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文档简介
ICS65.120
B46
备案号:58400-2018DB21
辽宁省地方标准
DB21/T2742—2017
饲料中动物源性成分—貂源性组织成分定
性检测方法PCR方法
AnimalderivedingredientsinFeed-qualitativedetectionofminktissuederived
ingredientswithPCRmethod
DB21/T2742—2017
饲料中动物源性成分—貂源性组织成分定性检测方法PCR方法
1范围
本标准规定了检测饲料中貂源组织成分的聚合酶链式反应检测方法。
本标准适用于配合饲料、浓缩饲料和单一饲料中貂源性成分的检测。
本方法的貂源性成分检测限为0.5%(w/w)。
2规范性引用文件
下列文件对于本文件的应用是必不可少的。凡是注日期的引用文件,仅所注日期的版本适用于本文
件。凡是不注日期的引用文件,其最新版本(包括所有的修改单)适用于本文件。
GB/T6682分析实验室用水规格和试验方法
GB/T14699.1饲料采样
GB/T19495转基因产品检测
GB/T20195动物饲料试样的制备
SN/T1193基因检验实验室技术要求
3原理
利用氯仿抽提法或使用等效的基因组DNA提取试剂盒提取DNA,以提取的DNA为模板进行PCR扩
增,琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物;PCR产物用限制性内切酶酶切后电泳和测序进行确证。
4试剂和材料
除另有规定外,试剂为分析纯或生化试剂;实验用水为灭菌双重蒸馏水;所有实验室使用的试剂等
级应为不含DNA和DNA酶的分析纯试剂,试剂的选购、验收、储存应符合规定。
4.1引物
根据Primer6软件设计,貂源性成分扩增产物为622bp,检测用引物(对)序列为:
F:5’-TTAGTAGCTCATAACGCCTTG-3’
R:5’-CGTGAGTATGTTCTTGGTTAG-3’
根据合成引物的标示浓度,用双重蒸馏水配制成10μM。
4.2BstXⅠ限制性内切酶。
4.3PCRMastermix(或DNA聚合酶、dNTP等PCR用试剂)。
4.4基因组DNA提取试剂盒或其他替代试剂。
4.5裂解缓冲液:250mmol/LSDS,使用前加入蛋白酶K至100mg/mL。
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DB21/T2742—2017
4.6TE缓冲液:10mmol/LTris-HCl,1mMEDTA,pH8.0。
4.7胶回收试剂盒或其他替代试剂。
4.8电泳缓冲液:Tris54g,硼酸27.5g,0.5mol/LEDTA(pH8.0)20mL,加蒸馏水至1000mL;使用
时10倍稀释。
4.9琼脂糖:分子生物学级别。
4.10溴化乙锭贮存液(10mg/mL)或荧光染料替代品。
4.11DNA分子量标准品(100bp-1000bp)。
5仪器设备
5.1分析天平:感量为0.01g和0.0001g。
5.2台式离心机:离心力12000r/min。
5.3水浴锅:温度可调范围为28℃-95℃,误差为±0.5℃。
5.4PCR仪。
5.5电泳仪。
5.6凝胶成像仪。
5.7核酸蛋白分析仪或紫外分光光度计(可测量微量样品)。
6测定程序
饲料中貂源性成分测定程序见图1。
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DB21/T2742—2017
试样
配合饲料浓缩饲料肉骨粉饲料单一饲料
磨碎、过筛
DNA提取
DNA浓度及纯度测定
PCR扩增及电泳检测
酶切及电泳检测
PCR扩增产物胶回收及测序
图1饲料中貂源性成分测定程序图
7操作步骤
7.1制样
按GB/T14699.1规定采集试样后,按GB/T20195规定,取有代表性的样品1kg,四分法缩减,取约
200g,经粉碎,全部过0.45mm孔筛,混匀装入磨口瓶中备用。
7.2模板提取
称取50mg试样于1.5mL离心管中,加入200μLTE,混匀;加入400μL裂解液,加400μL三氯甲烷,
混匀;10000r/min离心5min,取上清液;加0.8倍体积异丙醇,沉淀;10000r/min离心5min,弃上清液;
70%乙醇洗涤一次,晾干;加入50μLTE,溶解沉淀。
也可采用等效的基因组DNA提取试剂盒,按照试剂盒使用说明书提取DNA。
7.3核酸浓度及纯度检测
提取的DNA采用紫外分光光度计在260nm和280nm处检测其吸光值,紫外分光光度法检测核酸浓度
的最佳范围是2μg/mL-50μg/mL,OD值应在0.05-1.0区间内。1OD260=50μg/mL双链DNA,用水稀释,调
整DNA浓度至20µg/mL。用于PCR反应的DNA溶液OD260/OD280比值一般不低于1.8,如低于1.8则重新进
行DNA的提取。
7.4PCR扩增
7.4.1PCR反应体系
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按表1的体系进行PCR反应液的配制。
表1PCR反应体系
成分鉴定体系
PCRMasterMix25μL
上游引物(10μM)0.5μL
下游引物(10μM)0.5μL
DNA模板100ng±50ng
ddH2O调整体系体积至50μL
7.4.2PCR扩增参数
按表2的条件进行PCR反应。
表2PCR反应条件
反应预变性扩增延伸
循环数1301
温度/℃9595487272
时间5min30s30s45s5min
7.4.3质控样品
检测过程中分别设阳性对照和空白对照。
在貂源性成分的鉴定中,以貂肉粉末作为阳性对照。PCR过程中,以水作为空白对照。
7.4.4PCR扩增产物电泳检测
取1.5g琼脂糖,于100mL电泳缓冲液中加热,充分熔化,加入溴化乙锭贮存液至终浓度为0.5μg/mL,
制胶。在电泳槽中加入电泳缓冲液,使液面刚刚没过凝胶。将5μl-10μLPCR扩增产物点样。9V/cm恒压
电泳,直到指示剂迁移至凝胶尾部。凝胶成像仪下观察电泳结果并记录。
7.4.5限制性内切酶酶切反应
酶切反应体系为20µL,具体见表3,酶切条件根据说明书操作,电泳分析。
表3酶切反应体系
成分体积/µL
10×Buffer2
限制性内切酶BstXⅠ2
PCR产物7
ddH2O9
7.4.6PCR扩增产物测序
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7.4.6.1PCR扩增产物回收
采用经验证的胶回收试剂盒进行电泳后的PCR目的片段回收,按照试剂盒使用说明书回收DNA。
7.4.6.2PCR扩增产物测序
将特异性条带进行琼脂糖凝胶回收,纯化并委托测序,测序结果见附录A。
7.5结果表述
7.5.1PCR扩增产物电泳检测结果
貂源性成分扩增产物为622bp,序列参考附录A,图谱见附录B。貂源性成分的PCR产物被BstXⅠ酶
切为107bp和515bp两个片段,图谱见附录B。
7.5.2结果判定
PCR产物为阳性,同时酶切结果符合附录B、测序结果同源性达到99%判为含有貂源性成分,表述为
检出貂源性成分;PCR产物为阴性者,不需要再进行酶切和测序鉴定,判为不含有貂源性成分,表述为
未检出貂源性成分。
8检测过程中防止交叉污染的措施
参考GB/T19495.2《操作过程中避免交叉感染》和SN/T1193《基因检验实验室技术要求》执行。
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AA
附录A
(资料性附录)
貂源性成分PCR产物测序结果
CAGTGATAAAAATTAAGCCATGAACGAAAGTTTGACTAAGCCATGTTAACACCAAGAGTTGGTA
AATTTCGTGCCAGCCACCGCGGTCATACGATTAACCCAAATCAATGGGCCAACGGCGTAAAACG
TGTTAAGGACTATACAACACTAAAGTTAAAATTTAACCAGGCCGTAAAAAGCTACTGTTAATACA
AAACAAACCACGAAAGTGACTTTACCACTTCCGACAACACGATAGCTGAGATCCAAACTGGGAT
TAGATACCCCACTATGCTCAGCCCTAAACATAAATAATTCACATAACAAAATTACTTGCCAGAGA
ATGTTAAAGCAATAGCTTAAAACTCAAAGGACTTGGCGGTGCTTTACATCCCTCTAGAGGAGCCT
GTTCTATAATCGATAAACCCCGATAAACCTCACCACTTCTAGCTAAATCAGTCTATATACCGCCA
TCTTCAGCAAACCCTTAAAAAGGAAGAAAAGTAAGCACAATAATGATACATAAAAAAGTTAGGT
CAAGGTGTAACCCAGAAGTGGGAAGAAATGGGCTACATTTTCTAACCAAGAAAATACTCACA
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BB
附录B
(资料性附录)
貂源性成分扩增产物及酶切凝胶电泳图
图B.1貂源性成分扩增产物及酶切凝胶电泳图
(LaneM:DL1000;Lane1:貂源性成分的扩增产物;Lane2-3:貂源性成分PCR产物酶切结果)
_________________________________
7
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