常见的基因检测技术及应用考核试题

常见的基因检测技术及应用考核试题本次考核共计70题，单选35道（1分/道），多选35道（2分/道），满分105分1、以下哪些关于MLPA检测的描述是正确的？A、可以检测到单亲二倍体和嵌合体B、是一种针对待检DNA序列进行定性和半定量分析的新技术。(正确答案)C、不会有假阳性结果D、样本DNA含量极少或纯度低也不会对实验结果造成影响答案解析：多重连接探针扩增技术（multiplexligation-dependentprobeamplification,MLPA）于2002年由Schouten等首先报道，是近几年发展起来的一种针对待检DNA序列进行定性和半定量分析的新技术。可以选B。但是MLPA技术也有局限性，1：MLPA用于检测基因的缺失或重复，不适合检测未知的点突变类型，不能检测染色体的平衡易位和单亲二倍体；2：引物附近的点突变或SNP可能影响探针结合，可能造成缺失假阳性，故请结合测序结果或qPCR分析；3：如果样本DNA含量极少或纯度低可能会对实验结果造成影响。因此，ACD不能选。2、遗传病基因组序列本身上的主要变异形式不包括哪种？A、点突变B、染色体畸变C、外显子缺失重复D、甲基化异常(正确答案)答案解析：遗传病主要的变异形式，大（CNV、UPD、倒位、易位等），中（基因及外显子缺失重复、基因融合）小（SNV、indel，动态突变等）3、核型分析是以细胞分裂那个时期的染色体为研究对象？A、前期B、后期C、中期(正确答案)D、末期答案解析：处于细胞分裂中期的细胞所有的染色体都整齐地排列在赤道板上，与其他时期相比，染色体的形态更稳定、数目更清晰，染色体数目一旦发生变化，在中期是最容易看出来的，误差也小4、核型分析最大缺点是什么A、辨率不足，只能检测5M以上的变异(正确答案)B、检测不了倒位C、检测不了易位D、价格昂贵答案解析：核型分析作为传统最早被应用于检测染色体变异的技术，最大的缺点是分辨率不足，只能检测>4-5M以上的染色体层面的变异5、哪项检测方法需要培养细胞？A、核型分析(正确答案)B、FISHC、CMAD、CNVseq答案解析：核型分析以细胞分裂中期的染色体为研究对象，需要培养细胞6、哪项检测方法不需要探针？A、MLPAB、CMAC、FISHD、CNVseq(正确答案)答案解析：CNVseq是全基因组低深度扫描，不需要探针捕获7、CNVseq的技术原理是什么？A、目标区域捕获B、全基因组测序(正确答案)C、探针杂交D、G带显色答案解析：CNVseq是全基因组低深度扫描，不需要探针捕获和杂交；WES及Panel检测需要目标区域探针捕获；FISH和CMA需要探针杂交；G带显色是核型分析技术原理8、CNVseq（WGS低深度）的分辨率A、100kb(正确答案)B、200kbC、300kbD、400kb答案解析：一般认为CNVseq分辨率是有效检出>100kb的CNV9、下列哪项是CNVseq技术的局限？A、缺失B、非整倍体改变C、重复D、倒位(正确答案)答案解析：CNVseq技术能检测拷贝数变异，不能检测倒位、易位10、MLPA中哪项是决定探针总长度的关键？A、上游引物B、填充序列(正确答案)C、杂交序列D、下游引物答案解析：填充序列是决定探针总长度的关键11、下列哪种疾病不是用MLPA方法可检测的？A、共济失调(正确答案)B、SMAC、佩梅病D、DMD答案解析：共济失调通常是三碱基重复所致，常用的是毛细管电泳方法12、Sanger测序的敏感性约是多少？A、35%(正确答案)B、10%C、50%D、5%答案解析：一般认为Sanger测序的敏感性是35%以上突变率变异的检出，低于此值，容易分辨不出是干扰峰，或者嵌合体等13、以下哪种检测技术最适合用于解决基因异质性难题？A、Sanger检测B、MLPA检测C、WES/WGS(正确答案)D、Qpcr答案解析：Sanger一次实验只能检测一个基因的特定区域，通量低；MLPA/Qpcr用于检测基因外显子缺失或重复，且一次实验也只能检测特定的目标基因，通量低；WES是高通量测序，一次实验可实现多个基因同时测序，甚至全基因外显子组测序，14、哪项不是NGS测序的优点？A、通量高B、成本低C、周期短D、读长长(正确答案)答案解析：二代测序读长约150bp,一代测序读长约为1000bp15、突变深度20X，总深度100X，突变率是？A、0.8B、0.2(正确答案)C、0.4D、0.6答案解析：突变率=突变深度/总深度16、相对可靠的覆盖度是多少X？A、1XB、2XC、10XD、20X(正确答案)答案解析：>20X的覆盖度是相对可靠的，理论上杂合变异10X，得到了10次的验证17、NGS测序中Q30对应的错误率A、碱基错误率千分之一(正确答案)B、碱基错误率1/100C、碱基错误率1/10D、碱基错误率30%答案解析：Q30对应的错误率为千分之一；Q20为百分之一18、哪种变异是用毛细管电泳方法检测？A、甲基化异常B、动态突变(正确答案)C、大片段倒转D、假基因干扰答案解析：动态突变（三碱基、四碱基等重复致病）采用的是毛细管电泳法19、智因线粒体高敏感检测平均测序深度A、10000XB、50000X(正确答案)C、20000XD、2000X答案解析：我司线粒体高敏感平均深度5万×20、哪项不是线粒体基因组的特征A、母系遗传B、同质性(正确答案)C、杂质性D、异质性答案解析：线粒体突变分布具有异质性和杂质性，线粒体基因组来源于卵母细胞，所以是母系遗传21、WGS（30X）测序深度下，检测线粒体变异突变率分辨率是A、1%B、5%(正确答案)C、10%D、0.1%答案解析：5%以上比较可靠，若低于5%，实际也可检出，但不能排除变异不可靠，所以一般会向生信部门核实突变可靠性才准予出报告22、WGS（30×）检测外显子缺失重复分辨率A、1个(正确答案)B、2个C、3个D、5个答案解析：WGS全基因组扫描，对于外显子缺失重复，可以精确到断点，单个也可以检出23、单亲二倍体中单亲异二体是指？A、同一亲本同一条染色体B、同一亲本的两条染色体(正确答案)C、同一亲本一条染色体片段来源D、三体染色体答案解析：同一亲本同一条染色为单亲同二体24、哪项不是完全性的单亲二倍体发生机制？A、同源染色体交叉互换(正确答案)B、三体营救C、配子互补D、有丝分裂复制答案解析：完全性的单亲二倍体发生机制有三种：三体营救、配子互补、有丝分裂复制，染色体交叉互换可能导致的是片段性的UPD25、某患者临床怀疑软骨发育不全，但又不能排除遗传代谢病，以下最佳的基因检测策略是？A、WES/WGS(正确答案)B、软骨发育不全PanelC、遗传代谢病PanelD、软骨发育不全Panel+遗传代谢病Panel答案解析：WES/WGS的基因检测范围全，避免漏检情况26、我们通常所说的遗传病大型变异的范围是多大A、>100K(正确答案)B、>50KC、>120KD、>80K答案解析：大型变异：>100k;中型变异：30bp~100k;小型变异：<30bp27、我们通常所说的遗传病中型变异的范围是多大A、>50KB、1K~100KC、30bp~100K(正确答案)D、<100K答案解析：大型变异：>100k;中型变异：30bp~100k;小型变异：<30bp28、我们通常所说的遗传病小型变异的范围是多大A、<30bp(正确答案)B、<100bpC、<50bpD、<1K答案解析：大型变异：>100k;中型变异：30bp~100k;小型变异：<30bp29、下列哪项技术需要培养细胞A、核型分析(正确答案)B、FISHC、CMAD、二代测序答案解析：只有核型分析技术需要培养细胞，其他三项都不需要培养细胞30、核型分析技术的检测分辨率是多少A、<4MB、>4M(正确答案)C、>2MD、<1M答案解析：核型分析技术的检测分辨率是>4M31、FISH技术的检测分辨率是多少A、>300KB、>200~300K(正确答案)C、<250KD、<100K答案解析：FISH技术的检测分辨率一般是200~300kb32、CNVseq的检测分辨率是多少A、>300KB、>100K(正确答案)C、>500KD、>10K答案解析：CNVseq的检测分辨率是>100K33、以下哪些变异可以用aCGH芯片进行检测A、易位B、倒位C、CNV(正确答案)D、单亲二倍体答案解析：aCGH芯片可以检测CNV，但不能检测倒位、易位34、CNVseq的技术原理是什么A、目标区域捕获B、全基因组测序(正确答案)C、探针杂交D、G带显色答案解析：CNVseq是基于全基因组测序的二代测序技术35、核型分析的技术原理是什么A、目标区域捕获B、全基因组测序C、探针杂交D、G带显色(正确答案)答案解析：核型分析的技术原理是G带显色36、大型变异常用的检测方法A、核型分析(正确答案)B、FISH(正确答案)C、染色体微阵列芯片分析(正确答案)D、NGS测序（CNVseq、WGS）(正确答案)答案解析：大型变异常用的检测手段有：核型分析、FISH、CMA（SNP芯片或aCGH等）、NGS测序；随着NGS发展，越来越多的使用NGS测序来检测大型变异，如CNVseq、WGS等37、中型变异常用的检测方法A、SNP芯片B、MLPA(正确答案)C、QPCR(正确答案)D、NGS测序（WES、WGS）(正确答案)答案解析：中型变异常用的检测手段有：MLPA，QPCR及NGS测序；随着NGS发展，越来越多的使用NGS测序来检测中型变异，如（Trio）WES、（Trio）WGS等38、小型变异常用的检测方法A、Sanger测序(正确答案)B、SNP芯片(正确答案)C、NGS测序（WES）(正确答案)D、NGS测序（WGS）答案解析：ABCD均可进行小型变异的检出；但sanger测序通量低，周期长，成本高，适用于单个或某几个基因的检测，或NGS测序后的位点验证；一种snp芯片也只能检测特定的突变位点,拓展性较差，成本高；随着NGS发展，越来越多的使用NGS测序来检测中型变异，如（Trio）WES、（Trio）WGS等39、下列哪项是染色体畸变？（多选）A、5p缺失综合征(正确答案)B、21三体综合征(正确答案)C、平衡易位(正确答案)D、倒位(正确答案)答案解析：5p缺失综合征也称之为猫叫综合征，由于5号染色体短臂缺失属于CNV，21三体综合征由于21号染色体多了一条属于染色体非整倍数改变，染色体畸变包括数目改变，CNV，易位、倒位等。40、以下哪些方法可用于CNV变异的检出？A、CNV-seq(正确答案)B、CMA(正确答案)C、WGS(正确答案)D、WES(正确答案)答案解析：ABCD均可检出CNV变异，WES及CMA是能一定程度上检出CNV，但精度差；WGS精度最高，可检出较短的CNV片段，如几K，几十K，因此对于CNV的检出率最高，且能直接达断点；CNVseq是全基因组低深度测序，对于CNV的检出精度一般在100kb以上41、检测中型变异的检测方法中哪种可以实现所有基因的普筛A、MLPAB、qPCRC、WES(正确答案)D、WGS(正确答案)答案解析：MLPA、qPCR只能对指定的基因、指定的外显子缺失重复进行检测，不能对所有基因进行普筛42、一代测序的优点是？A、准确(正确答案)B、稳定(正确答案)C、读长长(正确答案)D、灵敏度高答案解析：一代测序灵敏度较低，10%左右的嵌合难以检测出来43、一代测序的缺点是？A、通量小(正确答案)B、灵敏度低(正确答案)C、周期长(正确答案)D、成本低答案解析：一代测序通量小，仅能针对单个或几个基因；成本高；周期长，灵敏度低，10%左右的嵌合难以检测出来；44、Sanger方法无法实现以下哪种检测目的？A、检测与疾病相关的某个特定基因变异B、检测没有候选基因的某种疾病相关的基因变异(正确答案)C、检测有大量候选基因的某种疾病的致病变异(正确答案)D、检测某个或某些基因外显子缺失或重复变异(正确答案)答案解析：Sanger方法主要用于寻找与疾病相关的特定基因变异，点突变为主，尚无法实现BCD。45、以下说法正确的是A、测序深度：指同一个碱基的测序重复次数(正确答案)B、一个位置都有其变异reads数和总reads数，二者相除为变异丰度(正确答案)C、理论上纯合变异为100%，杂合变异为50%，实际上只是近似(正确答案)D、一般变异reads数越高变异越可靠(正确答案)答案解析：ABCD均正确46、对二代测序理解正确的是？A、比一代测序更准确B、有假阳性存在(正确答案)C、有假阴性存在(正确答案)D、价格便宜(正确答案)答案解析：二代测序即高通量测序，通量高，成本低，周期短；二代测序可能由于目标区段reads覆盖度不够、碱基检出的阈值设置太严苛、链特异性造成reads分布不均匀而未达到质控条件，而出现假阴性；也可由于文库扩增引入假阳性47、一个样本的平均测序深度100X，下列说法正确的是A、每个碱基测序深度均为100XB、有的位点不到100X(正确答案)C、有的位点未检测到(正确答案)D、有的位点高于100X(正确答案)答案解析：样本的平均测序深度指该样本测序的所有基因所有目标序列的平均测序深度，由于测序和捕获的不均衡性，各碱基深度不同，有的高有的低，平均是100X48、选择Panel可能出现的问题A、检测基因范围小，易漏检(正确答案)B、反复试错，成本高，周期长(正确答案)C、快速诊断D、panel探针均一度不高(正确答案)答案解析：panel是将某类疾病相关基因打一个包进行测序，疾病基因异质性高，panel很容易打包不全导致漏检，阳性率低；包含疾病种类少，因此检测阴性后需要再试下一个可能怀疑疾病方向的panel；反复试错，周期长；容易假阴性；且由于测序范围不全，导致检测出来的疑似致病突变可能并非患者真正的致病突变，可能假阳性；探针固定，无法随时更新，均一度也差49、为什么说先证者模式是不严谨的A、无共分离分析(正确答案)B、无生物学父母验证(正确答案)C、无法确定denovo、复合杂合变异(正确答案)D、测序深度低答案解析：先证者模式未进行家系成员，尤其是直系亲本的检测，无法进行生物学父母的验证，也无法做到家系共分离的分析；也也无法确定先证者携带的变异是否是复合杂合或denovo；50、选择检测策略一般从哪几方面考虑？A、高检出率(正确答案)B、周期，快速诊断(正确答案)C、回顾分析及科研挖掘(正确答案)D、经济性(正确答案)答案解析：选择检测策略一般从以下几个方面考虑：高检出率，阳性率高；周期短，能够快速诊断疾病；经济性，价格便宜；检测的数据具有回顾分析价值，检测的数据具有科研挖掘价值；51、X染色体失活检测的原理包括？A、X染色体嵌合性(正确答案)B、X染色体基因多态性(正确答案)C、失活的X甲基化(正确答案)D、失活的X染色体甲基化答案解析：X染色体失活的检测原理是基于女性体细胞组织的X染色体嵌合性和X染色体基因多态性进行的。其中多态性表现为X染色体的STR（shorttandemrepeat,短串联重复）重复次数不同。嵌合性表现为在一个女性体内部分细胞群母源X染色体有活性，部分细胞群父源X染色体有活性。失活的X染色体为甲基化的，而有活性的X染色体是非甲基化的52、动态突变检测方法A、PCR+毛细管电泳(正确答案)B、三代测序(正确答案)C、WGS(正确答案)D、WES答案解析：ABC均可进行动态突变的检出53、单亲二倍体的发病机理是？A、印记基因组效应(正确答案)B、残余三体效应(正确答案)C、缺失重复D、隐性等位基因纯合暴露(正确答案)答案解析：单亲二体表现型的发病机理主要是基因印记效应，其次是常染色体隐性遗传等位基因的双等位基因表达；另外还有残余三体效应，即通过三体营救，没有变成单亲二体的少量三体细胞仍然残留在胎盘或其他组织里，并产生异常的表现型，其机理可能与2号染色体母源性单亲二体的16号染色体母源性单亲二体的表现型发生有关54、哪些疾病存在特殊的发病机制？A、色素失禁症(正确答案)B、共济失调(正确答案)C、PWS/AS(正确答案)D、SMA(正确答案)答案解析：四种疾病均涉及到特殊检测55、以下哪种疾病可由于碱基重复（动态突变）导致？A、共济失调(正确答案)B、亨廷顿舞蹈证(正确答案)C、脆性X综合征(正确答案)D、强直性肌营养不良(正确答案)答案解析：ABCD均主要由于基因的三碱基重复导致，即动态突变56、下列哪些变异是我们通常所说的遗传病中型变异A、CNVB、一个基因的重复(正确答案)C、2个外显子的缺失(正确答案)D、1个外显子的重复(正确答案)答案解析：CNV是大型变异，中型变异包括整个基因的缺失重复及单个或多个外显子的缺失重复57、下列哪些变异我们通常所说的遗传病小型变异A、CNVB、外显子缺失重复C、点突变(正确答案)D、<30bp的插入/缺失(正确答案)答案解析：小型变异包括点突变和小于30bp的小片段缺失重复58、我们通常所说的遗传病小型变异有哪些A、一个外显子缺失B、移码突变(正确答案)C、非移码突变(正确答案)D、<30bp的重复(正确答案)答案解析：中型变异包括整个基因的缺失重复及单个或多个外显子的缺失重复;小型变异包括点突变和小于30bp的小片段缺失重复59、哪些技术能检测染色体大型变异A、核型分析(正确答案)B、FISH(正确答案)C、CMA(正确答案)D、CNVseq(正确答案)答案解析：均可检测60、核型分析能检测哪些染色体变异A、染色体重复(正确答案)B、染色体缺失(正确答案)C、环状染色体(正确答案)D、染色体倒位(正确答案)答案解析：核型分析可以分析染色体数量的变化和染色体结构的变化；可以检测的染色体结构的变化包括染色体大片段的缺失、重复、易位、倒位、环状染色体61、FISH技术能检测哪些染色体变异A、染色体重复(正确答案)B、染色体缺失(正确答案)C、染色体易位(正确答案)D、染色体倒位(正确答案)答案解析：FISH可以分析染色体数量的变化和染色体结构的变化；可以检测的染色体结构的变化包括染色体大片段的缺失、重复、易位、倒位62、CMA能检测哪些染色体变异A、染色体重复(正确答案)B、染色体缺失(正确答案)C、单亲二倍体(正确答案)D、染色体倒位答案解析：CMA可以检测的染色体结构的变化包括染色体大片段的缺失、重复、单亲二倍体、一定比例的嵌合体；不能检测倒位、易位63、CNVseq能检测哪些染色体变异A、染色体重复(正确答案)B、染色体缺失(正确答案)C、单亲二倍体D、染色体倒位答案解析