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文档简介
蛋白质的相关计算Protein-relatedcalculationsPre-classquestiononproteins蛋白质课前提问1、氨基酸的元素组成、结构通式、结构特点、种类2、氨基酸形成蛋白质的方式、水中H和O的来源3、多肽的命名原则是什么?4、蛋白质结构多样性的原因是什么?目录CONTENT01蛋白质结构复习Proteinstructurereview04Protein-relatedcalculations蛋白质相关计算01040104蛋白质结构复习PARTONE蛋白质的基本单位——氨基酸1.元素组成除
外,有的还含有
等。C、H、O、NS2.结构通式CHH2NR氨基羧基侧链基团COHO分子式C2H4O2N-R3.种类21种氨基酸非必需氨基酸必需氨基酸人体可自身合成的氨基酸,共13种人体不能自身合成的氨基酸,必须从外界环境中获取,共8种
谐音巧记八种必需氨基酸苯丙氨酸、蛋(甲硫)氨酸、赖氨酸、苏氨酸、色氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、缬氨酸"笨蛋,来宿舍晾一晾鞋”1.脱水缩合:
H2O肽键-OH‖O-C-CR2H---NH--C-CR1H2NH--‖OOH-H二肽一、氨基酸的结合方式2.肽命名原则:
肽键-C-COOHR3H---NH-HOH-肽键‖O-CR1H2NH---C-C-CR2H---NH-‖O三肽H2OH2O脱出来的H2OH来自氨基和羧基1O来自羧基2一、氨基酸的结合方式2.肽命名原则:
肽键-C-COOHR3H--NH-肽键‖O-CR1H2NH---C-C-CR2H---NH-‖O三肽H2OH2O以此类推,多个氨基酸分子脱水缩合而成的含有多个肽键的化合物,叫多肽。一、氨基酸的结合方式氨基酸层次肽链层次氨基酸的种类不同氨基酸的数量不同氨基酸的排列顺序千变万化多肽链盘曲、折叠的方式及其形成的空间结构千差万别蛋白质功能的多样性3.蛋白质结构多样性的原因:
蛋白质相关计算PARTTWO1.肽键与氨基酸的关系氨基酸数肽链数肽键数脱水数888123765765---======规律1:在链状多肽中:
肽键数=脱去的水分子数=氨基酸数-肽链数氨基酸数肽键数脱水数333555====1.肽键与氨基酸的关系规律2:在环肽中:
肽键数=脱去的水分子数=氨基酸数一.计算脱水数/肽键数数1.胰岛素分子有A、B两条肽链,A链有21个氨基酸,B链有30个氨基酸,胰岛素分子中肽键的数目是()A.48个B.49个
C.50个D.51个B2.游离—NH2(—COOH
)数目①一条肽链至少含有____个羧基和_____个氨基。②m条肽链至少含有____个羧基和_____个氨基。11mm2.游离—NH2(—COOH
)数目规律3:至少含有的游离氨基(羧基
)=肽链数规律4:游离氨基(羧基)=肽链数+R基中氨基(羧基
)数环肽呢?2.游离—NH2(—COOH
)数目环肽:游离氨基(羧基
)=R基中氨基(羧基
)数2.现有氨基酸800个,其中氨基总数为810个,羧基总数为808个,则由这些氨基酸合成的含有2条肽链的蛋白质共有肽键、氨基和羧基的数目依次分别为()A.798、2和2B.798、12和10C.799、1和1D.799、11和9B3.蛋白质相对分子质量【规律】每形成一个肽键,脱去
,相对分子质量减去
。【扩展】每形成一个二硫键,脱去
,相对分子质量减去
。
1个H2O182个H2SHSHSS+2H3.蛋白质相对分子质量SHSHSS+2H=氨基酸数×氨基酸平均分子质量-
。
脱水数×18=氨基酸数×氨基酸平均分子质量-
。
脱水数×18-二硫键数×23.组成某蛋白质的氨基酸的平均相对分子质量为128,1条含有100个肽键的多肽链的分子质量为多少?蛋白质的相对分子质量=氨基酸数×氨基酸的平均相对分子质量—脱水数×18蛋白质分子质量=101×128-100×18=11128肽链数目氨基酸数肽键数目脱去水分子数氨基数目羧基数目多肽(蛋白质)的相对分子质量1条nm条n环状多肽nn-1n-1至少1个至少1个na-18(n-1)n-mn-m至少m个至少m个na-18(n-m)nn至少0个至少0个na-18n蛋白质的计算相关小结
设氨基酸的平均相对分子质量为a,由n个氨基酸分别形成1条链状多肽或m条链状多肽。注:若肽链间含有二硫键,则蛋白质的相对分子质量=
。(p为二硫键的个数,n为氨基酸数,m为肽链数,a为氨基酸的平均相对分子质量)。na-18(n-m)-2p4.蛋白质中原子个数的计算✮一个氨基酸中:
C2H4O2N-R①C原子数=R基中的C原子数+2②H原子数=R基中的H原子数+4③
O原子数=R基中的O原子数+2④N原子数=R基中的N原子数+1
氨基酸脱水缩合形成多肽过程中,脱去水,H、O原子数目减少,C、N原子数目不减少CHRCOOHH2N
—CH2NR1H—C—ON—H
C—R2H—C—ON—H
C—R3H—C—ON—HR4HCCOOH4.蛋白质中原子个数的计算C原子、H原子规律?蛋白质上C原子数=
蛋白质上H原子数=
R基中的C原子数氨基酸数×2(主链上)各氨基酸中H原子总数脱去水分子数×2+-蛋白质上N原子数=
蛋白质上O原子数=
肽链上的N原子、O原子规律?肽键数肽链数R基上的N原子数肽键数肽链数×2R基上的O原子数=各氨基酸中N原子的总数=各氨基酸中O原子总数-脱水数
—CH2NR1H—C—ON—H
C—R2H—C—ON—H
C—R3H—C—ON—HR4HCCOOH4.蛋白质中原子个数的计算++++4.某蛋白质分子中有M个氨基酸,其中有N条肽链,则此蛋白质中至少含有多少个氧原子()A.2MB.M-NC.MD.M+N
—CH2NHR1—C—ON—H
CHR2—C—ON—H
C—COOHHR3O=肽键数+2×肽链数+R基上O原子数D四.计算N、O原子的数目常用公式总结①脱水数=肽键数=__________-肽链数②氨基数=肽链数+________________=各氨基酸中氨基的总数-肽键数③羧基数=肽链数+R基上的羧基数=_______________________-肽键数④蛋白质相对分子质量=
各氨基酸平均相对分子质量×氨基酸数-18×脱水数⑤N原子数=肽键数+肽链数+R基上的N原子数=各氨基酸中N的总数⑥O原子数=肽键数+_____________+R基上的O原子数=各氨基酸中O的总数-___________氨基酸数R基上的氨基数各氨基酸中羧基的总数2×肽链数脱水数5.氨基酸的排列与多肽的种类计算1、3种氨基酸,每种足量,可形成
种三肽2、n种氨基酸,每种足量,可形成
种m肽?3、3种氨基酸,每种只有一个,可形成
种三肽4、n种氨基酸,每种只有一个,可形成
种多肽33nm3×2×1n×(n-1)×(n-2)×....×1333、、、nnnn321、、、nn-1n-21氨基酸肽键3×3×3n×n×n×、、、×n当堂小测1
如图为牛胰岛素结构图,该物质中—S—S—是由两个—SH脱去两个H形成的。下列说法正确的是A.牛胰岛素含有50个肽键B.牛胰岛素中至少含有2个—NH2和2个
—COOHC.牛胰岛素水解产物含有21种不同的氨基酸D.牛胰岛素形成时,减少的相对分子质量为882当堂小测2如图表示某蛋白质(无环状肽)中氨基酸和相关基团的数目。下列有关叙述错误的是A.共有2条肽链B.共有124个肽键C.形成此蛋白质时,相对
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