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文档简介
1、会计学1丝氨酸蛋白酶水解机制丝氨酸蛋白酶水解机制什么是丝氨酸蛋白酶?丝氨酸蛋白酶是一个蛋白酶家族,其激活是通过活性中心一组氨基酸残基变化实现的,它们之中一定有一个是丝氨酸(Ser,serine)。在哺乳类动物里面,丝氨酸蛋白酶扮演着很重要的角色,特别是在消化,凝血和补体系统方面。第1页/共23页最典型的三种丝氨酸蛋白酶:胰蛋白酶胰凝乳蛋白酶弹性蛋白酶同属消化酶系,在胰腺泡内合成并分泌到十二指肠中。均可催化肽键的水解反应,但对肽键的选择性则有所不同第2页/共23页1.水解作用的动力学模型胰凝乳蛋白酶不仅可以水解肽键,同时也可以水解一般的酯键。以对硝基苯酚乙酸酯为例:对硝基苯酚乙酸酯乙酸对硝基苯酚
2、胰凝乳蛋白酶第3页/共23页这一反应过程具有两相特征:快速反应相:对硝基苯酚离子快速形成,与酶的浓度成正比。恒态反应相:对硝基苯酚离子形成较缓慢,形成速率恒定。(决定反应速率的关键步骤)快速反应相过程中酶和底物结合释放出对硝基苯酚离子,同时形成乙酰基-酶中间体;而恒态反应相过程则是乙酰基-酶中间体缓慢水解,放出酶,使之与底物相结合继续释放出对硝基苯酚离子。由于乙酰基-酶的水解很慢,使体系中酶浓度下降,进而导致对硝基苯酚释放速率变慢。第4页/共23页2.酶活化中心必需基团的测定(1)活性Ser基团:二异丙基磷酰氯(DIPF)能特异性与Ser基团的-OH反应,其结果导致作为酶活性中心的Ser的残基
3、发生不可逆失活,此方法可有效确定胰凝乳蛋白酶中的Ser-195是酶活性中心必需氨基酸残基。第5页/共23页第6页/共23页(2)活性His(组氨酸)基团:N-对甲苯磺酰苯丙氨酸氯甲基酮(TPCK)其中氯甲基酮基是一个很强的烷基化剂,它能够与反应中心His-57的咪唑基发生烷基化反应,并最终引起酶的失活。第7页/共23页蛋白质的原子结构。n牛的胰蛋白酶、胰凝乳蛋白酶以及住的弹性蛋白酶在结构上很相似,这三种酶大约由240个氨基酸残基组成,三者的一级结构大约有 40%是相同的,且活性中心的必需氨基酸也大致相同(Ser、His、Asp)第8页/共23页3.催化作用机制(1)结构特性 以胰凝乳蛋白酶举例
4、,其活性中心有三个必需氨基酸残基:Ser-195,His-57和Asp-102,这三部分通过氢键结合,整体呈三角形,即所谓的“催化三元区”。“催化三元区”的最显著特征是Ser-195的羟基高度极化,具有很高的亲核进攻能力。第9页/共23页(2)亲核共价催化作用易形成四联体结构的中间物Step 1:Ser-195作用于底物的肽键酰基,发起亲核进攻,形成一个包括Ser-195的羟基、底物酰基和氨基在内的共价四联体中间物。第10页/共23页Step 2:四面体中间物分解,即生成酰基-酶中间物并伴随着C-N键的断裂。R1NH2H2O 肽键断裂之后,R-NH2基团作为离去基团从反应体系中离去,此时水分子进入,其氧原子攻击羰基上的碳原子,从而又形成了一个水分子参与的四联体中间物。第11页/共23页Step 3:酰基-酶中间物的解离,这时His-57作为广义酸起催化作用。第12页/共23页第13页/共23页第14页/共23页第15
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