基因编辑Cas9系列讲座5CRISPR-Cas9其他CRISPR蛋白

®CRISPR-Cas9

其他CRISPR蛋白解螺旋

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知识金牌知识金牌Contents课程目录第八部分第九部分第十部分第十一节spCas9突变型CRISPR-Cas9

其他CRISPR蛋白Cpf1其他细菌Cas9RNA编辑-Cas13a知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴医

生

科

研

成

长第八部分

|

spCas9突变型-PAMKleinstiver

BP,

et

al.

Engineered

CRISPR-Cas9

nucleases

with

altered

PAM

specificities.

Nature.2015

Jul23;523(7561):481-5.

PMID:26098369SpCas9

variantMutations

(relative

to

SpCas9)PAM

sequence1135E

variantD1135ENGGVQR

variantD1135V,

R1335Q

and

T1337RNGAN

or

NGNGEQR

variantD1135E,

R1335Q

and

T1337RNGAGVRER

variantD1135V,

G1218R,

R1335E

and

T1337RNGCG知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第八部分

|

spCas9突变型-PAM知识金牌第八部分

|

spCas9突变型-PAM知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长Kleinstiver

BP,

et

al.High-fidelity

CRISPR-Cas9

nucleaseswithnodetectablegenome-wideoff-target

effects.

Nature.

2016Jan

28;529(7587):490-5.

PMID:26735016第八部分

|

spCas9突变型-RECspCas9-HF1知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长ChenJS,etal.Enhancedproofreadinggoverns

CRISPR-Cas9targetingaccuracy.Nature.2017Oct

19;550(7676):407-410.

PMID:28931002第八部分

|

spCas9突变型-RECHypaCas9知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第八部分

|

spCas9突变型-REC知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第九部分

|

其他细菌Cas9物种PAMGuide长度文献Streptococcus

pyogenes

(Sp)NGG20bp1368AAStaphylococcus

aureus

(Sa)NGRRT21bp1054AA2015 NatureNeisseria

meningitidis

(Nmor

Nme)NNNNGATT1082AA2013

PNASCampylobacter

jejuni

(Cj)NNNNRYAC984AA2017

Nat

CommunStreptococcus

thermophilus

(St)NNAGAAW1121AA2016

Biol

DirectFeng

Zhang

lab

bacterialCas9

orthologs other

27

species知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第九部分

|

其他细菌Cas9RanFA,etal.InvivogenomeeditingusingStaphylococcus

aureusCas9.Nature.2015Apr9;520(7546):186-91.PMID:

25830891SaCas9PI知识金牌26098369第九部分

|

其他细菌Cas9知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长KimE,etal.Invivogenomeeditingwithasmall

Cas9orthologuederivedfromCampylobacterjejuni.

NatCommun.

2017

Feb

21;8:14500.

PMID:28220790第九部分

|

其他细菌Cas9CjCas9NNNNR

Y

A

C知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第九部分

|

其他细菌Cas923bp知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第九部分

|

其他细菌Cas9知识金牌WuZ,etal.EffectofgenomesizeonAAVvector

packaging.MolTher.2010Jan;18(1):80-6.PMID:

19904234DongJY,

FanPD,

FrizzellRA.

Quantitative

analysis

of

the

packaging

capacityofrecombinantadeno-associatedvirus.HumGeneTher.1996

Nov

10;7(17):2101-12.

PMID:

8934224.第九部分

|

其他细菌Cas9知识金牌第九部分

|

其他细菌Cas9TsaiSQ,

et

al.

GUIDE-seqenables

genome-wide

profiling

of

off-

target

cleavage

by

CRISPR-Cas

nucleases.

Nat

Biotechnol.

2015

Feb;33(2):187-197.

PMID:

25513782KimD,etal.Digenome-seq:genome-wideprofilingofCRISPR-

Cas9off-targeteffectsinhumancells.NatMethods.2015

Mar;12(3):237-43,

1p

following

243.

PMID:25664545RanFA,etal.InvivogenomeeditingusingStaphylococcus

aureusCas9.Nature.2015Apr9;520(7546):186-91.PMID:

25830891知识金牌|陪

伴

医

生

科

研

成

长Zetsche

B,

etal.

Cpf1is

a

single

RNA-guided

endonucleaseofaclass2CRISPR-Cas

system.

Cell.2015

Oct

22;163(3):759-71.PMID:

26422227第十部分

|

Cpf123bp解

螺

旋知识金牌Kim

D,

et

al.

Genome-wide

analysis

reveals

specificities

ofCpf1

endonucleasesinhumancells.NatBiotechnol.2016Aug;34(8):863-

8.

PMID:

27272384第十部分

|

Cpf1知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长第十一节

|

Cas13aAbudayyeh

OO,

etal.

C2c2

is

asingle-componentprogrammable

RNA-guidedRNA-targeting

CRISPR

effector.Science.

2016

Aug

5;353(6299):aaf5573.

PMID:

27256883知识金牌解

螺

旋 | 陪

伴

医

生

科

研

成

长AbudayyehOO,etal.RNAtargetingwithCRISPR-Cas13.

Nature.

2017Oct

12;550(7675):280-284.

PMID:

28976959第十一节

|

Cas13aLwaCas13a3456bp知识金牌解

螺

旋 | 陪