋白质组完整解决方案 O'怨切tific您身边的生物信息专家应用实例检索输入 Taxonomy:物种类型,对于已测序生物,直接选择该物种数据库即可对于非测序生物,一般选择一种大类的数据库物种类型对搜库结
24、果的特异性有显著影响,能避免不同物种之间 同源蛋白质在结果列表中出现,如actin是一种在不同物种中广泛 存在的蛋白质,如果已知样品物种来源是水稻,但在物种选择 时,选绿色植物这一大类,则会出现在该大类下许多物种下的 actin,而排在第一位的不一定是水稻的actin,因此在非测序生物 的大类检索时,需要在成功鉴定的结果中认真选择与本物种亲缘 关系最近的蛋白质 Enzyme:实验所用的酶,一般选择最常用的Trypsin(胰蛋白酶) Missed cleavages:允许最大的未被酶切位点数,一般 选择1 Fixed modification:固定修饰,一般选择半胱氨酸碘 乙酰胺化-Carbam
25、idomethyl (C ) Variable modfication:可变修饰,一般选择甲硫氨酸 氧化-Oxidation (M),也可能存在N-乙酰化对于一些有特殊化学处理修饰的氨基酸功能基团修饰,可人为在本地数据库中进行配置。可变修饰选择 越多,检索速度越慢,而且易岀现假阳性结果,需人 工确认存在修饰的结果 Peptide tol. ± :肽段容差,主要以ppm和Da两种形 式,表示前体离子所测误差值的大小,其大小与仪器 类型相关,TOF等高分辨质谱可能在几个ppm到几十 个ppm之间,而离子阱质谱可能在0.5Da甚至更大 MS/MS tol. ± :表示二级质谱中碎
26、片离子的质量误差 Monoisotopic or Average: 一般选单同位素质量而不 选平均分子量,这样更准确 Data file:导入需要检索的质谱数据peaklist文件,对 于PMF的数据,也可以数据输入框直接粘贴 Peptide charge: 一级质谱中多肽或者前体离子的带电 荷情况,若为MALDI类型的质谱则一般为1 + ,若为 ESI类型的质谱则一般选1 +、2 +、3 +Precursor: 一般不需要选择博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信息专家应用实例检索输入
27、 Instrument:仪器类型,不同类型的质谱仪器产生的 系列碎片离子都不一样,选择对应的仪器类型有助于 选择用来比对的离子类型MS/MS中的主要离子类型Def ou ItESI QUADTOFmaldi TOF PSDESI TRAPESI QUADESIFTICRMALOI TOF TOFESISECTFTMS ECDETD TRAPMALDI MALDI QUAD QIT TOFTOFMALDI ISD1-* fragmentsXXXXXXXXXXXXX2* Fragmants if precursor 2" or higherXXXXXXXXX2* fragments if
28、 precursor 3* or higherImmonium ionsXXXXXa series ionsXXXXXXa-NH3 if fragment includes RKNQXXXXa-H2O if fragmant indudoc 6TEDXXXb series ionsXXXXXXXXXXb-NH3 if fragment includes RKNQXXXXXXXXXb-H2O if fragment includes 5TEDXXXXXXXXXc series ionsXxXx series ionsy series ionsXXXXXXXXXXXXXXXNH3 if fragm
29、ent includes RKNQXXXXXXy-H2O if fra ament includes 5TEDXXXXXXz sericas ionsZ4-H series ionsXXz十2H series ionsXXXinternal yb < 700 DaXXXXinternal ya < 700 DaXX一XXy or y- must bo significantV or y*- must be top sconng senes博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com。'怨角占etific您身边的生物信
30、息专家UserEmailSearch title MS data file Database Taxonomy Timestaw Protein hits:boyuanbio 使用者:boyuan_tech 电子由M牛地址:Project: zhang lab, Spot Set: zhang lab20D90701, Label: E15; Spot Id: 156958, Peak List Id: 159258, NS Job Run Id: 12333:F:resultsFFW_E15_124856308052.tHt 数据來源;HCBInr 20101016 (12044221 se
31、quences; 4112881769 residues)检索的数据库, :Homo sapiens (human) (234546 sequences)物种;19 Oct 2010 at 05:52:23 SIT 检索时间:qi|39505 pyruvate kinase Homo sapiens匹配的结果可以知道数据库大小搜索标题Mascot Score Histop'inIons score is -10*LogP), where P is the probability that the observed match is a random event.IndiYidualio
32、ns scores > 35 indicate identity or 沁 nsiye homology.大丁 3 5 分即成功鉴定(可靠性达到显著水平)Protein scores are derived from ions scores as a non-probabilistic basis for ranking protein hits.5 0 5 0 5 o 5 AY4 4 3 3 2 2115 如三工uo:匹配的蛋白数目阴影线:区分匹配结果 可靠与不可靠的分界线小红柱:匹配的结果250500750横坐标:匹配的蛋匸聘勢应用实例网页结果查看ISce Mascot Search
33、 Results博苑»BIO-TECH蛋白质组完整解决方案Scientific您身边的生物信息专家匹配的肽段得分列出每一个肽段中间红线标出的序列)QueryObservedMr(exEt)Mr (calc)PDmKissScoreExpect Rank UniquePeptide81359.69871358.69141358.6976-4.570630.000121UR.NTGIICTIGPASR.S111462.80461461.79731461.8079-7.2301202e-101uK.IYVDDGLISLQVK.Q1828.00291826.99561827.0142-10.
34、151645.8e-051uR.GDLGIEIPAEKVFLAQK.M生1837.89791836.89061836.9040-7.271530.000911uR.RFDEILEASDGIMVAR.G + Oxidation (M)18883.89181882.88451882.8962-6.2001282.6e-ll1uR.LHFSHGTHEYHAETIK.N202068.07372087.06642087.0799-6.471746.8e-061uR.EAEAAIYHLQLFEELRR.L2221 兀 10402174.09672174.1107-6.4201811.7e-161uR.LA
35、PITSDPTEATAVGAVEASFK.C242253AW452252.08722252.1086-9.51110386e-091uR. LNFSHGTHEYHAETIKHVR T262465.2342464.26612464.2849-7.640175.91uR TATESFASDPILYRPVAVALDTK G273017.593®3016.58573016.5869-0.4016201uR.TATESFASDPILYRPVAVALDTKGPEIR.T应用实例网页结果查看Peptide Siuninary ReportFormat As fp 即帕 e Summary) v|可
36、以在二级质谱(peptide suiiunaiy)上"""和一级质谱(piotein summary报告形式下切换HelpSigficaiiceWesEoIdp< 0-°5Standard scoring ® MudPIT scoring 0 Ions score or expect cut-off 0Show sub-sets 0Man number of hits AUTOSelect All En 01 tolerantShow pop-ups ® Suppress pop-ups 0 Sortunassned Decre
37、asingScore v Require bold 10个肽段归屈一个蛋白质,其 中有8个肽段的可信度单独超 过阈值分数,这里是大于35分Select NoneSearch Selected1. qi.| 35505 Mass: 58411 Score: 808 Matches: 10 (8)P7rUV9te kinaSe HOrn° 3aP1£n5匹配成功的结果及其具体信息this hit in error tolerant search Checkto include匹配的肽段序列(发表论文时,只需耍点击进入该肽段离子的二级质谱比对博苑科技 厂, 结果详细网页!见后面解
38、释1!3 BIO TECH蛋白质组完整解决方案 仁"怨禽占血c您身边的生物信息专家gil31416989Mass; 58512Score: 808Matches: 10(8)Sequences:Pyruvate kinase, muscle Homo sapiensgi|33286418Mass! 58470Score: 808Matches: 10(8)Sequences:pyruvate kinase isozywes M1/M2 isoform M2Homo sapiensgil62897413Mass: 58517Score: 808Matches: 10(8)Sequenc
39、es:pyruvate kinase 3 isoform 1variant Homosapiensgil67464392Mass; 60277Score; 808Matches: 10(8)Sequences:Chain A, Structure Of HumanMuscle Pyruvate Kinase (Pkm2)gi|73535278Mass: 62570Score: 808Matches: 10(8)Sequences:Chain A, HumanPyruvate Kinase M2gil127795697Mass: 58491Score: 808Matches: 10(8)Sequ
40、ences:Pyruvate kinasez muscle Homo sapiensgi|169404695Mass: 57091Score: 808Matches! 10(8)Sequences:M2-type pyruvate kinase Homo sapiens10(8)10(8)10(8)10(8)10(8)10(8)10(8)10(8)10(8)10(8)gi|224510884Mass;58690Score:Chain A, S437yHutantOf HumanHusclegi|226438362Mass:60495Score:Chain A; Act ivator-Bound
41、 Structure Ofgil119598292Mass:60773Score:Matches: 10 (8) Sequences: 10(8)Homo sapiens应用实例网页结果查看具有相同匹配结果的蛋白及其信息Proteins matching the same set of peptides:qiI 189998 Mass: 58447 Score: 808 Matches: 10 (8) Sequences: 10(8)Chain A, Pyruvate Kinase M2 Is A Phosphotyrosine Binding Proteinqi|169404699 Mass
42、: 58316 Score: 808 Matches: 10(8) Sequences:Chain A, Pyruvate Kinase M2 Is A Phosphotyrosine Binding Protein808Matches: 10 (8) Sequences:Pyruvate Kinase, Isoform H2808Matches! 10 (8) Sequences:Human Pyruvate Kinase M2807pyruvate kinase, muscle, isoform CRA c应用实例网页结果查看2“4LV<IU. VJVt71359.69871358.
43、691491395.77271393.7654101462.80461461.7973121828.00291826.9956141837.89791836.8906161S75.87501874.8677172883.89281882.8845192088.07372087.0664212175.10402174.0967232253.09452252.0872252465.27342464.2661Search Paiamelei-s检索数据库的一些具体参数设置Type of searchMS/MS Ion SearchEnzymeTrypsinFixed notificationsCar
44、heDnidcunethyl (CJVariable modificationsOxidation (H)Mass valuesMonoisotopicProtein MassUnrestrictedPeptide Mass Tolerance+ 50 ppmFragment Mass Tolerance+ 0.25 DaMax Missed Cleavages1Instroment typeMALDI-T0F-10FNumber of queries27Mascot: f应用实例网页结果查看| Select All | |Selec点击进入该蛋白的信息1- 沪I3沁 页面(下图)pyruva
45、te ki,2J Check to incsctence Mascot Seiirch ResultsProtein View下面列出了鉴定蛋白的具体信息,包括蛋白得分(808分)分子量(58411) >等电点(7.58)、覆盖率(27%)等Match to: ai|35503 score: 808pyruvate kxnasc Homo sapiensFound in search o£ F:resulcsppw_E15_124856308052 txcNominal :mcoo (Hr) : 50411; Calculat.cd pl value: 7 58NCDI BLA
46、ST search of qil 35505 aaeiinst nr单击此处可以进入BLAST页面深入了解该蛋白功能UnforiMQtted sequence 却匕!gm审 tgir posting into other epp 1 icat.ionsTax o noiwy: Homo o g i u noFixed modirlcaclons: Cartoamldomechyl (C)Variable modi£icat.ions : Oxidation (M)Cleavage by Trypsin: cuts C-terw side of KR unless next: resi
47、due is PSequence Coverage: 27%Matchea peptlaes shoun ln Bold Rert下表列出的红色序列为二级质谱匹配的序列1 MSKPHSEAGT AFIQTQQLHA AMADTFLEHM CRLDIDSPPI TARWTGIICT51 IlrPASRSVET LKEMIKSGMN VARI.WFSHGT HKYHAETIKN VRTATESFASEVELKKGATL KITLDNAYME101 DPILYRPVAV ALDTKGPEIR TGLIKGSGTA博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientif
48、ic. com°'2丫禽凸血c您身边的生物信息专家151 KCDENILWLI> YKNICKWEF-«S«EWDDGL201GSLGSKKGVNLPGAAVDLPA VSEKDIQDLKISLQVKQKGA DFLVTEVENG FGVEQDVDMV FASFIRKASD博 苑科技 BIO-TECH蛋白质组完整解决方案d www. cloudscientific. com°'2丫禽凸血c您身边的生物信息专家LESMIKKPPP TRAEGSDVAN IAREAEAATY HLQLFEELRR LTKSGRSAHQ VARYRPRA
49、PI AUAEDVDLRV NFAMNVGKAR251 VHEVRKVLGEKGKNIKIISK IENHEGVRRF DEILEASDGI IfVARGDLGIE301 IPAEKVELAQ KMMIGRCNRA GKPVICATQM331 AVLDGADCIM L3GETAKGDY PLEAVRMQHL401 LAPITSDPTE ATAVGAVEAS FKCCSGAIIV451 IAVTRNPQT丸 RQAHLYRGIF PVLCKDPVQE应用实例网页结果查看LOCUSCAA39849531 aalinear PRI 14-NOV-2006(wdQ)LCMJ 山Show predicted peptides also I Sort Peptides By ©Residue Number 0Increasing Mass 0Decreasing MassStart - EndObser
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