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文档简介
1、实验流程一、操作步骤适用仪器: 普通 PCR仪样本要求: EDTA抗凝剂的静脉全血 (100l ),室温保存不超过 7 天, 2 8保存不超过 1个月,- 20保存不超过 3个月,反复冻融次数不超过 5 次;DNA的浓度应不低于 5ng/ l , A260/ A 280 应在 之间。有血块的样本需经匀浆处理或用组织研磨仪研磨处理后再进行全血DNA的提取。检验方法:(试剂盒中的检本测卡、阳性 / 阴性对照卡上标识解释如下: M表示突变型, WT表示野 生型, C 表示质控线, T 表示检测线。)A: 样本 DNA的制备试剂盒准备工作:1、清洗液 BW-I:用 50 ml 量筒分别移取 35 ml
2、 无水乙醇(分析纯)和 35 ml 异丙醇加入至清洗 液 BW-I 试剂瓶中,颠倒混合均匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。2、清洗液 BW-II :用 50 ml量筒移取 49 ml 无水乙醇加入至清洗液 BW-II 试剂瓶中,颠倒混合均 匀,在试剂瓶上标明“已加入醇”和日期,备用。3、蛋白酶 K 准备:取出蛋白酶 K,室温解冻,涡旋混匀后备用。4、磁性微粒准备:将磁性微粒涡旋混匀,保证均一。实验操作步骤:1. 将 20 l 蛋白酶 K溶液加入 2 ml 离心管的管底。依次加入 100 l 全血、 200 l 裂解液 BL,用涡旋振荡器混合 15 sec( 以下简称涡旋混匀 ),56
3、 水浴 20 min。2. 向步骤 1裂解处理的样品中依次加入 300 l 结合液 BI、25 l 的磁性微粒 (移取前必须充 分涡旋混匀),涡旋混匀,室温静置 5 min 。磁性分离 5 min ,弃上清。3. 从磁性分离器上取出离心管, 加入 400 l 清洗液 BW-I,涡旋混匀, 磁性分离至上清澄清 (期 间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁) ,弃上清;重复本步操作,以 400l 清洗液 BW-I 重复 清洗一次。4. 从磁性分离器上取出离心管, 加入 400 l 清洗液 BW-II ,涡旋混匀,磁性分离至上清澄清 (期 间上下颠倒数次,以清洗离心管管壁) ,弃上清(尽可能弃去所有的清洗
4、液 BW-II )。5. 打开离心管盖,将其室温晾干 5 min6. 从磁性分离器上取下离心管,向管中加入 100 l 洗脱液 ES,涡旋混匀, 56水浴 5 min 。7. 将离心管置于磁性分离器上,磁性分离至上清澄清。将上清液(分离纯化得到的DNA溶液)转移到 2 ml 离心管中,直接用于下游实验或于 -20 保存备用。B:PCR扩增液准备(1)每人份需做两个反应,取两个无菌 PCR薄壁管,在 PCR薄壁管管盖上依次标有 M、WT。(2)将试剂从 - 20取出平衡至室温,瞬时离心。在标有 M的管中加入 29l 扩增液( M),在标 有 WT的管中加入 29 l扩增液( WT)。(3)分别向
5、以上 M和 WT各管中加入 1l反应液。将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心待用。C:待检测 DNA样本的配制在上述标有 M、WT管中分别加入 3l待测基因组 DNA,分别再加入 17l ddH2O使终体积为 50 l 。 将管盖盖紧后,涡旋混匀,瞬时离心。D:PCR扩增将 PCR管放入 PCR仪中,按如下程序扩增: 50 2 min;95 5min ; 94 30sec、60 30sec、65 1min ( 26Cycles );65 10min ; 4 Hold 。取出 PCR产物, 28保存。E:检测卡检测实验从密封袋中取出检测卡,将待测样本 M与 WT管中的 PCR产物分别滴加在检测卡对应
6、的样品垫处, 待 25 min 对结果进行判读, 20min后结果不可靠。F:质量控制1)检测结果中阳性对照应在阳性对照卡检测线( T线)出条带,阴性对照应在阴性对照卡检测线( T线)不出条带。正常检测时,应定期进行阳性对照品及阴性对照品实验。(2)阳性对照品实验:取两个无菌 PCR薄壁管,在 PCR薄壁管管盖上依次标有 M、WT,将 20l M阳性对照液、 20l WT 阳性对照液分别加入标有 M、WT的 PCR薄壁管中,再依次分别加入 M扩 增液 29l及 1l反应液、 WT扩增液 29l及 1l反应液,按照步骤中 DF完成,检测线( T 线)及质控线( C线)均应出现条带。(3)阴性对照
7、品实验:取两个无菌 PCR薄壁管,在 PCR薄壁管管盖上依次标有 M、WT,将 M扩增 液 29l 、1l反应液及 WT扩增液 29 l 、1l反应液分别加入标有 M、WT的 PCR薄壁管中, 再 分别加入 20l阴性对照液,按照步骤中 DF完成,质控线( C线)应出现条带,检测线( T 线) 应无条带出现。G:结果判读(如下图、下表)如上图一所示,以阳性对照液为模板进行 PCR反应,对 PCR产物进行检测,检测线( T 线)有条 带出现,作为阳性对照;以阴性对照液为模板进行PCR反应,对 PCR产物进行检测,检测线( T线)无条带出现,为阴性对照。若阴性样本有条带出现,有可能加样时未及时更换
8、吸头,有 DNA 污染,建议在操作过程中,先配制阴性对照管并及时闭合 PCR管盖。图二显示 MTHFR 677C表C 示 正常野生型;图三显示 MTHFR67 7TT表示一对等位基因的第 677 位胞嘧啶(C)均变为胸腺嘧啶(T), 即纯合突变;图四显示 MTHFR6 77CT表示其中一个等位基因的第 677位胞嘧啶( C)变为胸腺嘧啶 (T),即杂合突变;图五质控线( C线)无条带或质控线( C线)与检测线( T 线)均无条带,即 为无效检测。无效原因可能为操作不正确或试纸条已变质损坏。应再次仔细阅读说明书,并用新 的检测卡重新检测。如果问题仍然存在,应立即停止使用该批号产品,并与厂家或供应
9、商联系。图一 阳性及阴性对照图二 野生型 图三 纯合突变 图四 杂合突变图五 无效图H:注意事项( 1)实验室应该遵循 PCR实验规范的要求分区操作,各区物品均为专用,不得交叉使用,加模板和引物 的移液器不能混用,每次加样后均需更换吸头,推荐使用无核酶、带滤芯的吸头。各区的仪器、设备和工 作服应独立使用。(2)本试剂盒用于体外操作。用户切勿吸入试剂或直接接触皮肤。(3)使用本试剂盒前,请仔细阅读说明书,严格按照说明书的要求操作。打开包装后请尽快使用。( 4)使用本试剂盒时,因 PCR体系为 50 l 体系,应使用 200l 的 PCR扩增管进行操作。(5)本试剂盒备有“ PCR组分加入确认单”,在【检测方法】中的步骤B(PCR扩增系统
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