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文档简介
MCCC1/LAMP3降低了中国大陆
汉族人群散发性帕金森病的发病风险
背景帕金森病(Parkinson’sdisease,PD)是中老年人常见的神经系统变性疾病,可能是在老龄化的背景下遗传因素和环境因素共同作用的结果。
全基因组关联分析(genome-wideassociationstudies,GWAS)在揭示复杂性疾病的遗传背景方面,是目前最为强大和有效的实验设计。背景17项PDGWAS及其meta分析肯定了之前发现的PD相关基因:SNCA,MAPT。发现了许多新的PD相关基因及位点:PARK16,GAK/DGKQ,HLA,BST1,
12q24:rs4964469,(ACMSD,STK39,SYT11,MCCC1/LAMP3,CCDC62/HIP1R)1,STX1B,FGF20,STBD1,GPNMB,RIT2等。1.Nalls,M.A.,etal.ImputationofsequencevariantsforidentificationofgeneticrisksforParkinson'sdisease:ameta-analysisofgenome-wideassociationstudies.Lancet377,641-649(2011)目的
探讨MCCC1/LAMP3rs11711441多态性与中国大陆汉族人群散发性帕金森病发病的关系。
甲基巴豆酰辅酶A羧化酶1/溶酶体相关膜蛋白3(methylcrotonoyl-CoAcarboxylase1/lysosomeassociatedmembraneprotein3
,MCCC1/LAMP3)基因位于3q27。PD组对照组
757例来自华西医院神经内科门诊就诊并登记的PD患者,诊断符合英国PD协会脑库的临床诊断标准,无PD家族史。
671例来自我院的健康志愿者,并且与PD组患者在地区、种族、性别、年龄均相匹配。研究对象所有1428例研究对象均签署知情同意书,并留取外周静脉血5ml试验流程提取DNA酚氯仿法基因分型统计分析基质辅助激光解析/电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)
SPSS16.0结果
1.
MCCC1/LAMP3rs11711441基因分型图谱MCCC1/LAMP3rs11711441结果SNP病例组MAF对照组MAFOR95%(CI)P值rs1171144117.24%20.19%0.82(0.68,0.99)0.0432.MCCC1/LAMP3rs11711441病例组及对照组基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡3.MCCC1/LAMP3rs11711441(G>A)病例组及对照组最小等位基因频率(minorallelefrequency,
MAF)
分布结果4.MCCC1/LAMP3rs11711441病例组及对照组最小等位基因携带者与非携带者频率分布比较
n基因型(%)OR95%(CI)P值MCCC1/LAMP3rs11711441GGGA+AAPD组757511(67.5)246(32.5)0.78
(0.62,0.96)0.022EOPD259163(65.5)86
(34.5)0.91(0.62,1.34)0.641LOPD508348(68.5)160(31.5)0.72(0.55,0.93)0.014对照组671414(61.7)257(38.3)--对照组
<50岁226135(63.4)78(36.6)--对照组
≥50岁458279(60.9)179(39.1)--结果5.MCCC1/LAMP3rs11711441GA+AA基因型与GG基因型PD患者的临床特征GGGA+
AAP值性别
(%)女299(58.5)134(54.5)0.293男212(41.5)112(45.5)发病年龄(岁)a
所有患者54.23±10.5254.45±10.780.785EOPD42.20±4.6142.74±5.140.392LOPD59.86±7.2860.74±7.130.202首发症状静止性震颤
(%)264(51.7)120(48.8)0.378运动迟缓-强直
173(33.9)95(38.6)混合症状28(5.5)8(3.3)其他a46(9.0)23(9.3)a
包括疼痛、乏力、自主神经功能紊乱等症状讨论Nalls一项包括不同种族的更大范围的重复研究发现:MCCC1/LAMP3rs11711441亚洲人群(OR=0.81)高加索人群(OR=0.86)在2011年完成的一项包括5项PDGWAS及独立重复验证首次发现了5个新的PD相关基因包括:MCCC1/LAMP3rs11711441Lill基于PDGene数据库完成的meta分析(包括3项GWAS)也肯定了以前鉴定的11个PD相关基因包括:MCCC1/LAMP3rs11711441
(OR=0.86)一项在相对同质的斯堪的纳维亚人群(挪威、瑞典)的病例-对照研究也发现:MCCC1/LAMP3Rs11711441(OR=0.84)SharmaPihlstrøm1.
M.A.Nallsetal.,Lancet377,641(Feb19,2011).2.
C.M.Lilletal.,PLoSGenet8,e1002548(Mar,2012).3.
M.Sharmaetal.,Neurology79,659(2012).4.
L.Pihlstrometal.,NeurobiolAging34,1708e7(Jun,2013).讨论本研究MCCC1/LAMP3rs11711441降低了中国大陆汉族人群散发性PD发病风险(1428例研究对象,OR=0.82,P=0.043),这种相关性仅发生在晚发组(P=0.014)。近期研究近期的一项中国大陆汉族人群的研究(993例研究对象)表明:MCCC1/LAMP3rs11711441(早发性PD组,晚发性PD组,性别分层)1。Do等完成的一项PDGWAS表明:
MCCC1/LAMP3
rs10513789(P=2.67×10−10,OR=0.803)2在一项德系犹太人群的研究表明:MCCC1/LAMP3
rs12493053
(P=0.005,OR=0.64)31.
Y.-q.Wangetal.,Neuroscienceletters566,206(2014).2.
C.B.Doetal.,PLoSGenetics7,e1002141(2011).3.
X.Liuetal.,BMCmedicalgenetics12,104(2011).讨论结果略不一致标签位点不同连锁不平衡遗传异质性样本量讨论
MCCC1编码3-甲基巴豆酰辅酶A羧化酶,该
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