医学分子生物学技术 蛋白质

医学分子生物学实验技术12/30/20231第一章蛋白质的分别与纯化第一节蛋白质分别纯化的普通原那么一、蛋白质分别纯化技术及其根据表1－1主要的蛋白质分别纯化方法及根据性质分别方法分子大小与外形超滤、透析、密度梯度离心、凝胶过滤层析、凝胶电泳溶解度沉淀法、相分配法、分配层析、结晶、溶剂抽提、逆流分配电荷分布电泳技术、等电点沉淀、离子交换层析、聚焦层析、等电聚倍数电泳生物功能专注性亲和层析疏水性疏水作用层析、反相高效液相层析12/30/20232第一章蛋白质的分别与纯化二、蛋白质纯化的普通设计原那么1、目的蛋白的分别和纯化应该尽能够选择来源方便、本钱低、易操作的组织或细胞作为原料；2、要建立一个特异、快速、可反复、经济的目的蛋白活性检测方法；3、蛋白质分别纯化工艺的设计应该分级分别、先粗后细的原那么；4、纯化条件要尽能够温暖。12/30/20233第一章蛋白质的分别与纯化第二节蛋白质的层析(chromatography)分别一、层析技术的开展简史及科学意义二、层析技术的根本原理固定相：在层析系统分别过程中静止不动的相。流动相：在层析系统分别过程中在载体上延一定方向挪动的相。12/30/2023412/30/2023512/30/20236塔板实际：K＝＝(溶质在固定相中的浓度)Cs(溶质在流动相中的浓度)Cm把色谱柱比作一个精馏塔，沿用精馏塔中塔板的概念来描画组分在两相间的分配行为，同时引入实际塔板数作为衡量柱效率的目的，即色谱柱是由一系列延续的、相等的程度塔板组成。每一块塔板的高度用H表示，称为塔板高度，简称板高。12/30/20237塔板实际假设：1.在柱内一小段长度H内，组分可以在两相间迅速到达平衡。这一小段柱长称为实际塔板高度H。2.以气相色谱为例，载气进入色谱柱不是延续进展的，而是脉动式，每次进气为一个塔板体积〔ΔVm〕。3.一切组分开场时存在于第0号塔板上，而且试样沿轴〔纵〕向分散可忽略。4.分配系数在一切塔板上是常数，与组分在某一塔板上的量无关。12/30/20238简单地以为：在每一块塔板上，溶质在两相间很快到达分配平衡，然后随着流动相按一个一个塔板的方式向前挪动。对于一根长为L的色谱柱，溶质平衡的次数应为：n=L/Hn称为实际塔板数。与精馏塔一样，色谱柱的柱效随实际塔板数n的添加而添加，随板高H的增大而减小。12/30/2023912/30/20231012/30/20231112/30/202312洗脱法也称冲洗法。任务时，首先将样品加到色谱柱头上，然后用吸附或溶解才干比试样组分弱得多的气体或液体作冲洗剂。由于各组分在固定相上的吸附或溶解才干不同，被冲洗剂带出的先后次序也不同，从而使组分彼此分别。流出曲线以下图。层析的展开方式12/30/202313顶替法是将样品加到色谱柱头后，在惰性流动相中参与对固定相的吸附或溶解才干比一切试样组分强的物质为顶替剂〔或直接用顶替剂作流动相〕，经过色谱柱，将各组分按吸附或溶解才干的强弱顺序，依次顶替出固定相。很明显，吸附或溶解才干最弱的组分最先流出，最强的最后流出。顶替法的流出曲线如以下图。12/30/20231412/30/202315迎头法是将试样混合物延续经过色谱柱，吸附或溶解才干最弱的组分首先一纯物质的形状流出，其次那么以第一组分和吸附或溶解才干较弱的第二组分混合物，以此类推。流出曲线如以下图。A+BA12/30/202316层析流出曲线及相关术语色谱流出曲线和色谱峰由检测器输出的电信号强度对时间作图，所得曲线称为色谱流出曲线。曲线上突起部分就是色谱峰。假设进样量很小，浓度很低，在吸附等温线〔气固吸附色谱〕或分配等温线〔气液分配色谱〕的线性范围内，那么色谱峰是对称的。12/30/202317基线在实验操作条件下，色谱柱后没有样品组分流出时的流出曲线称为基线，稳定的基线应该是一条程度直线。峰高色谱峰顶点与基线之间的垂直间隔，以〔h〕表示。12/30/202318色谱流出曲线色谱流出曲线和色谱峰基线〔a〕峰高〔h〕信号进样空气峰色谱峰ha12/30/202319保管值死时间t0不被固定相吸附或溶解的物质进入色谱柱时，从进样到出现峰极大值所需的时间称为死时间，它正比于色谱柱的空隙体积，如以下图。信号进样t0由于这种物质不被固定相吸附或溶解，故其流动速度将与流动相流动速度相近。测定流动相平均线速ū时，可用柱长L与t0的比值计算，即ū=L/t012/30/202320信号进样tr2.保管时间tr试样从进样到柱后出现峰极大点时所经过的时间，称为保管时间，如以下图。12/30/2023213.调整保管时间tr´某组分的保管时间扣除死时间后，称为该组分的调整保管时间，即tr´=trt0由于组分在色谱柱中的保管时间tr包含了组分随流动相经过柱子所须的时间和组分在固定相中滞留所须的时间，所以tr实践上是组分在固定相中保管的总时间。保管时间是色谱法定性的根本根据，但同一组分的保管时间常遭到流动相流速的影响，因此色谱任务者有时用保管体积来表示保管值。12/30/2023224.死体积V0指色谱柱在填充后，柱管内固定相颗粒间所剩留的空间、色谱仪中管路和衔接头间的空间以及检测器的空间的总和。当后两相很小可忽略不计时，死体积可由死时间与色谱柱出口的载气流速Fco〔cm3·min-1〕计算。V0=t0Fco式中Fco为扣除饱和水蒸气压并经温度校正的流速。仅适用于气相色谱，不适用于液相色谱。12/30/2023235.保管体积Vr指从进样开场到被测组分在柱后出现浓度极大点时所经过的流动相的体积。保管时间与保管体积关系：Vr=trFco6.调整保管体积Vr某组分的保管体积扣除死体积后，称为该组分的调整保管体积。Vr=VrV0=trFco12/30/2023247.相对保管值r2,1某组分2的调整保管值与组分1的调整保管值之比，称为相对保管值。r2,1=tr2/tr1´=Vr2/Vr1由于相对保管值只与柱温及固定相性质有关，而与柱径、柱长、填充情况及流动相流速无关，因此，它在色谱法中，特别是在气相色谱法中，广泛用作定性的根据。12/30/202325在定性分析中，通常固定一个色谱峰作为规范〔s〕，然后再求其它峰〔i〕对这个峰的相对保管值，此时可用符号表示，即=tr(i)/tr(s)式中tr(i)为后出峰的调整保管时间，所以总是大于1的。相对保管值往往可作为衡量固定相选择性的目的，又称选择因子。区域宽度色谱峰的区域宽度是色谱流出曲线的重要参数之一，用于衡量柱效率及反映色谱操作条件的动力学要素。表示色谱峰区域宽度通常有三种方法。12/30/2023261.规范偏向即0.607倍峰高处色谱峰宽的一半。2.半峰宽W1/2即峰高一半处对应的峰宽。它与规范偏向的关系为W1/2=2.3543.峰底宽度W即色谱峰两侧拐点上的切线在基线上截距间的间隔。它与规范偏向的关系是W=412/30/20232712/30/202328从色谱流出曲线中，可得许多重要信息：(i)根据色谱峰的个数，可以判别样品中所含组分的最少个数；(ii)根据色谱峰的保管值，可以进展定性分析；(iii)根据色谱峰的面积或峰高，可以进展定量分析；(iv)色谱峰的保管值及其区域宽度，是评价色谱柱分别效能的根据；(v)色谱峰两峰间的间隔，是评价固定相〔或流动相〕选择能否适宜的根据。12/30/202329三、离子交换层析离子交换层析(ionexchangechromatography)利用物质的电荷与层析载体(离子交换剂)电荷之间的相互作用到达分别纯化的目的的层析方法称离子交换层析。离子交换剂：离子交换层析所用的固相基质，由不溶于水的、具有网状构造的高分子聚合物组成。12/30/20233012/30/202331离子交换层析的操作1、样品的预备：固体样品必需溶于适当离子强度和pH的缓冲液中。组织液或细胞裂解液用缓冲液稀释后可直接上柱。盐析样品必需除盐后才干进展分别。2、离子交换剂的处置：根据被分别样品的性质选择适宜的离子交换剂，离子交换剂在运用前须先进展处置。12/30/2023323、层析柱的预备：离子交换层析柱普通选择粗短柱为宜，使得样品在分别的同时进展浓缩。离子交换剂的用量根据样品量和交换剂的交换容量确定。4、样品分别：上样量的多少与目的蛋白的性质、浓度及交换剂的亲和力有关。在分别过程中，应留意12/30/2023331〕样品的浓度不宜过大2〕溶解蛋白质样品的缓冲液的离子强度要低于起始缓冲液3〕上样速度不要过快4〕上样缓冲液的pH应适宜5、洗脱12/30/2023346、洗脱液的鉴定和回收7、离子交换剂的再生与储存12/30/20233512/30/202336兔γ－球蛋白的木瓜蛋白酶水解物在CM纤维素柱上的层析分别12/30/202337天花粉各成分用特种离子交换剂层析分别12/30/20233812/30/20233912/30/202340二、分子筛原理12/30/20234112/30/20234212/30/202343凝胶过滤的分配系数K=(Ve-V0)(Vi)12/30/202344主要凝胶过滤介质的牌号及骨架构造12/30/202345葡聚糖凝胶(G)型号分离范围(分子量)吸水量(克／克干凝胶)膨胀体积(毫升／克干凝胶)浸泡时间蛋白质多糖20～25℃90~100℃10<700<7001.02-33115<1500<15001.52.5-3.531251000-5000100-50002.54-631501500-30000500-100005.09-1131753000-700001000-500007.512-152431004000-1500001000-1000001015-207251505000-4000001000-1500001520-307252005000-8000001000-2000002030-4072512/30/202346亲和层析：利用生物分子间特殊的亲和关系进展的分别方法。是蛋白质分别纯化的最有效的方法之一，有时甚至可以仅用一步纯化即可到达纯化目的。只需被分别蛋白、配基和载体之间能构成以下的关系，即可进展亲和层析12/30/20234712/30/202348根本原理：亲和层析法利用了生命景象中生物分子之间非常特异的相互作用而进展分别纯化的方法。生物体内能发生特异的相互作用的成分有：酶与酶的底物酶与酶的抑制剂酶与酶的变构效应剂酶与酶的辅酶激素与细胞膜上的受体维生素与结合蛋白核酸抗原与抗体外源凝集素与红细胞外表的抗原12/30/202349特异性强分辨率高回收率高层析柱的再生方便亲和层析特点特别适用于微量生物活性物质的分别12/30/202350电泳是指带电粒子在电场中向与其本身带相反电荷的电极挪动的景象

正极负极带负电粒子带正电粒子蛋白质的电泳分别12/30/202351++++++++--------++++++++--------蛋白质胶体颗粒的沉淀带正电荷的蛋白质带负电荷的蛋白质在等电点的蛋白质酸酸碱碱脱水脱水脱水不稳定的蛋白质颗粒〔沉淀〕带正电荷的蛋白质〔疏水胶体〕带负电荷的蛋白质〔疏水胶体〕碱酸〔亲水胶体〕〔亲水胶体〕〔亲水胶体〕12/30/202352带电颗粒在电场中所遭到的电场力F=EQ根据Stoke定律，球形分子在液体中泳动所遭到的阻力F’=6πrηv电泳原理：12/30/202353F=F’即：EQ=6πrηv时，V=EQ6πrη当物质在电场中挪动时，遭到电场力和液体阻力两方面的力的影响，当电场力和阻力平衡时，带电颗粒作匀速运动，12/30/202354两个带电颗粒能否分开，由两个颗粒在电泳过程中的迁移率所决议，即U=dlVt或d=UVtldU==VEtVl=dlVt或d1-d2=(U1-U2)VtlΔd=12/30/202355迁移率〔或泳动度〕是指带电颗粒在单位电场强度下泳动的速度，可用以下公式计算： Ｕ=υ/E=(d/t)/(V/l)=dl/VtＵ为迁移率〔cm2·V-1·min-1〕；υ为颗粒泳动速度〔cm·s-1〕；E为电场强度〔V·cm-1〕；d为颗粒泳动的间隔〔cm〕；l为滤纸有效长度〔cm〕；V为实践电压〔V〕；t为通电时间〔s或min〕。经过丈量d,l,V,t,即可计算出被分别物质的迁移率。12/30/202356影响电泳的要素1、带电粒子的性质与电泳行为2、电场强度对带电粒子迁移的影响：电场强度也称电位梯度，是指单位长度〔每一厘米〕支持物体上的电位降，它对泳动速度起着非常重要的作用。普通，电场强度越高，带电颗粒挪动速度越快。12/30/2023573、溶液的pH对带电粒子迁移的影响：溶液的pH值决议了带电颗粒解离的程度，也决议了物质所带净电荷的多少。4、电渗对电泳的影响：电渗是在电场中液体对固体的相对挪动。12/30/202358电渗作用12/30/2023595、离子强度对电泳的影响：电泳液中的离子添加会使电泳迁移率降低，缘由是带电的离子会吸引相反符号的离子聚集在其周围，构成一个与运动粒子符号相反的离子氛，它使该离子向相反的方向运动，从而降低了该粒子的迁移率。12/30/2023606、温度对的电泳的影响：电泳过程中由于通电产生焦耳热，热对电泳有很大的影响。温度每升高1℃，迁移率约添加2.4%。为降低热效应对电泳的影响，可控制电压或电流，或在电泳系统中安装冷却散热安装。12/30/202361电泳的分类和特点电泳的分类自在挪动界面电泳区带电泳稳态电泳12/30/202362自在挪动界面电泳〔movingboundaryelectrophoresis〕，没有支持物，在一个U形管中进展电泳，目前已被区带电泳所取代。区带电泳〔zoneelectrophoresis〕在一定的支持物上进展的电泳，电泳结果构成一条条的区带而得名。稳态电泳〔steadystateelectrophoresis〕带电颗粒电泳一定时间后到达稳态而停顿挪动。12/30/20236312/30/202364聚丙烯酰胺凝胶电泳〔polyacrylamidegelelectrophoresis,PAGE〕聚丙烯酰胺凝胶是由单体丙烯酰胺Acr和交联剂N,N’-甲叉双丙烯酰胺Bis聚合而成12/30/20236512/30/202366聚合过程需求有催化剂参与，有两种聚合方式，化学聚合和光聚合。催化剂包括引发剂和加速剂两部分组成。化学聚合反响的引发剂常为过硫酸铵，过硫酸铵首先构成自在基，经过自在基传送，使丙烯酰胺成为自在基，发动聚合反响。加速剂四甲基乙二胺〔tetramethylethylenediamine，TEMED〕可加快引发剂释放自在基的速度；光学聚合反响的引发剂为核黄素。12/30/202367聚丙烯凝胶的特点①在一定浓度时，凝胶透明，有弹性，机械性能好；②化学性能稳定，与被分别物不发生化学反响；③对pH和温度变化较稳定；④几乎无电渗作用，只需Acr纯度高，操作条件一致，那么样品分别反复性极好。⑤样品不易分散，且用量少，其灵敏度可达10-6g。⑥凝胶孔径可经过选择单体及交联剂的浓度调理。⑦分辩率高，尤其在不边疆凝胶电泳中，集浓缩、分子筛和电荷效应为一体。12/30/202368凝胶孔径及其有关性质①凝胶性能与总浓度及交联度的关系凝胶的孔径、机械性能、弹性、透明度、黏度和聚合程度取决于凝胶总浓度和Acr与Bis之比。T〔Acr和Bis总浓度〕%=×100%a+bmc〔交联剂百分比〕%=×100%ba+b12/30/202369a/b与凝胶的机械性能亲密相关。当〔a/b〕<10时，凝胶脆而易碎，巩固呈乳白色；〔a/b〕>100时，即使5%的凝胶也呈糊状，易于断裂。欲制备完全透明而又有弹性的凝胶，应控制〔a/b〕=30左右。T普通为5%~10%。②凝胶浓度与孔径的关系T与c不仅与凝胶的机械性能有关，还与凝胶的孔径关系极为亲密。普通讲，T越大，孔径越小。此外，孔径还同Bis与Acr的比例有关，Bis占Acr总浓度5%时，孔径最小。③凝胶浓度与被分别物相对分子质量有关。12/30/20237012/30/202371聚丙烯酰胺凝胶电泳垂直平板电泳程度板电泳圆盘电泳延续电泳不延续电泳Disc电泳12/30/202372丙烯酰胺凝胶电泳的运用聚丙烯酰胺凝胶电泳根据其有无浓缩效应，可分为延续的和不延续的两类。前者指整个电泳系统中所用缓冲液，pH值和凝胶网孔都是一样的；后者是指在电泳系统中采用了两种或两种以上的缓冲液、pH值和孔径，不延续电泳能使稀的样品在电泳过程中浓缩成层，从而提高分辨才干。12/30/202373在不延续PAGE系统里，存在三种物理效应,，即电荷效应、分子筛效应和浓缩效应。１、电荷效应：各种蛋白质按其所带电荷的种类及数量，在电场向一定电极，以一定速度泳动。２、分子筛效应：区别不同大小分子种类的才干是凝胶所具有的一种筛分大小的才干即分子筛效应。这种效应与凝胶过滤过程中的情况不同。12/30/202374浓缩效应12/30/20237512/30/20237612/30/20237712/30/202378§9蛋白质的研讨历史与方法SDS－PAGE电泳是运用聚丙烯凝胶电泳测定蛋白质分子量的一种有效的方法。SDS是阴离子变性剂，使蛋白质分子变性为直链状，且其所带阴离子将蛋白质分子所带电荷完全履盖，具有类似的荷质比，电泳过程完全与蛋白质的分子量相关。电泳终了后的凝胶用考马斯亮兰或银染后与知分子量的蛋白质的规范蛋白比较得出。12/30/20237912/30/202380§9蛋白质的研讨历史与方法二维电泳是等电聚焦电