实验12-父权指数与父权概率

实验十二父权指数与父权概率【实验目的】掌握父权指数与父权概率的计算方法，了解父权概率的意义。【实验原理】亲子鉴定中，经过DNA分型后，若争议父亲与孩子之间的基因型不违反孟德尔遗传规律（MendelianLaw），就有两种可能：一种是该争议父亲就是孩子的亲生父亲（生物学父亲，简称生父）。另一种是他是该人群中的随机男子，此人只是偶然具有孩子的生父基因型组合，以下称为随机男子。将这两种可能进行比较就是似然率（likelihoodratio,LR），此数值即为父权指数（paternityindex,PI）。显然，父权指数是反映检验结果（基因型组合）不违反孟德尔遗传规律时，对“争议父亲是孩子的生父”这一主张的支持强度。依据支持强度，可以评估他们之间是否存在亲生关系。根据Bayes定理，PI可以转换成父权概率（probabilityofpaternity），用以反映争议父亲是孩子生父可能性的高低，使结论容易被理解。【仪器与方法】纸、笔、计算器、电脑及计算软件。【检材】争议父、母亲、孩子复合STR基因座分型结果图谱。【实验步骤】1.三联体（母子亲生关系已经确定）案件PI和父权概率计算将已知实验结果的图谱进行分析，分别列出复合STR基因座分型结果，打开亲权鉴定软件，点击亲权鉴定菜单，选择三联体和试剂盒型号，按照方法输入父母子3人的基因型。输入完毕后，在生成结果表中勾选，点击右下角的计算器计算PI。2.二联体（父子）案件PI和父权概率计算将已知实验结果的图谱进行分析，分别列出复合STR基因座分型结果，打开亲权鉴定软件，点击亲权鉴定菜单，选择二联体和试剂盒型号，按照方法输入父子3人的基因型。输入完毕后，在生成结果表中勾选，点击右下角的计算器计算PI。注意事项a.性别基因座（AMEL）中的X和Y在程序中分别用1和2表示，在设置基因座时，基因座序号X请设为1，Y设为2。b.等位基因输入时，分隔符可为'/'、'-'、'+'，"13/15"或"13-15"或"13+15"都是正确的，纯合子可只输入一个等位基因，如"13/13"可输入为"13"，性别基因（AMEL）在输入时可不使用分隔符，如"X/Y"可直接输入为"XY"，"XX"可简化输入为"X"（"YY"或"Y"将不被程序所授），在偶合率计算时，AMEL的Pi值始终为0.5，而在亲权鉴定中，AMEL不列入计算。c.如果出现突变时，需按照司法部颁布的《亲权鉴定技术规范》（SF/ZJD0105001-2010）标准方法计算变异PI值。【实验结果与分析】三联体（母子亲生关系已经确定）及二联体案件PI和父权概率图12-4父亲样本STR基因型图谱图12-5母亲样本STR基因型图谱图12-6孩子样本STR基因型图谱图12-7DNA相关概率计算软件界面附：STR基因座的非父排除率参考表基因座非父排除率基因座非父排除率D3S13580.4806TPOX0.3701vWA0.6092CSF1PO0.5001FGA0.7068D7S8200.5576D8S11790.6882D2S13380.6950D18S510.7184D19S4330.6554D21S110.6502D6S10430.7310D5S8180.5671D12S3910.6790D13S3170.6000PentaD0.5907D16S5390.5749PentaE0.7325TH010.4046附：19个STR基因座的等位基因分布频率D3S1358vWAFGAD8S1179D21S11110.0005130.0020160.000280.001623.20.0002120.0014140.2567170.001690.001124.20.0002130.0014150.0303180.0181100.1054270.0036140.0473160.1644190.0445110.093627.20.0002150.3453170.2361200.0458120.1287280.0554160.3277180.1947210.1072130.222128.20.0054170.2062190.094821.20.0032140.1852290.2571180.0638200.0192220.1866150.171229.20.0023190.0061210.001822.20.0038160.0737300.2794200.0005230.2237170.014930.20.010923.20.0102180.0025310.0995240.189431.20.076924.20.0084320.0285250.097032.20.124625.20.0034330.0045260.042533.20.044326.20.0014340.0018270.010234.20.003827.20.0009350.0005280.000935.20.000928.20.0005290.0005D18S51D5S818D13S317D7S820D16S53970.000270.021370.001470.002050.000290.000780.003680.287480.138260.00079.20.000290.066990.131890.062980.0070100.0027100.1915100.1432100.163590.2840110.0032110.3222110.2368110.3471100.1278120.0351120.2406120.1592120.2453110.2585130.1904130.1421130.0341130.0351120.2058140.2160140.0109140.0061140.0054130.1015150.1712150.0007150.0005140.0140160.1312170.0002150.0005170.0710180.0455190.0466200.0318210.0215220.0181230.0090240.0045250.0007260.0002270.0002THO1TPOXCSF1POD2S1338D19S43360.099360.000760.0002160.0094110.006370.266470.000770.0029170.0469120.031380.051180.513680.0020180.143812.20.006390.521590.130090.0513190.1969130.23139.30.0326100.0289100.2433200.121913.20.0372100.0280110.2987110.2491210.0063140.2469110.0011120.0265120.3686220.053114.20.1531130.0007130.0719230.2031150.0594140.0002140.0100240.171815.20.1656150.0007250.0406160.0063260.003116.20.0563280.0031PentaDPentaED12S391D6S104360.003250.0053150.0156100.028670.024270.0021160.0078110.109480.069180.0043170.0885120.140690.364790.0139180.1901130.1328100.1263100.0544190.2292140.1641110.1232110.1948200.1927150.0026120.1328120.1177210.1250160.0052130.1012130.0674220.1016170.0495140.0433140.0851230.0286180.1719150.0072150.0752240.00781