（有机化学专业论文）核酸自由基性质和损伤机理的量子化学研究.pdf

摘螫 摘要 核酸是生物体中遗传物质的分子载体，在生命过程中起着+ 常重要的作用。 自由基和电子转移导致生物体系核酸的断链损伤，导致衰老、癌症、心血管、神 经紊乱等多种疾病的发生。因此，深入细致地研究核酸及其自由基与损伤中间体 的物化性质、研究因自由壁和电予转移诱导的d n a 损伤与癌症等疾病的关系， 是当前生物物理有机化学、化学生物学、生物医学等领域中最热门的f i 沿课题之 一。但由于实验条件和研究对象的限制，采用量子理论化学方法研究核酸就显得 ：犯常必要。 本沦文跗饮酸叭l 琏、捞i 伤中间体的物化性质及损伤帆理等进行了深入的研 究，本文的主要研究工作如下： 丌发一个新的商精度组合从头算方法( o n | o m g 3 8 3 ) ，通过对1 7 9 个有机化 合物c h ，n h ，o h 键离解能的理论计算，发现o n i o m g 3 8 3 方法可以准确颅 测各类有机化合物的键解离能，精度达到1 4k e a l m o l 。此方法为精确颅测各种 分子餐较大的有机化合物及生命体系的化合物的键解离能值提供了可行性。 确定了生物体系中存在较多的核苷和脱瓴核营的构型，这足对核= f j ：和脱氧核 = f ；f ：进行1 1 e 沦研究的基础；准确预测了核苷和脱辑孩e r 糖环及碱基上的c h 和n h b d e 值，核酸作为生命科学中蕈要的一类化合物，给出全部精确可靠的键解离 能值具有非常重要的意义；提出的合理的损伤机理帮助我们更好了解损伤与疾病 的关系。 确定了d n a 片段3 ，5 - 二磷酸脱氧核营及其阴离子r n a 片段中3 ，5 - 二磷 酸核苷和一2 价的3 ，5 二磷酸核苷阴离子的几何构型，研究讨论了3 ，5 位磷酸攮 团和水溶液对糖环不同位置炭自由基相对稳定性的影响，研究发现阴离子磷酸基 团( 一o p 0 3 h 。) 是比o h 基团更好的自由基稳定基团，然而中性磷酸基团( 一o p 0 3 h 2 ) 是比o h 基团更差的自由基稳定基团。另外发现磷酸基的存在显著降低核苷 c ：h 的b d e 值，为夺氢反应最易发生在糖环c 2 位的实验现象提供了理论支持。 开发了一种新的理论方法准确可靠地计算水相中d n a 和r n a 链在损伤过 中同科学技术大学博i j 学位论文 程产生的中性或者自由基残基化合物的标准氧化还原电动势值，提供一套完整的 d n a 和r n a 链损伤过程产生的中性或者自由基残基化合物的水相中的标准氧 化还原电动势图表，根据图表，深入研究讨论了生物体系内因电子转移反应导致 的d n a 和r n a 链损伤的合理机理。 抗氧化剂作为自由基清除剂，在抑制因自e h 基氧化引起的损伤过程中起至关 重要的作用。通过高精度计算方法准确预测了十类非常重要的抗氧化荆的键解离 能值，研究了各类抗氧化剂的构效关系和自由基作用机理，纠正了| ； 人的一些误 解，对新型高效的抗氧化剂药物的结构进行合理预测，提出合理的结构活性关系， 帮助设计合成新型更高效的抗氧化剂。 基于量子化学理论方法的第性原理，其计算结果是可靠的，同时它不受实 验条件的限制，可以解决一些通过实验手段难以解决的l u j 题。本论文的研究成果， 会对自由基生物学和接斟治疗学的发展提供有价值的基础资料。 关键词：核酸，核苷，脱氧核肾，自由基，键解离能，氧化还原电动势，抗氧化 剂 i i 摘望 a b s t r a c t n u c l e i ca c i d sa r ew e l l k n o w nt ob et h em o l e c u l a rc a r r i e r so fh e r e d i t a r y i n f o r m a t i o ni nl i v i n go r g a n i s m s ，a n dp l a yav e r yi m p o r t a n tr o l ei nl i f ep r o c e s s i n a d d i t i o n ，f r e er a d i c a l sp l a yas i g n i f i c a n tr o l ei nt h eo x i d a t i v ed a m a g i n gt od n a ， a m i n oa c i d s ，p r o t e i n s ，a n dm e m b r a n el i p i d s a c c o r d i n g l yt h e ya r ed e e p l yi n v o l v e di n m a n yi m p o r t a n tc h e m i c a la n db i o l o g i c a lp r o c e s s e ss u c ha sa g i n ga n dan u m b e ro f h u m a nd i s e a s e s i n c l u d i n gc a n c e r ，c a r d i o v a s c u l a rd i s e a s e ，a n d n e u r o l o g i c a l d y s f u n c t i o n s ，t h e r e f o r e ，t or e s e a r c ht h ep h y s i c o c h e m i c a lp r o p e r t i e so fn u c l e i ca c i d s a n dc o r r e s p o n d i n gr a d i c a l s ，a n dt or e s e a r c ht h er e l a t i o n sb e t w e e nd n al e s i o ni n d u c e d b ye n d o g e n o u sf l e er a d i c a l sa n dd i s e a s e s ( c a n c e ra n ds oo n ) a r eo n eo ft h em a i n d i r e c t i o n si nt h ea r e ao fm o d e r nb i o p h y s i c a lo r g a n i cc h e m i s t r y , b i o c h e m i c a la sw e l la s b i o m e d i c a l h o w e v e rf o rt h er e a s o no fl i m i t a t i o no f e x p e r i m e n t a lc o n d i t i o n sa n dl a c k o fe x p e r i m e n t a lm e t h o d s ，i ti sv e r yn e c e s s a r ya n di m p o r t a n tt or e s e a r c hn u c l e i ca c i d s b ym e a a so fq u a n t u mc h e m i s t r yt h e o r e t i c a lm e t h o d t h i sd i s s e r t a t i o nf o c u s e so an u c l e i ca c i d sa n dc o r r e s p o n d i n gr a d i c a l s ，a n dd e e p l y s t u d yp h y s i c o c h e m i c a lp r o p e r t i e so fr i b o n u c l e o s i d e sa n dd e o x y r i b o n u c l e o s i d e sw i t h t h e i rr a d i c a l s ，a n dl e s i o nm e c h a n i s m t h er e s e a r c ht o p i c sa r ea sf o l l o w s w ed e v e l o pan e wc o m p o s i t ea bi n i t i om e t h o do n i o m g 3 8 3w h i c hi se v a l u a t e d a g a i n s t17 9e x p e r i m e n t a lc h ，o ha n dn hb o n dd i s s o c i a t i o ne n t h a l p i e so fd i v e r s e o r g a n i cm o l e c u l e st ov e r i f yt h e i rp e r f o r m a n c e i ti sf o u n dt h a tt h eo n i o m g 3 8 3c a n b e u s e dt o r e l i a b l yp r e d i e tt h eb o n dd i s s o c i a t i o ne n t h a l p i e s o fd i v e r s eo r g a n i c c o m p o u n d s ，a n dt h ea c c u r a c yi sa b o u t1 4k c a l m 0 1 u s i n gt h i sm e t h o d ，i ti sf e a s i b l e t oa c c u r a t e l yp r e d i c tt h eb o n ds t r e n g t ho fv a r i o u ss i z a b l em o l e c u l e sr a n g i n gf r o m n a n o s i z em o l e c u l a rd e v i c e st ob i o l o g i c a l l ys i g n i f i c a n tc o m p o u n d s w eo p t i m i z ed e o x y r i b o n u c l e o s i d e ss t a r t i n gf r o mac o n f o r m a t i o ni d e n t i c a lt ot h e bf o r mo fd n aa n dr i b o n u c l e o s i d e ss t a r t i n gf r o mac o n f o r m a t i o ni d e n t i c a lt ot h ea l l 中闺科学技术人学搏e 学位论文 r n af o r mw h i c ha r ec o n s i d e r e dt h em o s ti m p o r t a n to n ef o rb i o l o g i c a ls y s t e m s f r o m t h e s ec o n f o r m a t i o n s ，t h ea d v a n c e dt h e o r e t i c a lr e a s e a r c hc a ng oo n i na d d a t i o n a l ， u s i n gt h eo n i o m g 3 8 3m e t h o d ，af u l ls c a l eo fc ha n dn hb d e sw e r eo b t a i n e d f o rt h ef i r s tt i m ef o rr i b o n u c l e o s i d e sa n dd e o x y r i b o n u c l e o s i d e sw i t ha ne s t i m a t e de r r o r b a ro f 1 4k c a l m 0 1 n u c l e o s i d e sr e p r e s e n to n eo ft h em o s ti m p o r t a n tg r o u p so f c o m p o u n d si ns c i e n c e af u l l s c a l eo fr e l i a b l eb o n dd i s s o c i a t i o ne n t h a l p i e sf o r n u c l e o s i d e si so ff u n d a m e n t a li m p o r t a n c e w ea l s oo p t i m i z ed e o x y r i b o n u c l e o s i d e3 ，5 一b i s p h o s p h a t e s ( i nb o t hn e u t r a la n d n e g a t i v ep a t t e r n s ) s t a r t i n gf r o mac o n f o r m a t i o ni d e n t i c a lt ot h ebf o r mo fd n a a n d r i b o n u c l e o s i d e3 ，5 一b i s p h o s p h a t e s ( i nb o t hn e u t r a la n dn e g a t i v ep a t t e r n s ) s t a r t i n g f r o mac o n f o r m a t i o ni d e n t i c a lt ot h ear n af o r m ，w h i c ha r ec o n s i d e r e dt h em o s t i m p o r t a n to n ef o rb i o l o g i c a ls y s t e m s c h o s i n gn u c l e o s i d e3 5 一b i s p h o s p h a t e s a s m o d e lc o m p o u n d sf o rd n aa n dr n a ，w ef u l l ys t u d yt h ee f f e c t so fb o t ht h ey , 5 p h o s p h o r y l a t i o ng r o u pa n dw a t e ro n r e l a t i v es t a b i l i t i e so fr i b o n u c l e o s i d e sa n d d e o x y r i b o n u c l e o s i d e ss u g a rr a d i c a l s i tw a sf o u n dt h a tt h ea n i o n i cp h o s p h a t eg r o u p ( 一o p 0 3 h 。) w a sab e t t e rr a d i c a ls t a b i l i z a t i o ng r o u pt h a nt h eo hg r o u p ，w h e r e a st h e n e u t r a lp h o s p h a t eg r o u p ( 一o p 0 3 t t 2 ) w a sas i g n i f i c a n t l yw o r s er a d i c a ls t a b i l i z a t i o n g r o u p t h a n o h s t r i k i n g l y , t h e b o n dd i s s o c i a t i o nf r e e e n e r g y o fc 2 一hi n r i b o n u c l e o t i d e sw a sd r a m a t i c a l l yl o w e rt h a nt h a to fa l lt h eo t h e rc hb o n d sb y5 - 6 k c a l m o l r e g a r d l e s so ft h ep h o s p h o r y l a t i o n s t a t ea n dt h ec h a r g ec a r r i e db yt h e p h o s p h a t eg r o u p w ed e v e l o pan e wm e t h o dc o s m o r s c p c m u a h ft oa c c u r a t e l yp r e d i c t t h e s t a n d a r dr e d o xp o t e n t i a l so fi n t e r m e d i a t e si nt h el e s i o np r o c e s so fd n aa n dr n a i n a q u e o u ss o l u t i o n s u s i n gt h i sm e t h o d ，w ep r e d i c tt h es t a n d a r dr e d o xp o t e n t i a l so f a l m o s ta l lt h ei n t e r m e d i a t e s f r o mt h e s er e u s t s ，t h ea d v a n c e ds t u d yo nt h em e c h a n i s m o fd n aa n dr n al e s i o np r o c e s so c c u r r e db ye l e c t r o n - t r a n s f e rr e a c t i o n i n b i o s y s t e m s r a d i c a l s c a v e n g i n ga n t i o x i d a n t sp l a yap i v o t a lr o l ei nt h ei n h i b i t i o no fo x i d a t i v e d a m a g eb yt h ef r e er a d i c a l s u s i n gt h en e w l y d e v e l o p e do n i o m - g 3 8 3m e t h o d ，t h e i v 摘要 b o n dd i s s o c i a t i o ne n t h a l p i e s ( b d e s ) o ft e nc l a s s e so fp o p u l a ra n t i o x i d a n t sw e r e s y s t e m a t i c a l l y s t u d i e d t h e s ea n t i o x i d a n t si n c l u d e d c o e n z y m eq ，f l a v o n o i d s ， c u r c u m i n s ，o l i v e s ，i n d o l i n o n i c h y d r o x y l a m i n e s ，p h e n o t h i a z i n e s ，e d a r a v o n e s ， c o m m e r c i a la n t i o x i d a n t su s e da sf o o da d d i t i v e s ，v i t a m i nea n dc a t e c h i n s t h e s t r u c t u r e a c t i v i t yr e l a t i o n s h i p s f o rv a r i o u sc l a s s e so fa n t i o x i d a n t sa n dr a d i c a l s c a v e n g i n gm e c h a n i s ma r es t u d i e d ，a n ds o l v es o m ec o n t r o v e r s i e sf r o mt h ee a r l i e r l i t e r a t u r e s ，w h i c hw o u l db eu s e f u lf o ru st op r e d i c tt h es t r u c t u r eo fn e wa n de f f e c t i v e a n t i o x i d a n t sa n dp r o v i d eh e l pi nt h ed e s i g no fn o v e la n t i o x i d a n t sw i t hi m p r o v e d a c t i v i t i e s l h e o r e t i c a l q u a n t u mc h e m i c a ls t u d yi sr e l i a b l e b e c a u s eo fi t sf i r s t p r i n c i p l e t h e o r e t i c a ls t u d i e sc a nr e s o l v et h ep r o b l e m sw h i c ha r ed i f f i c u l to ri n a c c u r a t ei n e x p e r i m e n t s t h c r e s e a r c hr e s u l to ft h i sd i s s e r t a t i o n p r o v i d e s v a l u a b l ea n d f u n d a m e n t a li n f o r m a t i o nt ot h ed e v e l o p m e n to ff l e er a d i c a lb i o l o g ya n dg e n et h e r a p y k e y w o r d s ：d n a ，r n a ，r i b o n u c l e o s i d e ，d e o x y r i b o n u c l e o s i d e ，r a d i c a l ，b d e ，r e d o x p o t e n t i a l ，a n t i o x i d a n t v 图表索0 图表索引 图l i 脱氧核酸结构单体2 | c ii - 2 核酸结构垃变2 图1 - 3d n a 结构的般螺旋模式5 翻i - 4d n a 结构的多态性6 图i - 5d n a 超螺旋结构8 | 鍪l 卜6d n a 特环上的7 个氢原子0r n a 糖环上的6 个氢原子i o 幽1 7 百种基本碱基被修饰位置1 0 i | 1 8 被修饰的碱基化俞物l l 图2 1o n i o m 三层分层模型2 0 图2 - 2 实验和b 3 l y p 6 - 3 i g ( d ) 方法计算的键解离能的线性拟合i ! i 2 8 图2 3 实验和o n l o m g 3 8 3 方法计算的键解离能的线性拟含圈2 8 i 餐l3 - i 核纾和脱氧饮曲的分f 结l 勾“3i i 鍪| 3 - 20 5 三种忙瓮3 2 图3 - 3d t 蒲id c 的二种构啦- ”3 3 1 5 i3 - 4s c h a e f e ri ：作与本文j f ：作的键k , t ：i i j , t l 角的比较3 5 图3 5r a 屑lr c 的二种构删”3 6 幽3 - 6 四种脱氧核的构删确定3 7 图3 7 四种核1 午丰句j i i ! 确定一3 8 图4 i 3 ，5 - 二磷酸脱氧核和2 价3 ，5 - 二磷酸脱氧核营阴离子j i a 1 构趔一4 3 剀4 - 2 九种构j 弘分布图4 5 图4 3 u 种3 。5 - 一：磷艘脱瓴核计母体构，幔4 6 图4 4四种负| 二价3 ，5 - ：磷酸脱氧核什阴离子母体构玳4 7 幽4 5 3 ，5 二：磷酸核苷用j 2 价3 ，5 - 二- ：磷酸核纾阴离f 几何构j 睁4 8 图4 - 6 四种3 ，5 - - 二磷酸核抒母体构，性4 9 幽4 7 p _ _ t l 平l p 负二价3 ，5 - 一：磷酸核：盱阴离_ 产 士体构型5 1 i 璺| 4 - 8 叫种脱氧核【f 张环c h 相舯b d e 值年相对g 。债5 3 图4 - 9 四种3 ，5 - 二二磷酸脱氧核：【：j ：桃环c h 相对b d e 值和相对g 。值5 4 图4 1 0 阴种负二价3 ，5 一二磷酸脱氧核f j ：糖环c h 相对b d e 值耵l 相对g 。值5 6 图4 一l l 脱氧腺苻、3 ，5 - - - 磷酸脱氧腺阡和一2 价3 ，5 - 二磷酸脱氧腺曲：阴离子糖环 c - h 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，l a t m ) 厢l 水相中a g a q ( 2 9 8 1 5 k ，l m o l l ) 值5 8 幽4 1 2 脱氧胞纾、3 ，5 - 二：磷酸脱氧胞f f 和一2 价3 ，5 - 二磷酸脱氧胞纾阴离子精环 c h 气牛 | b d e ( 2 9 8 1 5 k ，l a l m ) 1 手l l 水相中a g 。( 2 9 8 15 k ，1 r e e l l ) 值5 9 图4 1 3 脱氧鸟苻、3 ，5 - 二磷酸脱氧与苷和2 价3 ，5 二磷酸脱氧呜苷阴离子糖环 c 一 l 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，l a r m ) 和水相中a g 。a ( 2 9 8 1 5 k ，1 m o l ，l ) 值5 9 翻4 1 4 脱氧胸【f 、3 ，5 - 二- ：磷酸脱氧胸n ：静i 2 价3 ，5 - 二磷酸脱氧胸苻阴离子糖环 c h 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，1 a t m ) $ j l 水卡h 中a g 。( 2 9 8 1 5 k ，l m o l l ) 值6 0 图4 一1 5 四类脱氧核苷气相中各c hb d e 值和水溶液中a g 。值”6 l 斟4 1 6 四类3 ，5 一二磷酸脱氧核：c j ：气相中备c h b d e 值= f i i 水溶液中g 。值6 2 幽4 一1 7 四类负二价3 ，5 一二：磷酸脱氧核圩气相中各c hb d e 值和水溶液中g 。值 6 2 l x 中冈科学技术人学博l ：学位论文 x 幽4 一1 8 四种核营格环c h 相对b d e 值和相对a g 。值6 4 图4 1 9四种3 ，5 - 二磷酸核茁糖环c h 相对b d e 值和相对g 。值”6 5 幽4 2 0 负二价3 ，5 - 二磷酸四种核前糖环自由基相对b d e 值和相对g 。值6 6 图4 - 2 l腺营、3 ，5 - 二磷酸腺督和2 价3 。5 - 二二磷酸腺苗阴离子糖环c h 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，k n m ) | l 巾：相中a g 。( 2 9 8 1 5 k ，l t o o l l ) 值- 6 8 图4 2 2 胞营、3 ，5 - 二磷酸胞茁_ 手| i 2 价3 ，5 - 二二磷酸胞t j ：阴离子雅环c h 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，l a t m ) 平l l 水相中a g 。( 2 9 8 1 5 k ，i m o l l ) 值”6 8 剧4 2 3乌苷、3 ，5 - 二磷酸鸟苗和2 价3 ，5 - 二二磷酸鸟苻阴离子糖环c h 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，l a t m ) 雨l 水相中a g 。( 2 9 8 1 5 k ，l m o l l ) 值6 9 图4 2 4 尿前、3 ，5 - 二磷酸尿蜉和一2 价3 ，5 - 二磷酸尿【j = 阴离子糖环c h 气相b d e ( 2 9 8 1 5 k ，i a t m ) l l 水相中a g ( 2 9 8 1 5 k ，i t o o l l ) 值6 9 图4 - 2 5 四类核营气相中并c hb d e 值和水溶液中a g 。值“7 1 图4 - 2 6四类3 ，5 - 二磷酸核苜气相中各c hb d e 值和水溶液中ag 。值7 2 图4 2 7 四类- 2 价3 ，5 - 二磷酸核茁阴离子气相中各c hb d e 值和水溶液中g 。值 一- 。- - - ，- t - - - 7 3 幽4 2 8 脱氧核苻糖环不同位置c h 相对b d e 值7 4 j 1 6 | 4 - 2 9 核f = = 糖环不川位置c h 相对b d e 值7 4 幽5 1 核酸【岜化学府川的示意幽r 8 l f i5 2 水溶液l 】氧化还原反应的热力学循环图8 4 圈5 3 水溶液中考虑p h 值影响的氧化还原反麻的热力学循环幽8 5 图5 - 4计算还原电动势( c o s m o r s ，c p c m u a h 哨实验值的线中1 才以合8 7 图5 5 验证集合化合物的理论还原【乜动势与实验值的线性拟合”9 0 图6 1 泛配化合物结构一9 9 图6 - 2 异蓝酮类化合物结构1 0 0 图6 3 橄榄油l p 生物酚的结构1 0 3 幽6 4c m c u m i n 拥天化俞物结构“1 0 5 吲6 ，5j j 泛_ 【 j ：食- 铺漆加荆的四种酚类抗氧化剂结构1 0 6 图6 - 6i n d o l i n o n i ch y d r o x y l a m i n e 及其衍生物结构1 0 7 图6 7 吩噻嗪类化台物的结构1 0 9 图6 - 8e d a r a v o n e 及其衍生物结构1l o 幽6 - 9 维，l ；= 素e 族化合物的分f 结构ii l 图6 1 0 茶多酚类化合物的分子结构1 1 4 图6 - l l各种类玳抗氧化剂的b d e 值1 1 6 表i l 核精年脱氧核糖组成一2 表2 - lo n i o m g 3 8 3 理论方法详细步骤2 0 表2 - 25 3 个重原f 数在15 2 8 之问的化合物的理论年i i 实验c hb d e 值( k e a l m 0 1 ) 2 1 袭2 - 32 1 个苯胺类化台物和其它化合物的理论和实验n h 键解离能( k c a l m 0 1 ) 。2 3 袁2 - 41 0 2 个苯酚类化合物_ 手i i3 个非盼类化合物理论和实验o h 键解离能2 4 表3 - 1 核营和脱氧核苻抓角定义3 i 表3 - 2d t 和d c 三种构玳能镀3 4 表3 3 前人1 ：作与本文i ：作的脱氧核舒参数比较。3 4 表3 - 4r a 和r c 三种构删能最3 6 幽表索0 袭3 - 5前人：r 作与本文i ：作的核苷参数比较3 7 表3 - 6o n i o m g 3 8 3 预测的脱氧核营的c h 和n hb d e 值( k c a l m 0 1 ) 3 8 表3 7o n l o m ，g 3 8 3 预测的核茁的c h 平| in hb d e 值( k c a l m 0 1 ) ( k c a l m 0 1 ) 3 9 表4 。l四种3 。5 - 二磷酸脱氧核抒构，性的相对能繁( k c a l m 0 1 ) 4 6 表4 2四种负二价3 ，5 - 二二磷酸脱氧核苛构删阴离子的相对能量( k c a l m 0 1 ) 4 7 表4 3 四种3 。5 - 二磷酸核计构型的相对能量( k c a l m 0 1 ) 4 9 表4 _ 4 四种负二价3 ，5 - 二磷酸核1 f 构j 鹌阴离子的相对能龌( k c a l m 0 1 ) 5 0 表4 5 脱氧核督b d e 值( 2 9 8 1 5 k ，i a t m ) 及a g 。( 2 9 8 1 5 k ，1 m o l i ) ( k c a l m 0 1 ) 5 3 表4 6 3 ，5 - 二二磷酸脱氧核苻b d e 值( 2 9 8 1 5 k , 1 a t m ) 及g 。( 2 9 8 1 5 k ，1 m o l i ) ( k c a l m 0 1 ) 5 4 表4 - 7 负二价3 ，5 - 二二磷酸脱氧核苷b d e 值( 2 9 8 1 5 k ，l a t m ) 及ag 。( 2 9 8 1 5 k , l m o l 1 ) ( k c a l m 0 1 ) 5 6 表4 8 核纾c h b d e 值( 2 9 8 1 5 k ，1 a t m ) 及g 。( 2 9 8 1 5 k ，1 m o l i ) 6 3 表4 - 93 ，5 - 二磷酸核廿c hb d e 值( 2 9 8 1 5 k ，i m m ) 及ag 。( 2 9 8 1 5 k ，l m o l 1 ) 6 5 表4 一1 0 负二价3 ，5 - 二磷酸核苗c h b d e 值( 2 9 8 1 5 k ，l a t m ) 及a g 。( 2 9 8 1 5 k ，1 m o l 1 ) ，6 6 表4 一i l 模趔化合物c hb d e 值( k c a l m 0 1 ) 及 1 旋密度分布7 5 表4 一1 2 模耻化合物1 3 的c 2 hb d e 值( k c a l m 0 1 ) 7 7 表4 一1 3m p 2 6 3 l l + + g ( 3 d f , 3 p d ) m p 2 6 3 l + g ( d ) 方法得剑的氧键f l - ：；i jk c a l m 0 1 ) 7 8 表5 1不同溶剂化模，弘汁算的给定d h 值下的标准还原电动辨8 6 表5 2 不理论方法计解的化合物还原r h 动势与实验值的线性相笑系数及i 跫第8 7 表5 - 3 验证集合化合物的计算年实验标准还原电动势3 ( v s n h e ，e v ) 8 8 表5 4 水溶液中p h 为7 年“1 2 条件f 1 i 种基本核酸碱展的氧化还原电动势8 ( n h e ，e v ) ，9 1 辰5 5 水溶液中p h 为7 年| j 1 2 条什f 常见损伤中m 体的氧化还原l u 动势( n h e ，e v ) 9 2 农6 一l o n l 0 m ，g 3 8 3 计算的u b i q u i n o lo hb d e t ( k c a l m 0 1 1 a t m2 9 8 k ) 一9 9 表6 2o n i o m ，g 3 8 3 计算的藏酮类化含物o hb d e l ( k c a l m o l ，i a t m2 9 8 k ) 1 0 1 表6 3o n i o m g 3 8 3 讨。算的汕橄榄生物酚o 1 ib d e 值( k c a l m o l 。i a r m2 9 8 k ) 1 0 3 表6 4o n i o m g 3 8 3 计算的类姜萸索化合物o ( c ) hb d e 值( k c a l m 0 1 ) 1 0 5 表6 5o n i o m g 3 8 3 计算的四种酚类化合物o hb d e 值( k c a l m 0 1 ) 1 0 7 表6 6o n l o m g 3 8 3 计算的i n d o l i n o n i ch y d r o x y l a m i n e 及其衍生物o hb d e 值 ( k c a l m 0 1 ) l ( ) 8 表6 7o n i o m g 3 8 3 计算的p h e n o t h i a z i n e 及j f f 荚化合物n hb d e 值( k c a l m 0 1 ) 1 0 9 表6 8o n i o m g 3 8 3 计算的e d a r a v o n e 及其衍生物b d e 值( k c a l m o l l 1 ll 表6 - 9 维，上素e 族化合物的理论计算和实验键解离能( k c a l m 0 1 ) 1 1 2 表6 1 0 茶多酚类化合物理论计贸= 平实验键解离能( k c a l m 0 1 ) 1 1 4 x i 中国科学技术大学学位论文相关声明 本人声明所呈交的学位论文，是本人在导师指导下进行研究 工作所取得的成果。除已特别加以标注和致谢的地方外，论文中 不包含任何他人已经发表或撰写过的研究成果。与我一同工作的 同志对本研究所微的贡献均已在沦文中作了明确的说明。 本人授权中国科学技术大学拥有学位论文的部分使用权， 即：学校有权按有关规定向国家有关部门或机构送交沦文的复印 件和电子版，允许论文被查阅和借阅，可以将学位论文编入有关 数据库进行检索，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、 汇编学位论文。 保密的学位论文在解密后也遵守此规定。 作者签名：查邀：盘 加唧年3 月e t 第1 章绪论 第1 章绪论 1 8 6 8 年，瑞士的内科医生f r i e d r i c hm i e s c h e r 从外科医院包扎伤口的绷带上 的脓细胞核中提取到种富含磷元素的酸性化合物，将其称为核质( n u c l e i n ) ；后 来他又从鲭鱼精子中分离山类似的物质，并指出它是由一种碱性蛋白质与种酸 性物质组成的，此酸性物质即是现在所知的核酸( n u c l e i ca c i d ) 。1 9 4 4 年o s w a l d a v e r y ，