文献管理课件

文献管理Referencemanager计算机应用

王禄山May,2007文献管理以《論語·學而》第一首段开篇：

子曰：

學而時習之，不亦說乎？

有朋自遠方來，不亦樂乎？

人不知不慍，不亦君子乎？论语今读文献管理（一）孔子在此彰顯出求知、求學、求道的身心狀態的歷程描繪出人與真理接觸互動的生活圖像（二）求知、求學、求道之三難

1、學而厭（學而不習、不時）2、學而孤（獨學無友）3、學而驕（驕而怨怒）學習之道在於超越上述三難的處境達到君子的身心境界。论语今读文献管理学习什么？知识信息数据课本科学杂志实验结果求知、求学与求道大学怀疑精神自学方法文献管理

20002004RelatedRecords®TimeCitedCiting19951973跨越时间的限制

回顾创意的起源与前瞻研究的进展1999198519961980求学更应了解研究“历史”远古朋友学习智慧文献管理课本科学杂志科研成果创新性结果具有首创性1、背景介绍（提出问题）2、材料、方法、结果（分析问题）3、讨论及结论（解决问题）科技论文参考文献求学更应了解“历史”—参考文献文献管理参考文献的功能与作用

1）参考文献是科技论文的重要组成部分，它不仅能为作者的论点提供有力的论据，而且可以精练文字节约篇幅，增加论文的信息量，具有很高的信息价值。2）论文作者在其课题的选题论证、实验研究、以及总结和书写论文的过程中，都要参阅和利用大量的科学文献，由于作者在撰写论文时，不可能将所有引用前人成果都详尽地复述，只能将其主要引用文献注明出处列于文后。科研工作：从查阅文献开始。文献管理3）参考文献注明了被引理论、观点、方法、数据的来源，反映了论文的真实科学依据，没有参考文献的科学论文，应视为作者忽略了科学工作的继承性，也反映了作者科学学风和态度的欠缺。4）引用一定数量的参考文献，既表明学科的继承性和作者对他人劳动成果的尊重，也为编辑部、审稿专家和读者提供了鉴别论文价值水平的重要信息。5）参考文献为读者和审阅专家提供了与论文有关的文献题录，便于检索，以达到共享信息资源和推动科技进步的作用。6）著录参考文献有助于科技信息人员进行信息研究和文献计量学研究。科研工作：从查阅文献开始。文献管理如何查阅参考文献？原始文献文献管理文献管理中国期刊全文数据库ElsevierScience文献管理ElsevierScience是世界上公认的高品位学术出版公司，也是全球最大的出版商，已有100多年的历史。除了出版图书外，还是当今世界最大的学术期刊出版商，内容涉及生命科学，物理，医学，工程技术及社会科学，其中许多为核心期刊。近年来，Elsevier公司合并了一些出版社，如AcademicPress、CellPress的学术期刊全文数据也已加入到ScienceDirect，目前国际网站的服务器上安装有1500多种期刊。

文献管理综述（Review)文献专家分析（专业），对从事科技工作的初学者重要。是文献的深入加工，而不是简单的罗列。综述是对相关进展作出（专家）评判。如何查阅参考文献？CurrentOpinionsJournalsAnnualReviewJournals文献管理影响因子高综合性杂志科普性写作文献综述好在线他引全文献管理文献管理二次文献数据库及检索BiologicalAbstractMedline/Pubmed文献管理二次文献综述文献信息加工，一般为科技论文的摘要如何查阅参考文献？文献管理二次文献数据库及检索生物学文献中国期刊网文献管理概述收录范围:

1MEDLINE2PreMEDLINE3Publishersuppliedcitations文献管理MEDLINE收录了全世界70个国家和地区的4600余种生物医学期刊，起始时间1953年，目前文摘条目1200

万篇，年报道量近40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，周更新。内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。记录标注[PubMed-indexedforMEDLINE]文献管理PublisherSuppliedCitation出版商直接向PubMed递送的电子记录。记录标注[PubMed-assuppliedbypublisher]备注：提供的数据如果超出MEDLINE数据库的收录范围，如在综合性科学杂志（Science，Nature）上发表的地理学文章等，将不被采用。PreMEDLINE是临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次。记录标注[PubMed-inprocess]文献管理AB-Abstract LA-LanguageAD-Affiliation MH-MeSHTermsAU-Authors

PMID-PubMedUniqueIdentifierCY-Country PT-PublicationTypeDP-PublicationDate

SO-SourceEDAT-EntrezDate TA-JournalTitleAbbreviation

GS-GeneSymbo TI-TitleIS-ISSN UID-UniqueIdentifiersVI-Volume PG备注：检索词[字段标识符]字段标识符文献管理自动词语匹配链接点多，部分在网上免费获得全文也可以直接定购原文PubMed的特点文献管理AutomaticTermMapping词汇自动转换1、MeSHTranslationtableVitaminc转换为“ascorbicacid”[MeshTerms]ORvitaminc[TextWord]备注：想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可点击“details”按钮检索规则文献管理AutomaticTermMapping2、JournalsTranslationtableNewEnglandjournalofmedicine转换为“NEnglJMed”[Journal]备注：三种不同的表达方式

刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN检索规则文献管理AutomaticTermMapping3、PhraseList在前两个表中均未找到，而在短语列表中找到这个词4、AuthorIndex姓（全称）在前,名在后（首字母缩写）smithjc当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且有1或2个字母在词后时，PubMed就在该索引中查找。检索规则文献管理备注：如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时，PubMed就将短语劈开，再重复以上顺序单独分别查找，直到找到相匹配的词。如果仍找不到匹配词，则用AND将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找。例：pressurepoint转换为((“pressure”[MeSHTerms]ORpressure[TextWord])ANDpoint[AllFields])检索规则文献管理短语检索：如果在短语上加双引号，将不执行转换功能例如：“singlecell”“oxygenfreeradicals”检索规则截词检索：例：输入bacter*，检出bacteria、bacterium等备注：将不执行转换功能；截词检索只限于单词，对词组无效。文献管理布尔逻辑运算：AND、OR、NOT必须大写。

E-coliANDhamburger；vitamincORzinc；

traceelementNOTzinc逻辑符的运算次序是从左至右，括号内的检索式可作为一个单元，优先运行。布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识例如：dna[mh]ANDcrick[au]AND1993[dp]检索规则文献管理基本检索-BasicSearch高级检索-AdvancedSearch限定检索-LimitsSearch期刊检索–JournalSearch主题词检索-MeSHBrowser检索途径与方法文献管理基本检索文献管理检索步骤：输入检索词，点[Go]按钮或按回车检索词的输入形式：

输入单词或短语或表达式，也可用*及“”如，aspirin；stomachulcerIddmANDapoptosisasthmaKamadaA或asthma,KamadaA

者著姓名：wengxz、“wengxz”[au]

刊名标题：刊名全称、缩写、ISSN

Journalofleukocytebiology、Jleukocbiol、0741-5400文献管理备注：刊名后附加字段标识符

刊名与主题词相同的期刊

genetherapy[ta]、science[ta]、cell[ta]

单个词刊名的期刊,Scanning[ta]带括号刊名的期刊，录入时应将括号省略

JHandSurg[Am]输入格式为JHandSurgAm文献管理高级检索文献管理检索“阿尔茨海默病的基因治疗”检索步骤：在Searchfor框中输入alzheimerdisease，点击特征栏的[Preview/Index]按钮在“AllFields”选择一个检索字段，其右侧输入框中输入检索词genetherapy，点击[AND]，点击屏幕上部[Preview]开始检索并显示记录条数，这样可以反复操作；若点击[Go]则显示结果。文献管理如果选择一个检索字段，在提问框中输入检索词，点击[Index]，则系统显示相应字段的索引词列表。选中一个索引词，点击逻辑符（AND、OR、NOT），被选中的索引词会自动粘贴在提问框中，然后点击“Preview”或“Go”按钮备注：在高级检索界面，可以用逻辑组配符将检索历史中的序号加以组配。例，#1ANDenglish文献管理限定检索文献管理检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”检索步骤：在特征栏点击“Limits”键输入检索词apoptosis在Limitedto栏下,进行如下各种限定：

选择字段、只检带文摘的记录、文献类型（选择review）、语种、子集、年龄组、人类或动物实验、性别、录入系统日期（2years）、文献出版日期点击“Go”文献管理期刊

(Journal)

检索JAMA文献管理文献管理文献管理期刊编目信息浏览页机读格式NLM馆藏情况文献管理主题词(MeSH)

检索AminatedTutorial文献管理检索“阿司匹林引起胃溃疡的文献”检索步骤：点击“MeshBrowser”，进入MeSH浏览器的首页在提问框中输入aspirin，点击[Go]按钮，显示该主题词的定义。点击该词可做如下3种选择：

选择副主题词adverseeffects；

RestrictSearchtoMajorTopicheadingsonly；

DoNotExplodethisterm浏览树形结构文献管理……文献管理文献管理检索结果文献管理1、结果的显示Display旁的下拉菜单，选择记录格式：

summary默认、brief、Abstract、Citation、ASN.1、MEDLINE、XML等格式显示所有记录;记录前方框：显示标记记录显示每屏记录条数

Show：默认20（5-500）

page:1of13Next文献管理2、排序(Sort)

著者（Author）FirstAuthor,LastAuthor

刊名（Journal）出版日期（PubDate）3、打印或存盘(sentto)纯文本格式Sentto-Text

/file/Clipboard/email打印：使用浏览器的打印功能，存盘：点Sendto下拉按钮选file

首先选择所要存盘的数据（show），其次点击display显示所要存盘的格式，然后点Sendto-file即可文献管理RelatedArticles-链接相关文献链接NCBI数据库

Necleotide、Protein、Genome、Structure、Popset、Taxonomy、OMIM、Books、Probeset、3DDomainsLinksBooks-链接相关图书

Linkout–

链接外部资源，与生物医学文献出版商Web站点期刊全文的链接链接(link)功能文献管理ReferenceManager文献管理

Day-to-dayorganisedreading/archivingThesiswriting;300-400referencesWritingpapersre-submissiontodifferentjournalsWhydoyouneedcitationmanagementsoftware?文献管理SoftwarepackagesavailableAdeptScientific;()Endnote,ReferenceManager,ProcitePapyrus,Biblioscape3.3RefWorks;www.文献管理Whatcancitationmanagersoftwaredo?KeeptrackofallkeypapersinafieldRescueandimportreferencesviaInternetconnectiondirectlyintoyourdatabase(s)文献管理“Citewhileyouwrite”;automaticembeddingofcitationsinWorddocumentGeneratebibliographiesinanyjournalstyle(forendofyearreports,thesis,papers)Whatcancitationmanagersoftwaredo?文献管理InternetReferenceSearcher

CollectreferencesfromonlineandWebdatabases

SearchPubMedandInternetlibrariesworldwidefromReferenceManagerDatabaseManager

Organizeyourpersonalreferencecollectioneasily.

Locatereferencesinseconds,

WhatReferenceManagerdoes;文献管理Createbibliographiesinonestep

CreatebibliographieswithReferenceManager–

EasyReferenceSharing

SharereferencesonanetworkeditionAutomatickeywordassignment

ReferenceManagerscansthetitleandnotesofnewreferencesforanytermsthatarealreadyinyourkeywordlist.WhatReferenceManagerdoes;文献管理Neverleaveyourwordprocessortoidentifycitations

Workentirelywithinyourwordprocessor.ThisletsyouconcentrateonyourwritingwhileReferenceManagerlocatesthecorrectcitations–evenacrossmultipledatabases–CreatemultiplelinkstotheWorldWideWeb

LaunchyourWebbrowserfromReferenceManagertolinktofull-textarticlesontheWeb!WhatReferenceManagerdoes;文献管理ByauthorBytitleBykeyword……Retrievingreferencesfromyourdatabase文献管理文献管理ReferenceDisplayColumnheadingsReferencelistDatabasetabStatusbar文献管理RetrievingreferencesfromtheInternetDirectInternetconnectionestablishedtoPubMed(NCBI)Retrievalbasedonauthorname/keywordusinglogicaloperators(AND,OR,NOT)Directimportintoyourdatabase文献管理文献管理文献管理文献管理文献管理GenerateabibliographyListofreferencespulledoutofyourdatabaseFormattedinanyjournalstyleExporteddirectlytoarichtextWorduploading文献管理文献管理ReferenceListAltmann,M.,Muller,P.P.,Wittmer,B.,Ruchti,F.,Lanker,S.,andTrachsel,H.(1993).ASaccharomyces

cerevisiaehomologofmammaliantranslationinitiationfactor-4bcontributestoRNAhelicaseactivity.EMBOJ.12,3997-4003.Borman,A.M.,Kirchweger,R.,Ziegler,E.,Rhoads,R.E.,Skern,T.,andKean,K.M.(1997).EIF4Ganditsproteolyticcleavageproducts:effectoninitiationofproteins