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文档简介

1、血液RNA提取完全可以,我曾经全血标本6个小时后分离白细胞提RNA,结果很好.因为你提的是白细胞内的RNA,因而在细胞没破损前,一般情况下不会出现RNA的降解,当你开始加TIIZOL时,你的所有器材的处理尤其重要,因而放心的做吧,本人长期从事白血病融合基因的检测,曾经使用4度保存3天的血液进行RNA提取,效果同样非常满足,目前使用的一次性耗材基本上不用DEPC水处理,只要注重规范操作,按TIIZOL说明书操作,提取的RNA 质量同样非常的高。附上本试验室的简易操作程序:1外周血及骨髓(抗凝)利用淋巴细胞分离液分离单个核细胞(1)外周血送检需5-10ml抗凝血,骨髓需1-3ml抗凝,常温送检(样

2、本量根据单个核细胞的数量来确定,一般需要5x106单个核细胞以上)。(2)加进等体积无菌PBS于外周血及骨髓中充分混合,形成细胞悬液;(3)加进5ml淋巴细胞分离液于另一离心管。(4)吸取5ml细胞悬液沿管壁轻轻加进到淋巴细胞分离液表面(注重勿与淋巴细胞分离液混合)。离心1500rpm 20min。(5)用吸管轻轻吸出界面层(白膜)中的MNC进另一离心管中。无菌冷PBS洗2次,最后1次洗涤可以将细胞悬液移进EP管中,离心往上清直接或加进TRIzol混匀后-70冻存,或直接提取RNA(可以先进行细胞计数以保证细胞数)。2利用Trizol的方法提取细胞总RNA(参照Invitrogen公司Triz

3、ol说明书)以下步骤要严格防止RNA酶降解RNA,所使用的离心管和枪头要用0.1% DEPC水处理24h,然后高压灭菌并烤干。尽量快地进行操作,减少RNA降解。(1)先加1ml Trizol于1107细胞中,若冻存细胞直接加进Trizol,不需解冻,吹打裂解后室温静置5-10min。(可-70,1月)(2)加进0.2ml氯仿(三氯甲脘),剧烈震荡(vigorously)15s,室温静置2-3min。(3)在4下1,2021g离心15min。(4)小心吸出上清水相约500l移进另一离心管(注重不要抽到蛋白层),加进500l异丙醇(专用),颠倒混匀(不要太剧烈),室温静置10min(RNA沉到底部

4、)。(5) 41,2021g离心10min,倒往上清液,底部可见针尖大小白色物质(RNA)。(6)加进1ml 70%乙醇旋转洗涤,清洗异丙醇。(7) 47500 g离心5min,往除乙醇(尽量用枪头吸干净)后晾5-10min,不要太干,否则难以溶解。RNA可以在70%乙醇中-80保存1年。最新血液RNA提取!1、血液收集:最好用肝素抗凝,因为EDTA可能会对后续的pcr有影响,因为EDTA会螯合pcr 反应中的Mg2+,也可以根据实验的具体要求瞧选择怎么样的抗凝。2、白细胞的分离:一般选择1.5ML新鲜的血液,或选取冷冻的5ML的血液(冷冻血液的保存:先液氮速冻,再置于-80保存),或隔天的5

5、ML的血液,就可以分离到比较多的白细胞了。可以选择溶红素(BD公司的)或红细胞裂解液按一定的比例(1:3或1:5)分离白细胞,一般在3500转离心6分钟即可,效果不好的话,可以重新裂解一次。分离得到的白细胞,马上用质量好的TRIZOL裂解白细胞,假如不能马上提取的话,可以置于-20或-80保存,过后抽提。3、RNA抽提:选择一般的组织或细胞的RNA抽提试剂盒即可。本方法简单,省钱,经过大量的实验表明是可行的,并且本人用进口的血液RNA抽提试剂盒都不能跟上述方法比!在用血液标本进行基因表达研究时,需要及时把新鲜血液中有核细胞的RNA提取出来。全血还不能直接放到-80保存,即使在-80保存,全血中

6、的RNA也轻易发生降解。传统的提取新鲜全血RNA方法是把先把有核细胞从全血中分离出来,需要加白细胞分离液、离心等步骤,比较繁琐,在临床医院往往难以实施。作为RNA提取的领先公司,北京艾德莱的研发人员在05年国内首家研发成功液体样本RNA提取试剂RN01 TRIpure LS(LS 意思是Liquid Sample。可以直接裂解全血提取RNA,避免了先裂解白细胞可能导致的RNA降解,也大大简化了操作步骤。操作时间比普通方法节约至少三分之一。在临床上采血时,可以先把TRI pure LS Reagent分装750ul到1.5ml的离心管中。血液样本可以先抗凝处理(EDTA抗凝或者其他抗凝方式都可)

7、,然后取250ul全血样品加进到750ul的TRI pure LS Reagent中,用移液枪反复抽打并振荡混匀,在室温裂解5min-10min,直至血细胞充分发生裂解。然后可把此裂解液保存在-20下可达2个月,-80可达半年。在此期间,可以把该裂解液运输到北京艾德莱生物公司进行RNA的抽提,运输过程可以41天,-20一周。在全血RNA提取试剂直接裂解全血的基础上面,北京艾德莱又进一步简化了操作,增加了离心柱操作,推出了RN23 RNAliquid 超速全血(液体样本)总RNA 提取试剂盒。点此详见。经过离心柱子吸附漂洗,除了进一步简化了操作步骤外,更适合临床高通量操作外,还极大的提高了RNA

8、的纯度。除了一般常见的RT PCR 或者荧光定量PCR外,RNA纯度可以满足最严格的实验要求比如基因表达谱芯片要求, 1ml的全血可以得到10g左右的total RNA,足够满足芯片分析的需要需要预备的试剂氯仿、异丙醇、75%乙醇(用RNase-free水配制)、RNase-free 的水1.匀浆处理(Homogenization)直接取新鲜的血液,加进3倍体积红细胞裂解液,混匀后室温放置10分钟,10,000 rpm离心1分钟。彻底吸弃上清,收集白细胞沉淀。每100-200l血液收集的白细胞沉淀加进1ml TRIzol。2分层(Phase Separation)a. 样品加进TRIzol后,

9、室温放置5min,使样品充分裂解。注:如不进行下一步操作,样品可放进-70长期保存。可选步骤:4 12,000 rpm 离心10分钟,取上清。假如样品中含有较多蛋白、脂肪、多糖或肌肉、植物结节部分等,可离心往除。处理脂肪组织样品时,上层是大量油脂,应除往。取澄清的匀浆溶液进行下一步操作。b. 每1ml TRIzol加进200l氯仿,剧烈振荡混匀后室温放置3-5 min使其自然分相。3RNA沉淀(RNA Precipitation)a. 4 12,000rpm离心10-15min。样品会分成三层:黄色的有机相,中间层和无色的水相,RNA主要在水相中,把水相(通常可吸取550l)转移到新管中。注:

10、小心吸取水相,千万不要吸取中间界面,否则将导致RNA样品中有DNA 污染。b. 在上清中加进等体积冰冷的异丙醇,室温放置10-20min。4 12,000 rpm 离心10min,弃上清,RNA沉淀于管底。4RNA漂洗(RNA Wash)a. RNA沉淀中加进1ml 75%乙醇(用RNase-free水配制),热和振荡离心管,悬浮沉淀。每1ml TRIzol加进1ml 75乙醇。b. 4 5,000-8,000 rpm离心1-2min,弃上清;短暂快速离心,用移液器小心吸弃上清,注重不要吸弃沉淀。室温放置1-2分钟晾干沉淀。注:RNA样品不要过于干燥,否则很难溶解。5.溶解RNA(Rediss

11、olving the RNA)沉淀中加进50-100l RNase-free水,轻弹管壁,以充分溶解RNA,-70保存。注重事项1. 经常更换手套。因为皮肤经常带有细菌,可能导致RNase污染。2. RNA在TRIzol试剂中不会被RNase污染,但在氯仿分相后的上清中已经没有了RNase的抑制剂,所以分相后的所有操作要非凡小心,保证使用的离心管和枪头都是RNase-free的。3. RNase-free水的配制方法:将水加进干净的玻璃瓶中,加进DEPC至终浓度0.1%(v/v),放置过夜,高压灭菌;RNase-free的塑料和玻璃器皿处理方法:玻璃器皿可在150烘烤4小时;塑料器皿可在0.5

12、M NaOH中浸泡10分钟,然后用DEPC水彻底清洗,再灭菌,即可往除RNase。6. 不同组织或细胞中提取RNA预期得率血液 (35 g/ml人全血).RNA纯度及浓度检测完整性 RNA可用普通琼脂糖凝胶电泳(电泳条件:1.2%胶;0.5TBE电泳缓冲液;150v,15分钟)检测完整性。由于细胞中70-80%的RNA为rRNA,电泳后UV 下应能瞧到非常明显的rRNA条带。动物rRNA大小分别约为5kb和2kb,分别相当于28S和18S rRNA;植物叶片中由于含有大量的叶绿体RNA,可见4条或更多rRNA;细菌rRNA大小分别约为4kb和2kb,分别相当于细菌23S和16S rRNA。RNA样品中最大rRNA亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0倍,否则表示RNA样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。纯度 OD260/OD280比值是衡量RNA样品中蛋白质污染程度的指标。高质量的RNA样品,OD260/OD280值(10mM Tris, pH7.5)在2.0左右。OD260/OD280读数受测定所用溶液的pH值影响。同一

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