第三章 外文信息资源检索-PUBMED课件

第三章

外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMED第一节美国医学索引与Medline一、美国医学索引（IndexMedicus,IM）（一）美国医学索引概况1.收录范围：世界上著名大型医学文献题录型检索期刊2.文献类型：论文、社论、通信、综述等3.IndexMedicus特色(1)历史悠久(2)收录范围广(3)质量高(4)检索简便(5)回溯检索能力强第三章外文信息资源检索-PUBMED第一节美国医学索引与Medline一、美国医学索引（IndexMedicus,IM）（二）编排结构1.主题部分2.著者部分3.医学综述题录4.医学主题表(1)字顺表(2)树状结构表(3)副主题词表(4)收编期刊目录第三章外文信息资源检索-PUBMED第一节美国医学索引与Medline一、美国医学索引（IndexMedicus,IM）（三）检索方法1.主题途径检索2.著者途径检索（四）检索举例第三章外文信息资源检索-PUBMED第一节美国医学索引与Medline二、Medline数据库（一）Medline数据库概况（二）Medline的收录范围1966年以来的70多个国家和地区，37种语言的近5600种期刊文献（三）Medline数据库的检索方法第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBINIH、NLM、NCBI与EntrezNIH(NationalInstituteofHealth)：美国国立卫生研究院NLM(NatioanlLibraryofMedicine)：美国国立医学图书馆NCBI(NationalCenterforBiotechnologyInformation，美国生物技术信息中心)Entrez第三章外文信息资源检索-PUBMEDNCBI与EntrezNCBI创办了生物技术和生命科学的优秀网站——Entrez——基于多种数据库的集成检索系统，也是网上最大的免费检索生物医学资源的网站。通过该平台可检索到NCBI提供的28个数据库，这些数据库包含文献数据库、DNA和蛋白质序列数据库、三维蛋白质结构数据库、种群研究库、表达库、完全人类基因组库、分类信息库。其中，Pubmed属于文献数据库。文献数据库主要收藏生物医学方面的期刊、图书等。第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI一、Entrez资源整合系统NCBI，基于Web界面的综合生物信息数据库，网址为(1)GenBank和Nucletide(2)Genoma(3)OMIM(4)Protein(5)Structure(6)Pubmed(7)Taxonomy第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（一）Pubmed收藏范围：(1)Medline:标注为[Pubmed-indexedforMedline](2)OldMedline:标注为[Pubmed-OldMedline](3)InProgressCitations:标注为[Pubmed-inProcess](4)RecordSuppledbyPublisher:标注为[Pubmed-assuppliedbyPublisher]（二）Pubmed数据库结构（P135）字段限定符：[]例如：Stem[ti]ANDneuroscience第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索1.基本检索第三章外文信息资源检索-PUBMEDPubmed第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则1.逻辑运算符:AND

ORNOT如：commoncoldANDvitaminC

将检索出同时包含感冒和维生素C两个检索词的文献。

第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则2.词语自动转换：自然语言转换Mesh转换表、刊名转换表、短语表、著者索引对常用医学名词进行自动在MeSH转换表、刊名转换表、短语表、著者索引及所有记录字段中转换匹配。如：renalfailure（肾衰竭）转换为"renalinsufficiency"[MeSHTerms]OR("renal"[AllFields]AND"insufficiency"[AllFields])OR"renalinsufficiency"[AllFields]OR("renal"[AllFields]AND"failure"[AllFields])OR"renalfailure"[AllFields]第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则3.截词检索功能：截词符：”*”作为通配符进行截词检索。

例如：bacter*（系统会找到前一部分是bacter的单词，如：bacteria、bacterium等）4.短语精确检索用双引号来强制系统进行短语检索。例如：“oxygenfreeradicals”

（不再自动转换匹配和扩展检索）第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（三）Pubmed基本检索2.Pubmed的检索规则其他著者检索姓名,姓在前,名首字母在后限定加字段符如:genbacevo[AU]smithab[AU]第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（四）Pubmed主题词检索主题词概念与优势：统一概念，可扩展检索方法例：欲查肾衰竭（renalfailure）饮食疗法(diettherapy)的相关文献？第三章外文信息资源检索-PUBMEDMeshSearch第三章外文信息资源检索-PUBMEDMeshSearch第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMEDSubheadings第三章外文信息资源检索-PUBMED款目词树状词表第三章外文信息资源检索-PUBMED检索第三章外文信息资源检索-PUBMED检索结果第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（五）Pubmed高级检索1.检索构建器searchbuilder2.检索历史第三章外文信息资源检索-PUBMEDAdvancedSearch第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（六）期刊数据库检索通过输入刊名、缩写名、ISSN等,浏览期刊文献。提供电子原文的超链键。newenglandjournalofmedicineclinexpimmunol[so]1059-1524第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMEDJournal第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（七）单篇引文匹配器输入题录信息，查找特定文献进行补缺。刊名要准确，缩写要标准著者姓名大小写不敏感如：已知：第一著者是ChallisDE，出处是PediatricResearch；2000，47（3）：309-15，要求写出其他合著者第三章外文信息资源检索-PUBMED输入已知条件SingleCitationMatcher第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（八）临床查询1.ClinicalStudyCategories2.SystematicReview3.MedicalGenetics第三章外文信息资源检索-PUBMEDClinicalQueries第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI二、Pubmed检索系统（九）检索结果的显示、评价、分析与管理1.结果显示：2.检索结果的保存及输出3.检索结果的记录显示4.检索结果的限定和过滤第三章外文信息资源检索-PUBMED检索结果第三章外文信息资源检索-PUBMED显示方式保存方式第三章外文信息资源检索-PUBMED详细显示第三章外文信息资源检索-PUBMED结果限定第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI三、其他工具和链接（一）MyNCBI个性化功能1.保存检索策略及E-mail发送功能2.保存检索结果3.过滤检索结果（二）Linkout：全文链接（三）批量引文匹配器（四）临床试验数据库第三章外文信息资源检索-PUBMEDMyNCBI第三章外文信息资源检索-PUBMEDLinkOUT第三章外文信息资源检索-PUBMEDNCBIBatchCitationMatcher第三章外文信息资源检索-PUBMEDClinicalTrail第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI三、其他工具和链接（五）Gopubmed知识挖掘分析工具1.Gopubmed概述2.Gopubmed的分类统计功能(1)主题分布(2)作者分布(3)文献来源分布(4)年度分布3.Gopubmed与SCI信息分析功能比较第三章外文信息资源检索-PUBMEDGopubmed是一种Pubmed检索工具，是对于Pubmed资源的另一种组合检索方式，它比Pubmed的优点集中在于对于某一方面的研究我们能够直观得知研究时间、研究者、地域、研究过程、研究动态和各种信息之间的相关性摘自上海交通大学-生命医药学科博客：第三章外文信息资源检索-PUBMEDGoPummed第三章外文信息资源检索-PUBMED第二节Pubmed与NCBI四、PubMedCentral：免费全文数据库五、Entrez跨库检索第三章外文信息资源检索-PUBMEDPubmedCentral第三章外文信息资源检索-PUBMED第三章外文信息资源检索-P