耳聋基因检测PPT课件

1、耳聋基因检测 主要内容 背景介绍 耳聋基因检测的意义 产品介绍 案例分享 2 什么是耳聋？ 听觉障碍，不能听到外界声响的表现，轻者听而不真，重者不闻外声。 WHO 耳聋分级标准： 4 级别表现纯音听阈 轻度聋近距离听一般谈话无困难2640dB 中度聋近距离听话感到困难4160dB 重度聋在耳边大声呼喊方能听到6180dB 全聋听不到耳边大声呼喊的声音超过80dB 耳聋分类耳聋分类 耳聋分为传导性耳聋、感音性耳聋、混合性耳聋 耳聋的致病因素 遗传因素； 母亲怀孕期间的药物使用史； 孕母宫内感染:如巨细胞病毒、疱疹、毒浆体原虫病； 母亲的生产史； 新生儿高胆红素血症； 颅面部畸形； 早产或体重低；

2、 各种后天因素，如外伤 6 我生育下一个孩子还会耳聋吗？ 7 常染色体隐性遗传方式：有25%的几率 生育聋儿。 线粒体母系遗传：母系成员 均会有聋病 常染色体显性遗传：有50%的几率 生育聋儿。 听力障碍的发病率听力障碍的发病率：新生儿1；青年人1%；45-64岁 人群14%；65-75岁为30%-60%；75岁以后达50%-70%存 在不同程度的听力损失。 中国残疾人联合会公布： 1987年的第一次全国残疾人抽样调查各类残疾人总数 约为5164万，其中听力言语残疾为1770万人，占总残疾人总 数的34.28%，是各类残疾的首位。 2006年的第二次全国残疾人抽样调查，全国各类残疾 人总数为8

3、296万人，听力残疾2004万人占残疾人总数24.16%， 位于第二位，仅次于肢体残疾。 在对四岁及四岁以内的听力损 失患儿病因进行分析时，遗传 因素所占比例为71%，高于出 生时 新生儿听力损失中遗传 因素占据了65%的病因 N Engl J Med, 2006. 354: p. 2151-2164. 背景介绍耳聋发病原因 SLC26A4 3% GJB2基因 21% 综合征 11% 非综合征型 30% 其他环境因素 14% 临床明确的 感染因素 10% 临床不明确的 感染因素 11% 出生时发病率（186/100,000) SLC26A4 12% 迟发型听力损失 10% GJB2突变 15%

4、 综合征型 11% 非综合征型 22% 线粒体 mtDNA1555G 1% 其他环境因素 14% 临床确定的 感染因素 7% 临床不确定的感 染因素 8% 4岁时的发病率（270/100,000） 背景介绍流行病学的警示意义 确立了中国聋哑人群常见的3个易感基因及突变热点 药物敏感性耳聋（mtDNA 1555AG)： 占我国2780万听力残疾者的5-12%,意味着139-333万人可以通过用药警示而 避免致聋。 先天性重度耳聋(GJB2)： 占听力残疾者的20%,意味着556万人可以明确病因，早期发现，早期干预，聋 而不“哑”。 大前庭水管综合征(SLC26A4)： 占听力残疾者的16%,意味

5、着445万人通过早期发现可以避免永久性听力损失。 背景介绍干预措施 纯音测听，阈值在4090dB（中度重度耳聋）都应建 议配用。 1）先天性双耳重度-极重度感音性耳聋； Audiol Neurootol. 2004 Jul-Aug;9(4):224-33 2）语后聋及成年患者有基本语言识别能力及辨音能力且佩戴 助听器无效者。 耳聋基因检测意义 节省财政 支出 提高出生 缺陷防治 水平；同 时推进计 生、卫生 服务水平 分析耳聋基因 在当地的流行 病学分布 发现的药物敏 感性耳聋和迟 发性耳聋的个 体提高诊断效 率，减少漏诊 率 指导婚育。实现优生优育 早发现、早干预，实现聋而不哑 产品汇总 4

6、个基因20个位点 非综合征型耳聋基因检测-51 单个耳聋基因sanger全测序 遗传性听力损失基因检测-127 三个耳聋基因高通量测序 四个基因20个位点-飞行时间质谱(MALDI- TOF-MS)技术原理 Base Molecular Weight A 313.21 C 289.18 G 329.21 T 304.19 C ddATP ddCTP ddGTP ddTTP G 单碱基延伸技术 （iPLEX） 检测位点多：可同时检测20个基因位点； 灵敏度高：能分辨质量差别为1 Da的分子； 准确率高：99%； 通量大：每天可检测3000份以上； 自动化程度高：检测数据自动分析； 检测周期短：收

7、到样本后5个工作日可出报告。 突变 基因 GJB2SLC26A4 (PDS)12S rRNAGJB3 突变 位点 35delG、 167delT、 176-191del16、 299_300delAT、 235delC 281CT、 589GA、 IVS7-2AG、 1174AT、 1226GA、 1229CT、 1975GC、 2027TA、 2162CT、 2168AG、 IVS15+5GA 1494CT 1555AG 538CT 547GA 染色体13q11-127q31mtDNA1p33-p35 表达蛋白 缝隙连接蛋白 Connexin 26 多次跨膜蛋白 Pendrin 线粒体功能损

8、 失 缝隙连接蛋白 Connexin 31 临床表现 常染色体隐性遗传。 变异较大，可由轻度 到极重度，但多数为 重度或极重度耳聋 常染色体隐性遗传。 先天性或后天性耳聋， 耳聋发生或加重与外 伤、感冒有关 氨基糖甙类药 物性致聋，无 法逆反 常染色体显性遗 传。我国本土克 隆和鉴定的第一 个耳聋致病基因 适用人群 新生儿 婚前、孕前和产前人群 各种原因不明的耳聋，包括先天性聋 和后天性聋人群 听力正常，但有耳聋家族史的人群 受检人群 检测医院 初筛 TEOAE/DPOAE 结果不通过 结果通过 复筛(TEOAE/DPOAE )+AABR/ABR 阈值)筛选听力异常 知情同意、自愿选择 采取最

9、少3个采血斑 自愿选择， 知情同意 临床检验中心 耳聋基因检测 出具检测报告 检测结果正常 检测结果为杂合突 变或纯合突变 随访 检测医院确诊 出具确诊报告 确诊结果为 突变 确诊结果 正常 干预追踪 随访 基因检测流程 5个工作日 51个基因+2个位点 PCR、 第一代测序 目标区域捕获、 第二代高通量 测序 适用范围： 1）基因诊断：对于临床表 型难以确诊的病例给予分 子水平的鉴别诊断； 2）携带者筛查：对于无临 床表型的致病突变携带者 进行基因筛查； 检测周期：35工作日 检测流程 医院就诊样本采集DNA提取文库制备 高通量测序数据分析亲属验证发送报告 检测周期：35个工作日 检测基因/

10、位点 疾病基因 非综合征型耳聋 ACTG1,CCDC50,CDH23,CLD N14,COCH,DFNB31,DFNA5,D FNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB, EYA4,GJB2,GJB3,GJB6,GRHL 2,GRXCR1,HGF,KCNQ4,LHFP L5,LOXHD1,LRTOMT,MARVE LD2,MIR96,MYH14,MYH9,MY O15A,MYO1A,MYO3A,MYO6, MYO7A,OTOA,OTOF,PCDH15, POU3F4,POU4F3,PRPS1,RDX, SIX1,SLC17A8,SLC26A4,SLC2 6A5,STRC,TECTA,TMC

11、1,TMIE, TMPRSS3,TPRN,TRIOBP,USH 1C,WFS1,m.1555AG,m.1494 CT 综合征型耳聋综合征型耳聋基因基因 Waardenburg（瓦登伯 格）综合征 EDN3,EDNRB,MITF, PAX3,SNAI2,SOX10 遗传性共济失调性多 发 性 神 经 炎 样 病 （Refsum综合征） PEX1,PEX2,PEX26 尤塞氏综合征 （Usher syndrome） CDH23,CLRN1,GPR 98,USH2A Mohr-Tranebjaerg综合 征 TIMM8A 特雷彻-柯林斯综合征 （Treacher Collins syndrome）

12、TCOF1 Alport综合征（遗传性 肾炎） COL4A3,COL4A4,C OL4A5 Wolfram综合征1型WFS1 单个耳聋基因全测序 检测基因 GJB2 GJB3 SLC26A4 测序采用sanger法，在以下情况可建议进行单个基因全测序 1）耳聋患者检测某个耳聋基因杂合子突变，为明确病因做该基因的全测序 2）若胎儿母亲为某个耳聋基因的携带者，为了评估胎儿患有耳聋的风险，对父亲做该耳聋基因的全测序。 遗传因素的具体分析 先天性耳聋 （1/10003/1000） 遗传因素 （65%） 综合征型（SHL） （30%） 非综合征型 (NSHL)（70%） 常染色体隐性 （7585%） G

13、JB2/DFNB1 （50%） 其他DFNB （50%） 常染色体显性 （1524%） X-连锁 （12%） 非遗传因素 （35%） 遗传性耳聋基因检测内容 疾病分类疾病中类基因数目 非综合征型 （72个基因） 常染色体隐性45 常染色体显性28 X-连锁 3 大前庭水管综合征3 听神经病4 综合征型 （66个基因） 伴外耳畸形11 伴眼病17 伴代谢性疾病2 伴肌肉骨骼异常10 伴泌尿生殖疾病6 伴内分泌疾病3 伴皮肤疾病6 伴神经病变2 伴心脏缺陷4 线粒体遗传性 听力损失 - -5 临床服务：127 个基因（重复11 个基因） 技术简介：采用新一代高通量测序技术，对受检者的耳聋相关基因区

14、域进行检测和 分析。 目标区域捕获测序 检测时间：35个工作日（7周） 检测样本：全血：5ml，EDTA抗凝 (紫盖)； DNA：6ug，OD在1.7-2.0，未降解 运输条件：冰袋+干冰运输 检测结果：形成报告文件 27 样本处理样本检测数据分析报告发送血样接收解读咨询 适用条件 主要适用于以下情况： 1：通过热点突变检测未能发现致病原 因的耳聋患者 2：非综合征型耳聋，无法确定致病基 因及遗传方式的 3：综合征型耳聋患者 4：存在耳聋家族史的人群 筛查案例 一家9口人，6人是耳聋 佛山家系为3代遗传的耳聋家系，现有家系成员9人，其中6名为 耳聋患者，除由于婚姻关系成为该家系成员的2名耳聋患

15、者外， 剩余的4名患者均为母系家庭成员。 家系基因 30 外婆 同质突变 外公 正常 姨妈 同质突变 祖父 杂合突变 祖母 杂合突变 叔叔 纯和突变 女：1555A纯和 235delc杂合 12SrRNA A1555G GJB2 235delc 母亲重聋 同质突变 父亲重聋 纯和突变 启示 非常值得警惕的是：这个孩子通过了听力筛查，如 果没有做基因筛查，一旦误用了氨基糖苷类药物将 一针致聋，导致严重后果 31 临床案例 患儿杜某，女，11岁； 自述4岁左右，“感冒”后出现耳聋症状； 临床诊断：大前庭水管综合征； 否认孕期病毒感染及耳聋家族史； 检测结果： 患儿：SLC26A4基因1174AT+

16、2168AG复合突变； 患儿父亲： SLC26A4基因1174AT杂合突变； 患儿母亲： SLC26A4基因2168AG杂合突变。 临床案例 患儿 父亲 AT 患儿 患儿 母亲 SLC26A4基因 1174AT杂合突变 SLC26A4基因 2168AG杂合突变 AG AT AG SLC26A4基因 1174AT+2168 AG复合突变 指导婚育案例 ？ 客户为待孕女士，与前夫生了一个耳聋孩子，组成新的家庭后担心是否 还会生一个耳聋的孩子，特来做孕前基因诊断 先证者127个基 因检测 母亲突变基因 的sanger检测 丈夫突变基因的 sanger检测 主要内容 背景介绍 耳聋基因检测的意义 产品

17、介绍 案例分享 36 在对四岁及四岁以内的听力损 失患儿病因进行分析时，遗传 因素所占比例为71%，高于出 生时 新生儿听力损失中遗传 因素占据了65%的病因 N Engl J Med, 2006. 354: p. 2151-2164. 背景介绍耳聋发病原因 SLC26A4 3% GJB2基因 21% 综合征 11% 非综合征型 30% 其他环境因素 14% 临床明确的 感染因素 10% 临床不明确的 感染因素 11% 出生时发病率（186/100,000) SLC26A4 12% 迟发型听力损失 10% GJB2突变 15% 综合征型 11% 非综合征型 22% 线粒体 mtDNA1555G

18、 1% 其他环境因素 14% 临床确定的 感染因素 7% 临床不确定的感 染因素 8% 4岁时的发病率（270/100,000） 检测基因/位点 疾病基因 非综合征型耳聋 ACTG1,CCDC50,CDH23,CLD N14,COCH,DFNB31,DFNA5,D FNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB, EYA4,GJB2,GJB3,GJB6,GRHL 2,GRXCR1,HGF,KCNQ4,LHFP L5,LOXHD1,LRTOMT,MARVE LD2,MIR96,MYH14,MYH9,MY O15A,MYO1A,MYO3A,MYO6, MYO7A,OTOA,OTOF,PCDH15,

19、 POU3F4,POU4F3,PRPS1,RDX, SIX1,SLC17A8,SLC26A4,SLC2 6A5,STRC,TECTA,TMC1,TMIE, TMPRSS3,TPRN,TRIOBP,USH 1C,WFS1,m.1555AG,m.1494 CT 综合征型耳聋综合征型耳聋基因基因 Waardenburg（瓦登伯 格）综合征 EDN3,EDNRB,MITF, PAX3,SNAI2,SOX10 遗传性共济失调性多 发 性 神 经 炎 样 病 （Refsum综合征） PEX1,PEX2,PEX26 尤塞氏综合征 （Usher syndrome） CDH23,CLRN1,GPR 98,USH2A Mohr-Tranebjaerg综合 征 TIMM8A 特雷彻-柯林斯综合征 （Treacher Collins syndrome） TCOF1 Alport综合征（遗传性 肾炎） COL4A3,COL4A4,C OL4A5 Wolfram综合征1型WFS1 检测基因/位点 疾病基因 非综合征型耳聋 ACTG1,CCDC50,CDH23,CLD N14,COCH,DFNB31,DFNA5,D FNB59,DIAPH1,ESPN,ESRRB, EYA4,G