
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文档简介
1、一、填空题现代分子生物学习题及答案1. 基因工程是 70 年代发展起来的遗传学的一个分支学科。2. 基因工程的两个基本特点是:(1)分子水平上的操作, (2)细胞水平上的表达3. 基因克隆中三个基本要点是:克隆基因的类型;受体的选择;载体的选择4. 通过比较用不同组合的限制性内切核酸酶处理某一特定基因区域所得到的不同大小的片段,可以构建显示该区域各限制性内切核酸酶切点相互位置的限制性酶切图谱。5. 限制性内切核酸酶是按属名和种名相结合的原则命名的,第一个大写字母取自属名的第一个字母,第二、三两个字母取自_种名的前两个字母,第四个字母则用株名表示。6. 部分酶切可采取的措施有:(1)减少酶量;(
2、2)缩短反应时间;(3)增大反应体积等。7. 第一个分离的限制性内切核酸酶是 ecok;而第一个用于构建重组体的限制性内切核酸酶是_ecorl。8限制性内切核酸酶 bsuri 和 hae的来源不同, 但识别的序列都是 ggcc,它们属于异源同工酶。9. dna 聚合酶 i 的 klenow 大片段是用_枯草杆菌蛋白酶切割 dna 聚合酶 i 得到的分子量为 76kda 的大片段,具有两种酶活性: (1) 5-3合成酶的活性; (2) 3-5外切核酸酶的活性。10. 为了防止 dna 的自身环化,可用碱性磷酸酶去双链dna_5端的磷酸基团。11. egta 是_ca2+_离子螯合剂。12. 测序
3、酶是修饰了的 t7 dna 聚合酶,它只有_ 5-3合成酶的活性,而没有 3-5外切酶的活性。13. 切口移位(nick translation)法标记 dna 的基本原理在于利用 dna 聚合酶 i 的 5一 3外切核酸酶和 5一 3合成酶的作用。14. 欲将某一具有突出单链末端的双链 dna 分子转变成平末端的双链形式,通常可采用 聚合酶补平。s1 核酸酶切割或 dna15. 反转录酶除了催化 dna 的合成外,还具有核酸水解酶 h 的作用,可以将 dna-rna杂种双链中的_rna_水解掉。16基因工程中有 3 种主要类型的载体:质粒 dna,病毒dna,质粒和病毒dna杂合体。17就克
4、隆一个基因(dna 片段)来说,最简单的质粒载体也必需包括三个部分:复制区:含有复制起点;选择标记: 主要是抗性基因;克隆位点: 便于外源 dna 的插入。另外,一个理想的质粒载体必须具有低分子量。18. 一个带有质粒的细菌在有 eb 的培养液中培养一段时间后,一部分细胞中已测不出质粒,这种现象叫质粒消除(或治愈) 。19. pbr322 是一种改造型的质粒,它的复制子来源于pmbl ,它的四环素抗性基 因来自于 pscl01,它的氨苄青霉素抗性基因来自于 psf2124(r 质粒)。20. yac 的最大容载能力是1000kb,bac 载体的最大容载能力是300kb 。21. pscl01
5、是一种严紧复制的质粒。22. pucl8 质粒是目前使用较为广泛的载体。puc 系列的载体是通过 pbr322 和 m13 两种质粒改造而来。它的复制子来自pmbl,amp抗性基因则是来自转 座 子 。23噬菌体之所以被选为基因工程载体,主要有两方面的原因:一是它在细菌中能够大量繁殖,这样有利于外源dna 的扩增; 二是对某些噬菌体(如 l 噬菌)的遗传结构和功能研究得比较清楚,其大肠杆菌宿主系统的遗传也研究得比较详尽。24. 野生型的 m13 不适合用作基因工程载体,主要原因是没有合适的限制性内切核酸酶识别位点和 选择标记。25. 黏粒(cosmid)是质粒噬菌体杂合载体,它的复制子来自质粒
6、、cos 位点序列来自l 噬菌体,最大的克隆片段达到45 kb。26. 野生型的 l 噬菌体 dna 不宜作为基因工程载体,原因是:(1)分子量大,(2)酶的多切点,(3)无选择标记 27噬菌粒是由质粒和噬菌体 dna 共同构成的,其中来自质粒的主要结构是复制区,而来自噬菌体的主要结构是 ig 区 。28. l 噬菌体载体由于受到包装的限制,插入外源 dna 片段后,总的长度应在噬菌体基因组的75105的范围内。29. 在分离 dna 时要使用金属离子螯合剂,如 edta 和柠檬酸钠等,其目的是 螯合 mg2+离子,抑制核酸酶的活性。30. 用乙醇沉淀 dna 时,通常要在 dna 溶液中加人
7、单价的阳离子,如 nacl 和 naac,其目的是 中和 dna 分子的负电荷,增加 dna 分子间的凝聚力。31. 引物在基因工程中至少有 4 个方面的用途:(1)合成探针;(2)合成 cdna;(3)用于 pcr 反应;(4)进行序列分析32clark 发现用 taqdna 聚合酶得到的 pcr 反应产物不是平末端,而是有一个突出碱基末端的双链 dna 分子。根据这一发现设计了克隆 pcr 产物的 t载体。33在 cdna 的合成中要用到 s1 核酸酶,其作用是切除在第二链合成时形成的发夹环 34乙醇沉淀 dna 的原理是乙醇使 dna 分子脱水。35. 假定克隆一个编码某种蛋白质的基因,
8、必须考虑其表达的三个基本条件:(1) 保持正确的可读框 (2)能够使其转录的启动子 (3)具有翻译的起始和终止信号36. 受体细胞的感受态是接受外源 dna 的生理状态_。37. dna 重组连接的方法大致分为四种:(1)黏性末端连接; (2)平末端连接;(3)同聚物接尾连接;(4)接头连接法。38. 将含有外源基因组一个酶切片段的质粒称之为含有一个基因组 dna 克隆_,各种此类质粒的集合体称之为构建了一个基因组 dna 文库。39. 将含有一个 mrna 的 dna 拷贝的克隆称作一个_cdna 克隆,源于同一批 rna 制备物的克隆群则构建了一 个 _cdna文 库 _。40只要知道基因
9、组中某一特定区域的部分核苷酸组成, 用_聚合酶链式反应(pcr)可以将这段 dna 进行百万倍的扩增。41. 人工感受态的大肠杆菌细胞在温度为 0c 时吸附 dna, 42c _时摄人 dna。42. 目前,在重组体的筛选中,已经发展了许多构思巧妙、具有极高准确性的筛选方法。大致可以分为:(1)遗传学方法;(2)物理筛选法;(3)核酸杂交法;(4)表达产物分析法等。43. pcr 扩增筛选重组体是比较简便的筛选方法,它适合于_插入外源片段的种类较多,大小又极为相似的重组体的筛选。44. 核酸杂交探针可分为两大类: dna 探针和 rna 探针。其中 dna 探针又分为 基因组 dna 探针和
10、cdna探针。45. 如果用限制性内切核酸酶切割双链 dna 产生 5突出的黏性末端,则可以用_ klenow 酶填补的方法_进行 3末端标记。如果用限制性内切核酸酶切割 dna 产生的是 3突出的黏性末端,可以用t4dna 聚合酶进行 3末端标记。46单链 dna 探针的标记可以采用下列方法:(1)用 m13噬菌体载体合成单链 dna 探针;(2)从 mrna 反转录合成单链 cdna 探针;(3)用不对称 pcr 合成单链dna 探针。47. 根据 northern 杂交的结果可以说明:外源基因是否进行了转录_。48. 差示杂交(differential hybridization)技术需
11、要两种不同的细胞群体能够表达不同的基因,即在一个群体中能够表达一些基因,而在另一个细胞群体中不能表达这些基因。49. rna 分子经凝胶电泳后按大小不同分开,然后被转移到一张硝酸纤维素膜(尼龙膜)上,同一放射 dna 探针杂交的技术称northern 印迹_ 。50. 在 southern 印迹_技术中,dna 限制性片段经凝胶电泳分离后,被转移到硝酸纤维素膜(或尼龙膜)上,然后与放射性的 dna 探针杂交。51. 可用 t4 dna 聚合酶进行平末端的 dna 标记,因为这种酶具有 53合成酶_和_3 5外切核酸酶_的活性。52. 根据外源片段提供的遗传表型筛选重组体,必需考虑 三种因素:(
12、1)克隆的是完整的基因;(2)使用的是表达载体; (3)不含内含子。53. northern 印迹和 southern 印迹有两点根本的区别:(1) 印迹的对象不同:northern 是 rna,southern 是dna;(2)电泳条件不同,前者是变性条件,后者是非变性条件。54. 放射免疫筛选的原理基于以下三点:(1)抗体能够被吸附到固体支持物上;(2)同一个抗原可以同几种抗体结合; (3)抗体能够被标记二、选择题(单选或多选)1. 因研究重组 dna 技术而获得诺贝尔奖的科学家是() (a)akornberg (b)wgilbert(c)pberg(d)bmcclintock2. 第一个
13、作为重组 dna 载体的质粒是() (a)pbr322(b)colel(c)pscl01(d)pucl83. 关于宿主控制的限制修饰现象的本质,下列描述中只有()不太恰当。(a) 由作用于同一 dna 序列的两种酶构成(b) 这一系统中的核酸酶都是类限制性内切核酸酶 (c)这一系统中的修饰酶主要是通过甲基化作用对 dna进行修饰(d)不同的宿主系统具有不同的限制-修饰系统4型限制性内切核酸酶: ()(a)有内切核酸酶和甲基化酶活性且经常识别回文序列(b)仅有内切核酸酶活性,甲基化酶活性由另外一种酶提供(c)限制性识别非甲基化的核苷酸序列(d)有外切核酸酶和甲基化酶活性(e)仅有外切核酸酶活性,
14、甲基化酶活性由另外一种酶提供5. 下面有关限制酶的叙述哪些是正确的?() (a)限制酶是外切酶而不是内切酶(b) 限制酶在特异序列(识别位点)对 dna 进行切割(c) 同一种限制酶切割 dna 时留下的末端序列总是相同的(d) 一些限制酶在识别位点内稍有不同的点切割双链dna,产生黏末端(e) 一些限制酶在识别位点内相同的位置切割双链dna,产生平末端6. 第一个被分离的类酶是: ()(a) ecok(b)hind(c)hind (d)ecob7. 在下列进行 dna 部分酶切的条件中,控制那一项最好?() (a)反应时间(b)酶量(c)反应体积(d)酶反应的温度8. 在下列试剂中,那一种可
15、以螯合 ca2+离子?() (a)edta(b)柠檬酸钠(c)sds(d)egta9. 在下列工具酶中,那一种可以被 egta 抑制活性?() (a)s1 单链核酸酶 (b)末端转移酶 (c)碱性磷酸酶 (d)bal 31 核酸酶10. 限制性内切核酸酶可以特异性地识别: ()(a) 双链 dna 的特定碱基对(b)双链 dna 的特定碱基序列(c)特定的三联密码(d)以上都正确 11下列关于限制性内切核酸酶的表示方法中,正确一项的是()。(a)sau3a i(b)ecori(c)hind iii(d)sau 3a1 12限制性内切核酸酶的星号活性是指:()(a)在非常规条件下,识别和切割序列
16、发生变化的活性。(b)活性大大提高(c)切割速度大大加快(d)识别序列与原来的完全不同13下面哪一种不是产生星号活性的主要原因?() (a)甘油含量过高(b)反应体系中含有有机溶剂(c)含有非 mg2+的二价阳离子(d)酶切反应时酶浓度 过 低14关于宿主控制的限制修饰现象的本质,下列描述中只有()不太恰当(a) 由作用于同一 dna 序列的两种酶构成(b) 这一系统中的核酸酶都是类限制性内切核酸酶 (c)这一系统中的修饰酶主要是通过甲基化作用对 dna进行修饰(d)不同的宿主系统具有不同的限制-修饰系统 15在长模板链的指导下引物延伸合成长的 dna 互补链时应选用()(a)t4dna 聚合
17、酶(b)klenow 酶(c)大肠杆菌 dna 聚合酶 i(d)t7dna 聚合酶16末端转移酶是合成酶类,()(a) 作用时不需要模板(b) 在 ca2+的存在下,可以在突出的 3,末端延长 dna链(c) 在 ca2+的存在下,可以在隐蔽的 3,末端延长 dna链(d) 上述说法有两种是正确的17. 在基因工程中,可用碱性磷酸酶()(a) 防止 dna 的自身环化(b)同多核苷酸激酶一起进行 dna 的 5,末端标记(c)制备突出的 3,末端(d)上述说法都正确18下列酶中,除()外都具有磷酸酶的活性(a) 核酸外切酶(b)外切酶(c)单核苷酸激酶(d)碱性磷酸酶19.下列哪一种酶作用时需
18、要引物?(a)限制酶(b)末端转移酶()(c)反转录酶(d)dna 连接酶20. s1 核酸酶的功能是()(a) 切割双链的 dna(b)切割单链的 rna(c)切割发夹环 (d)以上有两项是正确的21. klenow 酶与 dna 聚合酶相比,前者丧失了()的活性。(a)5,-3,合成酶,(b)3,-5,外切酶(c)5,-3,外切酶(d)转移酶22. 下面关于松弛型质粒(relaxed plasmid)性质的描述中, ()是不正确的(a) 质粒的复制只受本身的遗传结构的控制,而不受染色体复制机制的制约,因而有较多的拷贝数(b) 可以在氯霉素作用下进行扩增(c)通常带有抗药性标记(d)同严紧型
19、质粒融合后,杂合质粒优先使用松弛型质粒的复制子23. 基因工程中所用的质粒载体大多是改造过的,真正的天然质粒载体很少,在下列载体中只有()被视为用作基因工程载体的天然质粒载体(a) pbr322(b)pscl01(c)publl0(d)pucl824. 下列哪种克隆载体对外源 dna 的容载量最大?() (a)质粒(b)黏粒 (c)酵母人工染色体(yac)(d)l 噬菌体(e) cdna 表达载体25. 松弛型质粒: ()(a) 在寄主细胞中拷贝数较多(b)可用氯霉素扩增(c)一般没有选择标记(d)上述(a)、(b)两项正确26. col el 是惟一用作基因工程载体的自然质粒,这种质粒:()
20、(a) 是松弛复制型(b)具有,四环素抗性(c)能被氯霉素扩增(d)能产生肠杆菌素 27同一种质粒 dna,以三种不同的形式存在,电泳时, 它们的迁移速率是:()(a)ocdnascdnaldna (b)scdnaldnaocdna(c)ldnaocdnascdna (d)scdnaocdnaldna28. pbr322 是一种改造型的质粒,含有两个抗性基因,其中四环素抗性基因来自: ()(a) colel(b)ri 质粒 (c)pscl01(d)pucl8 29关于穿梭质粒载体,下面哪一种说法最正确?()(a) 在不同的宿主中具有不同的复制机制(b) 在不同的宿主细胞中使用不同的复制起点 (
21、c)在不同的宿主细胞中使用不同的复制酶(d)在不同的宿主细胞中具有不同的复制速率30. 能够用来克隆 32kb 以下大小的外源片段的质粒载体是() (a)charomid(b)plasmid(c)cosmid(d)phagemid31. 第一个作为重组 dna 载体的质粒是() (a) pbr322(b)colel(c)pscl01(d)pucl832. ti 质粒:()(a) 可从农杆菌转到植物细胞中(b)作为双链 dna 被转移(c)在植物中导致肿瘤(d)介导冠瘿碱的合成,作为细菌的营养物和植物的生长激素(e)需要细菌的 vir 基因帮助转移(f)在植物细胞中作为染色体外质粒33. 黏粒(
22、cosmid)是一种人工建造的载体,()(a) 它具有 cos 位点,因而可进行体外包装(b)它具有质粒 dna 的复制特性(c)进入受体细胞后,可引起裂解反应(d)进入受体细胞后,可引起溶源化反应 34有两种确定核酸中核苷酸序列的方法:化学序列分析法(maxam-glbert)和酶学序列分析法(sanger)。酶学测序法的基本原理优点是:()(a) 碱基与特殊染料间不同的相互作用(b) 一个合成引物的延伸和 dna 修复合成的可靠终止(c) 限制性位点与 dna 末端标记的相关性(d) 可同时对 dna 双螺旋的两条链进行测序(e) 反应是 dna 特异的,rna 不会带来干扰。这样既减少纯
23、化步骤,也节约了开支。35. 关于 cdna 的最正确的说法是:()(a) 同 mrna 互补的单链 dna (b)同 mrna互补的双链 dna(c)以 mrna 为模板合成的双链 dna(d)以上都正确36. 用碱法分离质粒 dna 时,染色体 dna 之所以可以被除去,是因为:()(a) 染色体 dna 断成了碎片(b)染色体 dna 分子量大,而不能释放(c)染色体变性后来不及复性(d)染色体未同蛋白质分开而沉淀37. 关于碱解法分离质粒 dna,下面哪一种说法不正确?() (a)溶液 i 的作用是悬浮菌体(b)溶液的作用是使 dna 变性(c) 溶液的作用是使 dna 复性(d) 质
24、粒 dna 分子小,所以没有变性,染色体变性后不能复性38. clark 做了一个有趣的实验,发现 taqdna 聚合酶可以不需要模板,在双链 dna 的末端加一个碱基,主要是加() (a) dgtp(b)datp(c)dctp(d)dttp39. 根据构建方法的不同,基因文库分为基因组文库、cdna 文库等。在下列文库中,()属 cdna 文库(a) yac 文库(b)mac 文库(c)扣减文库(d)bac 文库40. 下面关于多克隆位点(multipleclonesite,mcs)的描述, 不正确的句是()(a) 仅位于质粒载体中(b)具有多种酶的识别序列(c)不同酶的识别序列可以有重叠(
25、d)一般是人工合成后添加到载体中41. 在 cdna 技术中,所形成的发夹环可用()(a) 限制性内切核酸酶切除(b)用 3外切核酸酶切除(c)用 s1 核酸酶切除(d)用 5外切核酸酶切除42. 在 dna 的酶切反应系统中,通常:()(a) 用 ssc 缓冲液(b)加入 mg2+作辅助因子(c)加入 bsa 等保护剂(d)上述说法中,有两项是正确的43. 黏性末端连接法,不仅操作方便,而且()(a) 产生新切点(b)易于回收外源片段 (c)载体不易环化 (d)影响外源基因的表达44. 在下列表型中,()是基因工程上理想的受体菌表型(a)r+m+rec*(b)r-m-rec-(c)r-m-r
26、ec+(d)r+m+rec- 45关于 dna 接头在基因工程中的作用,下列说法中哪一项不正确?()(a) 给外源 dna 添加适当的切点(b)人工构建载体(c)调整外源基因的可读框(d)增加调控元件46. cdna 文库包括该种生物的()(a) 某些蛋白质的结构基因(b)所有蛋白质的结构基因(c)所有结构基因(d)内含子和调控区47. 下列关于建立 cdna 文库的叙述中,哪一项是错误的?() (a)从特定组织或细胞中提取 dna 或 rna(b)用反转录酶合成 mrna 的对应单链 dna (c)以新合成的单链 dna 为模板合成双链 dna (d)新合成的双链 dna 甲基化48. 下列
27、对黏性末端连接法的评价中,哪一项是不正确的? ()(a) 操作方便(b)易于回收片段(c)易于定向重组(d)载体易于自身环化,降低重组率49. 关于感受态细胞性质的描述,下面哪一种说法不正确?() (功具有可诱导性(b)具有可转移性(c)细菌生长的任何时期都可以出现(d)不同细菌出现感受态的比例是不同的50. 下面关于用 t4 多核苷酸激酶标记 5端制备探针的描述中()是不正确的。(a) 既能标记 dna,又能标记 rna(b)既能标记双链 dna 又能标记单链 dna(c) 只能标记突出的 5 端不能标记其他类型末端(d) dna 或 rna 必须有 5-oh 的存在51southem 印迹
28、的 dna 探针()杂交。(a)只与完全相同的片段(b)可与任何含有相同序列的 dna 片段(c) 可与任何含有互补序列的 dna 片段(d) 可与用某些限制性内切核酸酶切成的 dna 片段(e) 以上都是52. 用下列方法进行重组体的筛选,只有()说明外源基因进行了表达。(a) southem 印迹杂交(b)northem 印迹杂交(c)western 印迹(d)原位菌落杂交53. 下列哪一个不是 southern 印迹法的步骤?()(a) 用限制酶消化 dna(a)dna 与载体的连接(c)用凝胶电泳分离 dna 片段(d)dna 片段转移至硝酸纤维素膜上(e)用一个标记的探针与膜杂交54
29、. 报告基因()(a) 以其易于分析的编码序列代替感兴趣基因的编码序列(b) 以其易于分析的启动子区代替感兴趣基因的启动子区(c) 能用于检测启动子的活性(d)能用于确定启动子何时何处有活性55. 在利用 lacz 失活的显色反应筛选法中,iptg 的作用是()(a) 诱导宿主的 肽的合成(b)诱导宿主的 肽的合成(c)作为酶的作用底物(d)作为显色反应的指示剂56. 切口移位是指在()作用下,使()带上放射性标记。(a) dna 聚合酶 i,rna(b)dna 聚合酶 i,dna (c)dna 聚合酶,rna(d)dna 聚合酶,dna 57用于核酸分子杂交的探针可以是放射性标记的()(a)
30、dna(b)rna(c)抗体(d)抗原58southern 印迹是用 dna 探针检测 dna 片段,而northern 印迹则是:()(a)用 rna 探针检测 dna 片段(b)用 rna 探针检测 rna 片段(c)用 dna 探针检测 rna 片段(d)用 dna 探针检测蛋白质片段59. 用免疫化学法筛选重组体的原理是()(a) 根据外源基因的表达(b)根据载体基因的表达(c)根据 mrna 同 dna 的杂交(d)根据 dna 同dna的 杂 交60. 随机引物标记探针,下列各项中哪一项是不正确的?()(a) 双链 dna、单链 dna、rna 都是可以标记的(b) 不需要用 dn
31、ase i 预处理(c) 反应时可用 klenow 酶(d)反应时可用 dna聚合酶 161. 在切口移位标记 dna 探针时只能使用() (a) klenow 酶(b)dna 聚合酶 i(c)dna 聚合酶(d)dna 聚合酶62. 要对一双链的 dna 分子进行 3末端标记,可用() (a)klenow 酶(b)dna 聚合酶 i(c)t4dna 聚合酶(d)t7dna 聚合酶答案1c;2c; 3b; 4b5b,c,d,e; 6c; 7b; 8d;9d; 10b;11d;12a;13d;14b15d;16c;17a,b;18a;19c;20d;21c;22c;23b;24c;25d;26a
32、,c,d;27b;28c;29b;30a;31c;32a,c,d,e,33a,b,c;34b;35c;36c;37d;38b;39c;40a;41c;42a,b,c;43b;44b;45d;46a;47a;48c;49c;50b;51c;52c;53b;54a,c,d;55a;56b;57a,b;58c;59a;60d;61b; 62c;三、简答题1. 说明 sanger dna 测序法的原理。sanger dna 测序法是建立在两个基本原理之上:(1)核酸是依赖于模板在聚合酶的作用下由 5端向 3端聚合(dna 聚合酶参与了细菌修复 dna 合成过程);(2)可延伸的引物必须能提供游离的 3
33、羟基末端,双脱氧核苷酸由于缺少游离的 3羟基末端, 因此会终止聚合反应的进行。如果分别用 4 种双脱氧核苷酸终止反应,则会获得 4 组长度不同的 dna 片段。通过比较所有 dna 片段的长度可以得知核苷酸的序列。2. 某学生在用 ecori 切割外源 dna 片段时,出现了星号活性,请分析可能的原因?盐离子浓度不对,温度不对,甘油浓度过高。3. 在序列 5-cgaacatatggagt-3中含有一个 6bp 的类限制性内切核酸酶的识别序列, 该位点的序列可能是什么?回文序列是:5-catatg-3,4. 下面几种序列中你认为哪一个(哪些)最有可能是类酶的识别序列: gaatcg,aaattt
34、, gatatc, acggca?为 什 么 ? gatatc;aaattt,因为它们是回文序列。5. 当两种限制性内切核酸酶的作用条件不同时,若要进行双酶切,应采取什么措施?为什么?注意星活性,先低盐,后高盐;先低温酶,后高温酶;并且可以直接在换酶前将第一种酶失活,再加第二种酶,否则,易产生星活性。或使用通用缓冲液。6. 为什么反转录酶在聚合反应中会出错?由于反转录酶缺少在 ecoli dna 聚合酶中起校正作用的 3-5外切核酸酶活性,所以聚合反应往往会出错,在高浓度的 dntp 和 mg2+下,每 500 个碱基中可能有一个错配。7. 什么是测序酶(sequenasetm)?所谓测序酶即
35、是修饰了的 t7 dna 聚合酶,是采用缺失的方法,从外切核酸酶结构域中除去 28 个氨基酸,这样使 t7 dna 聚合酶完全失去了 3-5的外切核酸酶活性,只有5-3聚合酶的活性,而且聚合能力提高了 39 倍,测序时常用此酶。8. 什么是 s1 核酸酶作图(s1 nuclease mapping)?s1 核酸酶作图是一种对 rna 转录产物的末端和剪接位点进行作图的方法9yac 载体具有什么样的功能性 dna 序列?为什么在克隆大片段时,yac 具有优越性?yac 带有天然染色体所有的功能元件,包括一个着丝粒,一个 dna 复制起点,两个端粒。yac 能够容纳长达几百 kb 的外源 dna,
36、这是质粒和黏粒办不到的。大片段的插入更有可能包含完整的基因,在染色体步移中每次允许更大的步移距离,同时能够减少完整基因组文库所需的克隆数目。10. 列举质粒载体必须具备的 4 个基本特性。(1) 独立复制;(2)有选择标记;(3)有独特的酶切位点;(4)能转化但不扩散。11. 什么叫穿梭载体?含有细菌质粒和克隆的真核生物 dna 片段的杂种质粒,有两个复制起点和既能在细菌又能在真核细胞中进行选择的选择标记,所以,很容易从一宿主转到另一个宿主(来回穿梭)。12. 如何将野生型的 l 噬菌体改造成为一个理想的载体?(1) 削减分子量(除去非必需区和整合区); (2)削减酶切位点; (3)添加选择标
37、记; (4)引入终止突变13. pcr 的基本原理是什么?用 pcr 扩增某一基因,必须预先得到什么样的信息? (1)dna 半保留复制的原理,在体外进行 dna 的变性、复性和引物延伸。(2)至少要预先知道足够合成一对引物的靶 dna 序列。14. cdna 克隆与基因组克隆有何不同?基因组克隆包含所有不在 cdna 中出现的内含子。15. 怎样将一个平末端 dna 片段插入到 ecor i 限制位点中去?化学合成一些长为 10bp 含有 ecori 识别位点的短的 dna 片段,然后与待克隆片段两端连接起来,如果用 ecori 切割这种连接片段,就会产生 ecori 的单链末端。这种片段就
38、可以插入到任何 ecori 的限制性内切酶位点中16. 简述以黏粒为载体构建基因文库的原理。(1) cos 位点可以自身环化; (2)可以利用 cos 位点包装 l 噬菌体颗粒;(3)可以感染寄主细胞; (4)利用质粒复制子复制,不整合、不裂解。17. 酵母人工染色体要在酵母细胞中稳定存在,必须有哪些基本的结构? (1)着丝粒; (2)端粒; (3)ars 序列。18. 何谓 yac? 主要特性是什么?(1) 含有来自其他生物 dna 的酵母人工染色体,叫 yac; (2)主要特性是可以克隆较大的外源片段。19. muller 的 pcr 反应同大肠杆菌体内的 dna 复制有哪些不同?你认为根
39、本的差别在哪里?pcr 用双引物,体内复制用单引物。20. 欲将一真核生物的结构基因克隆后转移到原核生物(如 ecoli)中进行表达,克隆时应注意哪些问题?应注意的问题有:启动子、密码子、剪接、分泌。21. 假定你分离到一个 ecoli 的 thy- 突变体,并推测有可能是 thya 基因突变。请设计一个方案用 pcr 从染色体 dna 扩增突变的 thya 基因,测定突变的序列。(注:ecoli野生型的 thya 基因的序列是已知的)为了扩增突变体的 thya 基因,先设计一对引物,其中一个引物的序列与 thya 基因的5端相同,另一个引物同该基因的 3端互补。在引物的 5端加上合适类限制性
40、内切核酸酶的识别序列,以便于后来的克隆。将染色体 dna 同引物混合后,进行 pcr 扩增。然后进行琼脂糖凝胶电泳,纯化扩增片段,可以直接测序或克隆到合适的载体再测序。22. 你在做 southern 印迹分析,并且刚完成了凝胶电泳这一步。根据方案,下面一步骤是用 naoh 溶液浸泡凝胶,使 dna 变性为单链。为了节省时间,你略过了这一步, 直接将 dna 从凝胶转至硝酸纤维素膜上。然后用标记探针杂交,最后发现放射自显影片是空白。错在哪里?如果你的杂交探针是双链的,可能因为在加人杂交混合物之前忘记将探针变性而得到空白的放射自显影结果。23. 切口移位(nick translation)标记探
41、针的主要步骤有哪些? (1)dnasei 造成切口;(2) dna 聚合酶 iii 的 5 3外切核酸酶进行切割;(3) dna 聚合酶的 53合成酶进行修补;(4) 在修补过程中,随着切口(nick)的移动,将放射性的底物掺人到双链 dna 中。24. 用 ecori 和 hind 分别切割同一来源的染色体 dna,并进行克隆,在前者的克隆中筛选到 a 基因,但在后者的克隆中未筛选到 a 基因,请说明原因。原因是:hind的切点在 a 基因内。25. 什么是 western 印迹?它与 southern 印迹有什么不同?western 印迹是将蛋白质经电泳分离后从凝胶中转移到固相支持物上,然
42、后用特异性的抗体进行检测。它与 southern 的不同在于探针的性质不同,在 western 印迹中使用的探针是抗体(蛋白质)。26. 用一限制性内切核酸酶切割 lac+ tet+的质粒载体,已知该酶识别的是 4 个碱基序列, 并产生有两个碱基突出的单链末端,该酶在 lac 基因内有切割位点,并在第二个氨基酸密码子内,该位点可以被任何氨基酸所取代而不影响酶活性。用该酶切割后,用dna 聚合酶将单链末端补齐为双链的平末端,然后重新连接成环,转化 lac- tets受体菌,筛选 tetr 转化子,问:lac 的基因型是什么?并说明原因。基因型是 lac-原因是在该密码子中插入了两个碱基,造成了移
43、码突变,所以 lac 的基因是缺陷的。27. 在基因工程中,为了在细菌细胞中表达真核生物的基因产物,为什么通常要用 cdna而不用基因组 dna?为什么要在 cdna 前加上细菌的启动子?这是因为细菌没有内含子剪接系统,并且不能识别真核生物的启动子之故。四、问答题:1. 说明限制性内切核酸酶的命名原则要点。2. 什么是限制性内切核酸酶的星号活性?受哪些因素影向?3. 影响 dna 连接酶催化连接反应的因素有哪些?4. 什么是 klenow 酶?有哪些活性?在基因工程中有什么作 用 ? 5细菌碱性磷酸酯酶和小牛肠碱性磷酸酯酶有什么不同?在基因工程中有什么用途?6. 外切核酸酶(1ambdaexo
44、nuclease)基本活性是什么?在基因工程中有什么应用?7. mn2+、mg2+对 dnase i(deoxyribonuclease ?)的活性有什么影响?dnase i 在基因工程中有什么作用?8. 质粒如何维持在细胞中的稳定?9. 由于基因工程是人为改变遗传信息的操作,因此必须注意被操作基因的安全,进行严格的监控,质粒载体的安全性是十分重要的。请问质粒载体的安全条件包括哪几个方面?10. 为什么野生型的 l 噬菌体 dna 不宜作为基因工程载体?11. 什么是蓝白斑筛选法?12. 蓝白斑筛选法为什么也会有假阳性?13. m13 系列载体具有哪些优缺点? 14黏粒载体具有哪些特点与不足?
45、15. 辅助噬菌体 dna 和相应的噬菌粒是如何协同工作的?16. 如果知道某一基因的功能及其相应的蛋白质的氨基酸序列组成,可以通过何种方法克隆该基因?17. 什么是基因文库?18. 什么是基因组文库(genomic library)?构建基因组文库, 涉及哪些基本过程?它同遗传学上的基因库有什么不同?19. 什么是 cdna 文库(complementdnalibrary)?同基因组文库有何差别?20. 黏性末端连接法是最常用的连接方法,具有许多优点, 但是也有一些不足,请指出这些不足之处。 21什么是同聚物加尾连接法(homopolymer tails joining)?用何种方法加尾?具
46、有哪些优缺点?22. 何谓接头连接法(1inker ligation)?23. 什么是同裂酶?为什么说用同裂酶进行体外重组效率最高?24. 为了大量获得许多用于生化鉴定的产物,你想将拟南芥中的一个序列已知、编码单体酶蛋白的基因在单细胞微生物中表达,你如何确保最终能得到产物?25. 某一质粒载体具有 tetr 和 kanr 的表型,在 kan 抗性基因内有一 bgl i 的切点。现用bgli 切割该载体进行基因克隆,问:(1)转化后涂皿时应加什么样的抗生素?(2)培养后长出的菌落具有什么样的抗性基因型?(3)如何利用抗性变化筛选到含有插入片段的重组体?26. 以 pbr322 dna 作为载体,
47、从四环素抗性基因区克隆外源 dna 时,可采用环丝氨酸富集法筛选重组体,说明其基本原理和基本操作过程。27. 放射性抗体检测法(radioactive antibody test)的基本原理是什么?28. 什么是随机引物(random primer)?如何标记 dna? 29什么是印迹(blotting)杂交? 30什么是原位菌落杂交(colonyhybridization)? 31说明 southern 杂交的原理和方法。32. northern印迹与 southern印迹有什么不同? 33建立了一个基因文库后,如何鉴定一个携带目的基因的克隆?答案:1. 答:限制性内切核酸酶采用三字母的命名
48、原则,即属名+种名+株名的各一个首字母,再加上序号。基本原则:3-4 个字母组成,方式是:属名+种名+株名+序号; 首字母: 取属名的第一个字母,且斜体大写;第二字母:取种名的第一个字母,斜体小写;第三字母: (1)取种名的第二个字母,斜体小写;(2)若种名有词头,且已命名过限制酶,则取词头后的第一字母代替。第四字母: 若有株名,株名则作为第四字母,是否大小写,根据原来的情况而定, 但用正体。顺序号:若在同一菌株中分离了几种限制酶,则按先后顺序冠以i、等,用正体。2. 答:类限制酶虽然识别和切割的序列都具有特异性,但是这种特异性受特定条件的限制,即在一定环境条件下表现出来的特异性。条件的改变,
49、限制酶的特异性就会松动,识别的序列和切割都有一些改变,改变后的活性通常称第二活性,而将这种因条件的改变会出现第二活性的酶的右上角加一个星号表示,因此第二活性又称为星活性。概括起来,诱发星活性的因素有如下几种:(1)高甘油含量(5, vv);(2)限制性内切核酸酶用量过高(100uugdna);(3)低离子强度(25 mmoll);(4)高 ph(80 以上);(5)含有有机溶剂,如 dmso,乙醇等;(6)有非 mg2+的二价阳离子存在(如mn2+,cu2+,c02+,zn2+等)。3. 答:影响 dna 连接酶催化连接反应的因素有很多,但温度对连接反应的影响较大。黏性末端链通常以 12c 一
50、 15c 最好,这种温度有利于末端退火和连接酶的活性稳定。温度高了难以进行末端退火,低于上述温度会降低连接酶的活性。平末端连接以室温为宜,因为平末端连接不存在 dna 的退火问题,但是温度高于 30,连接酶特别不够稳定。平末端连接时连接酶的浓度要比黏性末端连接时高 10-100 倍。dna 中有残存的 trna 不会抑制 dna 连接酶的活性,但是,如果 nacl 的浓度高于 150mmoll, 则对连接反应有强的抑制作用。另外反应体系中有 nh4+离子的存在,对 ecolidna 连接酶具有激活作用。ecoli dna连接酶需要 nad+作辅助因子,而 t4 dna 连接酶需要 atp。4.
51、 答:klenow 酶是 1974 年 klenow 用枯草杆菌蛋白酶水解 dna 聚合酶 i,得到两个片段,其中大片段的分子量为 75kda,它具有 5-3聚合酶和 3-5外切核酸酶的活性,小片段具有 5-3外切核酸酶活性。由于大片段失去了 dna 聚合酶 i 中会降解 5引物的 5-3外切核酸酶的活性,所以在基因工程中更有用。klenow 酶主要有下列用途:(1) 修复反应,制备平末端可用 klenow 酶修复限制性内切核酸酶或其他方法产生的 5或 3突出末端,制备平末端, 这样可以使原来具有不相容的黏性末端的 dna 片段通过平末端重组。如在反应系统中加入放射性同位素标记的脱氧核苷酸,用
52、这种末端填补的方法可以制备 3末端标记的探针。用 klenow 酶修复 5突出末端的反应主要是利用了 klenow 酶的 dna 聚合酶活性,是填补反应;而修复 3突出末端则是用 klenow 酶的 3-5外切核酸酶的活性,是切割反应。用 klenow 酶的切割反应来修复 3突出末端是不理想的,改用 t4dna 聚合酶或其他的酶是更好的选择。(2) 标记 dna3突出末端(protruding end)该反应分两步进行:先用 3-5的外切核酸酶活性除去 3突出末端,产生 3隐含末端,然后在高浓度的标记底物( -32p-dntp)存在下,使降解(3-5)作用与聚合(5-3)作用达到平衡。这种反应
53、也叫交换或取代反应(exchangereplacement reaction)。不过这一反应用t4dna 聚合酶的效果更好,因它的 3-5外切核酸酶活性较强。(3) 其他的一些用途:包括用双脱氧末端终止法进行 dna 序列分析、用于 cdna 第二链的合成、在定点突变中用于合成第二链、用引物延伸法(primer extension)制备单链dna 探针等。5. 答:主要差别是:cip68c 时失活,而 bap68c 稳定,且耐酚抽提。应用: (1) dsdna 的 5端脱磷酸,防止 dna 的自身连接。但是用 cip 处理后,最好将 cip 除去后,再进行连接反应。(2)dna 和 rna 脱
54、磷酸,然后用于多核苷酸激酶进行末端标记。6. 答:外切核酸酶是从 噬菌体感染的 ecoli 中分离纯化的,能够从双链 dna 上依次切下5 单核苷酸,作用底物是双链 dna 的 5磷酸末端,不能切割羟基化 5端。该酶虽然能切割单链 dna,但效率较低(下降 200 倍)。不能切割带切口或缺口的 dsdna。该酶作用时是行进性的,一步一步进行的。在基因工程中主要用于除去双链 dna 突出的 5末端,以便让末端转移酶加尾。7. 答:dnase i 是一种内切核酸酶,在 mg2+存在下,dnase i 随机切割 dna 两条链中的任意一条链;当 mn2+代替 mg2+时,dnasei 几乎是在双链 dna 两条链相对的位置上打开缺口,使双链 dna 断裂,产生的末端几乎是平末端或只突出 12 个核苷酸的dna 片段。dnase i 有许多用途:(1)在切口移位标记中,制造切口;(2)在足迹法中保护 dna; (3)除去 rna 制备物中的 dna;(4)体外转录中除去 dna 模板;(5)检测染色体中的转录活性区;(6)产生可在噬菌体 m13 载体上进行测序的随机克隆。8. 答:质粒通过以下几种机制维持在细胞中的稳定:(1) 多聚体质粒的
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