快慢生长型肉鸡全基因组甲基化测序及比较分析的开题报告

快慢生长型肉鸡全基因组甲基化测序及比较分析的开题报告一、研究背景和意义：随着人口的不断增长和经济的不断发展，人们对高蛋白质和低脂肪肉制品的需求不断提高。肉鸡作为养殖业的主要品种之一，其生长速度和肌肉品质对肉制品生产具有重要影响。因此，在肉鸡生长过程中，为了能够更好地控制生长速度和提高肌肉品质，需要进行相关的分子生物学研究。DNA甲基化是一种常见的表观遗传修饰，它对于基因表达和生长发育等多个生物学过程具有重要影响。因此，对肉鸡DNA甲基化的研究可以揭示其生长发育机制，并为肉鸡选育和养殖提供理论基础。目前，针对肉鸡生长发育的DNA甲基化研究较少，有关肉鸡生长发育的DNA甲基化机制的深入探究仍具有重要意义。本研究旨在通过对快慢生长型肉鸡进行全基因组甲基化测序及比较分析，揭示其生长发育过程中的DNA甲基化模式，为肉鸡生长发育的细胞分化和分子机制提供新的理论依据。二、研究目标和内容：目标：分析快慢生长型肉鸡DNA甲基化的差异，探讨其在肉鸡生长发育过程中的功能及机制，为肉鸡的选育和生产提供理论基础。内容：1.采集快慢生长型肉鸡的全基因组DNA，并建立DNA文库。2.对文库进行高通量甲基化测序，得到快慢生长型肉鸡的甲基化谱。3.利用生物信息学方法进行甲基化谱的数据分析，包括数据质控、比对、差异甲基化位点筛选和功能注释等。4.分析快慢生长型肉鸡DNA甲基化谱的差异，探讨其在肉鸡生长发育过程中的功能及机制。三、研究方法：1.样品准备：选取快慢生长型肉鸡7天龄和21天龄各10只，采集其全血细胞，提取全基因组DNA，并建立DNA文库。2.甲基化测序：对文库进行高通量Bisulfite测序，得到快慢生长型肉鸡的甲基化谱，数据量不少于50G。3.数据分析：利用生物信息学方法对甲基化谱进行数据分析，包括数据质控、比对、差异甲基化位点筛选和功能注释等。四、研究预期结果：1.获得快慢生长型肉鸡全基因组甲基化谱，揭示其在生长发育过程中的DNA甲基化模式。2.分析快慢生长型肉鸡DNA甲基化谱的差异，探讨其在肉鸡生长发育过程中的功能及机制。3.为肉鸡选育和养殖提供新的理论依据，推动肉鸡生产的发展。五、主要参考文献：1.LiX,ZhuangQ,WangK,ShenJ,LiY,etal.2016.ComparativeDNAmethylomeanalysisofendometrialcarcinomarevealscomplexanddistinctderegulationofcancerpromotersandenhancers.BMCGenomics.17(1):665.2.LuongMX,ChenL,PengL,TuckerMA,LuongHT,etal.2019.Large-scaleDNAMethylationProfilingRevealsTranscriptionallyRepressiveGeneExpressionModulesinSepsis-inducedARDS.SciRep.9(1):4650.3.L.A.Ghazali,I.Bartelink,L.deKoning,2017.CharacterisationofglobalDNAmethylationlevelsinavianspeciestissues,Sci.Rep.7(1):16103.4.WangC,YuH,DengW,QuY,SongC,etal.2021.ComprehensiveanalysisofDNAmethylationandtranscriptionalchangesinchicke