新版PubMed文献检索专业教育

1、第一节 pubmed pubmed概述概述1pubmed的检索方法的检索方法 2pubmed检索结果的处理检索结果的处理 3pubmed的其他工具与链接的其他工具与链接 4小结小结524.1.1 pubmed概述概述3pubmed概述概述v什么是什么是pubmed？vpubmed的发展过程的发展过程vpubmed的收录范围的收录范围vpubmed的记录来源的记录来源vpubmed的常用字段的常用字段4什么是什么是pubmed?v生物医学研究领域应用最广泛也最重要的数据库，生物医学研究领域应用最广泛也最重要的数据库，由美国国立卫生研究院（由美国国立卫生研究院（nih）下属的美国国立）下属的美国国

2、立医学图书馆（医学图书馆（nlm）的国家生物技术信息中心）的国家生物技术信息中心（ncbi）开发、维护）开发、维护v面向全世界免费提供最新的生物医学信息面向全世界免费提供最新的生物医学信息v每周每周5天更新数据，检索功能完善，使用方便天更新数据，检索功能完善，使用方便v整合在整合在ncbi的统一检索平台的统一检索平台entrez上，与该平台上，与该平台其他数据库建立无缝链接，可实现跨库检索其他数据库建立无缝链接，可实现跨库检索 /pubmed56pubmed发展过程发展过程1997-1983-1971-1879-pubmed网络数据库网络数据

3、库medline光盘数据库光盘数据库medline联机检索系统联机检索系统index medicus （im）检索期刊）检索期刊6pubmed的收录范围的收录范围v收录全世界收录全世界80多个国家多个国家5200多种生物医学期刊的多种生物医学期刊的文摘及题录数据文摘及题录数据v绝大部分可回溯至绝大部分可回溯至1948年，最早回溯至年，最早回溯至1865年年v累积了累积了1900多万条文献记录多万条文献记录v部分文献可直接获取全文，包括：部分文献可直接获取全文，包括： pubmed central (pmc，收录期刊780余种)：nlm开发的免费生物医学数字化期刊全文数据库 开放获取（open

4、access，oa）期刊 部分出版商提供的免费文献 v与出版商的电子期刊文献同步发布，标注为与出版商的电子期刊文献同步发布，标注为epub ahead of print（先于印刷版期刊发表的电子文献）（先于印刷版期刊发表的电子文献）或或epub7pubmed的记录来源的记录来源v medline：pubmed主体部分主体部分pubmed-indexed for medlinev in-process citations： 尚未进行尚未进行mesh主题词主题词标引的最新文献标引的最新文献pubmed-in processv publisher supplied citations：出版商提供，：

5、出版商提供，但不被但不被medline收录的文献收录的文献pubmed - as supplied by publisherv oldmedline：部分：部分1966年以前出版且未被年以前出版且未被medline收录的文献收录的文献pubmed-oldmedline 8pubmed记录的主要字段记录的主要字段字段标识：字段名称字段标识：字段名称 ab：abstract ad：affiliation all：all field au：authors 1au：first author fau：full author name lastau：last author pmid：pubmed uniq

6、ue identifier cy：country dp：publication date edat：entrez date gs：gene symbol gn：grant number 字段标识：字段名称字段标识：字段名称 is：issn la：language mh：mesh terms majr：mesh major topic sh：mesh subheadings pt：publication type so：source ta：journal title ti：title tw：text words uid：unique identifiers nm：substance number

7、 tiab：title/abstract94.1.2 pubmed的检索方法的检索方法104.1.2 pubmed的检索方法的检索方法v 基本检索基本检索 自动词语匹配检索 著者检索 期刊检索 短语精确检索 截词检索 字段限定检索 布尔逻辑检索v 高级检索高级检索 检索史 组合检索 检索限定 索引检索 主题词检索 期刊数据库检索 单篇引文匹配器 临床查询 专类查询 11pubmed主页面主页面基本检索高级检索登录my ncbi12自动词语匹配检索自动词语匹配检索(automatic terms mapping) v输入有实际意义的检索词，点击输入有实际意义的检索词，点击“search”，系，系

8、统按照自动词语匹配的原理进行检索统按照自动词语匹配的原理进行检索vpubmed最具特色的检索功能之一最具特色的检索功能之一 智能化的检索过程 基本原理：对输入的检索词，首先在多个索引词表进行搜索、比对，并自动转换为相应的mesh主题词、著者或刊名，再将检索词在all fields（所有字段）中检索，并执行“or”逻辑运算。如有多个检索词或短语词组，则继续将其拆分为单词后分别在all fields（所有字段）中检索，单词之间的逻辑关系为“and”vsearch details框详细显示自动词语匹配的实际框详细显示自动词语匹配的实际检索式检索式v有较好的查全率，同时保证一定的查准率有较好的查全率，

9、同时保证一定的查准率13v例如，查找阿司匹林防治心肌梗死的文献，最简单例如，查找阿司匹林防治心肌梗死的文献，最简单的方法是在检索框中直接输入的方法是在检索框中直接输入heart attack aspirin三个词，系统即进行自动词语匹配检索，三个词，系统即进行自动词语匹配检索，detail栏栏目显示目显示pubmed实际执行的检索式为实际执行的检索式为(myocardial infarctionmesh terms or (myocardialall fields and infarctionall fields) or myocardial infarctionall fields or (

10、heartall fields and attackall fields) or heart attackall fields) and (aspirinmesh terms or aspirinall fields)14著者检索著者检索v 在检索框中输入著者姓名，在检索框中输入著者姓名，pubmed自动执行著自动执行著者检索者检索v 一般姓在前名在后，姓用全称，名用首字母一般姓在前名在后，姓用全称，名用首字母例如，输入smith sr可检索出姓为smith，名的首字母为sr的所有著者的文献v 为提高查准率，可将著者与著者单位、主题等信为提高查准率，可将著者与著者单位、主题等信息结合起来检索息

11、结合起来检索v 2002年以后的文献，年以后的文献，pubmed可实现对姓名全称可实现对姓名全称的检索，而且姓名排列顺序不限的检索，而且姓名排列顺序不限例如，输入smith sr的姓名全称steven r smith，可检索出2002年以来该著者被pubmed收录的文献。v 通过字段限定检索及组合检索可实现更精确的著通过字段限定检索及组合检索可实现更精确的著者检索者检索例如，输入smith sr 1au可检索出第一著者为smith sr的所有文献。 15期刊检索期刊检索v 在检索框中输入期刊信息，在检索框中输入期刊信息，pubmed自动检索出该自动检索出该期刊的文献：期刊的文献：刊名全称：如t

12、he american journal of pathology标准的medline刊名缩写：如am j pathol期刊的issn号：如0002-9440， am j pathol issn号v 当刊名与当刊名与mesh词相同时，词相同时，pubmed默认将其作为默认将其作为mesh词检索。为避免误检，可采用刊名字段限定词检索。为避免误检，可采用刊名字段限定检索检索例如，cell ta可检索出在期刊cell被pubmed收录的所有文献v 利用利用pubmed的的journals database可查找期刊的可查找期刊的详细信息详细信息 16短语精确检索短语精确检索v 短语精确检索是将检索词加

13、上双引号进行强制短语精确检索是将检索词加上双引号进行强制检索检索v 短语精确检索时，短语精确检索时，pubmed关闭自动词语匹配关闭自动词语匹配功能，直接将该短语作为一个检索词进行检索，功能，直接将该短语作为一个检索词进行检索，避免了自动词语匹配时将短语拆分可能造成的避免了自动词语匹配时将短语拆分可能造成的误检，可提高查准率误检，可提高查准率例如，输入“metabolic syndrome”, pubmed在所有可检索字段中查找含有短语词组metabolic syndrome的文献 17截词检索截词检索v 在检索词后加在检索词后加“*”可实现截词检索，以提高查全可实现截词检索，以提高查全率率v

14、 截词检索时，截词检索时，pubmed关闭自动词语匹配功能关闭自动词语匹配功能 例如，输入immun*可检索出immun开头的所有词语，如immunity, immunology, immune, immunological等18字段限定检索字段限定检索v字段限定检索的形式：检索词字段限定检索的形式：检索词 字段标识字段标识 例如，leukemia ti可检索出篇名中含有leukemia的文献 myocarditis majr可检索出mesh major topic为myocarditis的文献v字段限定检索可提高查准率字段限定检索可提高查准率19布尔逻辑检索布尔逻辑检索v 支持支持and，o

15、r，not布尔逻辑运算布尔逻辑运算v 逻辑运算符要大写逻辑运算符要大写v 直接输入几个检索词，系统默认词之间是直接输入几个检索词，系统默认词之间是and的逻辑组配关系的逻辑组配关系v 可以输入检索式的序号进行布尔逻辑运算，如可以输入检索式的序号进行布尔逻辑运算，如#1 and #3 20pubmed高级检索页面高级检索页面检索史组合检索检索限定索引检索临床咨询、专题咨询、主题词检索、期刊检索、单篇引文匹配器21检索史（检索史（search history）v点击点击search history，显示检索史，包括检索式，显示检索史，包括检索式序号、检索提问式、检索时间及检索结果数序号、检索提问式

16、、检索时间及检索结果数v单击检索式序号，显示单击检索式序号，显示options选项，可执行选项，可执行and, or, not、delete（删除检索式）、（删除检索式）、go（直接检索）、（直接检索）、details（显示检索式详情）、（显示检索式详情）、save in my ncbi（把检索式保存在（把检索式保存在my ncbi）等不同操作等不同操作v检索史最多保留检索史最多保留8小时小时 22pubmed高级检索的检索史高级检索的检索史点击检索式序号，显示options选项23组合检索（组合检索（search by author，journal，publication date，and

17、more）v组合检索可以实现多个字段的逻辑组配检索组合检索可以实现多个字段的逻辑组配检索v默认在最近一次检索式的基础上进行字段限定检默认在最近一次检索式的基础上进行字段限定检索，以提高查准率索，以提高查准率v检索时，先选择检索字段，输入检索词（点击检索时，先选择检索字段，输入检索词（点击index显示该检索词的索引，帮助选词），再确显示该检索词的索引，帮助选词），再确定检索词的逻辑关系，默认为定检索词的逻辑关系，默认为all of these（and），也可以选），也可以选any of these （or），点），点击击search，完成检索，完成检索 24举例：举例：通过组合检索查找通过组合

18、检索查找2000年以来美国路易斯安州年以来美国路易斯安州pennington biomedical research center的的smith sr在在diabetes上发表的文献上发表的文献 多个字段的组合检索，提高查准率点击index可帮助选词25检索限定（检索限定（limit by topics，languages, and journal groups）v检索限定可以对检索结果进行精确的限定，包括：检索限定可以对检索结果进行精确的限定，包括： full text, free full text, and abstracts（限定检索结果含全文链接、免费全文或摘要） human or

19、animals（研究对象） gender（性别） language（语种） type of article（文献类型） ages（年龄） subsets（子集，可以按journal groups、topics等划分）v注意：检索限定一经选定，会保持激活状态而在此注意：检索限定一经选定，会保持激活状态而在此后的检索中持续起作用后的检索中持续起作用 26举例：检索举例：检索“罗格列酮治疗罗格列酮治疗老年人老年人糖尿病的糖尿病的随机对照临床试验随机对照临床试验的的英文英文文文献献”，可输入，可输入 diabetes mellitus rosiglitazone，再进行检索限，再进行检索限定定文献类型

20、选“随机对照试验（rct）”语种选“英语”年龄选“老年人”27索引检索（索引检索（index of fields and field values）v索引检索主要用于正确选择检索词索引检索主要用于正确选择检索词v先选择检索字段，输入检索词后点击先选择检索字段，输入检索词后点击index，可，可显示该词的相关索引词，选定检索词后点击显示该词的相关索引词，选定检索词后点击and、or或或not，可以与最近一次的检索式进行布尔，可以与最近一次的检索式进行布尔逻辑运算逻辑运算 28pubmed的索引检索的索引检索myocardial infarction的所有索引词选定检索词后进行布尔逻辑运算29me

21、sh主题词检索（主题词检索（mesh） vmesh主题词检索是主题词检索是pubmed最具特色的检索功能最具特色的检索功能之一，能保证较好的查全率和查准率之一，能保证较好的查全率和查准率 主题词对同一概念的不同表达方式进行了规范 主题词可以组配相应的副主题词，使检索结果更加专指 主题词的树状结构表：系统默认对含有下位概念的主题词进行扩展检索（点选do not explode this term则不进行扩检） 应用major topic（主要主题词）检索，可以使检索结果更加准确v注意：用注意：用mesh词检索时，只检索来源于词检索时，只检索来源于medlilne的文献，不检索的文献，不检索pub

22、med其他来源的文其他来源的文献（包括献（包括in-process， supplied by publisher, oldmedline等）等） 30举例：用举例：用mesh主题词检索有关艾滋病流行病学的文献主题词检索有关艾滋病流行病学的文献v检索步骤检索步骤1. 进入mesh database主页面，在检索框中输入aids，点击go，系统提供与aids相关的所有主题词及其含义2. 浏览选词，确定aids的规范化mesh主题词为acquired immunodeficiency syndrome，点击进入主题词细览页面，包括主题词定义，副主题词(subheadings)，入口词或款目词(ent

23、ry terms)，相关参照(see also)，树形结构(mesh tree)3. 在subheadings中点选epidemiology（流行病学）4. 点选restrictions search to major topic headings only（检索结果限定为主要主题词）5. 在sent to下拉菜单中点选search box with and，检索框中出现检索式acquired immunodeficiency syndrome /epidemiologymajr，点击search pubmed，可得检索结果 31mesh主题词检索主页面主题词检索主页面输入入口词aidsaid

24、s的规范化主题词及含义aids的相关主题词32mesh主题词细览页面主题词细览页面选择副主题词“流行病学”限定检索结果为主要主题词（major topic）确定主题词及副主题词后，点选search box with and点击search pubmed完成检索33mesh主题词的其他信息主题词的其他信息mesh主题词的入口词或款目词mesh主题词的相关参照mesh主题词的树形结构34期刊数据库检索（期刊数据库检索（journals）v期刊数据库检索可查询期刊数据库检索可查询pubmed及及entrez平台其平台其他数据库所收录的期刊信息他数据库所收录的期刊信息v提供提供topic、刊名全称、刊

25、名全称、medline刊名缩写、刊名缩写、issn等检索途径，也可以按学科（等检索途径，也可以按学科（subject terms）进行浏览）进行浏览v在在journal database主页面主页面 点击limits可以按语种、不同子集及其他字段进行期刊检索 点击lists of all entrez journals，链接到entrez平台所收录期刊一览表（包括pubmed收录的所有期刊） 点击links to full-text web sites，可链接到linkout journal lists页面，了解能提供期刊全文的web站点 35举例：查询举例：查询pubmed收录了哪些生理学方

26、面的期刊？收录了哪些生理学方面的期刊？输入刊名关键词”生理学”某种期刊的详细信息期刊的基本信息36单篇引文匹配器（单篇引文匹配器（single citation matcher）v单篇引文匹配器主要用于查找某一篇文献的准确单篇引文匹配器主要用于查找某一篇文献的准确信息信息v点击点击journal citation matcher，在系统给出的，在系统给出的选项中输入已知信息，点击选项中输入已知信息，点击go，返回符合要求的，返回符合要求的文献信息文献信息 journal：输入刊名的任何有效信息，系统会主动给出提示，帮助选择正确的刊名 date：输入期刊的出版日期 volume、issue、fi

27、rst page：输入期刊的卷、期、起始页码 author name：输入著者 title works中：输入文献篇名中的任意词37举例：已知举例：已知2008年年circulation上有关于心源性休克的综述文献，查询该篇文上有关于心源性休克的综述文献，查询该篇文献的准确信息献的准确信息输入刊名、年份、题名中的词等已知信息38临床查询（临床查询（clinical queries）v临床查询是专门为临床医生设计的检索服务，包临床查询是专门为临床医生设计的检索服务，包括括 search by clinical study category 查找疾病的etiology、diagnosis、ther

28、apy、prognosis及clinical predictions guides文献，综合考虑检索结果的敏感性（broad，sensitive search，查全率较高）与特异性（narrow，specific search，查准率较高） finding systematic reviews 提供systematic reviews、meta analysis、reviews of clinical trials、guidelines等循证医学文献 medical genetics searches 查询疾病的遗传学文献，有all 、diagnosis、differential diagno

29、sis、clinical description、management、genetics counseling、molecular genetics、genetics testing等选项39pubmed的临床查询（的临床查询（clinical queries）页面）页面检索系统评价等循证医学文献检索疾病的遗传学文献查找疾病的病因、诊断、治疗、预后等信息40专题查询（专题查询（special queries）v专题查询汇总整合了专题查询汇总整合了pubmed提供的其他专题检索提供的其他专题检索功能（功能（directory of topic-specific pubmed queries），并

30、提供相应的链接，包括：），并提供相应的链接，包括： 不同的学科专题（subjects）设立的子集（subsets）：如aids，toxicology、cancer、history of medicine等 不同的期刊专辑（journal collections） 414.1.3 pubmed检索结果的处理检索结果的处理42检索结果显示检索结果显示vpubmed检索结果显示默认为检索结果显示默认为summary格式，包格式，包括：括： 篇名 著者 刊名 出版年月及卷期页码 pmid号 记录状态（indexed for medline; in process；) 相关文献（related arti

31、cles）链接 如有免费全文，则有free article链接43vsummary显示格式的页面右侧有多个栏目，主显示格式的页面右侧有多个栏目，主要包括：要包括： limits activated：处于激活状态的检索限定点击，remove去除限定，change更改限定 filter your results：结果过滤，包括综述、免费全文等 titles with your search terms：提供20条篇名中包含了检索词的文献记录（密切相关文献） free full-text articles in pubmed central：在pubmed central中能直接获取全文的文献 fi

32、nd related data：链接到ncbi其他数据库中检索 search details：详细显示pubmed实际完成的检索式 recent activity：显示最近8小时内在ncbi的操作记录 44pubmed检索结果的检索结果的summary显示格式显示格式处于激活状态的检索限定检索结果滤过（综述、免费全文）篇名中包含了检索词的密切相关文献pubmed central中的免费全文点击display setting可更改显示格式、每页显示条数及排序方式相关文献及免费全文链接45pubmed检索结果的检索结果的abstract显示格式显示格式出版类型、mesh主题词出版商的全文链接保存及

33、输出格式pmid号及记录状态最近的操作记录46检索结果保存及输出检索结果保存及输出v 点击检索结果显示页面的点击检索结果显示页面的send to下拉菜单，下拉菜单，pubmed提供了以下保存及输出方式，包括：提供了以下保存及输出方式，包括：1. file：选中文献记录以文件的形式保存（ 用medline格式保存文件可以将结果直接转入endnote等文件管理软件）2. clipboard（剪贴板）：浏览、选择选所需文献，在send to中选择clipboard，点选add to clipboard，选中文献用绿色提示“item in clipboard” 。剪贴板中最多可保存500条记录，保存时

34、间为8小时。点击clipboard链接，显示所有暂存文献，再集中进行处理473. collections：注册了my ncbi的用户可以选择collections将检索结果保存在my ncbi中，特别是对那些尚不确定是否相关的检索结果，可以先保存在collections中，以后再登录my ncbi对这些文献记录进行浏览、删除、排序4. email：将选中的检索结果直接发送到指定的电子邮箱中。一次最多发送200条文献记录485. order：如果用户无法获取选中文献的全文，可用order选项通过loansomedoc文献传递系统向nlm订购全文，这项服务需支持一定的费用6. rss feed：点

35、击rss图标，再点击create rss即可订阅，随时浏览追踪这一检索策略的最新检索结果 494.1.4 pubmed的其他工具与链接的其他工具与链接50my ncbi（我的（我的ncbi）vmy ncbi：提供个性化服务，非常实用的文献管：提供个性化服务，非常实用的文献管理工具理工具vpubmed主页的右上方有登录主页的右上方有登录my ncbi 按钮按钮v用户注册并建立用户注册并建立my ncbi账号后，可以管理在账号后，可以管理在ncbi所有数据库的检索过程及检索结果，追踪了所有数据库的检索过程及检索结果，追踪了解所在研究领域的最新进展解所在研究领域的最新进展 51v my ncbi的主

36、要功能：的主要功能：1. 保存检索策略及email定期自动更新检索结果完成检索后，点击save search，进入my ncbi的my saved data页面，在name of search栏中输入检索策略的名称，点击save，系统自动提示是否需要通过email定期自动发送新的检索结果，以及发送的频率、格式保存检索策略后，登录my ncbi主页面，点击saved searches子栏目下已保存的各个检索策略，即可完成检索点击saved searches子栏目下的manage按钮，可以对保存的多个检索策略进行排序、删除、更改522. 保存检索结果 浏览并选定检索结果后，在send to菜单中选

37、择collections，即进入my ncbi中的collections子页面 默认为建立一个新文件保存选定的检索结果，输入文件名，系统自动提示保存了多少条记录；也可以将检索结果添加到已有的文件记录中 保存检索结果后，只要登录my ncbi主页面， 点击collections子栏目下的文件名，即可显示已保存的检索结果 点击collections子栏目下的manage按钮，可以对保存的检索结果进行删除、排序、重命名、合并、共享等操作 533.过滤检索结果 my ncbi的过滤器（filter）提供了个性化的检索结果过滤功能在my ncbi主页面，点击左栏的search filters，点选pub

38、med，进入pubmed filters，点击frequently requested filters可对检索结果进行过滤，有综述、临床试验、免费全文、全文、最近5年的文献、英文、人类、有摘要等多个选项，勾选所需的项目，即可完成检索结果过滤的设置。以后只要登录my ncbi后检索pubmed，检索结果显示页面右侧会显示已设定的过滤结果，方便用户浏览选择4.建立个人书目记录（my bibliography）以及其他感兴趣著者的文献记录（other citations）5.my ncbi页面的recent activity可以显示最近6个月用户的检索记录，包括检索时间、检索的数据库、检索结果、浏览

39、的文献等 54pubmed中中my ncbi主页面主页面my ncbi中保存的数据（检索策略、检索结果、个人书目及操作记录）设置检索结果过滤55在在my ncbi中保存及管理中保存及管理检索结果及检索策略检索结果及检索策略点击manage进入检索结果管理页面点击edit对检索结果进行编辑（删除、排序、共享、重命名等）点击setting可设置email定期发送检索结果点击manage进入检索策略管理页面56外部链接（外部链接（linkout）vpubmed主页主页more resources栏目下有栏目下有linkout外部链接外部链接vpubmed及及ncbi的其他数据库通过的其他数据库通过l

40、inkout与其与其他外部资源与服务建立链接，包括在线全文数据他外部资源与服务建立链接，包括在线全文数据库、生物学数据库、图书馆馆藏信息、消费者健库、生物学数据库、图书馆馆藏信息、消费者健康信息、研究工具等康信息、研究工具等57批量引文匹配器（批量引文匹配器（batch citation matcher）v点击点击pubmed主页的主页的pubmed tools栏目下的栏目下的batch citation matcher，进入批量引文匹配器，进入批量引文匹配器，主要用于批量核对文献信息主要用于批量核对文献信息v检索时输入的格式为：检索时输入的格式为： 刊名年卷起始页码著者核对文献的标识 返回的

41、结果含有文献记录的唯一识别码pmidv用用batch citation matcher一次可核对不超过一次可核对不超过100条文献，检索结果可通过条文献，检索结果可通过email发送或直接存入发送或直接存入文件中文件中 58临床试验数据库（临床试验数据库（clinical trials）v点击点击pubmed主页主页more resources栏目下的栏目下的clinical trials，进入美国国立医学图书馆研制开，进入美国国立医学图书馆研制开发的临床试验数据库发的临床试验数据库 /vclinical trials收录了美国及全世界收录了美国

42、及全世界170多个国家多个国家经注册登记的经注册登记的8万多个临床试验的详细信息，目万多个临床试验的详细信息，目前包含有前包含有8万多条，是十分重要的循证医学万多条，是十分重要的循证医学信息信息资源资源594.1.4 pubmed小结小结60 pubmed的自动词语匹配检索一般适合检索经验有限的初级用户，也适合对课题做初步检索。检索经验丰富的用户，或者对查全率查准率有较高要求的检索课题，需要仔细分析课题，编制比较完备的检索策略，综合运用pubmed提供的各种高级检索功能 主题词检索是pubmed最具特色的功能之一，能保证较好的查准率及查准率。主题词组配副主题词使检索结果更为专指，限定在主要主题

43、词检索能使结果更准确。但是主题词检索也有一些固有的缺陷，比如很多专指的概念没有相应的主题词，一些新出现的概念要几年后才收录为主题词。这种情况下，采用字段限定检索等方法也能得到较好的查准率。此外，主题词检索还可能会漏掉一些最新的文献（in process citations） 熟练运用pubmed 的检索限定、临床查询、引文匹配等工具，能大大提高检索效率。此外，个性化服务工具my ncbi功能强大，能保存、管理在pubmed中的所有检索过程及检索结果 61第二节 embase 62一、概一、概 况况 v荷兰荷兰elsevier（爱思唯尔）出版公司出版。（爱思唯尔）出版公司出版。v生命科学领域最重

44、要的四种文献检索工具之一。生命科学领域最重要的四种文献检索工具之一。 v收录来自收录来自70多个国家的多个国家的7200多种同行评审期刊，多种同行评审期刊，数据每日更新，每年新增大约数据每日更新，每年新增大约60多万篇文献。多万篇文献。v学科覆盖范围涉及广泛。学科覆盖范围涉及广泛。v提供提供emtree主题词表辅助检索，词表整合了主题词表辅助检索，词表整合了nlm的的mesh词表，共计包括词表，共计包括5.5万多个药物、万多个药物、生物医学和生物学术语，生物医学和生物学术语，22万多个同义词，大约万多个同义词，大约2万个万个cas化学物质登记号。化学物质登记号。63二、检索运算符与运算规则二、

45、检索运算符与运算规则v布尔逻辑运算符：布尔逻辑运算符：and、or和和notv邻近度算符：邻近度算符：near/n和和next/nv截词符：截词符：*号和号和?号号v短语检索：词组或短语必须加上引号短语检索：词组或短语必须加上引号v字段限定符：主要包括字段限定符：主要包括“：”号和号和“/”号号v多种运算符的联用：多种运算符的联用：(symptom* near/5 (headache* or head ache):ti,ab 64三、检索方法与技巧三、检索方法与技巧v快速检索快速检索v高级检索高级检索v药物检索药物检索v疾病检索疾病检索v文章检索文章检索vemtree主题词表辅助检索主题词表辅

46、助检索v期刊浏览期刊浏览v著者检索著者检索65（一）快速检索（一）快速检索（quick search）v对输入的检索式进行全文检索，即在全字段范围对输入的检索式进行全文检索，即在全字段范围内的检索。内的检索。v可输入任意的单词、词组或检索表达式，可进行可输入任意的单词、词组或检索表达式，可进行布尔逻辑检索、邻近度检索、截词检索和字段限布尔逻辑检索、邻近度检索、截词检索和字段限定检索。定检索。vautocomplete功能利用后台词表为用户指引功能利用后台词表为用户指引推荐合适的主题词，供用户选择。推荐合适的主题词，供用户选择。v勾选输入框下的勾选输入框下的extensive search选项，

47、系统选项，系统将对检索式进行扩词检索。将对检索式进行扩词检索。66（一）快速检索（一）快速检索（quick search）快速检索界面67（二）高级检索（二）高级检索（advanced search）v检索表达式的编制方法与规则与快速检索相同。检索表达式的编制方法与规则与快速检索相同。v提供多种对检索式进行修饰和限定的方法。提供多种对检索式进行修饰和限定的方法。v提供五种检索式的修饰方法。提供五种检索式的修饰方法。map to preferred terminology（匹配主题词检索）also search as free text（还作自由词检索）include sub-terms/der

48、ivatives（扩展下位词和派生词检索）search terms must be of major focus in articles found（主题词加权检索）search also for synonyms, explosion on preferred terminology（还检索同义词及主题词扩展检索）v提供多种检索式的限定检索方法提供多种检索式的限定检索方法 。68（一）快速检索（一）快速检索（quick search）快速检索界面高级检索界面69（三）药物检索（三）药物检索（drug search）v专为检索药物信息而设计的检索途径，检索界面、专为检索药物信息而设计的检索途径

49、，检索界面、检索式修饰和限定方法与高级检索基本相同。检索式修饰和限定方法与高级检索基本相同。v针对药物检索增设针对药物检索增设17种药物副主题词和种药物副主题词和47种给种给药途径的限定选择。药途径的限定选择。v可输入药物属名、专利商品名，实验室代码和化可输入药物属名、专利商品名，实验室代码和化学名来检索药物信息，如学名来检索药物信息，如claritin、loratadine、sch 29851等。等。v输入的检索词会强制转换匹配输入的检索词会强制转换匹配emtree药物主题药物主题词进行检索。词进行检索。70药物检索界面71（四）疾病检索（四）疾病检索（disease search）v专为检

50、索疾病信息而设计的检索途径，检索界面、专为检索疾病信息而设计的检索途径，检索界面、检索式修饰和限定方法与高级检索基本相同。检索式修饰和限定方法与高级检索基本相同。v针对疾病检索的需要增设针对疾病检索的需要增设14种疾病副主题词的限种疾病副主题词的限定选择，如定选择，如complication、congenital d i s o r d e r 、 d i a g n o s i s 、 d i s e a s e management等，这样可以增强疾病检索深度，等，这样可以增强疾病检索深度，提高查准率。提高查准率。v输入的疾病名称检索词会强制转换匹配输入的疾病名称检索词会强制转换匹配emt

51、ree疾病主题词进行检索。疾病主题词进行检索。72疾病检索界面73（五）文章检索（五）文章检索（article search）v利用某些已知信息检索某篇或某类文献的检索途利用某些已知信息检索某篇或某类文献的检索途径。径。v文章检索提供作者、期刊名称、刊名缩写、期刊文章检索提供作者、期刊名称、刊名缩写、期刊分类编号、分类编号、issn号码、期刊卷、期号及文章起号码、期刊卷、期号及文章起始页等多个字段检索，并可进行出版日期范围限始页等多个字段检索，并可进行出版日期范围限制，对刊名和刊名缩写字段还能进行精确查找。制，对刊名和刊名缩写字段还能进行精确查找。74文章检索界面75（六）（六）emtree主

52、题词表辅助检索主题词表辅助检索vemtree是是embase数据库提供用户对生物医学数据库提供用户对生物医学文献进行主题分析、标引和检索时使用的权威性文献进行主题分析、标引和检索时使用的权威性主题词表。主题词表。 v利用系统内嵌的利用系统内嵌的emtree主题词表，提供用户浏主题词表，提供用户浏览探索该词表、选择最合适的主题词、查核主题览探索该词表、选择最合适的主题词、查核主题词的用词范围、浏览主题词树结构并最终构建一词的用词范围、浏览主题词树结构并最终构建一个有效的主题词检索策略的过程。个有效的主题词检索策略的过程。 v提供两种查询浏览主题词的方法：提供两种查询浏览主题词的方法： 查找主题词（find term） 按类浏览主题词（browse by facet）76emtree主题词表辅助检索界面，在find term后输入检索词，查找主题词。77主题词查询结果，use：后为规范主题词，前面则为款目词。78主题词树状结构表，以及扩展检索和主要主题词检索选项添加到检索框进行检索79按类浏览主题词（browse by facet） 80（七）期刊浏览（七）期刊浏览（journals）v提供用户按刊名字顺浏览期刊（提供用户按刊名字顺浏览期刊（browse journals），按字顺找到相关