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文档简介

多序列比对及 系统发生树的构建, 邹长江,主要目的：,了解分子进化及系统发育分析 掌握多序列比对方法 熟悉系统发育树建立方法 掌握用Mega软件进行构建系统发育树,系统发生（phylogeny）是指生物形成或进化的历史 系统发生学(phylogenetics)研究物种之间的进化关系 系统发育树（phylogenetic tree）描述物种之间进化关系,系统发育树（phylogenetic tree）又称evolutionary tree进化树)就是描述这一群有机体发生或进化顺序的拓扑结构。它可以用来研究不同物种间的进化关系，这一直是生物学的研究热点。 拓扑（Topology）将讨论范围内的事物之间的相互关系表示出来，将这些事物之间的关系通过图表示出来。,两个临近的分支的连接处称为节点（node）,表示推断祖先的现存类群在树最底部的分支点成为根节（root node）, 一个单一的共同的祖先被定义为进化支（clade）或者单源群（monophyletic group） 树的分支模式被成为拓扑结构（tree topology）,系统发育树建立方法,NCBIBLAST输入序列对比记录好以下几方面： 名 称： Uncultured bacterium clone YU201H10 序列号： FJ694683 /FJ694514 文 献： TITLE Circumpolar synchrony in big river bacterioplankton 序列长度：353 相 似 比： 99% 核酸序列 分类地位,Mega下载地址,没有一种方法能够保证一棵系统发育树一定代表了真实进化途径。然而，有些方法可以检测系统发育树检测的可靠性。 第一，如果用不同方法构建树能得到同样的结果，这可以很好的证
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