第七章-拟合优度检验-(1).ppt

1、第七章拟合优度检查，教育目的要求，把握：拟合优度检查的基本原理和程序，各种数据类型分布的定制检查，独立测试方法。熟悉：适用性测试和独立性测试的应用。理解：拟合优度检查在遗传学及其他生物学科领域的应用。教学内容，1，拟合优度检查的一般原理2，拟合优度检查3，独立检查，1，拟合优度检查的一般原理，1，拟合优度检查(goodness of fit)定义：根据观察数和任何假设或分布模型检查计算的理论数之间的一致性的统计假设，适宜性检查，检查观测数和理论数之间的一致性，判断事件之间的独立性。2，拟合优度检查程序将观测分为K组，以计算N次观测期间每个组的观测频率数。Oi根据变量的分布规则或概率算法，以Pi

2、计算每组的理论频率。各组理论频率Ti检查Oi和Ti的差异显著。两者之间的不一致程度，A，零假设：H0: O-假设选择：O-T0(此处检查的是参数，确定观测值是否符合理论分布)，B，检查统计值：此处的N牙齿必须足够大。n50点(最高100)，定义的检查统计量为卡方分布，Ti=nPi不能小于5。小于5的情况下，C，设置拒绝域D，统计结论，(1)整体参数未知正则性检查，2，拟合优度检查，问题解决，(1)将观测除以K组。根据分组原理，分为10组，创建频率分布表，(2)在获得的N次观察中，I组的观察频率以Oi记录，(3) I组的理论频率以Pi计算，首先假定采样平均值和标准差假设高粱“3英尺3”牙齿正态分

3、布匹配。根据参数估算原理，估计为s/c4=4.98/0.9975=4.99。也就是说，根据高粱的株高Y与正态分布概率的计算关系，调查附表3，计算每个群体边界的理论频率，计算高粱“3英尺3”株高观测频率和理论频率计，(4)计算每个群体的理论频率为Ti=npi，填写下表，(5)计算Oi和TiHA: O-T0检查统计信息：高粱“3英尺3”株高观察频率和理论频率表(合并后)，金钟仁平方值的自由度df=k-1-a，其中K是组合的组数，A是应估计为样本的参数总数。组合组数k=6，标本中整体平均值和标准差估计，因此a=2，df=3，已知每包标准重量为500克，调查了100包，如下表所示。问题解决，(1)零假

4、设：h0:o-t=0；替代假设HA: O-T0 (2 2)群组：范例容量n=100、群组数目m=10、群组距离8g (3)计算理论频率pi和理论频率Ti (4)检查统计计算(5)自由度df=1000，问题解决，1，假设建议h0:o-t=0；HA: O-T0 2，整体参数未知，取样率P=590/n=1000=0.59 3，必须估计计算理论和金钟仁平方值，理论频率Pi根据二项分布公式为n=10，0K 10，理论数Ti=NPi 4其中恒星明确，敏感性为隐性，ss和Ss杂交，20个后代中有14株抗性植物，6株敏感植物。问后代的分离比是否符合孟德尔分离定律。根据问题解决孟德尔分离定律，ss和Ss的杂交后

5、代代表型的比例为1: 1，即10个恒星植物和10个敏感植物(1)假设的H0:O-T=0；HA: O-T0 (2 2)计算理论值和卡方值：理论值是根据孟德尔遗传定律计算的后代分离理论数(3)检验统计量计算。牙齿情况是两组数据：无估计参数、k=2、a=0、df=1 Ti表示理论值区域。适宜性卡方检验，3，独立性检查，原则：通过观察数和理论数之间的一致性来判断事件之间的独立性。也就是说，它确定两个事件是独立事件还是处理之间的差异显着。方法：将数据作为列联接表(也称为列联接表卡方检验)列出。1，22列年表卡方检验，(1)原则：例5青霉素可注射，口服，每天给感冒患者口服或注射80万单位的青霉素，两种茄子

6、给药方法的药效调查结果如下表所示，青霉素两种茄子给药方法的药效效果不同吗？这是两种茄子青霉素药物传递方式的药用效果调查表，通常在样品中各处理之间是否有关联，处理间独立事件检查时各处理间无关，或各处理为独立事件的零假设检查程序1，假设H0: o HA: 决定自由度：22列联合表的自由度DF=(R-1) (C)注意：22列联合表卡方检验与前面所说的一致度也与检查一样，要求理论数不能小于5。 理论数小于5的时候，要使用22列年表精密检查法。2，RC列联表，如果行数和列数都大于2，则称为RC列联表，理论数计算仍然是，例6植物基因操作法中常用的三种。基因总介导转化法、农杆菌介导转化法、花粉管通道法、三种

7、茄子方法转化烟草的成功率(种子数)，如表所示，询问三种茄子遗传转化方法的基因操作。问题解决，1，假设建议h0:o-t=0；HA: O-T0 2，根据概率的乘法计算理论数：理论数，3，检查统计： 4，确定自由度：列表中的自由度df=(r-1)(c-1)，R是列表中的行数，C是，3，22列组合表精确检查方法，检查过程：1，查找组合概率：P值指示总行数和总列数保持不变的情况。上述热耦合表的发生概率2，假设提出：热耦合表的精确检验零假设仍然没有处理效果。重要级别是3，检验统计：即P。相反，在总行数和列数保持不变的条件下，必须将4个列中最小的数字再减少一个(一次减少一个)为零，以获得两个或更多的22列联合表，并计算每个22列联合表的P值。多个P值的总和为总概率p