真菌类四分子分析与作图.ppt

Chap 7 真菌类四分子分析与作图,一.真菌作为遗传学材料的优势 二.四分子分析 三.着丝粒作图 四.分类,一. 真菌作为遗传学材料的优势,真菌是一种单倍体 （无显隐之分，通过表型即可 推 出基因型） 分析一次减数分裂的产物 较 二倍体简单 可进行无性繁殖，且周期短,二.四分子分析,四分子分析： 是对四分子孢子进行遗传学的分析 顺序四分子： 第一个孢子来自于一条染色单体，第二个孢子来自于这条染色单体的姐妹染色单体，第三、四个孢子来自于前一条染色体的同源染色体的姐妹染色单体,二.四分子分析,三.着丝粒作图 (染色体作图的一种特例),着丝粒作图： 利用四分子分析法，测定基因与着丝粒间的 距离称为着丝粒作图,顺序四分子可记录着丝粒的行为 (减数分裂期着丝粒没分裂，减数分裂期着丝粒发生分离。) 顺序四分子记录了减数分裂的过程。 （姐妹染色单体发生分离，减二后期，着丝粒分开）,一对基因的染色体作图,材料：粗糙脉孢霉 有两种不同接合型的脉孢菌菌株： 一种是能合成赖氨酸(lysine)的野生型菌株(记作lys+，或+)， 该菌株成熟的子囊孢子呈黑色。 另一种是赖氨酸缺陷型(记作lys - 或- )，这种菌株的子囊孢子成熟较迟，呈灰色。,将这两种菌株杂交： 杂种子囊减数分裂的产物根据黑色孢子和灰色孢子的赖氨酸 缺陷型(lys-) 野生型(lys+)， 排列次序可有6种子囊型，其计数的结果：,子囊类型 1 2 3 4 5 6 + - + - + - + - - + - + - + + - - + - + - + + - 数目 105 129 7 5 10 16 分类 MI MI M M M M,M模式： 即在减数分裂期带有lys+的两条染色单体移向一极，而带有lys-的两条染色单体移向另一极，即lys+/lys-这对基因在减数分裂就发生分离。,M模式： 由于lys+/lys-这对基因与着丝粒发生了一次单交换，所以在减数分裂这对基因没有发生分离，而分离发生在减数分裂期，即姐妹染色单体发生分离的的时期。,M模式图（仅代表一种可能）,M模式（仅代表一种可能）,重组率 RF(+lys)= M /(M +M1 ) 0.5100%,两对基因的染色体作图,1、利用顺序四分子分析，同样可以进行两个基因的连锁作图 nic（nicotinic acid）为烟酸依赖型 n ade（adenine） 为腺嘌呤依赖型 a 2、不考虑同源染色体随机趋向，不考虑姐妹染色单体趋向 3、两对基因的杂交实验，可产生(66)36种不同的子囊型，归纳为7种基本的的子囊型,序号 1 2 3 4 5 6 7 子囊型+ a + + + + + a + a + + + + + a + + + a n a n + n a n a n + n a n + + + + a + + + a n + n a n a n + n + n a n + 分离 类型 MIMI MIMI MIMII MIIMI MIIMII MIIMII MIIMII 类别 PD NPD T T PD NPD T 数目 808 1 90 5 90 1 5,四.归类与重组率,1.归类 （1）分裂分离模式：MI MII MI：非交换 + + - - - - + + MII :发生交换 + - + - - + - + + - - + - + + -,（2）四分子类型 亲二型（PD）：即有两种基因型与亲本一样。 非亲二型(NPD)：即有两种基因型与亲本不一样。 T型：四种中有两种与母本一样。,2、是否连锁： 亲本重组， 即 PDNPD,3、计算重组率,判断是否同臂,n、a在染色体上的排列可能有两种方式： 在着丝粒的同侧或者是异侧 有三种方法判断，分别如下：,（1）通过计算n与a两个基因间的重组率与着丝粒与他们的单个距离做对比 0.5T+NPD RF（na）= 100%=5.2% ,5.2CM PD+NPD+T 5.055.2=10.259.3 由此可知：n与a同臂,（2）通过PD与NPD的频率 如果n、a在异侧上，则PD与NPD都是由双交换形成，因而PD与NPD的频率相等。但是，上表的实验数据显示，同处MM的PD子囊数为90，同处MM的NPD子囊数为1。 即PD多于NPD，即n与a同侧,（3）通过子囊（5）（6）来判断 若子囊数（5）=（6），则为异臂； 若子囊数（5）（6），则为同臂。,4、被低估的重组率 A: RF(n)=0.5(4)+(5)+(6)+(7)/总数 100% B: RF(a)=0.5(3)+(5)+(6)+(7)/